乳腺癌分型基因群及其应用制造技术

本发明专利技术提供一组乳腺癌分型基因群，可将乳腺癌分为间质型、增殖型和代谢型三种亚型，不同亚型的乳腺癌具有不同的基因表达谱。不同亚型的乳腺癌病人对内分泌治疗药物和化疗药物有不同的反应，据此采用合适的药物将极大的提高乳腺癌病人的生存率。本发明专利技术对乳腺癌分型基因群可用于制备乳腺癌分型检测试剂盒，对乳腺癌进行分型，适用于临床指导用药，对于实现乳腺癌的精准治疗具有重要的应用价值。

【技术实现步骤摘要】
乳腺癌分型基因群及其应用
本专利技术属于生物
，具体涉及一组乳腺癌分型基因群及其应用。
技术介绍
高通量的癌症基因组学证实，乳腺癌并非单一疾病，而是由多种亚型组成的疾病。目前通过基因表达谱对乳腺癌几个亚型(PAM50,专利号WO2009158143A1)：管腔A型、管腔B型、HER2阳性型、基底细胞型，以及类正常细胞型。这种对癌症进行分型对预后有比较准确的预测效果。比如，管腔A型，侵袭性与转移性比较弱，术后复发转移风险相对低，对内分泌治疗比较敏感。管腔B型预后中等，需要内分泌治疗联合化疗。HER2阳性型和基底细胞型则预后很差。HER2阳性型，一般用抗HER2靶向治疗(曲妥珠单抗)联合化疗和(或)内分泌治疗。基底细胞型预后最差，需要化疗治疗。另外一种技术(OncotypeDx)是对专门针对雌激素受体阳性及淋巴结阴性的乳腺癌病人，用21个基因表达量来计算复发分数，复发分数低的病人只需要内分泌治疗，复发分数高的病人则需要化疗。然而，以上两种基因分型技术均存在一些问题。PAM50分子分型不够精准，比如是否存在类正常细胞型还存在争论，各亚型之间的比例也不确定。另外，PAM50无法精确地证实哪种亚型需要用具体的化疗药物。OncotypeDx只是针对雌激素受体阳性的乳腺癌病人，而不适用于雌激素受体阴性的病人。
技术实现思路
针对上述技术问题，本专利技术提供了乳腺癌分型基因群，其将乳腺癌病人的肿瘤分成三种亚型：间质型、增殖型和代谢型。不同亚型的乳腺癌病人对内分泌治疗药物和化疗药物有不同的反应，根据这三种类型采用合适的药物将极大的提高乳腺癌病人的生存率，尽量避免不适用药物，这样会减小化疗的毒性和副作用。本专利技术的一方面提供一组乳腺癌分型基因群，所述基因群包含间质型乳腺癌基因指纹谱、增殖型乳腺癌基因指纹谱和代谢型乳腺癌基因指纹谱，所述间质型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号1-20所示的基因，所述增殖型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号21-40所示的基因，所述代谢型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号41-60所示的基因。进一步地，特异性表达所述间质型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为间质型乳腺癌。进一步地，特异性表达所述增殖型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为增殖型乳腺癌。进一步地，特异性表达所述代谢型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为代谢型乳腺癌。本专利技术的另一方面提供上述乳腺癌分型基因群在制备乳腺癌分型检测试剂盒中的应用，其中，所述检测试剂盒包括扩增所述乳腺癌分型基因群的基因的引物。本专利技术的另一方面还提供了所述乳腺癌分型基因群在乳腺癌分型中的应用，所述基因群将乳腺癌分为间质型乳腺癌、增殖型乳腺癌和代谢型乳腺癌三种亚型，其中，特异性表达所述间质型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为间质型乳腺癌，特异性表达所述增殖型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为增殖型乳腺癌，特异性表达所述代谢型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为代谢型乳腺癌。本专利技术还提供了乳腺癌分型基因群在乳腺癌指导用药中的应用，所述基因群将乳腺癌分为间质型乳腺癌、增殖型乳腺癌和代谢型乳腺癌三种亚型，其中，特异性表达所述间质型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为间质型乳腺癌，特异性表达所述增殖型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为增殖型乳腺癌，特异性表达所述代谢型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为代谢型乳腺癌。进一步地，他莫昔芬适用于所述间质型乳腺癌的治疗。进一步地，紫杉醇适用于所述增殖型乳腺癌的治疗。进一步地，赫赛汀适用于HER2阳性的所述增殖型乳腺癌的治疗。进一步地，5-氟尿嘧啶适用于所述代谢型乳腺癌的治疗。本专利技术的有益效果本专利技术使用一组乳腺癌分型基因群，将乳腺癌分为间质型、增殖型和代谢型三种亚型，并且发现药物对三种亚型对治疗效果不同，找到对三种亚型有较好疗效对药物，从而实现精准治疗。本专利技术对乳腺癌分型基因群可用于制备乳腺癌分型检测试剂盒，对乳腺癌进行分型，用于临床的指导用药，在乳腺癌的治疗上具有重要的应用价值。附图说明图1显示本专利技术125个乳腺癌病人没有药物治疗的无复发生存率；图2显示62个乳腺癌病人采用他莫昔芬治疗的无复发生存率；图3显示327个乳腺癌病人对5-氟尿嘧啶治疗的5年总生存率；图4显示53个HER2阳性的乳腺癌病人对赫赛汀治疗的3年无复发生存率；图5显示47个HER2阳性的乳腺癌病人对赫赛汀的手术前新辅助治疗的病理完全缓解率。具体实施方式下面将结合本专利技术实施例对本专利技术的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。实施例一、乳腺癌基因分型本技术是通过检测乳腺癌的的基因表达来分为三种亚型：间质型、增殖型和代谢型。根据251个乳腺癌的病人的基因表达数据(GSE3494,昂飞HG-U133A检测平台)，我们采用基于聚类分析得到乳腺癌的病人的三种亚型：间质型、增殖型和代谢型。将其中一种类型的基因表达与另外两种类型进行比较，我们得到这三种类型的基因指纹谱。以间质型为例，该指纹谱的基因在间质型中的表达值显著高于其他两种亚型中的表达值(表达倍数FC>1.5,p<0.05)。表1列出了三种乳腺癌亚型的典型的基因指纹谱(60个基因)。表1乳腺癌分型基因群的60个基因表2A-F列出了对基因指纹谱进行信号通路的分析。表2A间质型乳腺癌的基因本体(Geneontology)通路分析间质型基因本体(Geneontology)GO:0007155～celladhesionGO:0030198～extracellularmatrixorganizationGO:0001525～angiogenesisGO:0002576～plateletdegranulationGO:0014068～positiveregulationofphosphatidylinositol3-kinasesignalingGO:0045766～positiveregulationofangiogenesisGO:0016525～negativeregulationofangiogenesisGO:0007517～muscleorgandevelopmentGO:0032355～responsetoestradiolGO:0007507～heartdevelopment表2B间质型乳腺癌的KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes)通路分析间质型KEGGhsa04510:Focaladhesionhsa04512:ECM-receptorinteractionhsa04610:Complementandcoagulationcascadeshsa04151:PI3K-Aktsignalingpathwayhsa05200:Pathwaysincancerhsa04923:Regulationoflipolysisinadipocyteshsa00982:Drugmetabolism-cytochromeP450hsa04974:Proteindigestionandabsorptionhsa04015:Rap1signalingpathwayhsa05144:Mala本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一组乳腺癌分型基因群，所述基因群包含间质型乳腺癌基因指纹谱、增殖型乳腺癌基因指纹谱和代谢型乳腺癌基因指纹谱，所述间质型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号1‑20所示的基因，所述增殖型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号21‑40所示的基因，所述代谢型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号41‑60所示的基因。

【技术特征摘要】
1.一组乳腺癌分型基因群，所述基因群包含间质型乳腺癌基因指纹谱、增殖型乳腺癌基因指纹谱和代谢型乳腺癌基因指纹谱，所述间质型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号1-20所示的基因，所述增殖型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号21-40所示的基因，所述代谢型乳腺癌基因指纹谱包含表1序号41-60所示的基因。2.根据权利要求1所述的乳腺癌分型基因群，其特征在于，特异性表达所述间质型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为间质型乳腺癌。3.根据权利要求1所述的乳腺癌分型基因群，其特征在于，特异性表达所述增殖型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为增殖型乳腺癌。4.根据权利要求1所述的乳腺癌分型基因群，其特征在于，特异性表达所述代谢型乳腺癌基因指纹谱的乳腺癌为代谢型乳腺癌。5.根据权利要求1所述的乳腺癌分型基因群在制备乳腺癌分型检测试剂盒中的应用，其中，所述检测试剂盒包括扩增所述乳腺癌分型基因群的基因的引物。6.根据权利要求1所述的乳腺癌分型基因群在乳腺癌分型中的应用，所述基因群将乳腺癌分为间质型乳腺癌、增殖型乳...

【专利技术属性】
技术研发人员：雷政登，
申请(专利权)人：福州大彻精准医学科技有限公司，
类型：发明
国别省市：福建,35