The present invention discloses a SNP marker related to chili hotness and its application. The application of the invention provided specifically for the pepper genome following SNP loci of single nucleotide polymorphisms or single nucleotide polymorphisms for substance detection in the pepper genome following SNP loci in the identification or identification of pepper spicy characters in the auxiliary application; the SNP locus in the pepper genome corresponding to the sequence in the sequence table 4 shows the nucleotide sequence twenty-fourth; the nucleotide SNP site is A or C. The invention does not need to be determined by the ripening period of the pepper fruit, only when the DNA of the pepper plants is detected at the seedling stage, can it determine whether or not the hotness of the pepper is hot, and can be widely applied to the molecular marker assisted breeding. Moreover, the marker can be detected in large quantities by KASPar genotyping technology, which can improve efficiency and shorten identification time.
【技术实现步骤摘要】
与辣椒辣味相关的SNP标记及其应用
本专利技术属于分子生物学领域,涉及一种与辣椒辣味相关的SNP标记及其应用。
技术介绍
辣椒(Capsicumspp.)的“辣味”,由辣椒果实特有的辣椒素引起的灼痛感,辣椒辣味的有无为质量性状,由显性Pun(最早用C表示)基因位点控制,Pun基因的突变导致辣椒辣味的丢失,产生人们所说的甜椒。在辣椒遗传育种中常根据不同的育种目标,选择辣椒或者甜椒育种材料,但往往要等到辣椒果实成熟后才进行选择,比较费时。分子标记辅助育种针对基因型筛选种质资源,避免表型选择的盲目性,大大缩短育种进程,提高育种效率。获得与辣椒辣味性状连锁的分子标记,特别是针对目标基因的关键突变位点开发的功能性分子标记是利用分子标记辅助辣椒辣味转育,实现种质创新的重要条件。虽然基于PCR和电泳技术的分子标记辅助选择可大大提高效率,但仍存在成本较高、通量低等问题。KASPar技术的SNP分子标记的高灵敏度和高通量,以及成本较低、易操作等优点在分子标记辅助选择中具有独特优势。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种与辣椒辣味相关的SNP标记及其应用。本专利技术所提供的应用具体为辣椒基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性或用于检测辣椒基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质在鉴定或辅助鉴定辣椒辣味性状中的应用;所述SNP位点在辣椒基因组中对应于序列表中序列4所示核苷酸序列的第24位;所述SNP位点处的核苷酸为A或C。本专利技术还提供了一种用于鉴定或辅助鉴定辣椒辣味性状的试剂。本专利技术所提供的用于鉴定或辅助鉴定辣椒辣味性状的试剂,具体是用于检测辣椒基因组中如下SNP位 ...
【技术保护点】
辣椒基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性或用于检测辣椒基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质在鉴定或辅助鉴定辣椒辣味性状中的应用;所述SNP位点在辣椒基因组中对应于序列表中序列4所示核苷酸序列的第24位;所述SNP位点处的核苷酸为A或C。
【技术特征摘要】
1.辣椒基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性或用于检测辣椒基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质在鉴定或辅助鉴定辣椒辣味性状中的应用;所述SNP位点在辣椒基因组中对应于序列表中序列4所示核苷酸序列的第24位;所述SNP位点处的核苷酸为A或C。2.用于鉴定或辅助鉴定辣椒辣味性状的试剂,是用于检测辣椒基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质;所述SNP位点在辣椒基因组中对应于序列表中序列4所示核苷酸序列的第24位;所述SNP位点处的核苷酸为A或C;具体的,所述“用于检测辣椒基因组中如下SNP位点的单核苷酸多态性的物质”为如下a)或b):a)成套单链DNA甲,为如下(a1)或(a2):(a1)由序列表中序列1的第22-45位核苷酸所示的单链DNA、序列表中序列2的第22-45位核苷酸所示的单链DNA、和序列表中序列3所示的单链DNA组成的成套单链DNA;(a2)由将序列表中序列1的第22-45位核苷酸、序列表中序列2的第22-45位核苷酸和序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的三条单链DNA分子组成的,且与(a1)中所述成套单链DNA功能相同的成套单链DNA;b)成套单链DNA乙,为如下(b1)或(b2):(b1)由序列表中序列1所示的单链DNA、序列表中序列2所示的单链DNA、和序列表中序列3所示的单链DNA组成的成套单链DNA;(b2)由将序列表中序列1、序列2和序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的三条单链DNA分子组成的,且与(b1)中所述成套单链DNA功能相同的成套单链DNA。3.用于鉴定或辅助鉴定辣椒辣味性状的试剂盒,含有权利要求2所述的试剂;具体的,所述试剂盒中还含有荧光探针A、荧光探针B、淬灭探针A和淬灭探针B;所述荧光探针A的核苷酸序列为序列表中序列1的第1-21位,5’末端连接荧光基团A;所述淬灭探针A的核苷酸序列为序列表中序列1的第1-21位的反向互补序列,3’末端连接淬灭基团;所述荧光探针B的核苷酸序列为序列表中序列2的第1-21位,5’末端连接荧光基团B;所述淬灭探针B的核苷酸序列为序列表中序列2的第1-21位的反向互补序列,3’末端连接淬灭基团;更加具体的,所述荧光基团A为FAM;所述荧光基团B为HEX;所述淬灭基团为Q。4.权利要求2所述试剂或权利要求3所述试剂盒在鉴定或辅助鉴定辣椒辣味性状中的应用。5.一种鉴定或辅助...
【专利技术属性】
技术研发人员:张正海,张宝玺,王立浩,曹亚从,
申请(专利权)人:中国农业科学院蔬菜花卉研究所,
类型:发明
国别省市:北京,11
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