确定的微生物组合物制造技术

本文公开了包含一组确定的微生物物种(例如，3种、16种、18种、19种、21种或22种微生物物种)的细胞的组合物。还公开了使用所述微生物组合物的方法，所述方法包括使土壤、植物、植物部分或种子与所述组合物接触。所述微生物组合物还用于降解诸如含几丁质的生物材料之类的生物材料的方法中。

Determined microbial composition

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】确定的微生物组合物相关申请的交叉引用本申请要求2016年8月30日提交的美国临时申请No.62/381,441的权益，该美国临时申请全文以引用方式并入本文。
本公开涉及微生物组合物及其使用方法，特别是用于农业过程和用途的微生物组合物及其使用方法。
技术介绍
由于人口增长，食物消耗也在不断增加。另一方面，由于全球工业化、干旱、盐度以及全球变暖，可耕农地显著减少且生产力显著降低(Galamero等人，在MicrobialStrategiesforCropImprovement，SpringerBerlin，第1-22页，2009中)。该问题可以通过实行可持续农业来解决，可持续农业的基本原理是显著减少化学投入，诸如肥料、杀虫剂和除草剂，同时减少温室气体的排放。在农业中过量使用化学肥料会导致大量的环境问题，因为一些肥料含有重金属(例如，镉和铬)和高浓度的放射性核素。这些肥料在农业生态系统中构成植物中重金属和放射性核素的主要来源，并且一些肥料导致了无机污染物的积累(Savci，Int.J.Env.Sci.Dev.3：77-80，2012；Malakoff，Science281：190-192，1998)。温室和水产养殖在旺季期间使用特别大量的化学肥料，从而导致水资源污染，以及作物产量和产品质量的劣化。鉴于化学肥料的这些缺点，有益于植物的微生物接种物作为综合养分管理策略的组分而提供了希望。专利技术概述本文公开了包含一组确定的微生物物种(例如，3种微生物物种、16种微生物物种、17种微生物物种、19种微生物物种、20种微生物物种、21种微生物物种，或22种微生物物种)的细胞的组合物。在一些实施方案中，组合物包含具有包括但不限于以下的功能特征或活性(诸如代谢活性)的一种或多种微生物物种的细胞：氮代谢、耐盐性、磷酸盐和/或钙盐和/或锌盐增溶活性、纤维素分解活性、几丁质分解活性、植物激素产生、铁代谢活性和/或有机物去磷酸化活性。在一些实施方案中，所述组合物包含一种或多种(诸如2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或更多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种)在好氧条件下生长的微生物物种的细胞。在其他实施方案中，所述组合物包含一种或多种(诸如2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种)在厌氧条件下生长的微生物物种的细胞。在一个非限制性示例中，所述组合物包括16种在好氧条件下生长的微生物物种的细胞和6种在厌氧条件下生长的微生物物种的细胞。好氧和厌氧生长条件包括但不限于本文实施例1中描述的那些条件。在一个实施方案中，所述组合物包含包括以下各项或由以下各项组成的微生物物种的细胞：德氏乳杆菌(Lactobacillusdelbrueckii)、嗜盐枝芽孢杆菌(Virgibacillushalophilus)、棕色固氮菌(Azotobactervinelandii)、巴氏梭菌(Clostridiumpasteurianum)、千叶类芽孢杆菌(Paenibacilluschibensis)、灰色链霉菌(Streptomycesgriseus)、假单胞菌属(Pseudomonassp.)(与嗜虫假单胞菌(P.entomophila)、荧光假单胞菌(P.fluorescens)和恶臭假单胞菌(P.putida)密切相关，例如具有与SEQIDNO：17具有至少99％序列相同性的16SrRNA序列的微生物物种)、恶臭假单胞菌(Pseudomonasputida)、芽孢杆菌属(Bacillussp.)(与科赫芽孢杆菌(B.kochii)、抱川芽孢杆菌(B.pocheonensis)和芽孢杆菌属(菌株R-27341)密切相关，例如具有与SEQIDNO：15具有至少99％序列相同性的16SrRNA序列的微生物物种)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillusamyloliquefaciens)、小鳟鱼大洋芽孢杆菌(Oceanobacillusoncorhynchi)、灿烂类芽孢杆菌(Paenibacilluslautus)(例如，与灿烂类芽孢杆菌和类芽孢杆菌属(菌株Y412MC10)密切相关，例如具有与SEQIDNO：12具有至少99％序列相同性的16SrRNA序列的微生物物种)、地衣芽孢杆菌(Bacilluslicheniformis)、酒乳杆菌(Lactobacillusvini)、库氏类芽孢杆菌(Paenibacilluscookii)、枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis)、布氏乳杆菌(Lactobacillusbuchneri)、巨大芽孢杆菌(Bacillusmegaterium)、巴氏醋杆菌(Acetobacterpasteurianus)、拜氏梭菌(Clostridiumbeijerincii)、干酪乳杆菌/副干酪乳杆菌(Lactobacilluscasei/pracasei)，以及弯曲芽孢杆菌(Bacillusflexus)。在另一个实施方案中，所述组合物包含包括以下各项或由以下各项组成的微生物物种的细胞：德氏乳杆菌、嗜盐枝芽孢杆菌、棕色固氮菌、巴氏梭菌、灰色链霉菌、假单胞菌属(与嗜虫假单胞菌、荧光假单胞菌和恶臭假单胞菌密切相关，例如具有与SEQIDNO：17具有至少99％序列相同性的16SrRNA序列的微生物物种)、恶臭假单胞菌、芽孢杆菌属(与科赫芽孢杆菌、抱川芽孢杆菌和芽孢杆菌属(菌株R-27341)密切相关，例如具有与SEQIDNO：15具有至少99％序列相同性的16SrRNA序列的微生物物种)、解淀粉芽孢杆菌、小鳟鱼大洋芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、酒乳杆菌、枯草芽孢杆菌、布氏乳杆菌、巨大芽孢杆菌、巴氏醋杆菌、拜氏梭菌、干酪乳杆菌/副干酪乳杆菌，以及弯曲芽孢杆菌。在其他实施方案中，所述组合物包含包括以下项或由以下项组成的微生物物种的细胞：具有与以下项具有至少99％序列相同性的16SrDNA序列的微生物：SEQIDNO：3-24中的每一者；SEQIDNO：3-8、10、11、13-18、以及20-24中的每一者；SEQIDNO：3-7和9-24中的每一者；SEQIDNO：3-7、10、11、13-18、以及20-24中的每一者；SEQIDNO：3-8、10、11、14、16-18、20-22、以及24中的每一者；或者SEQIDNO：3-14、16-22、以及24中的每一者。在另一个实施方案中，所述组合物包含在美国典型培养物保藏中心(AmericanTypeCultureCollection)保藏号PTA-123288、PTA-123298和/或PTA-123289中的一种或多种中所含有的微生物的集合。在其他实施方案中，所述组合物包含以下微生物物种的细胞：至少一种具有氮代谢活性的微生物物种、至少一种耐受5％NaCl的微生物物种、至少一种具有磷酸盐和/或钙盐和/或锌盐增溶活性的微生物物种、至少一种具有纤维素分解和/或几丁质分解活性的微生物物种、至少一种具有苹果酸代谢活性的微生物物种、至少一种具有植物激素(例如吲哚(生长素))产生活性的微生物物种、至少一种具有铁代谢活性的微生物物种、至少一种本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种组合物，所述组合物包含包括以下各项或由以下各项组成的微生物物种的细胞：德氏乳杆菌(Lactobacillus delbrueckii)、嗜盐枝芽孢杆菌(Virgibacillus halophilus)、棕色固氮菌(Azotobacter vinelandii)、巴氏梭菌(Clostridium pasteurianum)、千叶类芽孢杆菌(Paenibacillus chibensis)、灰色链霉菌(Streptomyces griseus)、假单胞菌属(Pseudomonas sp.)、恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)、芽孢杆菌属(Bacillus sp.)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)、小鳟鱼大洋芽孢杆菌(Oceanobacillus oncorhynchi)、灿烂类芽孢杆菌(Paenibacillus lautus)、地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)、酒乳杆菌(Lactobacillus vini)、库氏类芽孢杆菌(Paenibacillus cookii)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、布氏乳杆菌(Lactobacillus buchneri)、巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)、巴氏醋杆菌(Acetobacter pasteurianus)、拜氏梭菌(Clostridium beijerinckii)、干酪乳杆菌/副干酪乳杆菌(Lactobacillus casei/paracasei)，以及弯曲芽孢杆菌(Bacillus flexus)。...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2016.08.30 US 62/381,4411.一种组合物，所述组合物包含包括以下各项或由以下各项组成的微生物物种的细胞：德氏乳杆菌(Lactobacillusdelbrueckii)、嗜盐枝芽孢杆菌(Virgibacillushalophilus)、棕色固氮菌(Azotobactervinelandii)、巴氏梭菌(Clostridiumpasteurianum)、千叶类芽孢杆菌(Paenibacilluschibensis)、灰色链霉菌(Streptomycesgriseus)、假单胞菌属(Pseudomonassp.)、恶臭假单胞菌(Pseudomonasputida)、芽孢杆菌属(Bacillussp.)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillusamyloliquefaciens)、小鳟鱼大洋芽孢杆菌(Oceanobacillusoncorhynchi)、灿烂类芽孢杆菌(Paenibacilluslautus)、地衣芽孢杆菌(Bacilluslicheniformis)、酒乳杆菌(Lactobacillusvini)、库氏类芽孢杆菌(Paenibacilluscookii)、枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis)、布氏乳杆菌(Lactobacillusbuchneri)、巨大芽孢杆菌(Bacillusmegaterium)、巴氏醋杆菌(Acetobacterpasteurianus)、拜氏梭菌(Clostridiumbeijerinckii)、干酪乳杆菌/副干酪乳杆菌(Lactobacilluscasei/paracasei)，以及弯曲芽孢杆菌(Bacillusflexus)。2.一种组合物，所述组合物包含包括以下各项或由以下各项组成的微生物物种的细胞：德氏乳杆菌、嗜盐枝芽孢杆菌、棕色固氮菌、巴氏梭菌、灰色链霉菌、假单胞菌属、恶臭假单胞菌、芽孢杆菌属、解淀粉芽孢杆菌、小鳟鱼大洋芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、酒乳杆菌、枯草芽孢杆菌、布氏乳杆菌、巨大芽孢杆菌、巴氏醋杆菌、拜氏梭菌、干酪乳杆菌/副干酪乳杆菌，以及弯曲芽孢杆菌。3.一种组合物，所述组合物包含包括以下各项或由以下各项组成的微生物物种的细胞：德氏乳杆菌、嗜盐枝芽孢杆菌、棕色固氮菌、巴氏梭菌、千叶类芽孢杆菌、灰色链霉菌、假单胞菌属、恶臭假单胞菌、芽孢杆菌属、解淀粉芽孢杆菌、小鳟鱼大洋芽孢杆菌、灿烂类芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、酒乳杆菌、库氏类芽孢杆菌、布氏乳杆菌、巨大芽孢杆菌、巴氏醋杆菌、拜氏梭菌、干酪乳杆菌/副干酪乳杆菌，以及弯曲芽孢杆菌。4.一种组合物，所述组合物包含包括以下项或由以下项组成的微生物物种的细胞：德氏乳杆菌、嗜盐枝芽孢杆菌、棕色固氮菌、巴氏梭菌、灰色链霉菌、假单胞菌属、恶臭假单胞菌、芽孢杆菌属、解淀粉芽孢杆菌、小鳟鱼大洋芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、酒乳杆菌、枯草芽孢杆菌、布氏乳杆菌、巨大芽孢杆菌、巴氏醋杆菌、拜氏梭菌、干酪乳杆菌/副干酪乳杆菌，以及弯曲芽孢杆菌。5.一种组合物，所述组合物包含包括以下各项或由以下各项组成的微生物物种的细胞：德氏乳杆菌、棕色固氮菌、巴氏梭菌、灰色链霉菌、假单胞菌属、恶臭假单胞菌、解淀粉芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、酒乳杆菌、枯草芽孢杆菌、布氏乳杆菌、巨大芽孢杆菌、巴氏醋杆菌、拜氏梭菌、干酪乳杆菌/副干酪乳杆菌，以及弯曲芽孢杆菌。6.一种组合物，所述组合物包含包括以下各项或由以下各项组成的微生物物种的细胞：德氏乳杆菌、棕色固氮菌、巴氏梭菌、千叶类芽孢杆菌、灰色链霉菌、假单胞菌属、恶臭假单胞菌、解淀粉芽孢杆菌、小鳟鱼大洋芽孢杆菌、灿烂类芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、酒乳杆菌、库氏类芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、布氏乳杆菌、巨大芽孢杆菌、巴氏醋杆菌、拜氏梭菌、干酪乳杆菌/副干酪乳杆菌，以及弯曲芽孢杆菌。7.一种组合物，所述组合物包含包括以下项或由以下项组成的微生物物种的细胞：具有与SEQIDNO：3-24中的每一者具有至少99％序列相同性的16SrDNA序列的微生物。8.一种组合物，所述组合物包含包括以下项或由以下项组成的微生物物种的细胞：具有与SEQIDNO：3-8、10、11、13-18以及20-24中的每一者具有至少99％序列相同性的16SrDNA序列的微生物。9.一种组合物，所述组合物包含包括以下项或由以下项组成的微生物物种的细胞：具有与SEQIDNO：3-7和SEQIDNO：9-24中的每一者具有至少99％序列相同性的16SrDNA序列的微生物。10.一种组合物，所述组合物包含包括以下项或由以下项组成的微生物物种的细胞：具有与SEQIDNO：3-7、10、11、13-18以及20-24中的每一者具有至少99％序列相同性的16SrDNA序列的微生物。11.一种组合物，所述组合物包含包括以下项或由以下项组成的微生物物种的细胞：具有与SEQIDNO：3-8、10、11、14、1...

【专利技术属性】
技术研发人员：F·肯迪尔基，X·L·刘，D·R·瓦格纳，SY·H·尹，
申请(专利权)人：阿坤纳斯公司，
类型：发明
国别省市：挪威,NO