本申请实施例公开了一种基因多态性分析报告的生成方法、装置、设备及计算机存储介质,方法包括:获取生物样本的对象信息;获取所述生物样本的聚合酶链式反应PCR检测的信息;基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息,其中,所述元数据包括PCR检测的信息与多态性信息之间的关系;基于所述对象信息和所述检测基因的多态性信息,生成所述生物样本的基因多态性分析报告。如此,可以实现根据PCR检测结果快速完成多个生物样本的多种基因多态性的分析,从而降低解读PCR检测结果的错误率。以及能够快速生成生物样本的基因多态性分析报告,提高生成分析报告的工作效率,避免耗时过长的缺陷。
【技术实现步骤摘要】
基因多态性分析报告的生成方法、装置、设备及存储介质
本申请涉及生物信息
,尤其涉及一种基因多态性分析报告的生成方法、装置、设备及计算机存储介质。
技术介绍
目前,基因多态性的检测方法有多种,如限制性长度多态性分析、直接测序法、印记杂交法以及聚合酶链反应(PolymeraseChainReaction,PCR)检测法。其中,随着PCR检测技术的发展,单次PCR检测试验可以同时检测多个生物样本的多个单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphisms,SNP)位点。因此,随着检测的基因型种类和样本数目的增加,针对PCR检测信息,工作人员需要根据分析大量PCR检测结果得到多种基因型分型结果,并且检索不同公共数据库、文献库和书籍,来生成解读上述基因型分型结果的分析报告。然而,工作人员即使采用简单的复制粘贴的方式书写分析报告,也需要花费较长的时间。同时,生成的分析报告的信息并不全面,以及分析报告标准化程度低。
技术实现思路
本申请实施例提供一种基因多态性分析报告的生成方法、装置、设备及存储介质。第一方面,本申请实施例提供一种基因多态性分析报告的生成方法,所述方法包括:获取生物样本的对象信息;获取所述生物样本的聚合酶链式反应PCR检测的信息;基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息,其中,所述元数据包括PCR检测的信息与多态性信息之间的关系;基于所述对象信息、所述检测基因的多态性信息,生成所述生物样本的基因多态性分析报告。在一些实施例中,在所述基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息之前,所述方法还包括:基于所述PCR检测的信息中反应孔的位置信息,以及所述元数据中反应孔的位置信息与变异位点的信息之间的关系,确定所述PCR检测的信息中,每个所述反应孔对应的所述检测基因中变异位点的信息。在一些实施例中,在所述基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息之前,所述方法还包括:基于所述PCR检测的信息中反应孔的位置信息和荧光通道的信息,以及所述元数据中反应孔的位置信息、荧光通道的信息与变异位点的信息之间的关系,确定所述PCR检测的信息中,每个所述荧光通道对应的所述检测基因中变异位点的信息。在一些实施例中,所述检测基因的多态性信息包括基因分型的信息,所述基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息,包括:基于所述PCR检测的信息中,至少一个所述变异位点对应的至少两个不同类型的反应结果信息,以及所述元数据中至少两个不同类型的反应结果信息与基因型之间的关系,确定所述基因分型的信息。在一些实施例中,所述检测基因的多态性信息包括临床解读信息,所述基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息,包括:基于所述基因分型的信息,以及元数据中基因型、风险值与临床风险注解之间的关系,生成所述检测基因的临床解读信息。在一些实施例中,所述临床解读信息包括风险信息,所述方法还包括:基于所述基因分型的信息,以及所述元数据中基因型与风险值之间的关系,确定所述检测基因中至少两个变异位点的风险值;基于各个所述变异位点的风险值以及所述元数据中风险值与风险信息之间的关系,确定所述基因的风险信息。在一些实施例中,所述基于所述对象信息和所述检测基因的多态性信息,生成所述生物样本的基因多态性分析报告,包括:利用所述对象信息和所述检测基因的多态性信息替换分析报告模板中待替换的内容标签,生成所述生物样本的基因多态性分析报告。第二方面,本申请实施例提供一种基因多态性分析报告的生成装置,所述装置包括:对象信息获取模块、检测信息获取模块、第一信息确定模块、生成模块;所述对象信息获取模块,用于获取生物样本的对象信息;所述检测信息获取模块,用于获取所述生物样本的聚合酶链式反应PCR检测的信息;所述第一信息确定模块,用于基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息,其中,所述元数据包括PCR检测的信息与多态性信息之间的关系;所述生成模块,用于基于所述对象信息和所述检测基因的多态性信息,生成所述生物样本的基因多态性分析报告。第三方面,本申请实施例提供一种设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,其中,所述处理器执行所述程序时以实现以如本申请任一实施例所提供的基因多态性分析报告的生成方法的步骤。第四方面,本申请实施例提供一种计算机存储介质,所述计算机可读存储介质上存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现本申请任一实施例所提供的基因多态性分析报告的生成方法的步骤。本申请实施例中,获取生物样本的对象信息,获取所述生物样本的聚合酶链式反应PCR检测的信息。基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息,其中,所述元数据包括PCR检测的信息与多态性信息之间的关系,如此,利用元数据可以实现根据PCR检测结果快速完成多个生物样本的多种基因多态性的分析,从而降低解读PCR检测结果的错误率。基于所述对象信息和所述检测基因的多态性信息,生成所述生物样本的基因多态性分析报告,如此,将对象信息和检测基因的多态性信息进行整合,使得PCR检测多种基因多态性的数据分析和生成报告的过程简便化,能够快速生成生物样本的基因多态性分析报告,从而提高生成分析报告的工作效率,避免耗时过长的缺陷。同时分析报告中的信息更加全面,以及分析报告的信息标准化。附图说明图1为本申请一实施例中基因多态性分析报告的生成方法的处理流程示意图。图2为本申请一实施例中基因多态性分析报告的生成装置的结构示意图。图3为本申请一实施例中基因多态性分析报告的生成系统的结构示意图。图4为本申请一实施例中基因多态性分析报告的生成系统的应用场景示意图。图5为本申请另一实施例中基因多态性分析报告的生成方法的处理流程示意图。图6为本申请一实施例中基因多态性分析报告的生成系统的主界面的示意图。图7为本申请一实施例中基因多态性分析报告的生成系统的样本文件上传界面的示意图。图8a为本申请一实施例中基因多态性分析报告的生成系统的样本文件查询界面的示意图一。图8b为本申请一实施例中基因多态性分析报告的生成系统的样本文件查询界面的示意图二。图9为本申请一实施例中基因多态性分析报告的生成系统的PCR结果上传界面的示意图。图10a为本申请一实施例中基因多态性分析报告的生成系统的PCR结果查询界面的示意图一。图10b为本申请一实施例中基因多态性分析报告的生成系统的PCR结果查询界面的示意图二。图11a为本申请一实施例中叶酸代谢能力基因分析报告第一页的示意图。图11b为本申请一实施例中叶酸代谢能力基因分析报告第二页的示意图。图12a为本申请一实施例中APOE基因分析报告第一页的示意图。...
【技术保护点】
1.一种基因多态性分析报告的生成方法,其特征在于,所述方法包括:/n获取生物样本的对象信息;/n获取所述生物样本的聚合酶链式反应PCR检测的信息;/n基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息,其中,所述元数据包括PCR检测的信息与多态性信息之间的关系;/n基于所述对象信息和所述检测基因的多态性信息,生成所述生物样本的基因多态性分析报告。/n
【技术特征摘要】
1.一种基因多态性分析报告的生成方法,其特征在于,所述方法包括:
获取生物样本的对象信息;
获取所述生物样本的聚合酶链式反应PCR检测的信息;
基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息,其中,所述元数据包括PCR检测的信息与多态性信息之间的关系;
基于所述对象信息和所述检测基因的多态性信息,生成所述生物样本的基因多态性分析报告。
2.根据权利要求1所述方法,其特征在于,在所述基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息之前,所述方法还包括:
基于所述PCR检测的信息中反应孔的位置信息,以及所述元数据中反应孔的位置信息与变异位点的信息之间的关系,确定所述PCR检测的信息中,每个所述反应孔对应的所述检测基因中变异位点的信息。
3.根据权利要求1所述方法,其特征在于,在所述基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息之前,所述方法还包括:
基于所述PCR检测的信息中反应孔的位置信息和荧光通道的信息,以及所述元数据中反应孔的位置信息、荧光通道的信息与变异位点的信息之间的关系,确定所述PCR检测的信息中,每个所述荧光通道对应的所述检测基因中变异位点的信息。
4.根据权利要求2或3所述方法,其特征在于,所述检测基因的多态性信息包括基因分型的信息,所述基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息,包括:
基于所述PCR检测的信息中,至少一个所述变异位点对应的至少两个不同类型的反应结果信息,以及所述元数据中至少两个不同类型的反应结果信息与基因型之间的关系,确定所述基因分型的信息。
5.根据权利要求4所述方法,其特征在于,所述检测基因的多态性信息包括临床解读信息,所述基于所述PCR检测的信息和元数据,确定检测基因的多态性信息,包括:
基于所述基因分型的信息,...
【专利技术属性】
技术研发人员:刘让蛟,戴立忠,周玮欢,周小富,洪梅,李金良,郭鑫武,胡娟,
申请(专利权)人:圣湘生物科技股份有限公司,
类型:发明
国别省市:湖南;43
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。