细胞膜染色图像分析方法、装置及系统制造方法及图纸

技术编号:22644666 阅读:32 留言:0更新日期:2019-11-26 16:52
本公开提供一种细胞膜染色图像分析方法、装置及系统,涉及人工智能领域。该方法包括:获取细胞膜染色图像,对细胞膜染色图像中目标细胞的细胞核进行标记以获取标记细胞核,并对细胞膜染色图像中目标细胞的细胞膜进行勾画以获取标记细胞膜;根据标记细胞核的位置信息和标记细胞膜的标记信息获取包含标记细胞核和标记细胞膜的融合图像;根据融合图像中的细胞膜染色区域确定细胞膜染色度,并根据融合图像中对应不同细胞膜染色状态的细胞核数量确定具有不同细胞膜染色状态的目标细胞的数量。本公开能够对细胞膜染色图像进行系统性的分析,统计各种染色情况,实现对细胞膜染色图像的定性展示和定量统计分析,提高了分析结果的精准度。

Image analysis method, device and system of cell membrane staining

The invention provides a cell membrane staining image analysis method, device and system, which relates to the field of artificial intelligence. The method includes: obtaining the cell membrane staining image, marking the nucleus of the target cell in the cell membrane staining image to obtain the labeled nucleus, and sketching the cell membrane of the target cell in the cell membrane staining image to obtain the labeled cell membrane; obtaining the cell membrane containing the labeled nucleus and the labeled cell membrane according to the location information of the labeled nucleus and the labeling information of the labeled cell membrane Fusion image: determine the cell membrane staining degree according to the cell membrane staining area in the fusion image, and determine the number of target cells with different cell membrane staining status according to the number of nuclei corresponding to different cell membrane staining status in the fusion image. The present disclosure can systematically analyze the cell membrane dyeing image, count all kinds of dyeing conditions, realize the qualitative display and quantitative statistical analysis of the cell membrane dyeing image, and improve the accuracy of the analysis results.

【技术实现步骤摘要】
细胞膜染色图像分析方法、装置及系统
本公开涉及人工智能
,具体而言,涉及一种细胞膜染色图像分析方法、细胞膜染色图像分析装置及细胞膜染色图像分析系统。
技术介绍
免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)是利用抗原抗体的特异性结合反应来检测和定位组织和细胞中的某些化学物质的一门技术,它是免疫学和传统组织化学相结合而形成的,其特点是将形态学改变与功能、代谢变化结合起来,直接在组织切片、细胞涂片或培养细胞爬片上定位一些蛋白质和多肽类物质的存在,结合电子计算机图像分析系统或激光扫描共聚焦显微术等技术,对被检物质进行分析。目前,通过在显微镜下对染色的组织切片、细胞涂片或细胞爬片拍照,以获取细胞膜染色图像,并对细胞膜染色图像进行分析。在对细胞膜染色图像分析的时候,通常只是进行细胞核检测或者细胞膜勾画,缺少系统性对细胞核细胞膜的统一分析,导致病理科医生从细胞膜染色图像中获取的信息量较少,进而图像分析结果的精准度较低。鉴于此,本领域亟需开发一种新的细胞膜染色图像分析方法。需要说明的是,在上述
技术介绍
部分公开的信息仅用于加强对本公开的背景的理解,因此可以包括不构成对本领域普通技术人员已知的现有技术的信息。
技术实现思路
本公开的实施例提供了一种细胞膜染色图像分析方法、细胞膜染色图像分析装置及细胞膜染色图像分析系统,进而至少在一定程度上可以将细胞核检测结果和细胞膜勾画结果融合,并实现定性展示和定量统计分析,提高了细胞膜染色图像分析结果的精准度。本公开的其他特性和优点将通过下面的详细描述变得显然,或部分地通过本公开的实践而习得。根据本公开实施例的一个方面,提供了一种细胞膜染色图像分析方法,包括:获取细胞膜染色图像,对所述细胞膜染色图像中目标细胞的细胞核进行标记以获取标记细胞核,并对所述细胞膜染色图像中所述目标细胞的细胞膜进行勾画以获取标记细胞膜;根据所述标记细胞核的位置信息和所述标记细胞膜的标记信息获取包含所述标记细胞核和所述标记细胞膜的融合图像;根据所述融合图像中的细胞膜染色区域确定细胞膜染色度,并根据所述融合图像中对应不同细胞膜染色状态的细胞核数量确定具有不同细胞膜染色状态的目标细胞的数量。根据本公开实施例的一个方面,提供了一种细胞膜染色图像分析装置,包括:标记模块,用于获取细胞膜染色图像,对所述细胞膜染色图像中目标细胞的细胞核进行标记以获取标记细胞核,并对所述细胞膜染色图像中的细胞膜进行勾画以获取标记细胞膜;融合模块,用于根据所述标记细胞核的位置信息和所述标记细胞膜的标记信息获取包含所述标记细胞核和所述标记细胞膜的融合图像;统计模块,用于根据所述融合图像中的细胞膜染色区域确定细胞膜染色度,并根据所述融合图像中对应不同细胞膜染色状态的细胞核数量确定具有不同细胞膜染色状态的目标细胞的数量。在本公开的一些实施例中,基于前述方案,所述标记模块配置为:对具有RGB图像格式的所述细胞膜染色图像进行色彩通道分解,以获取与细胞核对应的色彩通道图像;对所述与细胞核对应的色彩通道图像进行处理,以标记所述细胞膜染色图像中所有的细胞核;根据与所述目标细胞对应的细胞形态对标记的细胞核进行筛选,以获取所述标记细胞核。在本公开的一些实施例中,基于前述方案,所述标记模块配置为:对具有RGB图像格式的所述细胞膜染色图像进行色彩通道分解,以获取与细胞膜对应的色彩通道图像;根据第一预设阈值对所述与细胞膜对应的色彩通道图像进行分割,以获取分割图像;根据骨架提取算法提取所述分割图像的中心线,并根据所述中心线勾画所述细胞膜,以获取所述标记细胞膜。在本公开的一些实施例中,基于前述方案,所述融合模块包括:区域划分单元,用于根据所述标记细胞膜的标记信息确定闭合区域和非闭合区域;细胞核重定义单元,用于确定所述闭合区域的重心位置,并将所述重心位置作为所述闭合区域中细胞核的位置信息;分割图形成单元,用于对所述闭合区域的内部进行填充,以获取与所述闭合区域对应的分割图;融合图像生成单元,用于根据所述标记细胞核的位置信息、所述闭合区域中细胞核的位置信息及所述分割图确定所述融合图像。在本公开的一些实施例中,基于前述方案,所述区域划分单元配置为:根据所述标记细胞膜对应的中心线确定连通边界区域,判断所述连通边界区域中是否存在闭合连通区域;若所述连通边界区域中存在闭合连通区域,则在判定所述闭合连通区域为最内层区域且所述闭合连通区域的面积大于或等于预设面积阈值时,将所述闭合连通区域标记为所述闭合区域;若所述连通边界区域中存在非闭合连通区域,则将所述非闭合连通区域标记为所述非闭合区域。在本公开的一些实施例中,基于前述方案,所述融合图像生成单元配置为:获取所述细胞膜染色图像中与所述分割图互补的第一补集区域;获取所述标记细胞核的位置信息与所述第一补集区域之间的交集,并获取所述交集与所述闭合区域中细胞核的位置信息的并集,以获得所述融合图像。在本公开的一些实施例中,基于前述方案,所述统计模块包括:图像分解单元,用于对具有RGB图像格式的所述细胞膜染色图像进行色彩通道分解,以获取与细胞膜对应的色彩通道图像;图像分割单元,用于根据第二预设阈值对所述与细胞膜对应的色彩通道图像进行分割,以获取细胞膜染色区域模板;图像提取单元,用于通过所述细胞膜染色区域模板对所述与细胞膜对应的色彩通道图像进行图像提取,以获取细胞膜染色区域图像,并根据所述细胞膜染色区域图像确定所述细胞膜染色度。在本公开的一些实施例中,基于前述方案,所述图像提取单元包括:第一细胞膜染色度判定单元,用于当所述细胞膜染色区域图像的面积为零时,则所述细胞膜染色度为零;第二细胞膜染色度判定单元,用于当所述细胞膜染色区域图像的面积不为零时,根据所述细胞膜染色区域图像中的像素值确定所述细胞膜染色度。在本公开的一些实施例中,基于前述方案,所述第二细胞膜染色度单元配置为:计算所述细胞膜染色区域图像中所有像素的像素平均值,并将所述像素平均值与染色阈值进行比较;当所述像素平均值小于所述染色阈值时,判定所述细胞膜染色度为弱染色;当所述像素平均值大于或等于所述染色阈值时,判定所述细胞膜染色度为强染色。在本公开的一些实施例中,基于前述方案,所述统计模块配置为:获取所述融合图像中所有所述闭合区域中的细胞核的第一数量,所述第一数量即为具有完整细胞膜染色状态的目标细胞的数量。在本公开的一些实施例中,基于前述方案,所述统计模块配置为:对所述细胞膜染色区域模板进行空洞填充,并将空洞填充后的所述细胞膜染色区域按照预设距离进行膨胀,以获取膨胀区域;获取所述细胞膜染色图像中与所述分割图互补的第一补集区域;获取所述膨胀区域与所述第一补集区域的并集,并获取所述并集与所述融合图像之间的交集,以确定不完整细胞膜染色区域;获取所述融合图像中与所述不完整细胞膜染色区域对应的细胞核的第二数量,所述第二数量即为具有不完整细胞膜染色状态的目标细胞的数量。在本公开的一些实施例中,基于前述方案,所述统计模块配置为:获取所述细胞膜染色图像中与所述膨胀区域互补的第二补集区域;本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种细胞膜染色图像分析方法,其特征在于,包括:/n获取细胞膜染色图像,对所述细胞膜染色图像中目标细胞的细胞核进行标记以获取标记细胞核,并对所述细胞膜染色图像中所述目标细胞的细胞膜进行勾画以获取标记细胞膜;/n根据所述标记细胞核的位置信息和所述标记细胞膜的标记信息获取包含所述标记细胞核和所述标记细胞膜的融合图像;/n根据所述融合图像中的细胞膜染色区域确定细胞膜染色度,并根据所述融合图像中对应不同细胞膜染色状态的细胞核数量确定具有不同细胞膜染色状态的目标细胞的数量。/n

【技术特征摘要】
1.一种细胞膜染色图像分析方法,其特征在于,包括:
获取细胞膜染色图像,对所述细胞膜染色图像中目标细胞的细胞核进行标记以获取标记细胞核,并对所述细胞膜染色图像中所述目标细胞的细胞膜进行勾画以获取标记细胞膜;
根据所述标记细胞核的位置信息和所述标记细胞膜的标记信息获取包含所述标记细胞核和所述标记细胞膜的融合图像;
根据所述融合图像中的细胞膜染色区域确定细胞膜染色度,并根据所述融合图像中对应不同细胞膜染色状态的细胞核数量确定具有不同细胞膜染色状态的目标细胞的数量。


2.根据权利要求1所述的细胞膜染色图像分析方法,其特征在于,所述对所述细胞膜染色图像中目标细胞的细胞核进行标记以获取标记细胞核,包括:
对具有RGB图像格式的所述细胞膜染色图像进行色彩通道分解,以获取与细胞核对应的色彩通道图像;
对所述与细胞核对应的色彩通道图像进行处理,以标记所述细胞膜染色图像中所有的细胞核;
根据与所述目标细胞对应的细胞形态对标记的细胞核进行筛选,以获取所述标记细胞核。


3.根据权利要求1所述的细胞膜染色图像分析方法,其特征在于,所述对所述细胞膜染色图像中所述目标细胞的细胞膜进行勾画以获取标记细胞膜,包括:
对具有RGB图像格式的所述细胞膜染色图像进行色彩通道分解,以获取与细胞膜对应的色彩通道图像;
根据第一预设阈值对所述与细胞膜对应的色彩通道图像进行分割,以获取分割图像;
根据骨架提取算法提取所述分割图像的中心线,并根据所述中心线勾画所述细胞膜,以获取所述标记细胞膜。


4.根据权利要求1所述的细胞膜染色图像分析方法,其特征在于,所述根据所述标记细胞核的位置信息和所述标记细胞膜的标记信息获取包含所述标记细胞核和所述标记细胞膜的融合图像,包括:
根据所述标记细胞膜的标记信息确定闭合区域和非闭合区域;
确定所述闭合区域的重心位置,并将所述重心位置作为所述闭合区域中细胞核的位置信息;
对所述闭合区域的内部进行填充,以获取与所述闭合区域对应的分割图;
根据所述标记细胞核的位置信息、所述闭合区域中细胞核的位置信息及所述分割图确定所述融合图像。


5.根据权利要求4所述的细胞膜染色图像分析方法,其特征在于,所述根据所述标记细胞膜的标记信息确定闭合区域和非闭合区域,包括:
根据所述标记细胞膜对应的中心线确定连通边界区域,判断所述连通边界区域中是否存在闭合连通区域;
若所述连通边界区域中存在闭合连通区域,则在判定所述闭合连通区域为最内层区域且所述闭合连通区域的面积大于或等于预设面积阈值时,将所述闭合连通区域标记为所述闭合区域;
若所述连通边界区域中存在非闭合连通区域,则将所述非闭合连通区域标记为所述非闭合区域。


6.根据权利要求4所述的细胞膜染色图像分析方法,所述根据所述标记细胞核的位置信息、所述闭合区域中细胞核的位置信息及所述分割图确定所述融合图像,包括:
获取所述细胞膜染色图像中与所述分割图互补的第一补集区域;
获取所述标记细胞核的位置信息与所述第一补集区域之间的交集,并获取所述交集与所述闭合区域中细胞核的位置信息的并集,以获得所述融合图像。


7.根据权利要求4所述的细胞膜染色图像分析方法,其特征在于,所述根据所述融合图像中的细胞膜染色区域确定细胞膜染色度,包括:
对具有RGB图像格式的所述细胞膜染色图像进行色彩通道分解以获取与细胞膜对应的色彩通道图像;
根据第二预设阈值对所述与细胞膜对应的色彩通道图像进行分割,以获取细胞膜染色区域模板;
通过所述细胞膜染色区域模板对所述与细胞膜对应的色彩通道图像进行图像提取,以获取细胞膜染色区域图像,并根据所述细胞膜染色区域图像确定所述细胞膜染色度。


8.根据权利要求7所述的细胞膜染色图像分析方法,其特征在于,所述根据所述细胞膜染色区域图像确定所述细胞膜染色度,包括:
当所述细胞膜染色区域图像的面积为零时,...

【专利技术属性】
技术研发人员:张军颜克洲姚建华韩骁
申请(专利权)人:腾讯科技深圳有限公司
类型:发明
国别省市:广东;44

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