HLA-结合肽,其前体,编码这些肽序列的DNA片段和重组载体制造技术

技术编号:1715421 阅读:195 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术提供一种与HLA-A型分子结合的HLA-结合肽,所述HLA-结合肽包含至少一种选自SEQ  ID  NOS:1-183的氨基酸序列,不少于8个且不多于11个氨基酸残基。通过预测程序,利用图1中所述的积极学习实验方法,所有氨基酸序列被预测具有与人HLA-A型分子的结合性质。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及HLA-结合肽,其前体,编码这些肽序列的DNA片段和重组载体。
技术介绍
当感染病毒,诸如丙型肝炎病毒(HCV)时,在天生免疫系统防卫之后,就会诱导病毒特异的免疫反应以消除所述病毒。当诱导特异性免疫反应时,分离的病毒粒子通过中和抗体丧失其传染性,并随后被消除。换言之,病毒感染的细胞由细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)裂解。CTL将HLA I型分子呈递的表位肽识别成抗原。这种表位肽长度上有8-11个氨基酸。因此,为了开发针对病毒的治疗性疫苗,至关重要的是鉴别病毒表位肽。这种技术从专利公报1是公知的。专利公报1描述了形成自特异性氨基酸序列的寡肽具有与HLA结合的性质。日本专利申请公开No.H8-151396(1996)
技术实现思路
然而,上述专利公报中所述的常规技术在下述几点尚有改进的余地。首先,不清楚上述公报中的HLA-结合肽是否与HLA分子有效结合,因此仍有改进与HLA结合的性质的余地。其次,上述公报叙述了其中的HLA-结合肽具有与HLA-DQ4结合的性质。然而,尚不清楚该肽是否与HLA-A2型分子(HLA-A*0201基因产物等)结合,该分子在欧美人中是常见的,以及是否与HLA-A24型分子(HLA-A*2402基因产物等)结合,该分子在日本人是常见的。在上述情形下,实现了本专利技术,并且提供对特异类型的HLA分子显示高亲和性结合的HLA-结合肽。根据本专利技术,提供了与HLA-A型分子结合的HLA-结合肽,其含有至少一种氨基酸序列并且由不少于8个且不多于11个氨基酸残基组成,所述氨基酸序列选自SEQ ID NOS1-183。而且,根据本专利技术,提供了含有至少一种氨基酸序列的HLA-结合肽,所述氨基酸序列选自SEQ ID NOS1,2,3,5,8,12,13,14,16,17,18,19,22,23,25,27,34,37,38,40,42,45,48,49,52,53,54,55,56,58,59,60,61,62,63,64,65,67,71,72,74,75,76,84,86,87,90,91,92,93,94,96,97,98,100,101,102,104,106,107,108,109,110,112,123,124,126,127,131,132,133,134,135,136,137,139,141,142,146,147,149,150,152,162,170,173,176,177,和179。此外,根据本专利技术,提供了与HLA-A型分子结合的HLA-结合肽,其含有一种氨基酸序列并且由不少于8个且不多于11个氨基酸残基,所述氨基酸序列是在上述HLA-结合肽中所含的氨基酸序列基础上,通过缺失,替换,或添加一个或两个氨基酸残基而形成的。以此,含有一种氨基酸序列的构建体也可显示与上述HLA-结合肽相似的效果,所述氨基酸序列是在具有与HLA-A型分子结合的性质的特异氨基酸序列中,通过缺失,替换,或添加一个或数个氨基酸残基而形成的。而且,根据本专利技术,提供了含有为上述HLA-结合肽编码的DNA序列的DNA区段。此外,根据本专利技术,提供了含有为上述HLA-结合肽编码的DNA序列的重组载体。而且,根据本专利技术,提供了在哺乳动物体内变成上述HLA-结合肽的HLA-结合肽前体。根据本专利技术,由于包括特异氨基酸序列,可获得在与HLA-A型分子结合方面具有优异性质的HLA-结合肽。附图简述上述目的,其他目的,特征和优点从下文所述的优选实施方案,参照附图可变得更加显而易见。示意图用于说明实施方案中所用的积极学习实验设计。实施本专利技术的最佳方式实施本专利技术的方式参照附图解释如下。在所有附图中,相同的组成元件以相同的标号和符号表示,以便不会重复解释。<实施方案1> 在该实施方案中,含有一种氨基酸序列并由不少于8个且不多于11个氨基酸残基组成的肽用作HLA-结合肽的候选物,利用积极学习实验方法(日本专利申请公开No.H11-316754(1999))得到假设,通过该假设预测,所述氨基酸序列与HLA分子结合的-log Kd值为3或以上。根据结合实验的结果,已确认这些肽真正为HLA-结合肽。结果,可有效获得大量HLA-结合肽,由于它们含有一种氨基酸序列,其在与HLA-A型分子结合方面具有优异性质,所述氨基酸序列与HLA分子结合的-log Kd值为3或以上。具体而言,与该实施方案有关的HLA-结合肽为与HLA-A型分子结合,含有至少一种氨基酸序列(选自SEQ ID NOS1-183,这将在下文描述),并由不少于8个且不多于11个氨基酸残基组成的HLA-结合肽。在人HLA-A型中,约50%的日本人为HLA-A24型。对于欧美人,诸如德国人,为HLA-A2型。所有在此所述的序列为由HCV(丙型肝炎病毒)某基因组蛋白中所含的9个氨基酸残基组成的序列。序列SEQ ID NOS1-44示于下表1。表1HLA-A24-结合肽 序列SEQ ID NOS1-44为由HCV D90208株某基因组蛋白(SEQ IDNO184)中所含的9个氨基酸残基组成的序列,这将在下文描述。序列SEQ ID NOS1-44为通过上述方法预测具有优良的与HLA-A24型分子结合的序列。SEQ ID NOS1-44以结合降低的顺序排列。即,SEQ IDNO1为预测具有最佳结合的序列。各个序列与HLA-A24型分子结合的预测分和结合实验数据以-log Kd值的形式表示。序列SEQ ID NOS45-83示于下表2。表2HLA-A24-结合肽 序列SEQ ID NOS45-83为由HCV D89815株某基因组蛋白(SEQID NO185)中所含的9个氨基酸残基组成的序列。序列SEQ IDNOS45-83为通过上述方法预测具有优良的与HLA-A24型分子结合的序列。SEQ ID NOS45-83以结合降低的顺序排列。即,SEQ ID NO45为预测具有最佳结合的序列。各个序列与HLA-A24型分子结合的预测分和结合实验数据以-log Kd值的形式表示。序列SEQ ID NOS84-123示于下表3。表3HLA-A24-结合肽 序列SEQ ID NOS84-123为由HCV pBRT703′X株某基因组蛋白(SEQ ID NO186)中所含的9个氨基酸残基组成的序列,这将在下文描述。序列SEQ ID NOS84-123为通过上述方法预测具有优良的与HLA-A24型分子结合的序列。SEQ ID NOS84-123以结合降低的顺序排列。即,SEQ ID NO84为预测具有最佳结合的序列。各个序列与HLA-A24型分子结合的预测分和结合实验数据以-log Kd值的形式表示。序列SEQ ID NOS124-183示于下表4。表4HLA-A2-结合肽 序列SEQ ID NOS124-183为由HCV pBRT703′X株某基因组蛋白(SEQ ID NO186)中所含的9个氨基酸残基组成的序列,这将在下文中描述。序列SEQ ID NOS124-183为通过上述方法预测具有优良的与HLA-A2型分子结合的序列。SEQ ID NOS124-183以结合降低的顺序排列。即,SEQ ID NO124为预测本文档来自技高网...

【技术保护点】
与HLA-A型分子结合的HLA-结合肽,所述HLA-结合肽包含至少一种选自SEQIDNOS:1-183的氨基酸序列,以及不少于8个且不多于11个氨基酸残基。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:宫川知也宇高惠子
申请(专利权)人:日本电气株式会社国立大学法人高知大学
类型:发明
国别省市:JP[]

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