本发明专利技术公开了整合素β4在区分结肠癌和直肠癌中的应用，包括以下步骤：1)将患者结直肠癌组织与正常组织相比表达改变的蛋白进行筛选；2)通过步骤1)筛选出整合素β4；3)将结肠癌组织中的整合素β4表达量与在直肠癌组织中的整合素β4表达量进行对比；以及4)确定区分直肠癌和结肠癌的整合素β4表达量的阈值范围；从而填补了通过分子生物学检测手段区分结肠癌和直肠癌领域的空白，进而更好的区分结、直肠癌肿瘤来源。
Application of integrin beta 4 in differentiating colon cancer from rectal cancer
The invention discloses the application of integrin beta 4 in differentiating colorectal cancer from rectal cancer, including the following steps: 1) screening proteins that express changes in patients'colorectal cancer tissues compared with normal tissues; 2) screening integrin beta 4 through step 1; 3) comparing integrin beta 4 expression in colorectal cancer tissues with integrin beta 4 expression in rectal cancer tissues; and 4) determining regions; The threshold range of integrin beta 4 expression in colorectal cancer and colorectal cancer fills the gap in the field of differentiating colorectal cancer from colorectal cancer by molecular biology detection, thus better differentiating the origin of colorectal cancer from that of colorectal cancer.
【技术实现步骤摘要】
整合素β4在区分结肠癌和直肠癌中的应用
本专利技术涉及生物
，具体涉及到整合素β4在区分结肠癌和直肠癌中的应用。
技术介绍
大肠癌是常见的消化系统恶性肿瘤之一，其包括结肠癌和直肠癌。居全世界男性恶性肿瘤发病谱第3位和女性恶性肿瘤发病谱第2位。近年来受饮食结构和生活方式的影响，在我国尤其是大城市，大肠癌发病率明显上升，已跃居恶性肿瘤发病第2位，防治工作严峻。大肠癌发生的早期多无明显症状，常被忽视而延误早期诊断和治疗时机。世界卫生组织提出，癌症筛查和早诊早治是癌症防控的最有效途径。因此，对城市居民高危人群进行大肠癌筛查并实现早诊早治是降低大肠癌死亡率、提高患者生存率的有效措施，也是当下大肠癌防治工作迫切需要解决的热点问题。目前，结肠癌或直肠癌的诊断局限于肠镜或肉眼观察肿瘤发生的部位而进行区分，并无明确的分子生物学检测区分方法。对于发生于直肠与乙状结肠交接处的肿瘤，并无有效办法明确区分肿瘤来源。由于晚期结肠癌患者与晚期直肠癌患者，治疗方案选择存在差异--晚期直肠癌患者或外科手术禁忌症患者，可以选择放射治疗，可获得较好效果；但结肠癌患者则更推荐化学疗法，进而获得更好的疗效。因此更好的区分肿瘤来源(直肠与结肠)，特别是直、乙交接处肿瘤来源，对治疗方案的选择有重要意义。整合素属于跨膜蛋白细胞黏附分子家族，通常是由α和β两个亚基组成的异二聚体结构，在哺乳动物中共有18个α亚基和8个β亚基，主要通过与配体(胶原蛋白、层粘连蛋白、纤连蛋白)相结合介导细胞黏附。整合素β4(ITGB4)是整合素家族β亚基的一个亚型。公开于该
技术介绍
部分的信息仅仅旨在增加对本专利技术的总体背景的理解，而不应当被视为承认或以任何形式暗示该信息构成已为本领域一般技术人员所公知的现有技术。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供整合素β4在区分结肠癌和直肠癌中的应用，从而填补了通过分子生物学检测手段区分结肠癌和直肠癌领域的空白，进而更好的区分结、直肠癌肿瘤来源。为实现上述目的，本专利技术提供了整合素β4在区分结肠癌和直肠癌中的应用，包括以下步骤：1)将患者结直肠癌组织与正常组织相比表达改变的蛋白进行筛选；2)通过步骤1)筛选出整合素β4；3)将结肠癌组织中的整合素β4表达量与在直肠癌组织中的整合素β4表达量进行对比；以及4)确定区分直肠癌和结肠癌的整合素β4表达量的阈值范围。上述应用在另一种实施方式中，整合素β4表达量是通过实时荧光定量PCR进行测定得出的mRNA相对表达量。上述应用在另一种实施方式中，实时荧光定量PCR所采用的上下游引物的碱基序列依次为：F：5’-TCTCTCAGAGTGAGCTGGCAG-3’即SEQID:1；R：5’-TTCAGCAGCTGGTACTCCAC-3’即SEQID:2。上述应用在另一种实施方式中，实时荧光定量PCR所采用的内参为GAPDH。上述应用在另一种实施方式中，实时荧光定量PCR所采用的mRNA相对表达量计算方法为方法，即上述应用在另一种实施方式中，所述阈值范围为0.005-0.03。上述应用在另一种实施方式中，所述阈值范围为0.008-0.02。上述应用在另一种实施方式中，通过SPSS软件绘制ROC曲线分析阈值范围的灵敏度和特异度。上述应用在另一种实施方式中，整合素β4的表达量高于所述阈值范围，则判断为结肠癌，低于所述阈值范围，则判断为直肠癌。与现有技术相比，本专利技术具有如下有益效果：本申请通过使用基因芯片数据库、蛋白芯片检测技术及国际先进质谱流式细胞技术，从60万个指标中成功筛选出1个对大肠癌早诊早治有重要价值的新肿瘤标志物整合素β4(ITGB4)，并经小样本组织学初步验证，通过ROC曲线分析证明ITGB4对区分结、直肠癌组织有重要价值，从而填补了通过分子生物学检测手段区分结肠癌和直肠癌领域的空白，进而更好的区分直乙交界处的结、直肠癌肿瘤来源，对是否选取放射治疗方案有重要意义；并且通过测定ITGB4的表达与否，可直接影响整合素单克隆抗体、西仑吉肽等抗血管生成药物的应用及选取。另外，对于晚期患者，对是否选取整合素单抗、以及抗血管治疗药物种类的选取均有重要价值。附图说明图1是根据本专利技术的直肠癌和结肠癌的整合素β4的mRNA相对表达量。图2是根据本专利技术的测定阈值的灵敏度和特异度的ROC曲线。具体实施方式下面结合附图，对本专利技术的具体实施方式进行详细描述，但应当理解本专利技术的保护范围并不受具体实施方式的限制。实施例1蛋白筛选用HumanGenecards(http://www.genecards.org/)和Compartments数据库(https://compartments.jensenlab.org/Downloads)对人类蛋白或多肽的分布部位进行分析，获得4433个分泌蛋白；经过BioGPSGeneAtlasU133A(http://biogps.org/dataset/GSE1133/geneatlas-u133a-gcrma/)数据库以及NC160onU133A(http://biogps.org/dataset/BDS_00011/nci60-on-u133a-gcrma/)数据库分析，发现包括整合素β4(ITGB4，即CD104)在内的23个分泌蛋白，在结直肠癌组织(与正常结肠组织比较)以及结直肠癌细胞株(与其他组织来源细胞比较)中表达量发生明显变化。实施例2整合素β4表达量阈值范围的确定对河北医科大学第一医院采集的结肠癌、直肠癌及其对应癌旁组织进行了ITGB4mRNA表达的分析，采用的是实时定量PCR法(ABI7500机型)，PCR条件：95℃10秒，60℃30秒，72℃30秒，42个循环；引物F：TCTCTCAGAGTGAGCTGGCAG，R：TTCAGCAGCTGGTACTCCAC；内参为GAPDH，相对表达量计算方法为，发现正常组织与癌组织之间存在的差异并不显著，进一步分析时，偶然发现其在结肠癌和直肠癌中表达有明显差异，p<0.05。经过16例直肠癌组织与29例结肠癌组织的验证后，确定阈值为0.01fold时，通过SPSS21.0软件绘制ROC曲线证明该阈值区分结肠癌与直肠癌的灵敏度与特异度依次为0.759和0.750，曲线下面积为0.763，结果详见附图2中的ROC曲线。前述对本专利技术的具体示例性实施方案的描述是为了说明和例证的目的。这些描述并非想将本专利技术限定为所公开的精确形式，并且很显然，根据上述教导，可以进行很多改变和变化。对示例性实施例进行选择和描述的目的在于解释本专利技术的特定原理及其实际应用，从而使得本领域的技术人员能够实现并利用本专利技术的各种不同的示例性实施方案以及各种不同的选择和改变。本专利技术的范围意在由权利要求书及其等同形式所限定。序列表<110>河北医科大学第一医院<120>整合素β4在区分结肠癌和直肠癌中的应用<130>P171597DD1F<160>2<170>SIPOSequenceListing1.0<210>1<211>21<212>DNA<213>人工序列(SEQID:1)<400>1tctctcagagtgagctggcag21<210本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.整合素β4在区分结肠癌和直肠癌中的应用，其特征在于，包括以下步骤：1)将患者结直肠癌组织与正常组织相比表达改变的蛋白进行筛选；2)通过步骤1)筛选出整合素β4；3)将结肠癌组织中的整合素β4表达量与在直肠癌组织中的整合素β4表达量进行对比；以及4)确定区分直肠癌和结肠癌的整合素β4表达量的阈值范围。
【技术特征摘要】
1.整合素β4在区分结肠癌和直肠癌中的应用，其特征在于，包括以下步骤：1)将患者结直肠癌组织与正常组织相比表达改变的蛋白进行筛选；2)通过步骤1)筛选出整合素β4；3)将结肠癌组织中的整合素β4表达量与在直肠癌组织中的整合素β4表达量进行对比；以及4)确定区分直肠癌和结肠癌的整合素β4表达量的阈值范围。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，整合素β4表达量是通过实时荧光定量PCR进行测定得出的mRNA相对表达量。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，实时荧光定量PCR所采用的上下游引物的碱基序列依次为：F：5’-TCTCTCAGAGTGAGCTGGCAG-3’即SEQID:1；R：5’-TTCAGCAGC...
【专利技术属性】
技术研发人员：赵增仁，姜霞，王桂琦，田延锋，张磊，翟从劼，于卫芳，
申请(专利权)人：河北医科大学第一医院，
类型：发明
国别省市：河北,13
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