用于治疗上皮屏障功能紊乱的蛋白质制造技术

本公开涉及治疗性蛋白质和包含所述蛋白质的药物组合物，其可用于治疗各种人类疾病。在特定方面，公开的治疗性蛋白质可用于治疗人胃肠道炎性疾病和与上皮细胞屏障功能或完整性降低相关的胃肠道病症。另外，公开的治疗性蛋白质可用于治疗人炎性肠病，包括克罗恩氏病和溃疡性结肠炎。

Proteins for the treatment of epithelial barrier dysfunction

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于治疗上皮屏障功能紊乱的蛋白质相关申请的交叉引用本申请要求2017年12月28日提交的美国临时申请号62/611,334,2017年12月19日提交的美国临时申请号62/607,706和2017年4月7日提交的美国临时申请号62/482,963的优先权，其全部内容通过引用全文纳入本文。电子申请文本说明在此电子形式提交文本的内容整体纳入本文：计算机可读形式序列表文件名：SEGE_001_03WO_SeqList_ST25.txt，创建日期，2018年4月4日，文件大小≈45.3千字节。
本公开涉及新型蛋白质和包含所述蛋白质的药物组合物，其尤其用于治疗胃肠道炎性疾病和上皮屏障功能紊乱。在一些实施方式中，本文所述的蛋白质和药物组合物在治疗或预防与异常渗透性上皮屏障以及炎性肠疾病或病症有关的疾病状态中具有特定应用。
技术介绍
炎性肠病(IBD)是一种病因不明的异质性疾病，会导致频繁且带血的肠运动以及对胃肠道粘膜的组织病理学破坏(Zhang等，2017，FrontImmunol，8：942)。虽然尚不清楚疾病的具体诱因，但疾病进展的一项研究计划表明，肠道屏障功能的破坏使细菌或细菌成分移位进入粘膜组织(Coskun，2014，FrontMed(Lausanne)，1：24；Martini等，2017，CellMolGastroenterolHepatol，4：33-46)。细菌移位导致炎症信号转导的激活，从而触发额外的屏障破坏，从而导致屏障破坏，细菌移位和炎症的循环放大环。尽管许多当前的疗法针对炎症，但是缺乏促进粘膜愈合的疗法为促进上皮修复和肠屏障完整性的新疗法提供了机会。根据细菌移位可触发IBD的假设出发，最近的研究表明肠道菌群的有害变化或失调可能促进IBD的发展。当前，市场上可获得的许多IBD疗法仅旨在靶向和抑制所讨论的与IBD相关的炎症反应。尽管有帮助，但这种狭窄的治疗作用模式忽略了上皮屏障完整性在疾病病因学中的重要作用。因此，在本领域中非常需要开发一种治疗剂，该治疗剂不仅抑制免疫系统的炎症反应，而且还起着恢复个人上皮屏障功能的作用。同样，需要生产如本文所述的蛋白质治疗剂，其在蛋白质治疗剂的制造和/或加工中以及在长期储存条件下是稳定的。
技术实现思路
本公开满足医学界对可以有效治疗患有胃肠道疾病例如炎性肠病(IBD)的对象的治疗剂的重要需求。一方面，提供了可以维持上皮屏障完整性和/或改善上皮屏障修复的新型蛋白质治疗剂。在一些实施方式中，上皮屏障是肠上皮屏障。这些蛋白质治疗剂还可以减轻对象肠道的炎症和/或减轻与肠道炎症有关的症状。本文提供的蛋白质治疗剂可用于治疗可能与胃肠道上皮细胞屏障功能或完整性降低有关的多种疾病和/或症状。在一些实施方式中，本公开教导了衍生自微生物组的新型蛋白质治疗剂以及利用所述蛋白质治疗剂的方法。在一个特定的实施方式中，提供了衍生自微生物组并且包含与SEQIDNO：19具有至少约70％，71％，72％，73％，74％，75％，76％，77％，78％，79％，80％，81％，82％，83％，84％，85％，86％，87％，88％，89％，90％，91％，92％，93％，94％，95％，96％，97％，98％，99％，99.1％，99.2％，99.3％，99.4％，99.5％，99.6％，99.7％，99.8％，99.9％或100％序列相同性的氨基酸序列的蛋白质。在一些实施方式中，治疗性蛋白质不包含与SEQIDNO：3相同的氨基酸序列。在其他实施方式中，治疗性蛋白质包含非天然存在的氨基酸序列。在一些实施方式中，所述蛋白质包含氨基酸序列SEQIDNO：1，SEQIDNO：3，SEQIDNO：5，SEQIDNO：7，SEQIDNO：9，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17或SEQIDNO：19。在其他实施方式中，该蛋白质包含SEQIDNO：3的氨基酸序列。在其他实施方式中，该蛋白质包含SEQIDNO：19的氨基酸序列。在一些实施方式中，蛋白质包含与SEQIDNO：19至少90％，91％，92％，93％，94％，95％，96％，97％，98％，99％，99.1％，99.2％，99.3％，99.4％，99.5％，99.6％，99.7％，99.8％或99.9％或100％相同的氨基酸序列，其中该氨基酸序列相对于SEQIDNO：19或相对于SEQIDNO：3具有至少1、2、3或4个氨基酸取代。在其他实施方式中，氨基酸序列相对于SEQIDNO：3具有至少2且小于3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34或35个氨基酸取代。在其他实施方式中，治疗性蛋白质包含非天然存在的氨基酸序列。在一些实施方式中，该蛋白质包含SEQIDNO：3的氨基酸序列。在关于SEQIDNO：3的其他实施方式中，X53为N，S，T，M，R，Q，和/或X83为N，R或K，和/或X84为G或A，和/或X147为C，S，T，M，V，L，A或G，和/或X151为C，S，T，M，V，L，A或G。在其他实施方式中，X53为N，S或K，和/或X83为N或R，和/或X84为G或A，和/或X147为C，V，L或A，和/或X151为C，S，V，L或A。在一些实施方式中，蛋白质的长度为约200至250个氨基酸，210至250个氨基酸，220至250个氨基酸，220至240个氨基酸，230至250个氨基酸，230至240个氨基酸，或230至235个氨基酸，220至275个氨基酸，220至260个氨基酸，230至260个氨基酸，240至250个氨基酸，250至260个氨基酸，230至256个氨基酸，240个氨基酸至256个氨基酸，245个氨基酸至256个氨基酸。在其他实施方式中，治疗性蛋白质的长度为220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259或260个氨基酸。在一些实施方式中，本公开教导了特异性结合包含SEQIDNO：19或其变体的治疗性蛋白质的抗体或其片段。在其他实施方式中，抗体或其片段不结合包含与SEQIDNO：3相同的氨基酸序列的蛋白质。在其他实施方式中，抗体或其片段结合包含与SEQIDNO：19相同的氨基酸序列的蛋白质，但不结合包含与SEQIDNO：3相同的氨基酸序列的蛋白质。在一些实施方式中，蛋白质在体外测定中增加上皮细胞层的屏障功能，其中该增加是相对于不存在蛋白质时该测定中的屏障功能而言的。在其他实施方式中，体外测定是跨上皮电阻(TEER)测定。在其他实施方式中，屏障功能的增加是比不存在所述蛋白质时测定中的电阻的大至少5％，10％，20％，30％，40％，50％，60％，70％，8本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种治疗胃肠道上皮细胞屏障功能紊乱的方法，包括：/na.向有需要的患者给予药物组合物，其包含：/ni.一种治疗性蛋白质，其包含与SEQ ID NO：3，SEQ ID NO：7，SEQ ID NO：11，SEQ IDNO：13，SEQ ID NO：15，SEQ ID NO：17，和/或SEQ ID NO：19有至少约85％的序列相同性的氨基酸序列；和/nii.药学上可接受的运载体。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170407 US 62/482,963;20171219 US 62/607,706;20171.一种治疗胃肠道上皮细胞屏障功能紊乱的方法，包括：
a.向有需要的患者给予药物组合物，其包含：
i.一种治疗性蛋白质，其包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17，和/或SEQIDNO：19有至少约85％的序列相同性的氨基酸序列；和
ii.药学上可接受的运载体。


2.如权利要求1所述的方法，其中所述胃肠道上皮细胞屏障功能紊乱是与胃肠道壁完整性降低相关的疾病。


3.如权利要求1所述的方法，其中所述胃肠道上皮细胞屏障功能紊乱是与胃肠道粘膜上皮完整性降低相关的疾病。


4.如权利要求1所述的方法，其中所述胃肠道上皮细胞屏障功能紊乱是与肠上皮完整性降低相关的疾病。


5.如权利要求1所述的方法，其中所述胃肠道上皮细胞屏障功能紊乱选自以下的至少一种：炎性肠病，克罗恩氏病，溃疡性结肠炎，囊袋炎，肠易激综合症，肠感染，艰难梭菌感染，代谢性疾病，肥胖症，2型糖尿病，非酒精性脂肪性肝炎，非酒精性脂肪肝，肝脏疾病，酒精性脂肪性肝炎，乳糜泻，坏死性小肠结肠炎，胃肠道疾病，短肠综合征，胃肠道粘膜炎，化学疗法诱发的粘膜炎，辐射诱发的粘膜炎，口腔粘膜炎，间质性膀胱炎，神经系统疾病，认知障碍，阿尔茨海默氏症，帕金森氏症，多发性硬化症，自闭症，化疗相关的脂肪性肝炎(CASH)和上述疾病的儿科形式。


6.如权利要求1所述的方法，其中所述胃肠道上皮细胞屏障功能紊乱是炎性肠病。


7.如权利要求1所述的方法，其中所述胃肠道上皮细胞屏障功能紊乱是克罗恩氏病。


8.如权利要求1所述的方法，其中所述胃肠道上皮细胞屏障功能紊乱是溃疡性结肠炎。


9.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约90％序列相同性的氨基酸序列。


10.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约95％序列相同性的氨基酸序列。


11.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约97％序列相同性的氨基酸序列。


12.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约98％序列相同性的氨基酸序列。


13.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约99％序列相同性的氨基酸序列。


14.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含选自以下的氨基酸序列：SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和SEQIDNO：19。


15.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：3的氨基酸序列。


16.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：7的氨基酸序列。


17.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：11的氨基酸序列。


18.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：13的氨基酸序列。


19.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：15的氨基酸序列。


20.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：17的氨基酸序列。


21.如权利要求1所述的方法，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：19的氨基酸序列。


22.如权利要求1所述的方法，其中给予包括直肠，肠胃外，静脉内，局部，口服，皮肤，透皮或皮下给予。


23.如权利要求1所述的方法，其中给予是针对所述患者的口腔，胃肠腔和/或肠。


24.如权利要求1所述的方法，其中所述患者经历与胃肠道上皮细胞屏障功能紊乱相关的至少一种症状的减轻。


25.如权利要求1所述的方法，其中所述患者经历与胃肠道上皮细胞屏障功能紊乱相关的至少一种症状的减轻，所述症状选自：腹痛，便血，便脓，发烧，体重减轻，频繁腹泻，疲劳，食欲下降，里急后重和直肠出血。


26.如权利要求1所述的方法，其中给予减轻了患者的胃肠道炎症。


27.如权利要求1所述的方法，其中给予减轻了患者的肠粘膜炎症。


28.如权利要求1所述的方法，其中给予增加了所述患者的肠组织中粘蛋白的产生。


29.如权利要求1所述的方法，其中给予增加了患者的肠上皮伤口愈合。


30.如权利要求1所述的方法，其中给予增加了患者的肠上皮细胞增殖。


31.如权利要求1所述的方法，还包括：向所述患者给予至少一种第二治疗剂。


32.如权利要求1所述的方法，其还包括：向所述患者给予至少一种第二治疗剂，所述第二治疗剂选自：止泻药，5-氨基水杨酸化合物，抗炎剂，抗生素，抗体，抗细胞因子剂，抗炎细胞因子剂，类固醇，皮质类固醇和免疫抑制剂。


33.一种药物组合物，其包含：
a.一种治疗性蛋白质，其包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17，和/或SEQIDNO：19有至少约85％的序列相同性的氨基酸序列；和
b.药学上可接受的运载体。


34.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约90％序列相同性的氨基酸序列。


35.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约95％序列相同性的氨基酸序列。


36.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约97％序列相同性的氨基酸序列。


37.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约98％序列相同性的氨基酸序列。


38.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约99％序列相同性的氨基酸序列。


39.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含选自以下的氨基酸序列：SEQIDNO：3，SEQIDNO：7，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和SEQIDNO：19。


40.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：3的氨基酸序列。


41.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：7的氨基酸序列。


42.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：11的氨基酸序列。


43.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：13的氨基酸序列。


44.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：15的氨基酸序列。


45.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：17的氨基酸序列。


46.如权利要求33所述的药物组合物，其中所述治疗性蛋白质包含SEQIDNO：19的氨基酸序列。


47.如权利要求33所述的药物组合物，其配制用于直肠，肠胃外，静脉内，局部，口服，皮肤，透皮或皮下给予。


48.如权利要求33所述的药物组合物，其经配制使得所述治疗性蛋白质在患者的胃肠腔和/或肠中有活性。


49.一种表达载体，其包含：多核苷酸，其编码包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：5，SEQIDNO：7，SEQIDNO：9，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约85％序列相同性的氨基酸序列的蛋白质。


50.如权利要求49所述的表达载体，其中所述编码的蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：5，SEQIDNO：7，SEQIDNO：9，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约90％序列相同性的氨基酸序列。


51.如权利要求49所述的表达载体，其中所述编码的蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：5，SEQIDNO：7，SEQIDNO：9，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约95％序列相同性的氨基酸序列。


52.如权利要求49所述的表达载体，其中所述编码的蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：5，SEQIDNO：7，SEQIDNO：9，SEQIDNO：11，SEQIDNO：13，SEQIDNO：15，SEQIDNO：17和/或SEQIDNO：19具有至少约97％序列相同性的氨基酸序列。


53.如权利要求49所述的表达载体，其中所述编码的蛋白质包含与SEQIDNO：3，SEQIDNO：5，SEQIDNO：...

【专利技术属性】
技术研发人员：A·W·韩，A·W·古德耶，T·古亚，T·Z·德桑蒂斯，K·达巴，T·竹内，Y·金，M·I·威尔科匈，S·巴纳斯，
申请(专利权)人：第二基因组股份有限公司，
类型：发明
国别省市：美国;US