用于治疗、延缓和/或预防人类遗传性疾病如强直性肌营养不良症1型的新化合物制造技术

本申请涉及用于治疗、延缓和/或预防人类遗传性疾病如强直性肌营养不良症1型的新化合物。具体地，本发明专利技术提供用于治疗、延缓和/或预防人类遗传性疾病的新化合物，所述人类遗传性疾病如由DM1/DMPK、SCA8或JPH3基因的转录本中的CUG重复扩张引起的强直性肌营养不良1型(DM1)、脊髓小脑性共济失调8型和/或亨廷顿氏病样2型。

New compounds for the treatment, delay and / or prevention of human genetic diseases, such as myotonic dystrophy type 1

This application relates to new compounds for the treatment, delay and / or prevention of human genetic diseases, such as myotonic dystrophy type 1. Specifically, the present invention provides compounds for treatment, delay and / or prevention of human genetic diseases, the human genetic diseases such as DM1/DMPK, SCA8 or JPH3 gene transcription in the CUG repeat expansion caused by myotonic dystrophy type 1 (DM1), spinocerebellar ataxia type 8 and / or Huntington's disease like type 2.

【技术实现步骤摘要】
用于治疗、延缓和/或预防人类遗传性疾病如强直性肌营养不良症1型的新化合物本申请是申请日为2012年04月23日的题为“用于治疗、延缓和/或预防人类遗传性疾病如强直性肌营养不良症1型(DM1)的新化合物”的中国专利申请号201280030219.5的分案申请。
本专利技术提供了用于治疗、延缓和/或预防人类遗传性疾病如DM1的新化合物。
技术介绍
强直性肌营养不良症1型(DM1)是一种具有复杂的、多系统病理的显性遗传性神经肌肉疾病(HarperP.S.etal)。DM1的特征是表达含有长CUG重复(repeats)的DMPK转录本，其隔离(sequester)或上调剪接因子和转录因子，从而干扰正常的细胞功能和活力。反义寡核苷酸(AON)介导的毒性DMPK转录本的抑制被认为是用于这种频繁的三核苷酸重复疾病的潜在治疗策略。CUG重复序列存在于DMPK转录本的外显子15中。(CUG)n段(tract)自身形成明显的靶，其为突变体和正常尺寸转录本之间的唯一已知多态现象。在先前的研究中，我们已经确定2’-O-硫代磷酸甲酯-修饰的(CAG)7寡核苷酸(PS58)(SEQIDNO:1)能诱导DM1细胞和动物模型中突变体转录本的断裂(MuldersS.A.etal)。为了使AON在DM1中临床有效，它们需要到达各种组织和其中的各细胞类型中，并且被成功地递送到这些细胞的核中。在本专利技术中，已经基于PS58设计了新化合物，其包含本文中所描述的甲基化胞嘧啶和/或脱碱基位点，所述化合物在靶向和/或递送至和/或由多种组织包括心脏、骨骼肌和平滑肌吸收方面具有提高的活性。WO2009/099326和WO2007/808532描述了包含(CAG)n重复单元(如PS58)的寡聚物。
技术实现思路
在第一方面，提供了包含或者由LGAQSNF/(NAG)m组成的化合物，其中包含于寡核苷酸部分(NAG)m中的N是C(即，胞嘧啶)或5-甲基胞嘧啶。这种化合物可以称为缀合物(conjugate)。该化合物包含含有或由LGAQSNF(SEQIDNO:2)组成的肽部分，该肽部分连接至或偶联至寡核苷酸部分或与寡核苷酸部分结合(缀合)，该寡核苷酸部分包含或由(NAG)m组成，其中的N为C或5-甲基胞嘧啶。该化合物也可以称为缀合物。LGAQSNF/(NAG)m中的斜线号(/)标示本专利技术的化合物的肽部分与寡核苷酸部分之间的键合、偶联或缀合。本专利技术的化合物的肽部分包含或由LGAQSNF组成。本专利技术的化合物的寡核苷酸部分包含或由(NAG)m组成，其中N为C或5-甲基胞嘧啶。在一个实施方式中，该化合物包含或由LGAQSNF/(NAG)m组成，其中包含于寡核苷酸部分(NAG)m中的N是C或5-甲基胞嘧啶，以使包含于寡核苷酸部分(NAG)m中的至少出现一次的A包含2,6-二氨基嘌呤核苷碱基(nucleobase)修饰。m优选地为整数，其是4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30。在一个优选的实施方式中，m为7。因此，优选的(NAG)m(其中N为C或5-甲基胞嘧啶)具有12至90个核苷酸的长度，更优选12至45个核苷酸，甚至更优选15至36个核苷酸，最优选21个核苷酸。所述寡核苷酸部分优选地包含与重复序列CUG互补的至少15至45个连续的核苷酸，或与重复序列CUG互补的至少18至42个连续的核苷酸，更优选与重复序列CUG互补的21至36个核苷酸，甚至更优选与重复序列CUG互补的18至24个核苷酸。根据本专利技术的这一方面的化合物可以由LGAQSNF/(NAG)m组成，这意味着除了LGAQSNF序列之外不存在其他氨基酸并且除了重复的NAG基序之外不存在其他核苷酸。可替代地，该化合物可以包含LGAQSNF/(NAG)m，这意味着除了LGAQSNF序列之外可以存在其他氨基酸、或其类似物或等价物，和/或在重复的NAG基序的一侧或两侧可以存在其他核苷酸或其类似物或等价物。在本专利技术的上下文中，氨基酸的“类似物”或“等价物”应被理解为一种氨基酸，相对于天然存在于肽中的氨基酸而言，其包含至少一个修饰。该修饰可以是骨架修饰和/或糖修饰和/或碱基修饰，进一步的解释和例示如下。在本专利技术的上下文中，核苷酸的“类似物”或“等价物”应被理解为一种核苷酸，相对于天然存在于RNA中的核苷酸(如A、C、G和U)而言，其包含至少一个修饰。该修饰可以是骨架修饰和/或糖修饰和/或碱基修饰，进一步的解释和例示如下。在一个优选的实施方式中，根据本专利技术的这一方面的寡核苷酸部分可以表示为L–(X)p–(NAG)m–(Y)q–L，其中N和m如上述限定。每次出现的L独立地为氢原子或如下进一步限定的连接至或与根据本专利技术的化合物的肽部分相关联的键合部分、偶联部分或缀合部分，其中至少一个出现的L为键合部分、偶联部分或缀合部分。在一个优选的实施方式中，一个出现的L为氢原子且另一个出现的L为键合部分、偶联部分或缀合部分。在另一个实施方式中，两个出现的L都是氢，并且该寡核苷酸通过内部核苷酸之一而键合至、偶合至或缀合至肽部分，例如通过核苷碱基或通过核苷间键。各个出现的X和Y独立地为如下进一步限定的脱碱基位点或核苷酸，如A、C、G、U或它们的类似物或等价物，并且p和q各自独立地为整数，优选0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、或大于10或上达至50。因此，p和q各自独立地为0至50的整数，优选0至10的整数，更优选0至6。因此，当p为0时，X不存在且当q为0时，Y不存在。本文中，(X)p–(NAG)m–(Y)q(其中N和m如上述所限定并且p和q为0)被认为是根据本专利技术的这一方面的化合物的寡核苷酸部分，其中其寡核苷酸部分由(NAG)m组成。包含(NAG)m的该寡核苷酸部分可以表示为(X)p–(NAG)m–(Y)q，其中N、m、X、Y、p和q如上述所限定并且p和q中的至少一个不为0。在一个优选的实施方式中，p不为0，并且由(X’)p’AG或(X’)p”G表示(X)p，其中每个出现的X’独立地为脱碱基位点(无碱基位点，abasicsite)或核苷酸，如A、C、G、U或它们的类似物或等价物，并且p’为p–2且p”为p–1。这样的化合物可以表示为：L–(X’)p’AG–(NAG)m–(Y)q–L或L–(X’)p”G–(NAG)m–(Y)q–L。在同样优选的实施方式中，q不为0，并且由NA(Y’)q’或N(Y’)q”表示(Y)q，其中N如上述所限定并且每个出现的Y’独立地为脱碱基位点或核苷酸，如A、C、G、U或它们的类似物或等价物，并且q’为q–2且q”为q–1。这样的化合物可以表示为：L–(X)p–(NAG)m–NA(Y’)q’–L或L–(X)p–(NAG)m–N(Y’)q”–L。在另一个优选的实施方式中，p和q均不是0，并且分别由(X’)p’AG或(X’)p”G和NA(Y’)q’或N(Y’)q”表示(X)p和(Y)q，其中N、X’、Y’、p’、p”、q’和q”如上述所限定。这样的化合物可以表示为：L–(X’)p’AG–(NAG)m–NA(Y’)q’–L、L–(X’)p”G–(NAG)m–NA(Y’)q’–L、L–(X’)p’AG–(本文档来自技高网...

【技术保护点】
包含寡核苷酸序列(NAG)m或由寡核苷酸序列(NAG)m组成的化合物，其中N为C或5‑甲基胞嘧啶并且至少一个出现的N为5‑甲基胞嘧啶，并且其中m为7、8、9、10、11、12、13、14或15，并且其中不存在肌苷核苷酸。

【技术特征摘要】
2011.04.22 EP 11163581.9;2011.04.22 US 61/478,0961.包含寡核苷酸序列(NAG)m或由寡核苷酸序列(NAG)m组成的化合物，其中N为C或5-甲基胞嘧啶并且至少一个出现的N为5-甲基胞嘧啶，并且其中m为7、8、9、10、11、12、13、14或15，并且其中不存在肌苷核苷酸。2.根据权利要求1所述的化合物，其中，所有出现的N都为5-甲基胞嘧啶。3.根据权利要求1所述的化合物，包含SEQIDNO:16或由SEQIDNO:16组成。4.根据权利要求3所述的化合物，包含SEQIDNO:16并且具有21、22、23、24、25、26、27、28、29、30个核苷酸的长度。5.根据权利要求1至4中任一项所述的化合物，其中，当与RNA-类寡核苷酸相比时，所述寡核苷酸包含至少一个修饰，其中所述修饰选自由骨架修饰、糖修饰和碱基修饰组成的组。6.根据权利要求5所述的化合物，其中，所述修饰选自由2’-O-甲基硫代磷酸酯、吗啉代磷酰二胺、锁核酸和肽核酸组成的组。7.根据权利要求6所述的化合物，其中，所述寡核苷酸为2’-O-甲基硫代磷酸酯寡核苷酸。8.根据权利要求1至4中任一项所述的化合物，其中，所述寡核苷酸进一步包含至少一个2,6-二氨基嘌呤、2-硫代尿嘧啶、2-硫代胸腺嘧啶、5-甲基尿嘧啶、5-甲基胞嘧啶、胸腺嘧啶、8-氮杂-7-去氮杂鸟嘌呤核苷和/或次黄...

【专利技术属性】
技术研发人员：玛丽亚·贝戈尼亚·阿吉莱拉迭斯，彼得·克里斯蒂安·德菲瑟，苏珊·阿列贡达·玛丽亚·马尔德斯，
申请(专利权)人：比奥马林技术公司，
类型：发明
国别省市：荷兰,NL