本发明专利技术涉及检测在６个异源物质代谢酶基因上的１５个与大肠癌（ｃｏｌｏｒｅｃｔａｌ ｃａｒｃｉｎｏｍａ，ＣＲＣ）相关联的单核苷酸多态性（ＳＮＰ）位点，以及应用这些单核苷酸多态性位点预测大肠癌的易患性，以及这种癌症的诊断和治疗方法。大肠癌在许多国家是第二大癌症致死因素，本发明专利技术所提供的信息有助于预防大肠癌及开发有效的新疗法。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及检测6个异源物质代谢酶基因上的15个与大肠癌(colorectal carcinoma，CRC)相关联的单核苷酸多态性(SNP)位点，以及应用这些单核苷酸多态性位点预测大肠癌的易患性，及诊断和治疗这种常见癌症的方法。本专利技术所提供了一种有助于预防大肠癌的方法，并开发了有效的新疗法。本专利技术也可应用于筛选针对不同类型大肠癌的适当疗法。
技术介绍
大肠癌是发病率第二高的恶性肿瘤，在西方国家，它是第二大癌症致死因素。在高加索人群中，大肠癌的发病率接近于肺癌(见Levi F，Lucchini F，Negri E.，et al 1999.Cancer mortality in Europe，1990-1994 and overview of trendsfrom 1955 to 1994.Eur.J.Cancer 35，1477-1516)。大肠癌的发病率在50岁以后会普遍增加。大肠癌的发病风险会由于个体的遗传易感性加上与内源性或外源性的致癌物的接触而增加。遗传性的大肠癌症候群包括家族性息肉症(FAP)和遗传性非息肉病性大肠癌(HNPCC)。但是这些症候群只占了所有大肠癌总数的3％(Samowitz WS，Curtin K，Lin HH，et al.，2001.The colon cancerburden of genetically defined hereditary nonpolyposis colon cancer.Gastroenterology 121830-838.)。零散的大肠癌病人的第一等血亲比其它人得大肠癌的风险要高两倍，在这种现象中占主导因素的似乎不是与FAP和HNPCC相关的基因。FAP和HNPCC在大肠癌方面的表现型在不同家系之间，甚至在同一家系中的不同患者之间，有明显差异。体内和体外的实验都显示日常饮食性致癌物能明显地增加患大肠癌的风险(Sachse C.，Smith G.，WilkieM.J.V.，et al.，2002.A pharmacogenetic study to investigate the role of dietarycarcinogens in the etiology of colorectal cancer.Carcinogenesis 231839-1849)。目前，认为大肠癌的发病过程可由一系列来源于环境或体内的致癌物所诱导或促进(de Jong MM，Nolte IM，te Meerman GJ，et al.，2002.Low-penetrance genesand their involvement in colorectal cancer susceptibility.Cancer Epidemiology，Biomarkers and Prevention 111332-1352)。许多证据显示，大肠癌可由改变饮食和生活习惯来预防，使用分子遗传分析筛选的预防策略也很有发展前景。遗憾的是，到目前为止还没有一种可靠的非侵入性的检测方法。大肠癌可以分为不同的阶段Dukes A期，B1期，B2期，C1期，C2期和D期。目前三分之二被诊断为Dukes C期和D期的病人无法只通过手术来治愈。因此，癌症诊断上的期型是决定预后最重要的因素。此外，大肠癌的不同类型也影响预后，粘液腺癌病人的预后比非粘液腺癌病人差，这些不同类型的大肠癌病人对化疗的反应也明显不同(Glasgow SC，Yu J，Carvalho LP et al.，2005.Unfavourable expression of pharmacologic markers in mucinous colorectal cancerBritish J of Cancer 20051-6)。异源物质代谢酶(YMEs)异源物质是非人体固有的天然或人工合成的物质，包括药物，工业产物，杀虫剂，污染性物质，生物碱，及由细菌，真菌，植物和动物产生的毒素。许多异源物质本身或其经生物转化后的形式具有致癌性。异源物质代谢酶(XMEs)能导致各种致癌物，致癌物前体，毒素和药物的活性化，它们也能参与宿主对异源物质的防御反应。由于治疗性药物对人体而言也是异源物质，因此某些异源物质代谢酶也被称为药物代谢酶(DMEs)。参与异源物质的氧化反应和连接反应的酶分别被称为I相和II相异源物质代谢酶。I相异源物质代谢酶，例如细胞色素P450s(CYPs)基因家族，催化多种内源性和外源性的异源物质(从类固醇到污染物)的氧化反应，在这些氧化过程中可能产生亲电的和可致癌的中间产物。II相异源物质代谢酶通常以氧作为进一步代谢反应的位点，比如接上协同因子使物质变得更亲水进而有利于该物质的排出。除了I相和II相异源物质代谢酶，ATP-结合盒(ABC)转运子，利用ATP水解的能量完成多种化合物的跨膜运输，亦促使异源物质的代谢。在肠壁，血脑屏障和胎盘里存在着大量的异源物质代谢酶和ABC，暗示这些酶能限制异源物质进入主要系统并在宿主的防御机制中发挥重要作用(Jonker JW，Buitelaar M，Wagenaar E，et al.，2002.The breast cancerresistance protein protects against a major chlorophyll-derived dietaryphototoxin and protoporphyria.Proc Natl Acad Sci U S A.9915649-54.)。虽然异源物质的解毒总是与肝脏的代谢联系在一起，但是肠道的结肠细胞也介入显著的解毒过程，这个过程可能影响大肠癌的发生(Roediger WEW andBabidge W.，1997.Human colonocyte detoxification.Gut.41731-734)并且在很大程度上影响个体对于致癌物质的生物反应。ABCG2(ABCP，MXR1，BCRP)基因是最新发现的ABC药物排出转运子，它是由几间不同实验室分别发现的。通过分析那些对米托蒽醌(mitoxantrone)有抗性，但没有超量表达ABCB1或ABCC1基因的细胞系找到了ABCG2基因。如果将ABCG2基因转到细胞中，可以使这些细胞获得对化疗药物的抗性。ABCG2蛋白是一个半转运子，它与对癌症化疗中常使用的结构与机理并不相关的各种药物的交叉抗性有关(Gottesman MM，FojoT and Bates SE.，2002.Multidrug resistance in cancer；role of ATP-dependenttransporters.Nat Rev Cancer 2，48-58)。对哺乳动物各种组织中ABCG2的分布在RNA和蛋白质水平上进行分析，显示ABCG2广泛的分布在许多正常组织中，包括小肠和结肠的肠绒毛上皮细胞腔面以及许多组织的毛细管内皮细胞(Doyle LA，and Ross DD.，2003.Multidrug resistance mediated by thebreast cancer resistance protein BCRP(ABCG2).Oncogene.227340-58本文档来自技高网...
【技术保护点】
一段独立的具有序列如同ＳＥＱＩＤＮＯ：１的多聚核苷酸，其特征在于，该多聚核苷酸序列为人类ＡＢＣＧ２基因的一部分，该序列在第１６８碱基与第１６９碱基之间的部份会呈现多态性。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：吴汪黔生，张浩，廖凌虹，
申请(专利权)人：华晶基因技术有限公司，
类型：发明
国别省市：HK[中国|香港]
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