本发明专利技术公开了一种小麦分子标记及其在鉴定小麦粒重性状中的应用。本发明专利技术提供了一种引物组,由引物6A‑90K‑236‑A、引物6A‑90K‑236‑B和引物6A‑90K‑236‑C组成;引物6A‑90K‑236‑A为序列1所示的单链DNA分子;引物6A‑90K‑236‑B为序列2所示的单链DNA分子;引物6A‑90K‑236‑C为序列3所示的单链DNA分子。本发明专利技术还保护一种鉴定待测小麦的粒重性状的方法,包括如下步骤:(1)以待测小麦的基因组DNA为模板,采用所述引物组进行KASP;(2)完成步骤(1)后,进行荧光扫描,确定待测小麦的基因型;(3)根据基因型结果进行判断:AA基因型小麦的粒重高于GG基因型小麦。本发明专利技术可用于分子标记辅助育种,对于培育高产小麦具有重大应用价值。
【技术实现步骤摘要】
一种小麦分子标记及其在鉴定小麦粒重性状中的应用
本专利技术属于生物
,具体涉及一种小麦分子标记及其在鉴定小麦粒重性状中的应用。
技术介绍
小麦是最重要的粮食作物之一,但由于种质资源、育种材料和方法的限制及多种生物和非生物逆境的影响,全球小麦产量增速逐渐放缓。耕地面积大幅减少,人口持续增加,粮食安全受到严重威胁,如何提高小麦产量是当前亟待解决的重要问题。千粒重是重要的产量因子,遗传力较高,相对于产量受环境影响较小,且与产量显著正相关因此,改良千粒重,即利用分子标记聚合粒重基因,是提高产量的重要途径。因此,发掘更多的小麦粒重基因,开发基因特异性分子标记,是进行基因聚合育种和产量性状分子机理研究的重要基础。KASP(KompetitiveAllele-SpecificPCR,竞争性等位基因特异性PCR)是由英国LGC(LaboratoryoftheGovernmentChemist,政府化学家实验室)开发的一项经济有效、灵活的SNP分型技术,基于引物末端碱基的特异匹配和通用荧光探针对SNP进行分型,可在96、384和1536孔PCR板中进行,荧光定量PCR仪或普通PCR仪结合酶标仪即可满足大部分用户的需求。与其他标记相比,KASP标记更适合应用于分子标记辅助选择育种。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种小麦分子标记及其在鉴定小麦粒重性状中的应用。本专利技术提供了一种引物组,由引物6A-90K-236-A、引物6A-90K-236-B和引物6A-90K-236-C组成;引物6A-90K-236-A为如下(a1)或(a2):(a1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;(a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;引物6A-90K-236-B为如下(b1)或(b2):(b1)序列表的序列2所示的单链DNA分子;(b2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子;引物6A-90K-236-C为如下(c1)或(c2):(c1)序列表的序列3所示的单链DNA分子;(c2)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子。所述引物组的用途为如下(d1)或(d2)或(d3)或(d4)或(d5)或(d6)或(d7)或(d8):(d1)鉴定或辅助鉴定小麦的粒重性状;(d2)鉴定或辅助鉴定小麦的千粒重性状;(d3)筛选或选育具有不同粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种;(d4)筛选或选育具有不同千粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种;(d5)制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的粒重性状的产品;(d6)制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的千粒重性状的产品;(d7)制备用于筛选或选育具有不同粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种的产品;(d8)制备用于筛选或选育具有不同千粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种的产品。本专利技术还保护所述引物组的应用,为如下(d1)或(d2)或(d3)或(d4)或(d5)或(d6)或(d7)或(d8):(d1)鉴定或辅助鉴定小麦的粒重性状;(d2)鉴定或辅助鉴定小麦的千粒重性状;(d3)筛选或选育具有不同粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种;(d4)筛选或选育具有不同千粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种;(d5)制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的粒重性状的产品;(d6)制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的千粒重性状的产品;(d7)制备用于筛选或选育具有不同粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种的产品;(d8)制备用于筛选或选育具有不同千粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种的产品。本专利技术还保护一种试剂盒,包括所述引物组。所述试剂盒的用途为如下(d1)或(d2)或(d3)或(d4):(d1)鉴定或辅助鉴定小麦的粒重性状;(d2)鉴定或辅助鉴定小麦的千粒重性状;(d3)筛选或选育具有不同粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种;(d4)筛选或选育具有不同千粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种。本专利技术还保护所述试剂盒的应用,为如下(d1)或(d2)或(d3)或(d4):(d1)鉴定或辅助鉴定小麦的粒重性状;(d2)鉴定或辅助鉴定小麦的千粒重性状;(d3)筛选或选育具有不同粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种;(d4)筛选或选育具有不同千粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种。本专利技术还保护一种鉴定待测小麦的粒重性状的方法,包括如下步骤:(1)以待测小麦的基因组DNA为模板,采用所述引物组进行KASP;(2)完成步骤(1)后,进行荧光扫描,确定待测小麦的基因型;(3)根据基因型结果进行判断:AA基因型小麦的粒重高于GG基因型小麦。所述粒重为千粒重。所述基因型为基于特异SNP的基因型。反应体系(总体积为5μl):模板DNA(DNA含量为110ng-220ng),2×KASPreactionmix2.5μl,引物混合试剂0.056μl,余量为ddH2O。2×KASPreactionmix,又称为KASP2×MasterMix,为LGC公司产品(货号KBS-1016-002)。引物混合试剂提供的有效成分为6A-90K-236-A、6A-90K-236-B和6A-90K-236-C。反应体系中,6A-90K-236-A、6A-90K-236-B和6A-90K-236-C的浓度均为100μM。FAM,蓝色(聚集于X轴),代表AA基因型。HEX,红色(聚集于Y轴),代表GG基因型。本专利技术还保护所述方法在小麦育种中的应用。所述育种的目的为获得高粒重小麦。所述育种的目的为获得高千粒重小麦。所述育种的目的为获得高产小麦。本专利技术还保护一种鉴定待测小麦的粒重性状的方法,包括如下步骤:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;AA基因型小麦的粒重显著高于GG基因型小麦。所述粒重为千粒重。本专利技术还保护一种小麦育种的方法,包括如下步骤:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;选择AA基因型小麦进行育种。所述育种的目的为获得高粒重小麦。所述育种的目的为获得高千粒重小麦。所述育种的目的为获得高产小麦。以上任一所述特异SNP为小麦基因组中的序列表的序列4所示DNA分子的第25位核苷酸。所述特异SNP为A/G多态。本专利技术还保护一种特异DNA分子,如序列表的序列4所示。本专利技术还保护所述特异DNA分子在鉴定小麦籽粒性状中的应用。所述籽粒性状为粒重性状。所述粒重具体可为千粒重。本专利技术可用于分子标记辅助育种,对于培育高产小麦具有重大应用价值。附图说明图1为基因分型结果图。具体实施方式以下的实本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.引物组,由引物6A-90K-236-A、引物6A-90K-236-B和引物6A-90K-236-C组成;/n引物6A-90K-236-A为如下(a1)或(a2):/n(a1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;/n(a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;/n引物6A-90K-236-B为如下(b1)或(b2):/n(b1)序列表的序列2所示的单链DNA分子;/n(b2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子;/n引物6A-90K-236-C为如下(c1)或(c2):/n(c1)序列表的序列3所示的单链DNA分子;/n(c2)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子。/n
【技术特征摘要】
1.引物组,由引物6A-90K-236-A、引物6A-90K-236-B和引物6A-90K-236-C组成;
引物6A-90K-236-A为如下(a1)或(a2):
(a1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;
(a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;
引物6A-90K-236-B为如下(b1)或(b2):
(b1)序列表的序列2所示的单链DNA分子;
(b2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子;
引物6A-90K-236-C为如下(c1)或(c2):
(c1)序列表的序列3所示的单链DNA分子;
(c2)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子。
2.权利要求1所述引物组的应用,为如下(d1)或(d2)或(d3)或(d4)或(d5)或(d6)或(d7)或(d8):
(d1)鉴定或辅助鉴定小麦的粒重性状;
(d2)鉴定或辅助鉴定小麦的千粒重性状;
(d3)筛选或选育具有不同粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种;
(d4)筛选或选育具有不同千粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种;
(d5)制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的粒重性状的产品;
(d6)制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的千粒重性状的产品;
(d7)制备用于筛选或选育具有不同粒重性状的小麦单株或株系或品系或品种的产品;
(d8)制备用于筛选或选育具有不同千...
【专利技术属性】
技术研发人员:高凤梅,徐登安,车京玉,马勇,张起昌,董亚超,董艳,李铁,李冬梅,赵远玲,孙铭隆,刘宁涛,田超,
申请(专利权)人:黑龙江省农业科学院克山分院,
类型:发明
国别省市:黑龙;23
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