本发明专利技术提供一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法及装置,涉及水环境与水生态保护领域,所述测试方法包括:步骤(1):采集目标测试鱼类活体生物样本;步骤(2):在鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中开展鱼类环境DNA脱落特性实验;步骤(3):在步骤(2)基础上,开展鱼类环境DNA降解特性实验;步骤(4):在步骤(2)基础上,开展鱼类环境DNA吸附特性试验;步骤(5):测试分析环境DNA浓度随时间变化过程,解析鱼类环境DNA动水归趋特性。本发明专利技术可精确定量测试不同类型及生活史阶段鱼类环境DNA的动水归趋特性,具有重要科学应用价值。
A Method and Device for Testing Dynamic and Hydrotaxis Characteristics of DNA in Fish Environment
【技术实现步骤摘要】
一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法及装置
本专利技术涉及水环境与水生态保护领域,具体是指一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法及装置。
技术介绍
水利工程对鱼类繁殖生境影响广受关注,监测评估是保护的重要基础。环境DNA监测作为非侵入高时效新兴方法,广泛用于评判珍稀或入侵物种存在与否。研究发现环境DNA浓度与鱼类生物特性和水体环境特性存在相关关系,但试图将其应用于预测评估鱼类及其繁殖生境分布、生活史行为、生物量等方面,尚需解决如何测试环境DNA动水归趋特性这一瓶颈问题。
技术实现思路
本专利技术的目的是为克服
技术介绍
的不足,提供一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法及装置。为实现上述目的,本专利技术提供一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法,其特征在于,包括以下步骤:一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法,包括以下步骤:步骤(1):采集目标测试鱼类活体生物样本;步骤(2):在鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中开展鱼类环境DNA脱落特性实验;步骤(3):在步骤(2)基础上,开展鱼类环境DNA降解特性实验;步骤(4):在步骤(2)基础上,开展鱼类环境DNA吸附特性试验;步骤(5):测试分析环境DNA浓度随时间变化过程,解析鱼类环境DNA动水归趋特性。进一步的,所述的步骤(1)从野外或繁育场采集目标测试鱼类活体生物样本,包括成鱼、幼鱼、鱼卵,同时测试鱼类的基本生物特性,包括重量、大小、发育阶段,在驯养池内适应24h,期间禁食。进一步的,所述的步骤(2)将目标测试鱼类活体生物样本放入鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中,分别设置不同流速(u,m/s)、水温(T,℃)、溶解氧(DO,mg/L)因子工况情景,2~4d内不同时间间隔(ti,s)采取定量水样(Vi,mL),分别在24h内通过孔径0.22μm的滤膜真空抽滤,将过滤好的滤膜置于-20℃条件下保存备用,供步骤(5)测试环境DNA浓度使用。进一步的,所述的步骤(3)在步骤(2)的基础上,将目标测试鱼类活体生物样本从鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中取出,4~8d内不同时间间隔(ti,s)采取定量水样(Vi,mL),分别在24h内通过孔径0.22μm的滤膜真空抽滤,将过滤好的滤膜置于-20℃条件下保存备用,供步骤(5)测试环境DNA浓度使用。进一步的,所述的步骤(4)在步骤(2)的基础上,将目标测试鱼类活体生物样本从鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中取出,加入一定量悬浮泥沙颗粒,营造不同浊度水流工况情景,1~2d内不同时间间隔(ti,s)采取定量水样(Vi,mL),分别在24h内通过孔径0.22μm的滤膜真空抽滤,将过滤好的滤膜置于-20℃条件下保存备用,供步骤5测试环境DNA浓度使用。进一步的,所述的步骤(5)采用定量即时聚合酶链锁反应(real-timeqPCR)技术测试步骤(2)、(3)和(4)中过滤好的滤膜中的环境DNA片段数量(Ni,copies),计算环境DNA浓度(Ci,copies/mL):Ci=Ni/Vi鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置可被认为是一个完全混合水体,鱼类环境DNA动水归趋特性的时间变化过程采用一维模型表征:其中Ci为环境DNA浓度,copies/mL;t为时间,s;S为环境DNA脱落率,copies/(mL·d);k1为环境DNA降解率,1/d;k2为环境DNA吸附率,1/d。当步骤(2)中鱼类环境DNA脱落至稳态时,因此,(1)式可表征为,S=(k1+k2)C0(2)当步骤(3)中将目标测试鱼类活体生物样本从鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中取出后,S=0,则(1)式可表征为,因此,鱼类环境DNA动水时间降解过程可表征为如下指数模型当步骤(4)中将目标测试鱼类活体生物样本从鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中取出后,S=0,,则(1)式可表征为,因此,鱼类环境DNA动水时间吸附过程可表征为如下指数模型以上,C0为将目标测试鱼类活体生物样本从鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中取出后初始稳态环境DNA浓度,copies/mL;分别绘制步骤(2)、(3)和(4)中不同时间间隔(ti,s)环境DNA浓度(Ci,copies/mL)的散点图,分析水体环境DNA浓度在脱落、降解和吸附等归趋过程中随时间变化规律,采用加权最小二乘等回归方法拟合式(4)和(6)所示指数模型,确定鱼类环境DNA脱落率(S)、降解率(k1)和吸附率(k2)等关键归趋特性参数。一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置,包括供鱼类栖息的环形流道、位于环形流道一侧的变频圆盘造流系统、设置于变频圆盘造流系统上下游的上游拦鱼栅和下游拦鱼栅、位于环形流道另一侧的水环境因子监测系统、ADV流速仪和取样系统,所述变频圆盘造流系统包括变频电机、传动带、转动轴和圆盘盘片,所述变频电机通过传动带驱动转动轴进而带动圆盘盘片旋转。进一步的,所述圆盘盘片的布置宽度与环形流道宽度相近,盘片之间间距设置为0.5~2cm。进一步的,所述环形流道采用有机玻璃制成,所述上游拦鱼栅采用直径0.5~2cm圆管制成蜂巢结构,下游拦鱼栅采用化纤网片制作,网孔大小应能阻止测试对象鱼类通过。进一步的,所述环形流道的上端设有定位支架,所述水环境因子监测系统和ADV流速仪架设在定位支架上,所述水环境因子监测系统包括水温传感器、溶解氧传感器、pH值传感器、电导率传感器、浊度传感器。本专利技术具有如下有益效果:1、本专利技术将鱼类环境DNA归趋机制分为脱落、降解和吸附三个典型过程,分别在鱼类环境DNA动水归趋特性专用测试装置中开展实验,基于qPCR技术测试不同时间节点鱼类环境DNA浓度,绘制不同时间间隔环境DNA浓度的散点图,回归拟合环境DNA浓度时间过程线,定量分析水动力和环境因子影响的条件下鱼类环境DNA浓度随时间变化规律。2、本专利技术基于水动力和其他环境因子可控的专用测试装置,可定理分析环境因子对鱼类环境DNA动水归趋特性的影响。3、本专利技术基于鱼类环境DNA浓度时间过程数据的测试及回归分析,定量计算出鱼类环境DNA脱落率、降解率和吸附率等关键归趋特性参数。附图说明图1为本专利技术鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法其中一个实施例的流程图;图2为本专利技术鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置其中一个实施例的平面结构示意图;图3为图2中A-A横剖面结构示意图;图4为图2中B-B剖面结构示意图;图5为鱼类脱落环境DNA浓度时间过程示意图;图6为鱼类降解或吸附环境DNA浓度时间过程示意图。图中:1-环形流道,2-变频电机,3-传动带,4-转动轴,5-圆盘盘片,6-上游拦鱼栅,7-下游拦鱼栅,8-定位支架,9-环境因子监测系统,10-ADV流速仪,11-取样系统,12-取样口,13-取样阀。具体实施方式下面结合附图对本专利技术较佳实施例作详细阐述,但它们并不构成对本专利技术的限定,仅做举例而已,同时便于本领域技术人员更加清楚理解本专利技术的内容和优点。如图1所示,本专利技术实施例提供一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤(1):采集目标测试鱼类活体生物样本;具体的,从野外或繁育场采集目标测试鱼类活体生物样本,包括成鱼、幼鱼、鱼卵等;同时测试鱼类的基本生物特性,包括重量、大小、发育阶段等。在驯养池内适应24h,期间禁食。步本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法,其特征在于:包括以下步骤:步骤(1):采集目标测试鱼类活体生物样本;步骤(2):在鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中开展鱼类环境DNA脱落特性实验;步骤(3):在步骤(2)基础上,开展鱼类环境DNA降解特性实验;步骤(4):在步骤(2)基础上,开展鱼类环境DNA吸附特性试验;步骤(5):测试分析环境DNA浓度随时间变化过程,解析鱼类环境DNA动水归趋特性。
【技术特征摘要】
1.一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法,其特征在于:包括以下步骤:步骤(1):采集目标测试鱼类活体生物样本;步骤(2):在鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中开展鱼类环境DNA脱落特性实验;步骤(3):在步骤(2)基础上,开展鱼类环境DNA降解特性实验;步骤(4):在步骤(2)基础上,开展鱼类环境DNA吸附特性试验;步骤(5):测试分析环境DNA浓度随时间变化过程,解析鱼类环境DNA动水归趋特性。2.根据权利要求1所述的一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法,其特征在于:所述的步骤(1)从野外或繁育场采集目标测试鱼类活体生物样本,包括成鱼、幼鱼、鱼卵,同时测试鱼类的基本生物特性,包括重量、大小、发育阶段,在驯养池内适应24h,期间禁食。3.根据权利要求1所述的一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法,其特征在于:所述的步骤(2)将目标测试鱼类活体生物样本放入鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中,分别设置不同流速(u,m/s)、水温(T,℃)、溶解氧(DO,mg/L)因子工况情景,2~4d内不同时间间隔(ti,s)采取定量水样(Vi,mL),分别在24h内通过孔径0.22μm的滤膜真空抽滤,将过滤好的滤膜置于-20℃条件下保存备用,供步骤(5)测试环境DNA浓度使用。4.根据权利要求1所述的一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法,其特征在于:所述的步骤(3)在步骤(2)的基础上,将目标测试鱼类活体生物样本从鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中取出,4~8d内不同时间间隔(ti,s)采取定量水样(Vi,mL),分别在24h内通过孔径0.22μm的滤膜真空抽滤,将过滤好的滤膜置于-20℃条件下保存备用,供步骤(5)测试环境DNA浓度使用。5.根据权利要求1所述的一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法,其特征在于:所述的步骤(4)在步骤(2)的基础上,将目标测试鱼类活体生物样本从鱼类环境DNA动水归趋特性测试装置中取出,加入一定量悬浮泥沙颗粒,营造不同浊度水流工况情景,1~2d内不同时间间隔(ti,s)采取定量水样(Vi,mL),分别在24h内通过孔径0.22μm的滤膜真空抽滤,将过滤好的滤膜置于-20℃条件下保存备用,供步骤5测试环境DNA浓度使用。6.根据权利要求1所述的一种鱼类环境DNA动水归趋特性测试方法,其特征在于:所述的步骤(5)采用定量即时聚合酶链锁反应(real-timeqPCR)技术测试步骤(2)、(3)和(4)中过滤好的滤膜中的环境DNA片段数量(Ni,copies),计算环境DNA浓度(Ci,copies/m...
【专利技术属性】
技术研发人员:郭辉,杨文俊,罗玉兰,段文刚,滕素芬,黄明海,李利,黄卫,
申请(专利权)人:长江水利委员会长江科学院,
类型:发明
国别省市:湖北,42
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