一种鸡全血简便快速DNA提取方法技术

技术编号:17555874 阅读:62 留言:0更新日期:2018-03-28 08:04
本发明专利技术公开一种鸡全血简便快速DNA提取方法,其提取方法包括将鸡全血加入抗凝剂后,再加入裂解液中混合,于56~60℃水溶锅放置20~30min,加入分离液,于70~80℃水溶锅放置20~30min后离心,取上清液转移到另一EP管中,再加入析出液,离心,留沉淀,加入洗涤液后混匀,离心;小心弃上清,收集沉淀室温干燥,加入TB缓冲液,即得鸡DNA提取液。本发明专利技术提取的DNA纯度和DNA完整性都能达到试验要求,浓度和纯度优于现有试剂盒提取的DNA。结合在鸡分子育种方面的应用,可证明该方法是一种成本低,操作简单,环境友好型的DNA提取方法。

A simple and rapid DNA extraction method for whole blood of chicken

【技术实现步骤摘要】
一种鸡全血简便快速DNA提取方法
本专利技术设计生物检测
,具体涉及一种鸡全血简便快速DNA提取方法。
技术介绍
20世纪50年代Watson和Crick提出DNA双螺旋模型以来,分子生物学获得空前的发展,动物分子育种在生产中的应用越来越多。基因组DNA的提取在动物分子育种中是一项基础、重要的技术,直接关系到基因检测的效果。目前,有关家禽基因组DNA的提取方法较多,如试剂盒法、盐析法、蛋白酶消化法、有机溶剂提取法等都有研究,但各种方法都存在一定的优、缺点。酚-氯仿法是提取DNA最为经典的方法,其原理是利用有机溶剂苯酚的蛋白变性,抑制DNase作用,蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。离心分层后取出水层,多次重复操作,合并含DNA的水相,再利用核酸不溶于醇的性质,用乙醇沉淀DNA。该法在鸡DNA提取上也有应用,研究者利用该法提取迪卡系白壳蛋鸡及褐壳蛋鸡祖代鸡外周抗凝血DNA,已公开的专利:一种提取家禽基因组DNA的方法(CN101768588A)和一种提取禽类全血DNA的方法(CN101748119A),在提取过程使用到有机溶剂Tris饱和酚/氯仿。有机溶剂提取方法的优点是提取的DNA保持天然状态。该方法提取DNA的缺点是耗时比较长,约在21h;提取过程多次使用对人体有害的氯仿,苯酚等有机试剂,影响研究操作人的工作情绪;操作过程多次加入有机溶剂,步骤繁琐,提取的DNA中可能含有有机试剂,影响进一步的试验研究工作。盐析法提取DNA的原理是利用蛋白质和核酸在电解溶液中溶解度不同,将二者分离。研究者用不同禽类品种(金定鸭、长乐灰鹅、象洞鸡和闽南火鸡)为试验材料,采用4种不同方法从其全血中提取DNA,比较不同方法的DNA提取效率。结果表明:由于品种之间DNA存在差异,DNA的质量和产率也有显著差异,金定鸭全血DNA用树脂法效果最佳;长乐灰鹅和闽南火鸡全血DNA用酚-氯仿法效果最佳;而盐析法是提取象洞鸡全血DNA的最佳方法。盐析法提取DNA优点,减少了有机溶剂的使用,减少了对环境和试验人员的伤害,缺点是提取DNA纯度差。吸附法提取DNA是利用核酸的吸附特性来获取组织DNA的方法。该方法的步骤是首先进行细胞的裂解和核酸,蛋白分离(如去污剂SDS,TLS,蛋白酶等),混合液经过吸附材料(树脂,玻璃等材料),核酸被吸附收集,经过特定洗脱液,收集核酸保存。该方法有开发成试剂盒产品,专供提取DNA。如TIANGEN生产的血液基因组DNA提取试剂盒,采用可以特异性结合DNA的离心吸附柱和独特的缓冲液系统,提取血液中的基因组DNA。离心吸附柱中采用的硅基质材料为本公司特有新型材料,高效、专一吸附DNA,可最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。提取的基因组DNA片段大,纯度高,质量稳定可靠。1h内即可获得超纯的基因组DNA。该方法的优点,提取的速度快。缺点是成本高,每个样本提取材料成本约3.5元,常在小批量的科研试验研究中使用,大量的检测,如鸡的分子育种过程中,需要成千上万份的检测,成本较大。加热煮沸法是利用DNA与蛋白的不同物理化学性质提取DNA,用加热法把细胞裂解,让基因组释放出来,冰浴后通过离心把细胞壁和一些蛋白离到管底,基因组会悬浮在上清中。研究者通过煮沸提取固始鸡和安卡鸡F2代抗凝血基因组DNA,经核酸蛋白定量仪检测,DNA的OD260/OD280达1.77±0.06,证明所提DNA质量较好,用于PCR扩增,也可以得到满意的扩增效果。但这种方法提取DNA,上清中还是存在一些蛋白的;煮沸的过程对DNA的完整性造成一定的损伤,在某些时候是会影响到PCR结果。该法对样本有选择性,鸡肉及凝集血等样本没见报道使用情况。综上所述,急需一种实验操作简单,可重复性好、所用试剂安全、无毒,提取的速度快,提取纯度高,样本DNA提取成本低的综合有效的鸡血基因组DNA提取的方法。
技术实现思路
本专利技术的目的是解决现有技术存在的问题,提供一种鸡全血简便快速DNA提取方法。为实现本专利技术目的所使用的技术方案为:一种鸡全血简便快速DNA提取方法,包括样本准备,样本裂解,样本分离DNA沉淀,DNA洗涤和制备DNA,具体制备步骤如下:(1)样本准备:取鸡全血,加入抗凝剂,获得鸡抗凝血;(2)样本裂解:将鸡抗凝血加入裂解液中混合,于56~60℃水溶锅放置20~30min,所述的鸡抗凝血与裂解液质量比为1:2.5,得鸡裂解血;(3)样本分离DNA沉淀:将鸡裂解血加入分离液,于70~80℃水溶锅放置20~30min后,在4000rpm离心机中离心分离10~15min,取上清液转移到另一EP管中,得鸡分离血;(4)DNA洗涤:在鸡分离血中加入析出液,于4000rpm离心机中离心分离1~2min,留沉淀,加入洗涤液后混匀,得鸡初级DNA提取液;(5)制备DNA:将鸡初级DNA提取液于4000rpm离心机中离心分离1~2min;小心弃上清,收集沉淀室温干燥,加入TB缓冲液,即得鸡DNA提取液。优选的,所述的抗凝剂为枸橼酸钠、Na2EDTA·2H2O或肝素钠。优选的,所述的枸橼酸钠终浓度为0.38%,所述的Na2EDTA·2H2O浓度为1.5~2.2mg/mL,所述的肝素钠浓度为300~400单位/ml,采集血液,加入抗凝剂后,轻微晃动离心管,抗凝剂均匀接触血液;2~8℃备用或-20℃长期保存。优选的,所述的裂解液为50mMNa2EDTA·2H2O、2%SDS、0.19MNaCl和蛋白酶K终浓度0.4μg/μL。优选的,其特征在于,所述的分离液为6MNaCl。优选的,所述的析出液为90~95%乙醇。优选的,所述的洗涤液为70%乙醇和0.14MNaCl。优选的,所述的TB缓冲液由Tris、Na2EDTA·2H2O和硼酸组成,所述的Tris浓度为0.108g/ml,Na2EDTA·2H2O浓度为7.44×10-3g/ml,硼酸浓度为5.5×10-2g/ml。优选的,所述的鸡DNA提取液在2~8℃备用或-20℃以下保存。优选的,具体制备步骤如下:(1)样本准备:取鸡全血,加入抗凝剂,获得鸡抗凝血;(2)样本裂解:将100μL鸡抗凝血加入250μL裂解液中混匀,于56~60℃水溶锅放置20~30min,得鸡裂解血;(3)样本分离DNA沉淀:将鸡裂解血加入600μL分离液,颠倒3~5次混匀,于70~80℃水溶锅放置20~30min后,在4000rpm离心机中离心分离10~15min,取200μL上清液转移到另一EP管中,得鸡分离血;(4)DNA洗涤:在鸡分离血中加入400μL析出液,于4000rpm离心机中离心分离1~2min,留沉淀,加入600μL洗涤液后上下颠倒3~5次混匀,得鸡初级DNA提取液;(5)制备DNA:将鸡初级DNA提取液于4000rpm离心机中离心分离1~2min;弃上清,收集沉淀室温干燥,加入200μLTB缓冲液,即得鸡DNA提取液。优选的,所述的室温干燥时间为5~10min。分子生物学研究首要考虑的问题是核酸的提取,是非常关键的过程。提取纯化核酸可分为三步:第一步,细胞破碎、第二步,除去样本中的蛋白,与核酸结合的蛋白质及多糖脂等杂质、除去其他杂质核酸,第三步,核酸的纯化。提取DNA的纯度和产量直接影响后续的试验和研究。如PCR扩增、酶切反本文档来自技高网
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一种鸡全血简便快速DNA提取方法

【技术保护点】
一种鸡全血简便快速DNA提取方法,包括样本准备,样本裂解,样本分离DNA沉淀,DNA洗涤和制备DNA,其特征在于,具体制备步骤如下:(1)样本准备:取鸡全血,加入抗凝剂,获得鸡抗凝血;(2)样本裂解:将鸡抗凝血加入裂解液中混合,于56~60℃水溶锅放置20~30min,所述的鸡抗凝血与裂解液质量比为1:2.5,得鸡裂解血;(3)样本分离DNA沉淀:将鸡裂解血加入分离液,于70~80℃水溶锅放置20~30min后,在4000 rpm离心机中离心分离10~15 min,取上清液转移到另一EP管中,得鸡分离血;(4)DNA洗涤:在鸡分离血中加入析出液,于4000 rpm离心机中离心分离1~2 min,留沉淀,加入洗涤液后混匀,得鸡初级DNA提取液;(5)制备DNA:将鸡初级DNA提取液于4000 rpm离心机中离心分离1~2 min;弃上清,收集沉淀室温干燥,加入TB缓冲液,即得鸡DNA提取液。

【技术特征摘要】
1.一种鸡全血简便快速DNA提取方法,包括样本准备,样本裂解,样本分离DNA沉淀,DNA洗涤和制备DNA,其特征在于,具体制备步骤如下:(1)样本准备:取鸡全血,加入抗凝剂,获得鸡抗凝血;(2)样本裂解:将鸡抗凝血加入裂解液中混合,于56~60℃水溶锅放置20~30min,所述的鸡抗凝血与裂解液质量比为1:2.5,得鸡裂解血;(3)样本分离DNA沉淀:将鸡裂解血加入分离液,于70~80℃水溶锅放置20~30min后,在4000rpm离心机中离心分离10~15min,取上清液转移到另一EP管中,得鸡分离血;(4)DNA洗涤:在鸡分离血中加入析出液,于4000rpm离心机中离心分离1~2min,留沉淀,加入洗涤液后混匀,得鸡初级DNA提取液;(5)制备DNA:将鸡初级DNA提取液于4000rpm离心机中离心分离1~2min;弃上清,收集沉淀室温干燥,加入TB缓冲液,即得鸡DNA提取液。2.根据权利要求1所述鸡全血简便快速DNA提取方法,其特征在于,所述的抗凝剂为枸橼酸钠、Na2EDTA·2H2O或肝素钠;所述的枸橼酸钠终浓度为0.38%,所述的Na2EDTA·2H2O浓度为1.5~2.2mg/mL,所述的肝素钠浓度为300~400单位/ml。3.根据权利要求1所述鸡全血简便快速DNA提取方法,其特征在于,所述的裂解液为50mMNa2EDTA·2H2O、2%SDS、0.19MNaCl和蛋白酶K终浓度0.4μg/μL。4.根据权利要求1所述鸡全血简便快速DNA提取方法,其特征在于,所述的分离液为6MNaCl。5.根据权利要求1所述鸡全血简便快速DNA提取方法,其特征在于,所述的析出液为90...

【专利技术属性】
技术研发人员:王树艳沈前程李军成凌丁
申请(专利权)人:广西农业职业技术学院
类型:发明
国别省市:广西,45

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