特异DNA分子及其作为启动子或分子标记的应用制造技术

本发明专利技术公开了特异DNA分子及其作为启动子或分子标记的应用。本发明专利技术首先保护一种特异DNA分子，为如下(a1)或(a2)或(a3)或(a4)：(a1)序列3第217‑2497位核苷酸所示的DNA分子；(a2)序列4自5’末端第217‑2498位核苷酸所示的DNA分子；(a3)序列3所示的DNA分子；(a4)序列4所示的DNA分子。本发明专利技术还保护所述特异DNA分子作为启动子的应用。本发明专利技术还保护所述特异DNA分子作为小麦籽粒性状的分子标记的应用。本发明专利技术提供了两种启动子，可用于启动目的基因的表达。本发明专利技术开发了与小麦籽粒性状相关的SNP位点。本发明专利技术对于选育具有不同籽粒性状的小麦具有极好的应用前景。

【技术实现步骤摘要】
特异DNA分子及其作为启动子或分子标记的应用
本专利技术涉及特异DNA分子及其作为启动子或分子标记的应用。
技术介绍
启动子是一段位于结构基因5’端上游区的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确地结合并具有转录起始的特异性。转录的起始是基因表达的关键阶段，而这一阶段重要的问题是RNA聚合酶与启动子的相互作用。研究发现，同一基因可能具有不同的启动子类型，启动子的结构直接影响其与RNA聚合酶的亲和力，从而影响目的基因的表达水平，进而影响基因的功能。小麦是我国重要的粮食作物之一，直接影响我国人民生活水平的高低和国家的粮食安全。提高小麦单产、使其高产稳产也一直是我国小麦育种家们长期追求的主要目标。因此，克隆小麦产量相关基因并进一步研究其调控序列(包括启动子)类型和活性，对于阐明启动子对产量基因的调控作用以及了解产量基因发挥功能的机制均具有重要的科学意义和实际应用价值。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供特异DNA分子及其作为启动子或分子标记的应用。本专利技术首先保护一种特异DNA分子，为如下(a1)或(a2)或(a3)或(a4)或(a5)或(a6)：(a1)序列表中序列3自5’末端第217-2497位核苷酸所示的DNA分子；(a2)序列表中序列4自5’末端第217-2498位核苷酸所示的DNA分子；(a3)序列表中序列3所示的DNA分子；(a4)序列表中序列4所示的DNA分子；(a5)在严格条件下与以上(a1)至(a4)中任一所述DNA分子杂交且具有相同功能的DNA分子；(a6)与以上(a1)至(a5)中任一所述DNA分子具有90％以上同源性且具有相同功能的DNA分子。上述严格条件可为用0.1×SSPE(或0.1×SSC)，0.1％SDS的溶液，在DNA或者RNA杂交实验中65℃下杂交并洗膜。本专利技术还保护所述特异DNA分子作为启动子的应用。本专利技术还保护所述特异DNA分子在启动目的基因表达中的应用。本专利技术还保护所述特异DNA分子作为分子标记在选育具有不同籽粒性状的小麦中的应用。所述小麦籽粒性状为小麦籽粒千粒重和/或小麦籽粒粒长。本专利技术还保护一种鉴别或辅助鉴别小麦籽粒性状的方法，包括如下步骤：检测待测小麦的基因型为P1纯合型、P1/P2杂合型还是P2纯合型；P1纯合型小麦的籽粒性状优于P2纯合型；所述籽粒性状优体现为千粒重高和/或粒长长。本专利技术还保护一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒千粒重的方法，包括如下步骤：检测待测小麦的基因型为P1纯合型、P1/P2杂合型还是P2纯合型；如果为P1纯合型、待测小麦候选为高千粒重小麦；如果为P2纯合型、待测小麦候选为低千粒重小麦；所述高千粒重小麦为籽粒千粒重≥35g的小麦；所述低千粒重小麦为籽粒千粒重＜35g的小麦。本专利技术还保护一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒粒长的方法，包括如下步骤：检测待测小麦的基因型为P1纯合型、P1/P2杂合型还是P2纯合型；如果为P1纯合型、待测小麦候选为长粒长小麦；如果为P2纯合型、待测小麦候选为短粒长小麦；所述长粒长小麦为籽粒粒长≥0.65mm的小麦；所述短粒长小麦为籽粒粒长＜0.65mm的小麦。所述P1纯合型指的是基因组DNA具有(b1)或(b2)且为纯合型；(b1)序列表中序列3自5’末端第217-2497位核苷酸所示的DNA分子；(b2)序列表中序列3所示的DNA分子；所述P2纯合型指的是基因组DNA具有(b3)或(b4)且为纯合型；(b3)序列表中序列4自5’末端第217-2498位核苷酸所示的DNA分子；(b4)序列表中序列4所示的DNA分子。本专利技术还保护一种鉴别或辅助鉴别小麦籽粒性状的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP409-410位点的基因型为TG型、杂合型还是TCG型；TG型小麦的籽粒性状优于TCG型小麦；所述籽粒性状优体现为千粒重高和/或粒长长。本专利技术还保护一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒千粒重的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP409-410位点的基因型为TG型、杂合型还是TCG型；如果为TG型、待测小麦候选为高千粒重小麦；如果为TCG型、待测小麦候选为低千粒重小麦；所述高千粒重小麦为籽粒千粒重≥35g的小麦；所述低千粒重小麦为籽粒千粒重＜35g的小麦。本专利技术还保护一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒粒长的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP409-410位点的基因型为TG型、杂合型还是TCG型；如果为TG型、待测小麦候选为长粒长小麦；如果为TCG型、待测小麦候选为短粒长小麦；所述长粒长小麦为籽粒粒长≥0.65mm的小麦；所述短粒长小麦为籽粒粒长＜0.65mm的小麦。所述SNP409-410位点为小麦基因组中序列表的序列3第409位核苷酸和第410位核苷酸。所述TG型指的是基因组DNA中序列表的序列3第409位核苷酸和第410位核苷酸依次为T和G且为纯合型。所述TCG型指的是基因组DNA中序列表的序列3第409位核苷酸T和第410位核苷酸G之间插入了一个核苷酸C且为纯合型。本专利技术还保护一种鉴别或辅助鉴别小麦籽粒性状的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP493位点的基因型为TT型、TC型还是CC型；TT型小麦的籽粒性状优于CC型小麦；所述籽粒性状优体现为千粒重高和/或粒长长。本专利技术还保护一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒千粒重的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP493位点的基因型为TT型、TC型还是CC型；如果为TT型、待测小麦候选为高千粒重小麦；如果为CC型、待测小麦候选为低千粒重小麦；所述高千粒重小麦为籽粒千粒重≥35g的小麦；所述低千粒重小麦为籽粒千粒重＜35g的小麦。本专利技术还保护一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒粒长的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP493位点的基因型为TT型、TC型还是CC型；如果为TT型、待测小麦候选为长粒长小麦；如果为CC型、待测小麦候选为短粒长小麦；所述长粒长小麦为籽粒粒长≥0.65mm的小麦；所述短粒长小麦为籽粒粒长＜0.65mm的小麦。所述SNP493位点为小麦基因组中序列表的序列7第1位核苷酸。本专利技术还保护一种鉴别或辅助鉴别小麦籽粒性状的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP1208位点的基因型为AA型、AG型还是GG型；AA型小麦的籽粒性状优于GG型小麦；所述籽粒性状优体现为千粒重高和/或粒长长。本专利技术还保护一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒千粒重的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP1208位点的基因型为AA型、AG型还是GG型；如果为AA型、待测小麦候选为高千粒重小麦；如果为GG型、待测小麦候选为低千粒重小麦；所述高千粒重小麦为籽粒千粒重≥35g的小麦；所述低千粒重小麦为籽粒千粒重＜35g的小麦。本专利技术还保护一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒粒长的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP1208位点的基因型为AA型、AG型还是GG型；如果为AA型、待测小麦候选为长粒长小麦；如果为GG型、待测小麦候选为短粒长小麦；所述长粒长小麦为籽粒粒长≥0.65mm的小麦；所述短粒长小麦为籽粒粒长＜0.65mm的小麦。所述SNP1208位点为小麦基因组中序列表的序列7第716位核苷酸。本专利技术还保护一种鉴别或辅助鉴别小麦籽粒性状的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP1708位点的基因型为T本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种DNA分子，为如下(a1)或(a2)或(a3)或(a4)或(a5)或(a6)：(a1)序列表中序列3自5’末端第217‑2497位核苷酸所示的DNA分子；(a2)序列表中序列4自5’末端第217‑2498位核苷酸所示的DNA分子；(a3)序列表中序列3所示的DNA分子；(a4)序列表中序列4所示的DNA分子；(a5)在严格条件下与以上(a1)至(a4)中任一所述DNA分子杂交且具有相同功能的DNA分子；(a6)与以上(a1)至(a5)中任一所述DNA分子具有90％以上同源性且具有相同功能的DNA分子。

【技术特征摘要】
1.一种DNA分子，为如下(a1)或(a2)或(a3)或(a4)或(a5)或(a6)：(a1)序列表中序列3自5’末端第217-2497位核苷酸所示的DNA分子；(a2)序列表中序列4自5’末端第217-2498位核苷酸所示的DNA分子；(a3)序列表中序列3所示的DNA分子；(a4)序列表中序列4所示的DNA分子；(a5)在严格条件下与以上(a1)至(a4)中任一所述DNA分子杂交且具有相同功能的DNA分子；(a6)与以上(a1)至(a5)中任一所述DNA分子具有90％以上同源性且具有相同功能的DNA分子。2.权利要求1所述DNA分子作为启动子的应用。3.权利要求2所述DNA分子在启动目的基因表达中的应用。4.权利要求1所述DNA分子作为分子标记在选育具有不同籽粒性状小麦中的应用。5.方法甲-Ⅰ或方法甲-Ⅱ或方法甲-Ⅲ；所述方法甲-Ⅰ为一种鉴别或辅助鉴别小麦籽粒性状的方法，包括如下步骤：检测待测小麦的基因型为P1纯合型、P1/P2杂合型还是P2纯合型；P1纯合型小麦的籽粒性状优于P2纯合型；所述籽粒性状优体现为千粒重高和/或粒长长；所述方法甲-Ⅱ为一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒千粒重的方法，包括如下步骤：检测待测小麦的基因型为P1纯合型、P1/P2杂合型还是P2纯合型；如果为P1纯合型、待测小麦候选为高千粒重小麦；如果为P2纯合型、待测小麦候选为低千粒重小麦；所述高千粒重小麦为籽粒千粒重≥35g的小麦；所述低千粒重小麦为籽粒千粒重＜35g的小麦；所述方法甲-Ⅲ为一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒粒长的方法，包括如下步骤：检测待测小麦的基因型为P1纯合型、P1/P2杂合型还是P2纯合型；如果为P1纯合型、待测小麦候选为长粒长小麦；如果为P2纯合型、待测小麦候选为短粒长小麦；所述长粒长小麦为籽粒粒长≥0.65mm的小麦；所述短粒长小麦为籽粒粒长＜0.65mm的小麦；所述P1纯合型指的是基因组DNA具有(b1)或(b2)且为纯合型；(b1)序列表中序列3自5’末端第217-2497位核苷酸所示的DNA分子；(b2)序列表中序列3所示的DNA分子；所述P2纯合型指的是基因组DNA具有(b3)或(b4)且为纯合型；(b3)序列表中序列4自5’末端第217-2498位核苷酸所示的DNA分子；(b4)序列表中序列4所示的DNA分子。6.方法乙-Ⅰ或方法乙-Ⅱ或方法乙-Ⅲ；所述方法乙-Ⅰ为一种鉴别或辅助鉴别小麦籽粒性状的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP409-410位点的基因型为TG型、杂合型还是TCG型；TG型小麦的籽粒性状优于TCG型小麦；所述籽粒性状优体现为千粒重高和/或粒长长；所述方法乙-Ⅱ为一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒千粒重的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP409-410位点的基因型为TG型、杂合型还是TCG型；如果为TG型、待测小麦候选为高千粒重小麦；如果为TCG型、待测小麦候选为低千粒重小麦；所述高千粒重小麦为籽粒千粒重≥35g的小麦；所述低千粒重小麦为籽粒千粒重＜35g的小麦；所述方法乙-Ⅲ为一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒粒长的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP409-410位点的基因型为TG型、杂合型还是TCG型；如果为TG型、待测小麦候选为长粒长小麦；如果为TCG型、待测小麦候选为短粒长小麦；所述长粒长小麦为籽粒粒长≥0.65mm的小麦；所述短粒长小麦为籽粒粒长＜0.65mm的小麦；所述SNP409-410位点为小麦基因组中序列表的序列3第409位核苷酸和第410位核苷酸；所述TG型指的是基因组DNA中序列表的序列3第409位核苷酸和第410位核苷酸依次为T和G且为纯合型；所述TCG型指的是基因组DNA中序列表的序列3第409位核苷酸T和第410位核苷酸G之间插入了一个核苷酸C且为纯合型。7.方法丙-Ⅰ或方法丙-Ⅱ或方法丙-Ⅲ；所述方法乙-Ⅰ为一种鉴别或辅助鉴别小麦籽粒性状的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于SNP493位点的基因型为TT型、TC型还是CC型；TT型小麦的籽粒性状优于CC型小麦；所述籽粒性状优体现为千粒重高和/或粒长长；所述方法乙-Ⅱ为一种鉴定或辅助鉴定小麦籽粒千粒重的方法...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘红霞，张学勇，郝晨阳，李甜，
申请(专利权)人：中国农业科学院作物科学研究所，
类型：发明
国别省市：北京,11