获取磁珠识别阈值的方法和系统、识别磁珠的方法和系统技术方案

技术编号:17656403 阅读:34 留言:0更新日期:2018-04-08 09:15
本发明专利技术涉及高通量基因测序领域,提供了一种获取磁珠识别阈值的方法和系统,一种识别磁珠的方法和系统。本发明专利技术通过根据预设阈值将高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点分成两类,然后分别计算这两类中所有像素点信号值的平均值,基于这两类的平均值的平均值重新进行分类,然后通过判断更新步骤所得任一像素点集的像素点均值与均值计算步骤所得相同像素点集的像素点均值的差值是否在预设区间内,从而确定所得分类是否恰当,然后最终获得磁珠识别阈值;本发明专利技术能够准确的获得高通量基因测序图像的磁珠识别阈值,进而能够准确的识别出高通量基因测序图像中的磁珠。

【技术实现步骤摘要】
获取磁珠识别阈值的方法和系统、识别磁珠的方法和系统
本专利技术涉及高通量基因测序领域,更具体地说,涉及一种获取磁珠识别阈值的方法和系统,一种识别磁珠的方法和系统。
技术介绍
对高通量基因测序图像中的磁珠进行识别是高通量基因测序结果获得过程中的一个重要步骤,识别结果的好坏直接关系到高通量基因测序结果的质量。现有技术中,操作者往往是通过经验来确定磁珠识别阈值,然后通过该磁珠识别阈值对高通量基因测序图像进行磁珠识别,但是高通量基因测序图像受样品制备的情况、拍摄时的条件、设备的运转状态影响,经验值经常需要调整;另外,经验值判断又受人的影响;因此,现有技术的方案适用性较差,又不准确,主观因素影响很大。因此需要一种新的能够准确的获取磁珠识别阈值的方法和系统。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种能够快速准确的获取磁珠识别阈值的方法和系统,旨在解决现有技术中的方案不准确的技术问题。为了实现专利技术目的,一种获取磁珠识别阈值的方法,包括以下步骤:均值计算步骤,根据预设阈值将高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点分别归类至磁珠像素点集和背景像素点集,然后计算磁珠像素点集中所有像素点信号值的平均值,得磁珠像素点均值,计算背景像素点集中所有像素点信号值的平均值,得背景像素点均值;更新步骤,令磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值为预设阈值,重复均值计算步骤一次;判断步骤,判断更新步骤所得任一像素点集的像素点均值与均值计算步骤所得相同像素点集的像素点均值的差值是否在预设区间内,若是,则进入磁珠识别阈值获得步骤;磁珠识别阈值获得步骤,计算更新步骤所得磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值作为磁珠识别阈值。其中,所述判断步骤,判断最新一次均值计算步骤所得任一像素点集的像素点均值与上一次均值计算步骤所得相同像素点集的像素点均值的差值是否在预设区间内,若是,则进入磁珠识别阈值获得步骤;若否,则进入更新步骤;所述磁珠识别阈值获得步骤,计算最后一次更新步骤所得磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值作为磁珠识别阈值。其中,所述方法还包括:预设阈值获得步骤,对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序,然后计算排序后位于第一位置的像素点信号值和位于第二位置的像素点信号值的平均值作为预设阈值;或对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序,然后计算排序后位于第一范围内的像素点信号值的平均值,得第一范围像素点均值,计算排序后位于第二范围内的像素点信号值的平均值,得第二范围像素点均值,以第一范围像素点均值和第二范围像素点均值的平均值为预设阈值。其中,所述方法还包括:验证步骤,验证均值计算步骤的结果,若均值计算步骤能够获得磁珠像素点均值和背景像素点均值,则进入更新步骤,否则,在进入预设阈值获得步骤获得预设阈值后,重新进入均值计算步骤;预设阈值获得步骤,对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序,然后计算排序后位于第一位置的像素点信号值和位于第二位置的像素点信号值的平均值作为预设阈值;或对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序;然后计算排序后位于第一范围内的像素点信号值的平均值,得第一范围像素点均值,计算排序后位于第二范围内的像素点信号值的平均值,得第二范围像素点均值;以第一范围像素点均值和第二范围像素点均值的平均值为预设阈值。其中,所述预设区域为高通量基因测序图像中的正中矩形区域。其中,所述预设阈值在1000至2000之间。其中,所述预设区间为-2至2。其中,所述高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点数量为M,M大于10;所述排序为由大到小排列;所述第一位置为第a个像素点;所述第二位置为第b个像素点;所述第一范围为第1至c位;所述第二范围为第d位至M位;所述a=int(10%×M);所述b=int(90%×M),所述c=int(15%×M);所述d=int(85%×M)。为了更好地实现专利技术目的,本专利技术还提供了一种获取磁珠识别阈值的系统,包括:均值计算模块,用于根据预设阈值将高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点分别归类至磁珠像素点集和背景像素点集,然后计算磁珠像素点集中所有像素点信号值的平均值,得磁珠像素点均值,计算背景像素点集中所有像素点信号值的平均值,得背景像素点均值;更新模块,用于令磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值为预设阈值,发出指令使均值计算模块工作;判断模块,用于判断更新模块所得任一像素点集的像素点均值与均值计算模块所得相同像素点集的像素点均值的差值是否在预设区间内,若是,则发出指令使磁珠识别阈值获得模块工作;磁珠识别阈值获得模块,用于计算更新模块所得磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值作为磁珠识别阈值。其中,所述判断模块,用于判断均值计算模块最新一次计算所得任一像素点集的像素点均值与均值计算模块上一次计算所得相同像素点集的像素点均值的差值是否在预设区间内,若是,则发出指令使磁珠识别阈值获得模块工作;若否,则发出指令,使更新模块开始工作;磁珠识别阈值获得模块,计算更新模块最后一次所得磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值作为磁珠识别阈值。其中,所述系统还包括:预设阈值获得模块,用于对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序,然后计算排序后位于第一位置的像素点信号值和位于第二位置的像素点信号值的平均值作为预设阈值;或用于对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序,然后计算排序后位于第一范围内的像素点信号值的平均值,得第一范围像素点均值,计算排序后位于第二范围内的像素点信号值的平均值,得第二范围像素点均值,以第一范围像素点均值和第二范围像素点均值的平均值为预设阈值。其中,所述系统还包括:验证模块,用于验证均值计算模块的工作结果,若均值计算模块能够获得磁珠像素点均值和背景像素点均值,则发出指令使更新模块开始工作,否则,发出指令使预设阈值获得模块开始工作;预设阈值获得模块,用于对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序,然后计算排序后位于第一位置的像素点信号值和位于第二位置的像素点信号值的平均值作为预设阈值,发出指令使均值计算模块开始工作;或用于对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序;然后计算排序后位于第一范围内的像素点信号值的平均值,得第一范围像素点均值,计算排序后位于第二范围内的像素点信号值的平均值,得第二范围像素点均值;以第一范围像素点均值和第二范围像素点均值的平均值为预设阈值,发出指令使均值计算模块开始工作。其中,所述预设区域为高通量基因测序图像中的正中矩形区域。其中,所述预设阈值在1000至2000之间。其中,所述预设区间为-10至10。其中,所述高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点数量为M,M大于10;所述排序为由大到小排列;所述第一位置为第a个像素点;所述第二位置为第b个像素点;所述第一范围为第1至c位;所述第二范围为第d位至M位;所述a=int(10%×M);所述b=int(90%×M),所述c=int(15%×M);所述d=int(85%×M)。本专利技术的另一个目的在于提供一种能够准确的识别磁珠的方法和系统,旨在解决现有技术中本文档来自技高网...
获取磁珠识别阈值的方法和系统、识别磁珠的方法和系统

【技术保护点】
一种获取磁珠识别阈值的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:均值计算步骤,根据预设阈值将高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点分别归类至磁珠像素点集和背景像素点集,然后计算磁珠像素点集中所有像素点信号值的平均值,得磁珠像素点均值,计算背景像素点集中所有像素点信号值的平均值,得背景像素点均值;更新步骤,令磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值为预设阈值,重复均值计算步骤一次;判断步骤,判断更新步骤所得任一像素点集的像素点均值与均值计算步骤所得相同像素点集的像素点均值的差值是否在预设区间内,若是,则进入磁珠识别阈值获得步骤;磁珠识别阈值获得步骤,计算更新步骤所得磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值作为磁珠识别阈值。

【技术特征摘要】
1.一种获取磁珠识别阈值的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:均值计算步骤,根据预设阈值将高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点分别归类至磁珠像素点集和背景像素点集,然后计算磁珠像素点集中所有像素点信号值的平均值,得磁珠像素点均值,计算背景像素点集中所有像素点信号值的平均值,得背景像素点均值;更新步骤,令磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值为预设阈值,重复均值计算步骤一次;判断步骤,判断更新步骤所得任一像素点集的像素点均值与均值计算步骤所得相同像素点集的像素点均值的差值是否在预设区间内,若是,则进入磁珠识别阈值获得步骤;磁珠识别阈值获得步骤,计算更新步骤所得磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值作为磁珠识别阈值。2.根据权利要求1所述的获取磁珠识别阈值的方法,其特征在于,所述判断步骤,判断最新一次均值计算步骤所得任一像素点集的像素点均值与上一次均值计算步骤所得相同像素点集的像素点均值的差值是否在预设区间内,若是,则进入磁珠识别阈值获得步骤;若否,则进入更新步骤;所述磁珠识别阈值获得步骤,计算最后一次更新步骤所得磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值作为磁珠识别阈值。3.根据权利要求1所述的获取磁珠识别阈值的方法,其特征在于,所述方法还包括:预设阈值获得步骤,对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序,然后计算排序后位于第一位置的像素点信号值和位于第二位置的像素点信号值的平均值作为预设阈值;或对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序,然后计算排序后位于第一范围内的像素点信号值的平均值,得第一范围像素点均值,计算排序后位于第二范围内的像素点信号值的平均值,得第二范围像素点均值,以第一范围像素点均值和第二范围像素点均值的平均值为预设阈值。4.根据权利要求1所述的获取磁珠识别阈值的方法,其特征在于,所述方法还包括:验证步骤,验证均值计算步骤的结果,若均值计算步骤能够获得磁珠像素点均值和背景像素点均值,则进入更新步骤,否则,在进入预设阈值获得步骤获得预设阈值后,重新进入均值计算步骤;预设阈值获得步骤,对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序,然后计算排序后位于第一位置的像素点信号值和位于第二位置的像素点信号值的平均值作为预设阈值;或对高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点按信号值大小进行排序;然后计算排序后位于第一范围内的像素点信号值的平均值,得第一范围像素点均值,计算排序后位于第二范围内的像素点信号值的平均值,得第二范围像素点均值;以第一范围像素点均值和第二范围像素点均值的平均值为预设阈值。5.根据权利要求1所述的获取磁珠识别阈值的方法,其特征在于,所述预设区域为高通量基因测序图像中的正中矩形区域。6.根据权利要求1所述的获取磁珠识别阈值的方法,其特征在于,所述预设阈值在1000至2000之间;所述预设区间为-2至2。7.根据权利要求3或4所述的获取磁珠识别阈值的方法,其特征在于,所述高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点数量为M,M大于10;所述排序为由大到小排列;所述第一位置为第a个像素点;所述第二位置为第b个像素点;所述第一范围为第1至c位;所述第二范围为第d位至M位;所述a=int(10%×M);所述b=int(90%×M),所述c=int(15%×M);所述d=int(85%×M)。8.一种获取磁珠识别阈值的系统,其特征在于,所述系统包括:均值计算模块,用于根据预设阈值将高通量基因测序图像的预设区域中的所有像素点分别归类至磁珠像素点集和背景像素点集,然后计算磁珠像素点集中所有像素点信号值的平均值,得磁珠像素点均值,计算背景像素点集中所有像素点信号值的平均值,得背景像素点均值;更新模块,用于令磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值为预设阈值,发出指令使均值计算模块工作;判断模块,用于判断更新模块所得任一像素点集的像素点均值与均值计算模块所得相同像素点集的像素点均值的差值是否在预设区间内,若是,则发出指令使磁珠识别阈值获得模块工作;磁珠识别阈值获得模块,用于计算更新模块所得磁珠像素点均值和背景像素点均值的平均值作为磁珠识别阈值。9.根据权利要求8所述的获取磁珠识别阈值的系统,其特征在于,所述判断模块,...

【专利技术属性】
技术研发人员:盛司潼冀高
申请(专利权)人:广州康昕瑞基因健康科技有限公司
类型:发明
国别省市:广东,44

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