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腋臭相关基因的定位方法技术

技术编号:1758173 阅读:400 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术提供了以腋臭家系为研究对象的腋臭相关基因(或位点)的定位、寻找、鉴定的方法,包括寻找并确定家系,收集血标本,利用STR、SNP等遗传标记对腋臭家系进行全基因组扫描、连锁分析、关联分析,定位腋臭相关基因或位点,精确定位,确定YAC文库,利用外显子捕获法、cDNA筛选法、ZooBlotting、CpG岛法等方法寻找基因,最后对所找到的基因及其编码的可能的蛋白质进行鉴定,确定与腋臭的关系及遗传传递规律。其涉及分子遗传学、基因组学、生物信息学、生物统计学等技术方法。本发明专利技术从基因水平阐明腋臭发病的分子基础。为临床防治等提供科学依据和技术。(*该技术在2022年保护过期,可自由使用*)

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
腋臭相关基因的定位方法,其特征是包括以下步骤:(1)、家系的收集与处理:收集经严格临床确诊的相对隔离封闭的腋臭大家系,作出系谱图分析,计算子代同胞间分离比是否同该病遗传方式所固有的理论分离比相一致;若所观察的分离比与理论分离比一致,则对 腋臭遗传方式的假设成立,即为常染色体显性或是常染色体隐性遗传;(2)、采集家系各成员血样,用常规有机溶剂法抽提基因组DNA;选择微卫星标志,使密度达到在染色体上平均覆盖约5~10cM,合成这些标志的PCR扩增产物,引物为荧光或非荧光的均 可,以前者为佳,并利用复合PCR进行扩增;也可用目前商业化的试剂盒进行;电泳检测各标志的基因分型,并用DNA测序仪及相关软件系统对电泳所得数据进行分析处理;(3)、连锁分析对基因初步定位:采用直接法、Bemstein统计法、Fisher μ统计法、经典似然法、参数连锁分析对数优势记分法(或对数概率比记分法)等对腋臭基因进行初步定位;(4)、确定YAC文库:利用距离上述定位的腋臭基因(位点)最近的DNA标志,筛选YAC、BAC、Pl、Cosmid类型基因组文库,运用染色体 步移技术获得覆盖腋臭基因(位点)的一组连续的重叠的克隆群,即Contigs。(5)、寻找表达序列:从上述确定的Contigs中寻找表达序列;(6)、寻找基因:利用得到的表达序列,去识别全长cDNA,找出腋臭相关基因;(7)、鉴定 基因:对所找到的基因所编码的蛋白质的氨基酸序列进行分析,确定该蛋白质的属性及可能的功能,再与腋臭基因具有的功能进行比较分析,进一步确定该基因是否致病基因、有否DNA结构变化(无义突变、移码突变、缺失、重排、剪接信号位点的改变等等)及其规律。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:江斌
申请(专利权)人:江斌
类型:发明
国别省市:43[中国|湖南]

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