核酸、包含该核酸的探针以及利用该探针的筛选方法技术

包含以下（ａ）或（ｂ）的核酸： （ａ）包含序列表中Ｎｏ．１序列的１－３９７２６位碱基序列所示的碱基序列的核酸，或者 （ｂ）其中１－３９７２６位碱基序列的部分碱基序列缺失、置换或添加，并具有８０％的碱基序列同源性的核酸。（*该技术在2022年保护过期，可自由使用*）

【技术实现步骤摘要】

技术介绍
1.专利
本专利技术涉及核酸、探针以及利用该探针的筛选方法，更具体而言，本专利技术涉及核酸、包含该核酸的探针以及利用该探针进行基因诊断的筛选方法。2.相关技术描述对于在染色体上定位人基因组以制作染色体图谱的基因定位方法，普遍实行利用人和啮齿类动物之间体细胞杂交或者染色体部分缺失的克隆图，分析其余的人特定染色体或者染色体的一部分的方法，以及将克隆基因用作Southern印迹探针的方法。近来，利用所谓原位杂交，将从基因组DNA克隆并标记的基因或DNA标志用作探针，在玻片上的染色体样本中直接形成分子杂交物，检测存在基因的部分，以便有效获得有关许多基因(例如人基因)的特定位置以及序列相互顺序的信息。对于原位杂交，一种方法是利用放射性同位素(主要为3H)标记DNA作为探针，通过放射自显影检测其位点，以及利用荧光显微镜检测标记DNA探针的荧光信号的方法。后者荧光原位杂交方法(以下记作FISH方法)的优点在于，不使用RI设备，操作程序简单，短时间内(2天)在染色体带上精确进行细微定位。目前，利用这些方法开发了可用于多种疾病/综合症的探针，进行临床诊断。例如，已知一种适用于多种染色体FISH方法的检查探针，针对具有微缺失的先天性畸形综合症。该探针检查靶疾病的基因，如果检查结果是阳性(即存在缺失等)，则作出确诊。例如，上述探针对普-威(Prader Willi)综合症有效，因为大约60％的患者带有缺失。如上所述，已经在该疾病基因的部分克隆中找到有用的探针。然而，还有自发性疾病，除疾病的身体表现和症状以外，尚未发现对其有效的检查和诊断方法。如果能够利用引起疾病的基因和/或同系物发现探针，其在基因诊断领域会很有益处。专利技术概述因此，本专利技术目的在于提供核酸、利用该核酸的有用探针以及利用该探针的筛选方法。为达此目的，本专利技术人对有关先天性畸形综合症和基因的关系进行了多种研究，找到了探针以及利用本专利技术这种探针的筛选方法。根据本专利技术的第一方面，该核酸是(a)包含序列表中No.1序列的1-39726位碱基序列所示的碱基序列的核酸，或者(b)其中1-39726位碱基序列的部分碱基序列缺失、置换或者添加，并具有80％碱基序列同源性的核酸。此外，根据本专利技术的第二方面，核酸是(a)包含序列表中No.2序列1-8511位碱基序列所示的碱基序列的核酸，或者(b)其中1-8511位碱基序列的部分碱基序列缺失、置换或者添加，并具有80％碱基序列同源性的核酸。根据本专利技术的第三方面，该探针包含本专利技术的第一或第二方面定义的核酸。在优选实施方案中，本专利技术的探针用于诊断索托斯综合症(Sotossyndrome)。根据本专利技术的第四方面，该肽片段是(a)包含序列表中No.3序列的1-309位氨基酸序列所示的氨基酸序列的肽片段，或者(b)其中No.3序列所示的部分氨基酸序列缺失、置换或者添加，并具有80％碱基序列同源性的肽片段。根据本专利技术的第五方面，该肽片段是(a)包含序列表中No.4序列1-2696位氨基酸序列所示的氨基酸序列的肽片段，或者(b)其中No.4序列所示的部分氨基酸序列缺失、置换或者添加，并具有80％的碱基序列同源性的肽片段。根据本专利技术的第六方面，该探针包含本专利技术的第四或第五方面定义的肽片段。根据本专利技术，用于诊断索托斯综合症的探针，其特征在于，该探针包含人染色体5上的以下(a)或(b)(a)包含序列表中No.5序列的1-190位碱基序列所示的碱基序列的核酸，或者(b)其中1-190位碱基序列的部分碱基序列缺失、置换或添加，并具有80％的碱基序列同源性的核酸。根据本专利技术，用于诊断索托斯综合症的探针，其特征在于，该探针包含人染色体5上的下列(a)或(b)(a)包含序列表中No.6序列的1-275位碱基序列所示的碱基序列的核酸，或者(b)其中1-275位碱基序列的部分碱基序列缺失、置换或添加，并具有80％的碱基序列同源性的核酸。根据本专利技术，用于诊断索托斯综合症的探针，其特征在于，该探针包含人染色体5上的下列(a)和(b)之间的任何序列(a)包含序列表中No.5序列的1-190位碱基序列所示的碱基序列的核酸，以及(b)其中序列表中No.6序列的1-275位碱基序列的部分碱基序列的核酸。根据本专利技术的第七方面，该筛选方法特征在于，利用本专利技术的第三、第四或第七至第十方面定义的探针。根据本专利技术，在该筛选方法的优选实施方案中，利用至少一种选自原位杂交方法、Southern印迹方法、基于巨阵列(macroarray)的杂交方法以及碱基序列测定方法(双脱氧链终止方法等)中的方法进行筛选。根据本专利技术，在该筛选方法的优选实施方案中，该原位杂交方法为荧光原位杂交方法。附图简述本专利技术将参考附图进行描述，其中附图说明图1显示物理图谱；图2显示NSD1的各种突变；图3显示一名患者的永生化成淋巴细胞系的直接序列测定结果；图4显示FISH分析结果；图5a显示序列表1的碱基序列；图5b是显示序列表1碱基序列的图5a的续图；图5c是显示序列表1碱基序列的图5b的续图；图5d是显示序列表1碱基序列的图5c的续图；图5e是显示序列表1碱基序列的图5d的续图；图5f是显示序列表1碱基序列的图5e的续图；图5g是显示序列表1碱基序列的图5f的续图；图5h是显示序列表1碱基序列的图5g的续图；图5i是显示序列表1碱基序列的图5h的续图；图5j是显示序列表1碱基序列的图5i的续图；图5k是显示序列表1碱基序列的图5j的续图；图5l是显示序列表1碱基序列的图5k的续图；图5m是显示序列表1碱基序列的图51的续图；图5n是显示序列表1碱基序列的图5m的续图；图6a显示序列表2的碱基序列；图6b是显示序列表2碱基序列的图6a的续图；图6c是显示序列表2碱基序列的图6b的续图；图6d是显示序列表2碱基序列的图6c的续图；图6e是显示序列表2碱基序列的图6d的续图；图7a显示序列表4的氨基酸序列；图7b是显示序列表4氨基酸序列的图7b的续图；图8显示序列表5的碱基序列；以及图9显示序列表6的碱基序列。专利技术详述首先阐述本专利技术的核酸。本专利技术的核酸是(a)包含序列表中No.1序列的1-39726位碱基序列所示的碱基序列的核酸，或者(b)其中1-39726位碱基序列的部分碱基序列缺失、置换或者添加，并具有80％、优选90％、更优选95％碱基序列同源性的核酸。这样的核酸来源于人的染色体5的NSD1，并与NSD1的一部分互补。具体而言，该核酸与包含NSD1的外显子1、外显子2和内含子的基因组DNA互补。本专利技术的核酸也包括其中碱基序列1-39726位的部分碱基序列缺失、置换或添加，并具有80％、优选90％、更优选95％碱基序列同源性的核酸。即使该部分缺失、置换或添加，如下所述后者的核酸也可用作探针。此外，本专利技术的核酸包含序列表中No.2序列的1-8511位碱基序列所示的碱基序列。该核酸来源于人的染色体5的NSD1，并与NSD1的一部分互补。具体而言，这是与包括NSD1的外显子1-23的cDNA互补的核酸。本专利技术的核酸也包括其中碱基序列1-8511位的部分碱基序列缺失、置换或添加，并具有80％、优选90％、更优选95％碱基序列同源性的核酸。另外，No.2序列所示碱基序列对应的氨基酸序列如下。该氨基酸序列如序列表的N本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：松本直通，新川诏夫，
申请(专利权)人：长崎大学，
类型：发明
国别省市：