用于诊断、预后和确认先兆子痫的方法与组合物技术

本发明专利技术提供用于诊断、预后、监测、表征、确定先兆子痫的严重性、确认存在先兆子痫或确认女性受试者中不存在先兆子痫的方法、组合物、试剂盒、算法、系统、专用计算机、软件、商业方法和试剂。方法和组合物用于多种应用中，包括例如预测个体是否会发展先兆子痫，诊断个体是否患有先兆子痫，表征先兆子痫，监测患有先兆子痫的个体，确定先兆子痫的严重性，确认存在先兆子痫或确认受试者中不存在先兆子痫。

Methods and compositions for diagnosis, prognosis, and confirmation of pre eclampsia

The present invention provides for the diagnosis, prognosis, monitoring, characterization, determination of preeclampsia severity, confirmed the existence of pre eclampsia or confirmation of female subjects did not exist in preeclampsia methods, compositions, kits, algorithm, system, computer, software, business methods and reagents. Methods and compositions for various applications, including for example to predict whether or not an individual will develop preeclampsia, diagnosis whether individuals with preeclampsia, characterization of preeclampsia, monitoring preeclampsia individuals, determine the severity of preeclampsia, confirmed the existence of pre eclampsia or pre eclampsia are not recognised in the subjects.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于诊断、预后和确认先兆子痫的方法与组合物本申请要求于2014年7月30日提交的美国临时专利申请62/031,132、于2014年7月31日提交的美国临时专利申请62/031,834和于2015年2月11日提交的美国临时专利申请62/115,077的权益和优先权。每个前述专利申请的内容和公开通过引用整体并入本文。相关领域本公开涉及提供先兆子痫的诊断和预后。专利技术背景先兆子痫(PE)是严重的妊娠多系统并发症，对母亲和婴儿有不良影响。该障碍的发生率是美国和全世界所有妊娠的约5-8％，并且该障碍占美国所有孕产妇死亡的18％。先兆子痫的病因和发病机制仍不确定，并且当前PE的实验室标志和临床症状发生在疾病过程的晚期，有时使得确定PE和临床管理决策很困难。具体地，区分先兆子痫与妊娠症状的并发症(例如妊娠高血压、慢性高血压和妊娠糖尿病，其中每一种需要不同的治疗选择)是关键的。更早和更可靠的诊断、预后、确认和监测疾病将导致更及时和个性化的先兆子痫治疗，并且因此将显著促进对先兆子痫发病机理的理解。专利技术概述本公开提供了用于在任何受试者、优选妊娠受试者中确认先兆子痫的方法，包括：评估来源于受试者的样品中的多个生物标志物以计算指数或以确认受试者是否患有先兆子痫，其中该确认具有大于90％的灵敏度、大于90％的特异性或大于0.9的接受者操作特征曲线(ROC和/或AUC)下的面积。本公开提供了用于确认受试者、优选妊娠受试者中的先兆子痫的测试，其中该测试能够以至少0.80、0.85、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98、0.99、0.995或更大的ROC值辨别没有患有PE但具有与PE相关的一个或多个症状的受试者与患有PE的受试者。与PE相关的一个或多个症状可以是糖尿病(例如妊娠糖尿病、I型或II型糖尿病)、高于正常葡萄糖水平、高血压(例如慢性或非慢性高血压)、过度或突然的体重增加、高于正常体重、肥胖、高于正常体重指数(BMI)、异常体重增加、异常血压、水潴留、遗传因素、异常蛋白尿、头痛、水肿、异常蛋白质/肌酐比、异常血小板计数、应激、未经产(nulliparity)、异常巴氏测试结果(Pap涂片)、先前先兆子痫发作(例如PE的个人病史)、PE的家族史、先前妊娠的PE、肾病、血栓形成倾向或其任何组合。本公开提供了用于确认受试者、优选妊娠受试者中的先兆子痫的测试，其中该测试能够以至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或更高的灵敏度、特异性和/或阴性预测值(NPV)辨别没有患有PE但具有与PE相关的一个或多个症状的受试者与患有PE的受试者。与PE相关的一个或多个症状可以是糖尿病(例如妊娠糖尿病、I型或II型糖尿病)、高于正常葡萄糖水平、高血压(例如慢性或非慢性高血压)、过度或突然的体重增加、高于正常体重、肥胖、高于正常体重指数(BMI)、异常体重增加、异常血压、水潴留、遗传因素、异常蛋白尿、头痛、水肿、异常蛋白质/肌酐比、异常血小板计数、应激、未经产、异常巴氏测试结果(Pap涂片)、先前先兆子痫发作(例如PE的个人病史)、PE的家族史、先前妊娠的PE、肾病、血栓形成倾向或其任何组合。本公开提供了用于确认受试者、优选妊娠受试者中的先兆子痫的方法，包括对来源于受试者的样品进行测试，其中该测试包括测量多个标志物的水平，并使用水平以至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％、99.5％或更高的灵敏度、特异性和/或阴性预测值(NPV)值或者以至少0.80、0.85、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98、0.99、0.995或更大的ROC值确认PE。与PE相关的一个或多个症状可以是糖尿病(例如妊娠糖尿病、I型或II型糖尿病)、高于正常葡萄糖水平、高血压(例如慢性或非慢性高血压)、过度或突然的体重增加、高于正常体重、肥胖、高于正常体重指数(BMI)、异常体重增加、异常血压、水潴留、遗传因素、异常蛋白尿、头痛、水肿、异常蛋白质/肌酐比、异常血小板计数、应激、未经产、异常巴氏测试结果(Pap涂片)、先前先兆子痫发作(例如PE的个人病史)、PE的家族史、先前妊娠的PE、肾病、血栓形成倾向或其任何组合。本公开还提供了用于确认受试者、优选妊娠受试者是否没有患有先兆子痫的方法，该方法包括：评估来源于受试者的样品以确定样品中多个生物标志物的水平，使用多个生物标志物的水平以计算代表受试者没有患有先兆子痫的可能性的指数；并且基于该指数，确认受试者是否没有患有先兆子痫。一种用于确认受试者、优选妊娠受试者是否确实患有先兆子痫的方法，该方法包括：(a)评估来源于受试者的样品以确定样品中多种生物标志物的水平，(b)使用多个生物标志物的水平以计算代表受试者患有先兆子痫的可能性的指数；和(c)基于该指数，确认受试者是否确实患有先兆子痫。本公开还提供了用于确认受试者、优选妊娠受试者是否没有患有先兆子痫的方法，该方法包括：(a)评估来源于受试者的样品以确定样品中生物标志物的水平；和(b)使用该生物标志物的水平以计算代表受试者没有患有先兆子痫的可能性的指数；其中该生物标志物不是铁蛋白(FT)、组织蛋白酶B(CTSB)、组织蛋白酶C(CTSC)、触珠蛋白(HP)、α-2-巨球蛋白(A2M)、载脂蛋白E(ApoE)、载脂蛋白C-III(Apo-C3)、载脂蛋白A-1(ApoA1)、视黄醇结合蛋白4(RBP4)、血红蛋白(HB)、血纤蛋白原α(FGA)、皮卡丘素(pikachurin)(EGFLAM)或血红素。本公开提供了用于确认受试者、优选妊娠受试者是否确实患有先兆子痫的方法，该方法包括：(a)评估来源于受试者的样品以确定样品中生物标志物的水平；和(b)使用该生物标志物的水平以计算代表受试者确实患有先兆子痫的可能性的指数；其中该生物标志物不是铁蛋白(FT)、组织蛋白酶B(CTSB)、组织蛋白酶C(CTSC)、触珠蛋白(HP)、α-2-巨球蛋白(A2M)、载脂蛋白E(ApoE)、载脂蛋白C-III(Apo-C3)、载脂蛋白A-1(ApoA1)、视黄醇结合蛋白4(RBP4)、血红蛋白(HB)、血纤蛋白原α(FGA)、皮卡丘素(EGFLAM)或血红素。本公开还提供了用于确认具有至少一个与PE相关的症状的受试者、优选妊娠受试者是否患有PE的方法，该方法包括：(a)评估来源于受试者的样品以确定样品中的一个或多个生物标志物的水平；和(b)使用一个或多个生物标志物的水平计算代表女性确实患有PE的可能性的指数，以计算指数，其中一个或多个生物标志物不是铁蛋白(FT)、组织蛋白酶B(CTSB)、组织蛋白酶C(CTSC)、触珠蛋白(HP)、α-2-巨球蛋白(A2M)、载脂蛋白E(ApoE)、载脂蛋白C-III(Apo-C3)、载脂蛋白A-1(ApoA1)、视黄醇结合蛋白4(RBP4)、血红蛋白(HB)、血纤蛋白原α(FGA)、皮卡丘素(EGFLAM)或血红素。本公开还提供了用于确认没有至少一个与PE相关的症状的受试者、优选妊娠受试者是否没有患有PE的方法，该方法包括：(a)评估来源于受试者的样品以确定样品中一个或多个生物标志物的水平；本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫的方法，该方法包括：a)测量来源于女性受试者的样品中一个或多个生物标志物的水平；b)基于一个或多个生物标志物的水平计算指数；和c)基于指数，确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.07.30 US 62/031,132;2014.07.31 US 62/031,834;1.一种用于确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫的方法，该方法包括：a)测量来源于女性受试者的样品中一个或多个生物标志物的水平；b)基于一个或多个生物标志物的水平计算指数；和c)基于指数，确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫。2.权利要求1的方法，其中测量一个或多个生物标志物的水平包括测量三个或更多个生物标志物的水平。3.权利要求1的方法，其中测量一个或多个生物标志物的水平包括测量四个或更多个生物标志物的水平。4.权利要求1的方法，其中测量一个或多个生物标志物的水平包括测量五个或更多个生物标志物的水平。5.一种用于确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫的方法，该方法包括：a)测量来源于女性受试者的样品中一个或多个生物标志物的水平；b)将一个或多个生物标志物的水平与各自的重组蛋白水平或与标准值进行比较；和c)基于比较，确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫。6.权利要求5的方法，还包括基于一个或多个生物标志物的水平计算指数。7.一种用于确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫的方法，该方法包括：a)测量来源于女性受试者的样品中纤连蛋白(FN)和两个或更多个生物标志物的水平，其中两个或更多个生物标志物中的至少两个不同于纤连蛋白，b)基于FN和两个或更多个生物标志物的水平计算指数；和c)基于指数，确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫。8.权利要求7的方法，其中两个或更多个生物标志物选自sFLT-1、P1GF、ADAM-12、HPX和PAPP-A。9.权利要求7的方法，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF和PAPP-A。10.权利要求7的方法，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF、PAPP-A和ADAM-12。11.权利要求7的方法，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF、PAPP-A和HPX。12.权利要求7的方法，其中生物标志物是P1GF、PAPP-A和ADAM-12。13.权利要求7的方法，其中生物标志物是sFLT-1和P1GF。14.权利要求7的方法，其中生物标志物是P1GF和PAPP-A。15.权利要求7的方法，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF和ADAM-12。16.权利要求7的方法，其中生物标志物是sFLT-1和ADAM-12。17.权利要求7的方法，其中生物标志物是P1GF、ADAM-12、sFLT1、PAPP-A2和HPX。18.权利要求7、8、9、10、11、12、13、14、15、16或17的方法，还包括将指数与阈值进行比较。19.一种用于确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫的方法，该方法包括：a)使用选择性结合纤连蛋白(FN)或FN片段的单克隆抗体测量来源于女性受试者的样品中FN或FN片段的水平；b)将纤连蛋白(FN)或FN片段的水平与各自的重组蛋白水平或与标准值进行比较；和c)基于比较，确认存在或不存在先兆子痫。20.权利要求19的方法，还包括测量来源于女性受试者的样品中两个或更多个生物标志物的水平。21.权利要求20的方法，其中两个或更多个生物标志物选自sFLT-1、P1GF、ADAM-12、HPX和PAPP-A。22.权利要求20的方法，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF和PAPP-A。23.权利要求20的方法，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF、PAPP-A和ADAM-12。24.权利要求20的方法，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF、PAPP-A和HPX。25.权利要求20的方法，其中生物标志物是P1GF、PAPP-A和ADAM-12。26.权利要求20的方法，其中生物标志物是sFLT-1和P1GF。27.权利要求20的方法，其中生物标志物是P1GF和PAPP-A。28.权利要求20的方法，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF和ADAM-12。29.权利要求20的方法，其中生物标志物是sFLT-1和ADAM-12。30.权利要求20的方法，其中生物标志物是P1GF、FN、ADAM-12、sFLT1、PAPP-A2和HPX。31.权利要求19的方法，还包括基于结合的单克隆抗体的水平计算指数。32.权利要求20、22、23、24、25、26、27、28或29的方法，还包括基于(1)结合的单克隆抗体和(2)两个或更多个生物标志物的水平计算指数。33.权利要求31或32的方法，还包括将指数与阈值进行比较，其中指数指示女性受试者中存在或不存在先兆子痫。34.一种用于确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫的方法，该方法包括：a)测量来源于女性受试者的样品中sFLT、P1GF和一个或多个生物标志物的水平，其中一个或多个生物标志物不同于VEGF，其中VEGF不包括VEGFR-1；b)基于sFLT、P1GF和一个或多个生物标志物的水平计算指数；和c)基于指数，确定女性受试者中存在或不存在先兆子痫。35.权利要求34的方法，其中一个或多个生物标志物选自纤连蛋白(FN)、ADAM-12、HPX和PAPP-A。36.权利要求34的方法，其中生物标志物是ADAM-12。37.权利要求34的方法，其中生物标志物是PAPP-A。38.权利要求34的方法，其中生物标志物是纤连蛋白(FN)。39.权利要求34的方法，其中生物标志物是纤连蛋白(FN)和PAPP-A。40.权利要求34的方法，其中生物标志物是纤连蛋白(FN)和ADAM-12。41.权利要求34的方法，其中生物标志物是纤连蛋白(FN)、ADAM-12和PAPP-A。42.权利要求34的方法，其中生物标志物是纤连蛋白(FN)、HPX和PAPP-A。43.权利要求34的方法，其中生物标志物是FN、ADAM-12、PAPP-A2和HPX。44.权利要求34、35、36、37、38、39、40、41或42的方法，还包括将指数与阈值进行比较。45.一种用于确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫的方法，该方法包括：a)测量由以下组成的生物标志物的水平：sFLT和P1GF；b)基于sFLT和P1GF的水平计算指数；和c)基于指数，确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫。46.权利要求45的方法，其中计算包括将sFLT和P1GF的测量水平各自乘以独特的权重因子，以及将一个或多个二元函数应用于sFLT和P1GF的加权测量水平。47.一种用于诊断、预后、表征、监测、确定女性受试者中先兆子痫的严重性、确认女性受试者中存在先兆子痫或确认女性受试者中不存在先兆子痫的方法，该方法包括：a)在两个不同的测定中测量至少一个纤连蛋白(FN)片段的水平，其中测定确定来源于女性受试者的样品中FN的水平；和b)基于在两个不同测定中测量的至少一个FN片段的水平，诊断、预后、表征、监测、确定女性受试者中先兆子痫的严重性、确认女性受试者中存在先兆子痫或确认女性受试者中不存在先兆子痫。48.权利要求47的方法，其中两个不同测定中的每一个测定使用不同的单克隆抗体。49.权利要求48的方法，还包括测量来源于女性受试者的样品中一个或多个生物标志物的水平，其中一个或多个生物标志物不同于纤连蛋白(FN)。50.权利要求49的方法，其中生物标志物选自sFLT-1、P1GF、ADAM-12、HPX和PAPP-A。51.权利要求49的方法，其中生物标志物是sFLT-1或P1GF。52.权利要求49的方法，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF或PAPP-A。53.权利要求49的方法，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF或ADAM-12。54.权利要求49的方法，其中生物标志物是P1GF、ADAM-12、sFLT1、PAPP-A2和HPX。55.权利要求49、50、51、52、53或54的方法，还包括基于(1)结合的单克隆抗体和(2)一个或多个生物标志物的水平计算指数。56.权利要求1、5、7、34或47的方法，其中测量包括：用对待测生物标志物具有亲和力的抗体包被免疫测定板；和用非特异性阻断蛋白质包被免疫测定板。57.权利要求56的方法，还包括：将标记的生物标志物与样品混合得到混合物；并将混合物加入免疫测定板。58.权利要求56的方法，还包括：将样品引入免疫测定板；和将缀合的二抗引入免疫测定板。59.权利要求1、6或55的方法，还包括将指数与阈值进行比较。60.权利要求7、18、31、32、33、34、44或59的方法，其中指数通过用于总计测量的生物标志物水平的实函数算法计算，其中算法包括将一个或多个变量乘以一个或多个对应的权重因子，其中生物标志物水平中每一个的水平被输入到一个或多个变量中的具体变量中，其中对应的权重因子对于每个具体变量是独特的，其中一个或多个对应的权重因子中的至少一个不同于一。61.权利要求60的方法，其中算法包括至少一个二元运算。62.权利要求61的方法，其中至少一个二元运算是除法。63.权利要求61的方法，其中至少一个二元运算是加法或减法。64.权利要求60的方法，其中一个或多个权重因子是两个生物标志物的测量水平的比率。65.权利要求1、5、7、19、34或47的方法，还包括产生指示女性受试者中存在或不存在先兆子痫的报告。66.权利要求1、5、7、19、34或47的方法，其中该方法不包括考虑血压、血糖水平、尿蛋白水平、先兆子痫家族史或体重增加。67.权利要求1、5、7、19、34或47的方法，其中女性受试者具有由以下组成的组中的至少一个症状：高于140/90mmHg的血压、高于100mg/dL的空腹血糖水平、在24小时收集中尿蛋白水平超过5克或者至少分开四小时收集的两个随机尿样的尿蛋白水平超过3+、一周中体重增加超过两磅、血小板水平在妊娠中期低于155,000(每微升)或在妊娠晚期过程中低于145,000(每微升)、在24小时内少于400毫升的少尿、高于25的体重指数、先兆子痫家族史、肺水肿、紫绀和视力变化。68.权利要求1或5的方法，其中一个或多个生物标志物选自sFLT-1、P1GF、纤连蛋白(FN)、ADAM-12、HPX和PAPP-A。69.权利要求1、5、7、19、34或47的方法，其中生物标志物不包括铁蛋白(FT)、组织蛋白酶B(CTSB)、组织蛋白酶C(CTSC)、触珠蛋白(HP)、α-2-巨球蛋白(A2M)、载脂蛋白E(ApoE)、载脂蛋白C-III(Apo-C3)、载脂蛋白A-1(ApoA1)、视黄醇结合蛋白4(RBP4)、血红蛋白(HB)、血纤蛋白原α(FGA)、皮卡丘素(EGFLAM)、游离人绒毛膜促性腺激素(游离βhCG)和血红素。70.如权利要求18、44或59的方法，其中比较包括将生物标志物与(1)患有先兆子痫的单个妊娠女性或妊娠女性组的生物标志物和(2)没有患有先兆子痫的妊娠女性组的生物标志物进行比较。71.权利要求70的方法，其中单个妊娠女性是女性受试者。72.权利要求70的方法，其中比较包括将生物标志物与各自的重组蛋白指数值进行比较。73.权利要求1、5、7、19、34或47的方法，其中生物标志物包括一个或多个蛋白质或蛋白质片段。74.权利要求1、5、7、19、34或47的方法，其中生物标志物包括多核苷酸。75.权利要求1、5、7、19、34或47的方法，其中测量包括利用免疫测定、质谱、色谱、比浊法、辐射状免疫扩散或单向辐射状免疫扩散测定。76.权利要求1、5、7、19、34或47的方法，其中测量包括通过免疫测定测量。77.权利要求76的方法，其中免疫测定选自ELISA、夹心ELISA、竞争性ELISA和IgM抗体捕获ELISA。78.一种用于诊断、预后、监测、表征、确定女性受试者中先兆子痫的严重性、确认女性受试者中存在先兆子痫或确认女性受试者中不存在先兆子痫的试剂盒，该试剂盒包含：至少两种不同的特异性用于测定来源于女性受试者的样品中纤连蛋白(FN)的水平的试剂。79.权利要求78的试剂盒，其还包含两个或更多个用于测量来源于女性受试者的样品中两个或更多个生物标志物的水平的试剂。80.权利要求79的试剂盒，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF和PAPP-A。81.权利要求79的试剂盒，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF、PAPP-A和ADAM-12。82.权利要求79的试剂盒，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF、PAPP-A和HPX。83.权利要求79的试剂盒，其中生物标志物是P1GF、PAPP-A和ADAM-12。84.权利要求79的试剂盒，其中生物标志物是sFLT-1和P1GF。85.权利要求79的试剂盒，其中生物标志物是P1GF和PAPP-A。86.权利要求79的试剂盒，其中生物标志物是sFLT-1、P1GF和ADAM-12。87.权利要求79的试剂盒，其中生物标志物是sFLT-1和ADAM-12。88.权利要求79的试剂盒，其中生物标志物是P1GF、FN、ADAM-12、sFLT1、PAPP-A2和HPX。89.权利要求78或79的试剂盒，其中该试剂盒不包括用于测量选自以下生物标志物的水平的试剂：铁蛋白(FT)、组织蛋白酶B(CTSB)、组织蛋白酶C(CTSC)、触珠蛋白(HP)、α-2-巨球蛋白(A2M)、载脂蛋白E(ApoE)、载脂蛋白C-III(Apo-C3)、载脂蛋白A-1(ApoA1)、视黄醇结合蛋白4(RBP4)、血红蛋白(HB)、血纤蛋白原α(FGA)、皮卡丘素(EGFLAM)、游离βhPC和血红素。90.一种用于确认女性受试者中存在或不存在先兆子痫的试剂盒，该试剂盒包括：a)特异性用于测定PAPP-A水平的第一试剂；和b)特异性用于测定ADAM12水平的第二试剂。91.权...

【专利技术属性】
技术研发人员：马修·库珀，林达尔·赫斯特贝格，埃里克·孔克尔，埃万杰洛斯·希托普洛斯，金伯利·施瓦茨，
申请(专利权)人：马修·库珀，林达尔·赫斯特贝格，埃里克·孔克尔，埃万杰洛斯·希托普洛斯，金伯利·施瓦茨，
类型：发明
国别省市：美国,US