电泳分离数据的解析装置制造方法及图纸

技术编号:24797141 阅读:51 留言:0更新日期:2020-07-07 20:41
提供一种电泳分离数据的解析装置。解析装置具备分离数据保持部、判定基准保持部以及成分峰判定部。所述分离数据保持部将针对包含作为已知成分的参照成分的参照用试样进行电泳分析得到的分离数据作为参照数据进行保持,并且将针对解析对象试样进行电泳分析得到的分离数据作为解析对象数据进行保持。所述判定基准保持部保持用于判定所述参照数据中的成分峰与所述解析对象数据中的成分峰是否相同的判定基准。所述成分峰判定部构成为使用所述判定基准来判定所述参照数据中的成分峰与所述解析对象数据中的成分峰是否相同。

【技术实现步骤摘要】
电泳分离数据的解析装置
本专利技术涉及一种具有对通过电泳分析得到的分离数据自动地进行指纹图谱分析(fingerprintinganalysis)解析的功能的解析装置。
技术介绍
作为通过电泳分析获取的分离数据的解析方法,已知如下一种指纹图谱分析:将与包含已知成分的参照用试样有关的分离数据(以下称为参照数据)同与解析对象试样有关的分离数据(以下称为解析对象数据)进行比较,来鉴定解析对象试样中包含的成分。一般情况下,将参照数据和解析对象数据(或者根据这些数据制作的凝胶图像(以特定的分离指标(例如片段大小)为轴排列各成分峰所得到的图像))并排配置,通过视觉观察来确认在解析对象数据上是否存在与参照数据上的各成分峰相同的成分峰,由此进行指纹图谱分析。现有技术文献专利文献专利文献1:日本特开2018-025536号公报
技术实现思路
专利技术要解决的问题在电泳分析中,即使对相同物质进行测定,分离数据有时也会产生偏差。特别是在使用多个泳动流路进行了电泳的情况下,由于泳动流路间的分析误差而分离数据易于产生偏差。如果分离数据间的偏差大,则难以通过参照数据与解析对象数据的比较来鉴定解析对象成分。为了减小分离数据间的偏差,提出了以参照数据为基准对解析对象数据的峰波形进行校正的方案(参照专利文献1。)。通过使解析对象数据中的特定范围的峰波形在固定条件下沿时间轴方向伸缩或移位来进行解析对象数据的波形校正。由此,参照数据与解析对象数据的比较变得容易。然而,在以往的指纹图谱分析中,基于通过视觉观察进行的判定来进行解析对象试样中的成分的鉴定,因此担心由用户的主观导致的结果的偏差。另外,还存在以下问题:用户通过视觉观察进行的判断需要长时间,容易引起人为错误。因此,本专利技术的目的在于提供一种具有对通过电泳分析得到的分离数据自动地进行指纹图谱分析的功能的解析装置。用于解决问题的方案本专利技术是用于对通过电泳分析得到的分离数据进行解析的解析装置。该解析装置具备分离数据保持部、判定基准保持部以及成分峰判定部。所述分离数据保持部将针对包含作为已知成分的参照成分的参照用试样进行电泳分析得到的分离数据作为参照数据进行保持,并且将针对解析对象试样进行电泳分析得到的分离数据作为解析对象数据进行保持。所述判定基准保持部保持用于判定所述参照数据中的成分峰与所述解析对象数据中的成分峰是否相同的判定基准。所述成分峰判定部构成为使用所述判定基准来判定所述参照数据中的成分峰与所述解析对象数据中的成分峰是否相同。在优选的实施方式中,还具备:解析对象成分指标值确定部,其构成为将所述解析对象数据中的成分峰的分离指标值确定为解析对象成分指标值;以及参照成分指标值确定部,其构成为将所述参照数据中的成分峰的分离指标值确定为参照成分指标值,所述成分峰判定部构成为:在所述参照数据中的成分峰的所述参照成分指标值与所述解析对象数据中的成分峰的所述解析对象成分指标值之差满足所述判定基准时,将所述参照数据中的成分峰和所述解析对象数据中的成分峰判定为同一成分峰。在上述情况下,所述判定基准也可以是差容许率,该差容许率是所述解析对象成分指标值与所述参照成分指标值之间的差相对于所述参照成分指标值的比例。另外,本专利技术所涉及的解析装置也可以具有执行波形校正的功能,在该波形校正中,使峰波形伸缩和/或移位,以使解析对象数据中的特定的范围的峰波形与参照数据中的对应范围的峰波形匹配。即,在本专利技术所涉及的解析装置的优选的实施方式中,还具备波形校正部,该波形校正部构成为执行波形校正,在该波形校正中,使在所述解析对象数据中设定的解析对象范围的峰波形在规定的容许范围内伸缩和/或移位,以使所述解析对象范围的峰波形与对应于该解析对象范围的所述参照数据中的范围的峰波形之间的相关性最大,所述成分峰判定部构成为:在执行了所述波形校正后的所述解析对象范围的峰波形与对应于所述解析对象范围的所述参照数据中的范围的峰波形之间的相关性满足了所述判定基准时,判定为处于所述解析对象范围内的成分峰与处于对应于所述解析对象范围的所述参照数据中的范围的成分峰为同一成分峰。此外,关于波形校正,在专利文献1中有详细地公开。在上述情况下,也可以是,用户能够任意地指定解析对象范围。即,也可以是,还具备解析对象范围指定部,该解析对象范围指定部构成为使用户指定所述解析对象范围,所述波形校正部构成为对由用户指定的所述解析对象范围执行所述波形校正。另外,也可以是,用户能够任意地设定波形校正的容许范围。即,也可以是,还具备校正容许范围指定部,该校正容许范围指定部构成为使用户指定所述容许范围,所述波形校正部构成为在由用户指定的所述容许范围内执行所述波形校正。另外,也可以构成为用户能够任意地设定判定基准。即,也可以是,还具备判定基准输入部,该判定基准输入部用于使用户输入所述判定基准,所述判定基准保持部构成为保持由所述用户输入的所述判定基准。也可以是,所述分离数据保持部构成为:保持多个分离数据,并且将所述多个分离数据中的由用户指定的一个分离数据作为所述参照数据进行保持,将剩余的分离数据中的至少一个分离数据作为所述解析对象数据进行保持。另外,也可以是,还具备指标值指定部,该指标值指定部构成为使用户通过分离指标值来指定想要确认在所述解析对象数据中的存在的成分峰,所述成分峰判定部构成为:在用户通过所述分离指标值指定了成分峰时,在用户所指定的所述分离指标值与所述解析对象数据中的成分峰的所述解析对象成分指标值之差满足了所述判定基准时,判定为所述解析对象成分中的该成分峰与由用户通过所述分离指标值指定的成分峰相同。于是,用户能够通过分离指标值来指定想要确认解析数据中的存在的成分峰。另外,也可以具备参照成分名称输入部,该参照成分名称输入部构成为使用户输入所述参照成分的名称。另外,如上所述,判定基准是解析对象数据中的成分峰的分离指标值与参照数据中的成分峰的分离指标值之差的容许率等,但如果设定这样的判定基准,则参照数据中彼此相邻的成分峰的判定基准彼此可能相互重合。在这样的情况下,如果解析对象数据中的成分峰的分离指标值处于判定基准重合的范围内,则判定为该成分峰与参照数据中的多个成分峰相同,导致解析对象数据中的一个成分峰被确定为多个成分峰。因此,所述成分峰判定部构成为:在使用所述判定基准进行判定的结果为存在多个能够判定为与所述解析对象数据中的成分峰相同的所述参照数据中的成分峰的情况下,将具有与所述解析对象数据中的成分峰的所述分离指标值最接近的所述分离指标值的所述参照数据中的一个成分峰判定为与所述解析对象数据中的成分峰相同。由此,能够防止解析对象数据中的一个成分峰被确定为多个成分峰。在上述情况下,输出所述成分峰判定部的判定结果的判定结果输出部能够构成为:在所述成分峰判定部从能够判定为与所述解析对象数据中的成分峰相同的所述参照数据中的多个成分峰中判定为其中一个成分峰与所述解析对象数据中的成分峰相同时,对所述判定结果附加警告。由此,用户能够根据对判定本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种解析装置,用于对通过电泳分析得到的分离数据进行解析,所述解析装置具备:/n分离数据保持部,其将针对包含作为已知成分的参照成分的参照用试样进行电泳分析得到的分离数据作为参照数据进行保持,并且将针对解析对象试样进行电泳分析得到的分离数据作为解析对象数据进行保持;/n判定基准保持部,其保持用于判定所述参照数据中的成分峰与所述解析对象数据中的成分峰是否相同的判定基准;以及/n成分峰判定部,其构成为使用所述判定基准来判定所述参照数据中的成分峰与所述解析对象数据中的成分峰是否相同。/n

【技术特征摘要】
20181227 JP 2018-2440821.一种解析装置,用于对通过电泳分析得到的分离数据进行解析,所述解析装置具备:
分离数据保持部,其将针对包含作为已知成分的参照成分的参照用试样进行电泳分析得到的分离数据作为参照数据进行保持,并且将针对解析对象试样进行电泳分析得到的分离数据作为解析对象数据进行保持;
判定基准保持部,其保持用于判定所述参照数据中的成分峰与所述解析对象数据中的成分峰是否相同的判定基准;以及
成分峰判定部,其构成为使用所述判定基准来判定所述参照数据中的成分峰与所述解析对象数据中的成分峰是否相同。


2.根据权利要求1所述的解析装置,其特征在于,还具备:
解析对象成分指标值确定部,其构成为将所述解析对象数据中的成分峰的分离指标值确定为解析对象成分指标值;以及
参照成分指标值确定部,其构成为将所述参照数据中的成分峰的分离指标值确定为参照成分指标值,
所述成分峰判定部构成为:在所述参照数据中的成分峰的所述参照成分指标值与所述解析对象数据中的成分峰的所述解析对象成分指标值之差满足所述判定基准时,将所述参照数据中的成分峰和所述解析对象数据中的成分峰判定为同一成分峰。


3.根据权利要求2所述的解析装置,其特征在于,
所述判定基准是差容许率,该差容许率是所述解析对象成分指标值与所述参照成分指标值之间的差相对于所述参照成分指标值的比例。


4.根据权利要求1所述的解析装置,其特征在于,
还具备波形校正部,该波形校正部构成为执行波形校正,在所述波形校正中,使在所述解析对象数据中设定的解析对象范围的峰波形在规定的容许范围内伸缩和/或移位,以使所述解析对象范围的峰波形与对应于该解析对象范围的所述参照数据中的范围的峰波形之间的相关性最大,
所述成分峰判定部构成为:在执行了所述波形校正后的所述解析对象范围的峰波形与对应于所述解析对象范围的所述参照数据中的范围的峰波形之间的相关性满足了所述判定基准时,判定为处于所述解析对象范围内的成分峰与处于对应于所述解析对象范围的所述参照数据中的范围的成分峰为同一成分峰。


5.根据权利要求4所述的解析装置,其特征在于,
还具备解析对象范围指定部,该解析对象范围指定部构成为使用户指定所述解析对象范围,
所述波形校正部构成为对由用户指定的所述解析对象范围执行所述波形校正。


6.根据权利要求4所述的解析装置,其特征在于,
还具备校正容许...

【专利技术属性】
技术研发人员:荻野康太原田亨熊谷英乡
申请(专利权)人:株式会社岛津制作所
类型:发明
国别省市:日本;JP

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