【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于分离靶核酸的组合物和方法本申请要求于2017年5月11日提交的美国临时专利申请第62/504,900号的权益，所述申请通过引用并入本文用于所有目的。本公开涉及分子生物学领域，更具体地说，涉及用于通过使用探针群体从混合物(如样品)中分离核酸的方法和组合物，所述探针群体与一个或多个靶核酸进行杂交以允许其与混合物的其它组分分离。序列表本申请与电子格式的序列表一同提交。所述序列表以创建于2018年5月1日的标题为“2018-05-01_01159-0016-00PCT_Seq_List_ST25.txt”的文件的形式提供，所述文件大小为4,131字节。序列表的电子格式信息通过引用整体并入本文。
技术介绍
与
技术实现思路
如核酸的体外扩增和体外杂交等许多分子生物学程序包含一些核酸的制备，以促进后续程序。核酸纯化的方法可以分离样品中存在的所有核酸、基于物理特征分离不同类型的核酸或从样品中分离特定核酸。许多方法涉及复杂的程序、使用苛刻的化学药品或条件，或者需要很长时间才能完成所述核酸分离。一些方法涉及使用专门的寡核苷酸，每个寡核苷酸对预期的靶核酸都具有特异性，这增加了方法的设计、优化和性能的复杂性，特别是如果需要分离一个以上靶核酸或期望的靶核酸的序列未知时。一些方法不需要特定的靶序列就可以分离靶核酸，但是不能高效地分离所有序列。因此，仍然需要一种简单、高效和快速的方法来将所关注的核酸与其它样品组分分离。因此，以下实施例在本公开提供的实施例中。实施例1是一种用于从样品中分离靶核酸的捕获探针群体，其...
【技术保护点】
1.一种用于从样品中分离靶核酸的捕获探针群体，其包括：第一区域和第二区域，所述第一区域的长度为至少约12个残基并且包括至少一个聚(r)序列，所述聚(r)序列包括(i)包括G和A核苷酸的随机序列或(ii)非随机重复(A和G)序列；所述第二区域包括第一特异性结合配偶体(SBP)，其中所述SBP能够特异性结合第二特异性结合配偶体(SBP2)。/n
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170511 US 62/504,9001.一种用于从样品中分离靶核酸的捕获探针群体，其包括：第一区域和第二区域，所述第一区域的长度为至少约12个残基并且包括至少一个聚(r)序列，所述聚(r)序列包括(i)包括G和A核苷酸的随机序列或(ii)非随机重复(A和G)序列；所述第二区域包括第一特异性结合配偶体(SBP)，其中所述SBP能够特异性结合第二特异性结合配偶体(SBP2)。
2.根据权利要求1所述的捕获探针群体，其中所述聚(r)序列包括包含G和A核苷酸的随机序列。
3.根据权利要求2所述的捕获探针群体，其中所述第一区域包括至少约2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个、11个、12个、13个、14个、15个、16个、17个、18个、19个、20个、21个、22个、23个、24个、25个、26个、27个、28个、29个或30个随机聚(r)序列核苷酸。
4.根据前述权利要求中任一项所述的捕获探针群体，其中所述聚(r)序列包括至少约4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个、11个、12个、13个、14个、15个、16个、17个、18个、19个、20个、21个、22个、23个、24个、25个、26个、27个、28个、29个或30个非随机重复(A和G)序列核苷酸。
5.根据前述权利要求中任一项所述的捕获探针群体，其中所述第一区域的长度为至少13个、14个、15个、16个、17个、18个、19个、20个、21个、22个、23个、24个、25个、26个、27个、28个、29个或30个核苷酸。
6.根据前述权利要求中任一项所述的捕获探针群体，其中所述第一区域由随机的G和A核苷酸、非随机重复(A和G)序列或其组合组成。
7.根据权利要求1到5中任一项所述的捕获探针群体，其中所述第一区域进一步包括处于所述聚(r)序列与第二聚(r)序列之间的连接子序列，并且所述第二聚(r)序列包括(i)包括G和A核苷酸的随机序列或(ii)非随机重复(A和G)序列。
8.根据权利要求7所述的捕获探针群体，其中所述聚(r)序列的长度为至少约6个残基，并且所述第二聚(r)序列的长度为至少约6个残基。
9.根据前述权利要求中任一项所述的捕获探针群体，其中所述第一区域包括2'-O-甲基修饰的RNA残基。
10.根据前述权利要求中任一项所述的捕获探针群体，其中所述第一区域包括聚(r)18、聚(r)24或聚(r)25序列。
11.根据前述权利要求中任一项所述的捕获探针群体，其中所述SBP是非核酸部分。
12.根据权利要求1到10中任一项所述的捕获探针群体，其中所述SBP包括均聚序列。
13.根据权利要求12所述的捕获探针群体，其中所述SBP包括dT3dA30(SEQIDNO:10)或dA30(SEQIDNO:11)序列。
14.根据前述权利要求中任一项所述的捕获探针群体，其中所述SBP位于所述第一区域的3'位。
15.一种包括前述权利要求中任一项所述的捕获探针群体和第二捕获探针群体的组合，所述第二捕获探针群体包括第一区域和第二区域，所述第一区域的长度为至少约12个残基并且包括聚(k)序列，所述聚(k)序列包括(i)包括G和U/T核苷酸的随机序列或(ii)非随机重复(G和U/T)序列；所述第二区域包括第三特异性结合配偶体(SBP3)，其中所述SBP3能够特异性结合第四特异性结合配偶体(SBP4)。
16.根据权利要求15所述的组合，其中所述SBP和所述SBP3能够结合相同SBP2/SBP4。
17.根据权利要求16所述的组合，其中所述SBP和所述SBP3彼此相同。
18.根据权利要求15到17中任一项所述的组合，其中所述第二群体的所述第一区域的长度为至少13个、14个、15个、16个、17个、18个、19个、20个、21个、22个、23个、24个、25个、26个、27个、28个、29个或30个核苷酸。
19.根据权利要求15到18中任一项所述的组合，其中所述第二群体的所述第一区域包括聚(k)18、聚(k)24或聚(k)25序列。
20.根据权利要求15到19中任一项所述的组合，其中所述第二群体的所述第一区域由随机的G和U/T核苷酸或非随机重复(G和U/T)组成。
21.一种用于从样品中分离靶核酸的试剂盒或反应混合物，所述反应混合物包括：
a.根据权利要求1到14中任一项所述的捕获探针群体或根据权利要求15到20中任一项所述的组合；以及
b.固定在载体上的SBP2。
22.根据权利要求21所述的试剂盒或反应混合物，其中所述SBP和SBP2是基本上互补的核酸序列。
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