The present invention discloses a SNP molecular marker tightly linked with the main effect QTL of sucrose / glucose ratio of pumpkin and its application. Molecular markers located on 19 linkage groups China pumpkin, sucrose / glucose ratios were located on both sides of the molecular marker gene; nucleotide sequence contains 26139 SEQ ID NO.1 shown or its homologous SNP sequence; molecular marker 13328 nucleotide sequence containing SEQ ID NO.2 shown or its homologous SNP sequence. Site location of QTL was significantly associated to the quantitative traits (p< 0.05), and the contribution of higher molecular markers explain the probability of 26139 to 11.9%, explain the probability of 13328 molecular markers was 11.6%, the predicted level of pumpkin sucrose / glucose ratio can be obtained by these two markers can be simple, fast and high throughput applied to the modified molecular assisted breeding for varieties of pumpkin, pumpkin sucrose / glucose ratio traits of early identification and screening of molecular assisted selection technology support, and greatly shorten the time of traditional gene mapping.
【技术实现步骤摘要】
与南瓜蔗糖/葡萄糖比值主效QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用
本专利技术属于分子检测技术及育种领域,特别涉及一种与南瓜蔗糖/葡萄糖比值主效QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用。
技术介绍
糖类是果实的品质成分,南瓜果实中的主要可溶性糖是蔗糖(sucrose)、果糖(fructose)和葡萄糖(glucose)。但这三种糖对南瓜果实的甜度贡献不同,果实的甜度不仅取决于糖的总量,还与糖的组成密切相关。糖含量不仅影响果实的甜味,也是淀粉、维生素和类胡萝卜素等风味物质合成的基础物质,糖类参与机体重要的生理功能代谢途径,为植物生长发育提供必要保障。研究表明中国南瓜积累较多的蔗糖和葡萄糖及少量的果糖,而蔗糖对南瓜的甜度贡献最大,蔗糖含量越高果实越甜,通过计算蔗糖和葡萄糖比值可以判断南瓜果实的甜度。随着科学研究的深入,社会的需求,人们越来越需要高品质的蔬菜水果,因此,选育高蔗糖低葡萄糖含量南瓜是未来南瓜品质育种的重要目标之一。传统育种方式选育高蔗糖品种虽然可行,但耗时耗力,不利于我国的南瓜育种事业。随着高通量测序技术的成熟,特别是大量的SNP(单碱基扩增多态性)标记的开发,应用高密度遗传图谱的方法开展植物性状基因定位成为挖掘植物基因的热点之一。利用高通量测序技术开发大量的SNP标记,开发性状连锁的分子标记进行品种的初期筛选,达到分子辅助育种的目的,可大大缩短育种的周期提高育种效率。因此,进行南瓜蔗糖/葡萄糖比值含量的基因定位,筛选紧密连锁的分子标记,建立早期辅助选择技术体系,对选育高蔗糖低葡萄糖南瓜的遗传改良具有重要意义。
技术实现思路
本专利技术的目的在于与南瓜蔗糖 ...
【技术保护点】
与南瓜蔗糖/葡萄糖比值主效QTL位点紧密连锁的SNP分子标记,为分子标记26139或分子标记13328,其特征在于:所述分子标记定位于中国南瓜19号连锁群上,分别位于蔗糖/葡萄糖基因两侧;其中,分子标记26139包含SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列或其同源SNP序列;分子标记13328包含SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列或其同源SNP序列。
【技术特征摘要】
1.与南瓜蔗糖/葡萄糖比值主效QTL位点紧密连锁的SNP分子标记,为分子标记26139或分子标记13328,其特征在于:所述分子标记定位于中国南瓜19号连锁群上,分别位于蔗糖/葡萄糖基因两侧;其中,分子标记26139包含SEQIDNO.1所示的核苷酸序列或其同源SNP序列;分子标记13328包含SEQIDNO.2所示的核苷酸序列或其同源SNP序列。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于:SEQIDNO.1所示序列自5’端起第260位碱基是SNP位点,其碱基为G或C。3.根据权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于:SEQIDNO.2所示序列自5’端起第25位碱基是SNP位点,其碱基为A或C。4.可识别或扩增权利要求1~3任一项所述的SNP分子标记的分子探针或引物对。5.根据权利要求4所述的分子探针或引物对,其特征在于:引物对为dCAPS引物对。6.根据权利要求5所述的分子探针或引物对,其特征在于:用于检测分子标记26139的dCAPS引物对的核苷酸序列如下所示:F1:5’-TCGAATCCTG...
【专利技术属性】
技术研发人员:钟玉娟,黄河勋,罗少波,李俊星,周洋洋,谢大森,
申请(专利权)人:广东省农业科学院蔬菜研究所,
类型:发明
国别省市:广东,44
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