一种检测药物基因组学基因型的引物组、试剂盒及指导个性化用药的检测方法技术

本发明专利技术涉及精准医学领域，具体而言，涉及一种检测药物基因组学基因型的引物组、试剂盒及指导个性化用药的检测方法。一种检测药物基因组学基因型的引物组，包括390个引物；所述390个引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：1‑390所示。本发明专利技术提供的检测药物基因组学基因型的引物组，经过大量筛选和分析，最后对77个基因，219个位点，进行引物设计，得到的上述引物组，该引物组能同时实现对160种药物在不同个体当中使用的安全性、有效性及毒副作用进行检测，节约了成本，提高了检测效率，经过多次试验论证，能够准确的检测目的基因，并能稳定准确的分析出对药物的反应情况，更好的满足临床需要。

Primer group, kit for detecting genotyping of genomics and detection method for individualized medication

The invention relates to the field of precision medicine, in particular, a primer group, a kit for detecting the genotyping of pharmacogenomics, a kit and a method for the detection of individualized drug use. A primer group for detecting genotyping of pharmacogenomics includes 390 primers, and the nucleotide sequences of the 390 primers are shown as SEQ ID NO:1 390. The primer group of the genomics genotyping provided by the present invention has been screened and analyzed, and the primers are designed for 77 genes and 219 loci, and the primer group can simultaneously detect the safety, efficacy and side effects of the 160 drugs in different individuals. It saves the cost and improves the detection efficiency. After many experiments, it can accurately detect the target gene, and can analyze the reaction of the drugs steadily and accurately, and better meet the clinical needs.

【技术实现步骤摘要】
一种检测药物基因组学基因型的引物组、试剂盒及指导个性化用药的检测方法
本专利技术涉及个体化用药基因检测领域，具体而言，涉及一种检测药物基因组学基因型的引物组、试剂盒及指导个体化用药的检测方法。
技术介绍
药物基因组学(Pharmacogenomics,PGx)是研究基因变异所致的不同疾病对药物的不同反应的学科，其主要研究内容为基因组或基因变异对药物在人体内吸收、代谢、疗效及不良反应产生影响的现象及其机制。2016年7月临床药理学实施联盟(CPIC)在GeneticsinMedicine杂志上发表文献，将药物基因组学相关基因分为三大类：药物代谢酶类(CYP家族，UGT1A1，DPYD和TPMT)，药物转运体(如SLCO1B1)，高风险基因型(如HLA-B)。药物体内代谢、转运及药物作用靶点基因的遗传变异及其表达水平的变化可通过影响药物的体内浓度和敏感性，导致药物反应性个体差异。近年来随着人类基因组学的发展，药物基因组学领域得到了迅猛发展，越来越多的药物基因组生物标记物及其检测方法相继涌现。药物基因组学已成为指导临床个体化用药、评估严重药物不良反应发生风险、指导新药研发和评价新药的重要工具，部分上市的新药仅限于特定基因型的适应症患者。美国FDA已批准在140余种药物的药品标签中增加药物基因组信息，涉及的药物基因组生物标记物42个。此外，部分行业指南也将部分非FDA批准的生物标记物及其特性(如MGMT基因甲基化)的检测列入疾病的治疗指南。药物反应相关基因及其表达产物的分子检测是实施个体化药物治疗的前提。药理学与遗传学结合的关键环节包括药物代谢动力学(pharmacokinetics，PK)和药物效应动力学(pharmacodynamics，PD)两方面。药物代谢动力学主要是定量研究药物在生物体内吸收、分布、代谢和排泄规律，侧重于阐明药物的体内过程；药物效应动力学主要研究药物对机体的作用、作用规律及作用机制，其内容包括药物与作用靶位之间相互作用所引起的生化、生理学和形态学变化，侧重于解释药物如何与作用靶点发生作用。对药物代谢酶和药物靶点基因进行检测可指导临床针对特定的患者选择合适的药物和给药剂量，实现个体化用药，从而提高药物治疗的有效性和安全性，防止严重药物不良反应的发生。目前对药物基因组学的检测只是基于单位点，只能检测单药。如果想要检测多个位点，只能进行多个试验检测，不仅成本高，而且周期长，不能满足临床需要。有鉴于此，特提出本专利技术。
技术实现思路
本专利技术的第一目的在于提供一种检测药物基因组学基因型的引物组，该引物组是根据现有个体化用药相关基因的多个位点，经分析后，设计得到，能同时进行多个基因位点的检测，大大缩短检测周期，更好的满足临床需要。本专利技术的第二目的在于提供一种药物基因组学基因型检测试剂盒，为个体化用药基因的检测提供便利。本专利技术的第三目的在于提供一种指导个体化用药的检测方法，同时检测77个基因，219个位点，对160种药物在不同个体当中使用的安全性、有效性及毒副作用进行评估，节约了成本，提高了检测效率，经过多次试验论证，能够准确的检测目的基因，并能稳定准确的分析出对药物的综合用药评估信息。为了实现本专利技术的上述目的，特采用以下技术方案：一种检测药物基因组学基因型的引物组，包括390个引物；所述390个引物的核苷酸序列如SEQIDNO：1-390所示。本专利技术提供的检测药物基因组学基因型的引物组，经过大量筛选和分析，最后对77个基因，219个位点，进行引物设计，得到的上述引物组，该引物组能同时实现对160种药物在不同个体当中使用的安全性、有效性及毒副作用进行检测，其所检测的位点基本覆盖了主要的药物代谢酶和药物转运体，随着更多的研究的开展，新的知识的出现，同样的检测位点，可以分析更多药物。本专利技术提供的检测药物基因组学基因型的方法极大地节约了成本，提高了检测效率，经过多次试验论证，能够准确的检测目的基因，并能稳定准确的分析出对药物的吸收代谢能力情况，更好的满足临床需要。本专利技术还提供了一种药物基因组学基因型检测试剂盒，含有上述的引物组。本专利技术提供的药物基因组学基因型检测试剂盒，为个体化用药基因的检测提供便利。进一步地，所述药物基因组学基因型检测试剂盒还包括增强子、dNTPs、缓冲液、酶、核酸纯化试剂、磁力架中的任一种或多种。进一步地，所述药物基因组学基因型测试剂盒还包括IGT-I5和/或IGT-I7,IGT-I5的核酸序列如SEQIDNO：391所示，IGT-I7的核酸序列如SEQIDNO：392所示。这两个核酸序列用于将目标序列进行进一步扩增。本专利技术还提供了一种指导个体化用药的检测方法，包括以下步骤：待检测样本采用上述的引物组以及上述的IGT-I5和IGT-I7进行多重PCR反应，进行文库的构建；得到的所述文库测序；对测序的结果进行分析，得到所述待检测样本的个体化用药信息。本专利技术提供的指导个体化用药的检测方法，先构建文库，根据文库的测序情况，分析得到待检测样本的个体化用药信息，方法简便易行，能够同时检测77个基因，219个位点，对160种药物在不同个体当中使用的安全性、有效性及毒副作用进行评估，节约了成本，提高了检测效率，经过多次试验论证，能够准确的检测目的基因。进一步地，所述待检测样本为唾液gDNA或血液gDNA。进一步地，DNA在反应体系中的浓度为2ng/μl以上。进一步地，待检测样本采用上述的引物组进行PCR反应，得到的产物进行纯化；纯化的产物以IGT-I5和IGT-I7进行PCR反应，纯化，得到文库。优选地，所述纯化采用磁珠方法纯化。进一步地，待检测样本采用上述的引物组进行PCR反应时，所述引物组分为两组，T1引物池为SEQIDNO：1-195所示，T2引物池为SEQIDNO：196-390所示，两个引物组的反应体系均为25μl，反应完成后，两者按照16.5μl和13.5μl的体积合并，然后进行纯化。该反应体系中的各组分按照常规的反应添加相应的组分即可。进一步地，构建的文库的靶片段分布区间在280bp-420bp之间，主峰在380bp左右，无杂峰。与现有技术相比，本专利技术的有益效果为：(1)本专利技术提供的引物组，同时检测77个基因，219个位点，对160种药物在不同个体当中使用的安全性、有效性及毒副作用进行评估，节约了成本，提高了检测效率。(2)本专利技术通过这219个位点的基因检测信息对160种药物的个体化用药情况进行评估，受检者一次检测，终身受益。(3)本专利技术提供的指导个体化用药的检测方法，通过高通量测序技术实现，一次检测后进行软件分析即可完成，大大缩短了时间了，降低了成本。附图说明为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，以下将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍。图1为本专利技术实施例2中提供的文库构建的过程示意图。具体实施方式下面将结合实施例对本专利技术的实施方案进行详细描述，但是本领域技术人员将会理解，下列实施例仅用于说明本专利技术，而不应视为限制本专利技术的范围。实施例中未注明具体条件者，按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市售购买获得的常规产品。实施例1一、查询资料1.各大指南：CPIC，DPWG，FDA，CFDA等相关权威平台给出关于本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种检测药物基因组学基因型的引物组，其特征在于，包括390个引物；所述390个引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：1‑390所示。

【技术特征摘要】
1.一种检测药物基因组学基因型的引物组，其特征在于，包括390个引物；所述390个引物的核苷酸序列如SEQIDNO：1-390所示。2.一种药物基因组学基因型检测试剂盒，其特征在于，含有权利要求1所述的引物组。3.根据权利要求2所述的药物基因组学基因型检测试剂盒，其特征在于，所述药物基因组学基因型检测试剂盒还包括增强子、dNTPs、缓冲液、酶、核酸纯化试剂中的任一种或多种。4.根据权利要求2或3所述的药物基因组学基因型检测试剂盒，其特征在于，所述药物基因组学基因型检测试剂盒还包括IGT-I5和/或IGT-I7,IGT-I5的核酸序列如SEQIDNO：391所示，IGT-I7的核酸序列如SEQIDNO：392所示。5.一种指导个体化用药的检测方法，其特征在于，包括以下步骤：待检测样本采用权利要求1所述的引物组以及权利要求4的IGT-I5和IGT-I7进行多重PCR反应，进行文库的构建；得到的所述文库测序；对测序的结果进行分析，得到所述待检测样本的个体化用药相关基因的基因型及个体化用药信...

【专利技术属性】
技术研发人员：不公告发明人，
申请(专利权)人：为朔医学数据科技北京有限公司，
类型：发明
国别省市：北京,11