本发明专利技术属于医药技术领域,通过全基因组大数据分析,发现ENSG00000213754.2是一种全新的肿瘤抑制ncRNA,本发明专利技术将其命名为PANC754(
Application of a new panc754 in the preparation of antitumor drugs
【技术实现步骤摘要】
一种全新的PANC754在制备抑制肿瘤药物方面的应用
本专利技术属于医药
,本专利技术涉及通过全基因组大数据分析,发现ENSG00000213754.2是一种全新的肿瘤抑制ncRNA,可具有广泛抑制肿瘤作用;本专利技术将其命名为PANC754(PAn-cancerNon-CodingRNA754,泛癌非编码RNA754);具体涉及一种全新的PANC754在制备抑制肿瘤药物方面的应用。
技术介绍
在过去的十年中,虽然癌症的发病率和死亡率有所下降,但癌症仍然是人类健康的第二大杀手。以肝癌、胃癌、结直肠癌为代表的癌症也是威胁中国人健康的第二大原因。癌基因和抑癌基因(TSGs)是参与肿瘤发生的两种主要基因类型。癌基因导致细胞不受控制的生长,而TSGs通常充当癌基因、细胞周期检查点或基因产物的负调控因子,抑制癌症的发生发展。经典的抑癌基因是RB(视网膜母细胞瘤基因)和TP53(肿瘤蛋白质P53)。随后被发现的抑癌基因包括ATM(毛细血管扩张症突变基因)、BRCA1(乳腺癌基因1)、BRCA2、BRIP1(BRCA1互作蛋白羧基端解旋酶1)、PALB1(BRCA1伙伴和定位器基因)、NF1(神经纤维瘤病Ⅰ型蛋白)、PMS2(PMS1同系物2)、MSH6(人MutS同系物6)、BUB1(纺锤体检查点蛋白)、BUBR1(Bub1相关激酶1)、TGF-βRII(转化生长因子β受体2)、SMAD4(母体抗人与果蝇同源序列4)、PPARγ(过氧化物酶体增殖物激活受体γ)、P16、PTEN(人第10号染色体缺失的磷酸酶及张力蛋白同源基因)和SMARCB1(SWI/SNF相关的基质相关的染色质依赖于肌动蛋白的调节子B家族成员1)等。非编码RNA(ncRNA)是一类未被翻译成蛋白质的RNA分子,包括转移RNA(tRNAs)、核糖体RNA(rRNAs)、microRNAs、siRNAs、piRNAs、snoRNAs、exRNAs、snRNAs、scaRNAs、circRNAs和lncRNAs。早期研究认为其为基因组的“垃圾”,但随着越来越多的证据表明ncRNA基因深度参与疾病的发生发展,研究其在疾病发病机制中扮演的角色越来越重要。特别是ncRNAs在肿瘤抑制中发挥的作用及机制将尤为重要。传统的肿瘤抑制基因筛选主要局限于蛋白编码基因,而将肿瘤抑制元件的筛选扩展到包括非蛋白编码基因/区域可以发现新的TSG。传统的肿瘤抑制基因筛选主要局限于蛋白编码基因,目前随着外显子测序技术等发展,发现新的基于编码区的肿瘤抑制基因已越来越困难。而人类基因组中RNA既可以作为信息携带载体,又可以执行催化功能,被认为生命起源最古老的分子。其中,非编码RNA(ncRNA)基因作为基因组的暗物质,约占基因组的98%,越来越多的研究发现,ncRNA广泛参与生命现象的各个环节,如生长、分化、发育、免疫,甚至在肿瘤的形成中也具有重要的调控作用。
技术实现思路
本专利技术要解决的技术问题是提供一种全新的PANC754在制备抑制肿瘤药物方面的应用。为解决上述技术问题,本专利技术的实施例提供一种全新的PANC754在制备抑制肿瘤药物方面的应用。进一步的,所述抑制肿瘤药物中至少包含PANC754。其中,所述PANC754为ENSG00000213754.2。其中,所述PANC754通过全基因组大数据分析,并以泛癌症分析作为研究工具进行分析。本专利技术的实施例还提供一种全新的PANC754,其特征在于,所述PANC754为ENSG00000213754.2。本专利技术的实施例另外还提供一种全新的PANC754所制备抑制肿瘤药物的验证方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)PANC754在23种癌症中呈广泛低表达模式;在结直肠癌和胃癌患者组织中验证了PANC754的低表达情况;(2)通过全基因组水平的meta分析与Cox回归分析,验证PANC754低表达的患者在23种癌症中生存率显著低于PANC754高表达者;(3)通过体外实验,在六种肝癌、胃癌、食管癌和结直肠癌细胞系中过表达PANC754基因cDNA,PANC754可显著抑制肿瘤细胞增殖、克隆形成、侵袭与转移;(4)根据PANC754为反义ncRNA的特性,基于反义ncRNA发挥作用的序列互补原理,通过全基因组blast分析发现,PANC754序列相似性基因为KPNA4和MTMR8,通过免疫印迹实验,验证PANC754可以与其靶基因KPNA4和MTMR8互作;(5)生物信息学挖掘PANC754表达与全基因组基因的表达相关性,再通过荧光定量PCR实验,验证了PANC754可通过共表达形式直接调控CDK2、DNMT1、NRAS基因mRNA表达,其中,CDK2具有直接相关性,R=-0.05,P=4.9×10-9,提示可通过KPNA4-CDK2信号通路发挥抑癌作用。本专利技术的上述技术方案的有益效果如下:本专利技术聚焦于新的抑癌元件--非编码RNA,以发现新的癌症治疗靶点;本专利技术着力于泛癌症ncRNA中抑癌元素的发现,解除了传统的肿瘤抑制基因筛选的局限性,进而发现了全新的肿瘤抑制ncRNA—PANC754,该PANC754具有广泛抑制肿瘤作用。附图说明图1为本专利技术的实施例中中全基因组RNA分析筛选PANC754并验证其低表达模式的验证图;图2为本专利技术的实施例中Meta分析发现23种癌症中PANC754呈低表达模式的验证图;图3为本专利技术的实施例中全基因组水平的meta分析与Cox回归分析PANC754的总体生存率的验证图;图4为本专利技术的实施例中PANC754可显著抑制肿瘤细胞增殖和克隆形成的验证图;图5为本专利技术的实施例中PANC754可显著抑制肿瘤细胞侵袭与转移的验证图;图6为本专利技术的实施例中全基因组blast分析发现典型的PANC754序列相似性基因的验证图;图7为本专利技术的实施例中免疫印迹实验发现PANC754可以与其靶基因KPNA4和MTMR8互作的验证图;图8为本专利技术的实施例中荧光定量PCR实验发现PANC754调控COPS7B、PMVK、SMIM12、CDK2、DNMT1、SRSF基因表达的验证图。具体实施方式为使本专利技术要解决的技术问题、技术方案和优点更加清楚,下面将结合附图及具体实施例进行详细描述。本专利技术通过全基因组大数据分析,发现ENSG00000213754.2是一种全新的肿瘤抑制ncRNA,可具有广泛抑制肿瘤作用。本专利技术将其命名为PANC754(PAn-cancerNon-CodingRNA754,泛癌非编码RNA754),并进行相关应用保护。一种全新的PANC754在制备抑制肿瘤药物方面的应用。在进一步的实施例中,所述抑制肿瘤药物中至少包含PANC754。其中,所述PANC754为ENSG00000213754.2。其中,所述PANC754通过全基因组大数据分析,并以泛癌症分析作为研究工具进行分析。本专利技术的实施例还提供一种全新的PA本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种全新的PANC754在制备抑制肿瘤药物方面的应用。/n
【技术特征摘要】
1.一种全新的PANC754在制备抑制肿瘤药物方面的应用。
2.根据权利要求1所述的一种全新的PANC754在制备抑制肿瘤药物方面的应用,其特征在于,所述抑制肿瘤药物中至少包含PANC754。
3.根据权利要求1或2所述的一种全新的PANC754在制备抑制肿瘤药物方面的应用,其特征在于,所述PANC754为ENSG00000213754.2。
4.根据权利要求1或2所述的一种全新的PANC754在制备抑制肿瘤药物方面的应用,其特征在于,所述PANC754通过全基因组大数据分析,并以泛癌症分析作为研究工具进行分析。
5.一种全新的PANC754,其特征在于,所述PANC754为ENSG00000213754.2。
6.一种根据权利要求1所述的全新的PANC754所制备抑制肿瘤药物的验证方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)PANC754在23种癌症中呈广泛低表达模式;在结直肠癌和胃癌患者组织...
【专利技术属性】
技术研发人员:丁伟峰,郭士成,
申请(专利权)人:南通大学附属医院,
类型:发明
国别省市:江苏;32
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。