用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因检测的引物探针组合、试剂盒及应用制造技术

本发明专利技术涉及一种用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因SNP的特异性引物探针组合，所述引物探针组合包括针对rs4149056、rs1045642、rs1128503、rs17244841、rs12916基因SNP的特异性引物探针组合。本发明专利技术还提供了包括了所述引物组合的试剂盒及其应用。本发明专利技术的有益效果在于：本发明专利技术提供了一种快捷的用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因SNP的分型试剂盒及应用，应用本发明专利技术获得的检测结果精确可靠，且成本较低，具有较好的实用性。

Primer Probe Combination, Kit and Application for Individualized Gene Detection of Simvastatin

【技术实现步骤摘要】
用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因检测的引物探针组合、试剂盒及应用
本专利技术涉及体外诊断
，具体涉及一种用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因检测的引物探针组合、试剂盒及应用。
技术介绍
辛伐他汀过量用药会导致横纹肌溶解、肌痛肌炎、急性肝功能衰退、肝炎、四肢活动转改、感觉异常、头痛失眠、性功能障碍。我国卫计委于2015年发布了《药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)》，指出对药物代谢酶和药物靶点基因进行检测，可指导临床针对特定的患者选择合适的药物和给药剂量实现个体化用药，从而提高药物治疗的有效性和安全性。SLCO1B1*5等位基因破坏了转运蛋白在质膜上的定位，导致肝摄取减少、他汀类药物的全身血浆浓度增加，肌肉他汀类药物暴露增加，与肌病的发生相关。携带521C等位基因的患者慎用辛伐他汀和西立伐他汀，以降低发生肌病的风险。HMG-CoA还原酶(HMGCR)是体内胆固醇合成的关键酶，是辛伐他汀的作用靶点。研究表明，HMGCR基因相关位点突变会降低辛伐他汀的降脂疗效。ABCB1基因编码的蛋白质是他汀类药物转运和代谢通路的主要蛋白,这些基因的多态性会影响其蛋白质的功能,进而影响他汀类药物的疗效。他汀类药物在心血管病治疗中起着非常重要的作用，但疗效却存在明显的个体化差异，同时，随之而来的毒副作用也严重危害病患的健康。通过检测辛伐他汀靶点基因、代谢相关基因，可以有效评估其疗效和毒副作用，为临床合理用药提供依据。目前市场上采用的基因多态性检测技术有PCR-RFLP，其主要原理是通过应用特异性限制性内切酶消化PCR扩增产物，并根据消化位点是否消失来判断其变异存在与否，但该方法操作复杂，样本量多时易造成PCR产物的交叉污染且容易出现酶切不充分或酶切过度而出现假阴性或假阳性结果，可靠性低。多重PCR方法尽管特异性有所提高，但是这种方法的原理仍然是基于普通PCR的原理，引物特异性以及低保真Taq酶等这些因素均可造成对结果的影响。DNA测序法虽然是目前进行基因诊断的金标准，但步骤繁琐，过程复杂，试剂价格昂贵，容易出现样本间的交叉污染而导致测序失败；另外测序仪的装备也超出了一般临床检验实验室的承受范围。高分辨率熔解曲线法是一种快速，简便，经济，实用的分型方法，但基因分型依赖于仪器温度控制的精密性，假阳性高。Taqman探针的方法采用特异性的荧光标记的探针，特异性强，灵敏度高且操作方便，快速。本专利技术采用Taqman探针与荧光定量PCR技术相结合的检测试剂盒，适用于临床推广和产业化。
技术实现思路
为了解决传统临床经验医疗方式诊断及辛伐他汀药物用药时易出现临床用药不良反应且没有合适的试剂盒产品的技术问题。本专利技术的目的在于提供一种用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因SNP的引物探针组合、试剂盒及应用。为实现上述目的，本专利技术提供了一种用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因SNP的特异性引物探针组合，所述引物探针组合包括针对rs4149056、rs1045642、rs1128503、rs17244841、rs12916基因SNP的特异性引物探针组合，具体如下：rs4149056引物探针序列为：rs4149056-F：5'-GAAACACTCTCTTATCTACATAGGTTGT-3'；rs4149056-R：5'-CCTTCTTTAGCGAAATCATCAA-3'；rs4149056-P1：5'FAM-CCCATGAACACATATA-MGB3'；rs4149056-P2：5'VIC-ACCCATGAACGCATATA-MGB3'；rs1045642引物探针序列为：rs1045642-F：5'-GAACATTGCCTATGGAGACAACAG-3'；rs1045642-R：5'-AGAGAGGCTGCCACATGCTC-3'；rs1045642-P1：5'FAM-TGGTGTCACAGGAAGAGATTGTGAG-TAMRA3'；rs1045642-P2：5'VIC-TGGTGTCACAGGAAGAGATCGTGA-TAMRA3'；rs1128503引物探针序列为：rs1128503-F：5'-TGAAGTTTTTTTCTCACTCGTCCT-3'；rs1128503-R：5'-GTCATCTCACCATCCCCTCTGT-3'；rs1128503-P1：5'FAM-TAGATCTTGAAGGGTCTGAACCTGAAG-TAMRA3'；rs1128503-P2：5'VIC-TAGATCTTGAAGGGCCTGAACCTG-TAMRA3'；rs17244841引物探针序列为：rs17244841-F：5'-GCAGAGGTTGCAGTGAACCAAG-3'；rs17244841-R：5'-GGCTTATATTAATATCAAATTACTATTCAAAGAG-3'；rs17244841-P1：5'FAM-ATTGTAATATAAAGGATTTTAA-MGB3'；rs17244841-P2：5'VIC-ATTGTAATATAAAGGATTTAAA-MGB3'；rs12916引物探针序列为：rs12916-F：5'-CACCTCTGAAGGCAAATATAAGCTG-3'；rs12916-R：5'-CTACAAAATCAGGAGTTTCATCAGCTAC-3'；rs12916-P1：5'FAM-TTCTCCCTCACTCCTGCCAGTTG-TAMRA3'；rs12916-P2：5'VIC-TTCTCCCTCACCCCTGCCAGT-TAMRA3'。本专利技术还提供了一种用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因SNP的荧光定量PCR试剂盒，包括所述的特异性引物探针组合的PCR反应液，所述PCR反应液分别为rs4149056、rs1045642、rs1128503、rs17244841、rs12916PCR反应液，所述PCR反应液还包括2×NuHiSNPMix(Taq酶、dNTPs、MgCl2、PCRbuffer、ROX参比荧光)及超纯水。在本专利技术提供的一种用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因SNP的荧光定量PCR试剂盒中，所述PCR反应液成分的终浓度为：1×NuHiSNPMix，0.5μM的各特异性引物及0.2μM探针。本专利技术还提供了一种用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因SNP多态性的应用，所述应用具体为用于制备指导阿司匹林药物个体化用药的装置，具体是利用所述的荧光定量PCR试剂盒，针对人基因组DNA进行荧光定量PCR反应，根据反应过程产生的荧光信号区分相应SNP位点的多态性。本专利技术的有益效果在于：本专利技术提供了一种快捷的用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因SNP的分型试剂盒及应用，应用本专利技术获得的检测结果精确可靠，且成本较低，具有较好的实用性。附图说明图1：本专利技术实施例中rs4149056的TT基因型的扩增曲线图(FAM在上)；图2：本专利技术实施例中rs4149056的TC基因型的扩增曲线图(FAM在上)；图3：本专利技术实施例中rs4149056的CC基因型的扩增曲线图(FAM在下)；图4：本专利技术实施例中rs4149056基因分型结果的PCR荧光分析图；图5：本专利技术实施例中rs1045642的TT基因型的扩增曲线图(本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因SNP的特异性引物探针组合，其特征在于，所述引物探针组合包括针对rs4149056、rs1045642、rs1128503、rs17244841、rs12916基因SNP的特异性引物探针组合，具体如下：rs4149056引物探针序列为：rs4149056‑F：5'‑GAAACACTCTCTTATCTACATAGGTTGT‑3'；rs4149056‑R：5'‑CCTTCTTTAGCGAAATCATCAA‑3'；rs4149056‑P1：5'FAM‑CCCATGAACACATATA‑MGB3'；rs4149056‑P2：5'VIC‑ACCCATGAACGCATATA‑MGB3'；rs1045642引物探针序列为：rs1045642‑F：5'‑GAACATTGCCTATGGAGACAACAG‑3'；rs1045642‑R：5'‑AGAGAGGCTGCCACATGCTC‑3'；rs1045642‑P1：5'FAM‑TGGTGTCACAGGAAGAGATTGTGAG‑TAMRA3’；rs1045642‑P2：5'VIC‑TGGTGTCACAGGAAGAGATCGTGA‑TAMRA3'；rs1128503引物探针序列为：rs1128503‑F：5'‑TGAAGTTTTTTTCTCACTCGTCCT‑3'；rs1128503‑R：5'‑GTCATCTCACCATCCCCTCTGT‑3'；rs1128503‑P1：'FAM‑TAGATCTTGAAGGGTCTGAACCTGAAG‑TAMRA3'；rs1128503‑P2：5'VIC‑TAGATCTTGAAGGGCCTGAACCTG‑TAMRA 3'；rs17244841引物探针序列为：rs17244841‑F：5'‑GCAGAGGTTGCAGTGAACCAAG‑3'；rs17244841‑R：5'‑GGCTTATATTAATATCAAATTACTATTCAAAGAG‑3'；rs17244841‑P1：5'FAM‑ATTGTAATATAAAGGATTTTAA‑MGB3'；rs17244841‑P2：5'VIC‑ATTGTAATATAAAGGATTTAAA‑MGB3'；rs12916引物探针序列为：rs12916‑F：5'‑CACCTCTGAAGGCAAATATAAGCTG‑3'；rs12916‑R：5'‑CTACAAAATCAGGAGTTTCATCAGCTAC‑3'；rs12916‑P1：5'FAM‑TTCTCCCTCACTCCTGCCAGTTG‑TAMRA 3'；rs12916‑P2：5'VIC‑TTCTCCCTCACCCCTGCCAGT‑TAMRA 3'。...

【技术特征摘要】
2019.05.05 CN 20191036882131.一种用于指导辛伐他汀药物个体化用药相关基因SNP的特异性引物探针组合，其特征在于，所述引物探针组合包括针对rs4149056、rs1045642、rs1128503、rs17244841、rs12916基因SNP的特异性引物探针组合，具体如下：rs4149056引物探针序列为：rs4149056-F：5'-GAAACACTCTCTTATCTACATAGGTTGT-3'；rs4149056-R：5'-CCTTCTTTAGCGAAATCATCAA-3'；rs4149056-P1：5'FAM-CCCATGAACACATATA-MGB3'；rs4149056-P2：5'VIC-ACCCATGAACGCATATA-MGB3'；rs1045642引物探针序列为：rs1045642-F：5'-GAACATTGCCTATGGAGACAACAG-3'；rs1045642-R：5'-AGAGAGGCTGCCACATGCTC-3'；rs1045642-P1：5'FAM-TGGTGTCACAGGAAGAGATTGTGAG-TAMRA3’；rs1045642-P2：5'VIC-TGGTGTCACAGGAAGAGATCGTGA-TAMRA3'；rs1128503引物探针序列为：rs1128503-F：5'-TGAAGTTTTTTTCTCACTCGTCCT-3'；rs1128503-R：5'-GTCATCTCACCATCCCCTCTGT-3'；rs1128503-P1：'FAM-TAGATCTTGAAGGGTCTGAACCTGAAG-TAMRA3'；rs1128503-P2：5'VIC-TAGATCTTGAAGGGCCTGAACCTG-TAMRA3'；rs17244841引物探针...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵艳伟，裴婷婷，刘颖，杜晴晴，孙子奎，
申请(专利权)人：上海派森诺生物科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：上海,31