C/EBPα组合物和使用方法技术

技术编号:16047166 阅读:59 留言:0更新日期:2017-08-20 06:25
本发明专利技术涉及靶向C/EBPα转录物的saRNA和包含所述saRNA的治疗性组合物。还提供了使用所述治疗性组合物的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】C/EBPα组合物和使用方法相关申请的交叉引用本申请要求2013年11月22日提交的美国临时申请号61/907,732的优先权,所述文献的内容通过引用的方式完整并入本文。
本专利技术涉及用于调节C/EBPα和C/EBPα途径的多核苷酸、尤其saRNA、组合物,并且涉及在治疗性应用如治疗代谢疾病、过度增生性疾病和调节干细胞系中使用该组合物的方法。专利技术背景CCAAT/增强子结合蛋白α(C/EBPα,C/EBPα或C/EBPA)是一种在人类和大鼠之间保守的亮氨酸拉链蛋白。这种核转录因子富含于肝细胞、骨髓单核细胞、脂肪细胞以及其他类型的乳腺上皮细胞中[Lekstrom-Himes等人,J.Bio.Chem,vol.273,28545-28548(1998)]。它由N端部分中的两个激活结构域,和介导与其他C/EBP家族成员二聚化的亮氨酸拉链区域,和在C端部分的DNA结合结构域组成。C/EBP转录因子家族的结合位点存在于参与维持正常肝细胞功能和损伤反应的多种基因的启动子区中。C/EBPα对涉及免疫和炎症反应、发育、细胞增殖、抗凋亡和几条代谢途径的几种肝特异性基因的转录具有多效性影响[Darlington等人,CurrentOpinionofGeneticDevelopment,vol.5(5),565-570(1995)]。它对维持肝细胞分化状态至关重要。它激活白蛋白转录并协调编码多种参与脲产生的鸟氨酸循环酶的基因的表达,因此在正常肝功能中发挥重要作用。在成年肝脏中,C/EBPα定义为在终末分化的肝细胞中发挥作用,而快速增殖的肝瘤细胞仅表达C/EBPα的一部分[Umek等人,Science,vol.251,288-292(1991)]。已知C/EBPα通过上调视网膜母细胞瘤并抑制Cdk2和Cdk4,而上调细胞增殖强力抑制剂p21[Timchenko等人,Genes&Development,vol.10,804-815(1996);Wang等人,MolecularCell,vol.8,817-828(2001)]。在肝细胞癌(HCC)中,C/EBPα作为具有抗增殖性特性的肿瘤抑制物发挥作用[Iakova等人,SeminarsinCancerBiology,vol.21(1),28-34(2011)]。多种方法被实施用以研究C/EBPαmRNA或蛋白的调节作用。已知C/EBPα蛋白通过翻译后磷酸化和SUMO化而受到调节。例如,FLT3酪氨酸激酶抑制剂和胞外信号调节的激酶1和/或2(ERK1/2)阻断C/EBPα的丝氨酸-21磷酸化,这增加了C/EBPα蛋白的粒细胞分化潜能[Radomska等人,JournalofExperimentalMedicine,vol.203(2),371-381(2006)和Ross等人,MolecularandCellularBiology,vol.24(2),675-686(2004)]。此外,C/EBPα翻译可以由2-氰基-3,12-二氧齐墩果烷-1,9-二烯-28-酸(CDDO)高效诱导,这改变了C/EBPα蛋白同工型的比率,有利于全长p42形式超过p30形式,从而诱导粒细胞分化[Koschmieder等人,Blood,vol.110(10),3695-3705(2007)]。C/EBPα基因是位于染色体19q13.1上的无内含子基因。大部分真核细胞使用RNA-互补性作为调节基因表达的机制。一个例子是使用双链短干扰性RNA借助RNA诱导性沉默复合体(RISC)敲减基因表达的RNA干扰(RNAi)途径。现已确立,短双链体RNA寡核苷酸还具有靶向基因的启动子区并介导这些基因的转录激活的能力,并且它们已被称作RNA活化(RNAa)、抗基因RNA(agRNA)或短活化性RNA(saRNA)[Li等人,PNAS,vol.103,17337-17342(2006)]。saRNA诱导的基因激活在其他哺乳动物物种(包括小鼠、大鼠和非人灵长类)中保守并且正迅速成为一种研究基因内源上调的影响的流行方法。因此,需要用saRNA出于治疗目的靶向调节C/EBPα。专利技术概述本专利技术提供了设计、制备、制造、配制和/或使用出于治疗目的(包括诊断和预后)而调节C/EBPα基因表达和/或功能的短活化性RNA(saRNA)分子的组合物、方法和试剂盒。本专利技术的一个方面提供一种包含靶向C/EBPα转录物的saRNA和至少一种可药用载体的药物组合物。本专利技术的另一个方面提供一种调节受试者的代谢途径的方法,所述方法包括向所述受试者施用靶向C/EBPα转录物的saRNA。本专利技术的另一个方面提供一种抑制过度增殖性细胞增殖的方法,所述方法包括使细胞与靶向C/EBPα转录物的saRNA接触。本专利技术的另一个方面提供一种治疗或预防过度增殖性疾病的方法,所述方法包括向患有所述过度增殖性疾病的受试者施用靶向C/EBPα转录物的saRNA。本专利技术的另一个方面提供一种调节细胞上皮-间充质转变的方法,所述方法包括使细胞与靶向C/EBPα转录物的saRNA接触。本专利技术的又一个方面提供一种调节干细胞分化和多能性的方法,所述方法包括使所述干细胞与靶向C/EBPα转录物的saRNA接触。在下文描述中叙述了本专利技术的多种实施方案的详细内容。本专利技术的其他特征、目的和优点将从本描述及附图并且从权利要求书中显而易见。附图简述前述目的和其他目的、特征和优点将从以下对如附图中所示的本专利技术具体实施方案的描述显而易见,其中相同参考字符在不同视图间始终指相同的部分。附图不必然地符合比例,反而重点在于说明本专利技术各种实施方案的原理。图1显示C/EBPα对肝脏的主要影响。图2显示C/EBPα对脂肪组织的次要影响。图3是一系列说明本专利技术saRNA的作用的直方图。A显示在HepG2细胞中转染C/EBPα-saRNA正向调节C/EBPα基因的表达;B显示在HepG2细胞中转染C/EBPα-saRNA正向调节白蛋白基因的表达。C是剂量递增的C/EBPα-saRNA显示在96小时内对C/EBPα基因表达的剂量-依赖性影响。D是剂量递增的C/EBPα-saRNA显示在96小时内对白蛋白基因表达的剂量-依赖性影响。组图E-G显示白蛋白启动子(白蛋白D框)结合蛋白(DBP)的D位点,并且白蛋白(ALB)均具有一个或多个C/EBPα结合位点。该组图显示了含有各自基因上游和下游2000个核苷酸的(E)C/EBPα、(F)DBP和(G)白蛋白(ALB)的基因组区。显示了染色体坐标(“尺度”和染色体标示符)、C/EBPα结合位点(“CEBPA”;黑色框)、C/EBPα结合基序(“GCAAT基序”;黑色竖直线)的出现和基因组区内部的RefSeq基因(蓝色框和线)。图4显示对甲基化状态和对基因表达影响的研究。A-B显示对(A)C/EBPA和(B)DBP的启动子区处CpG岛的甲基化分析,表明与对照相比时甲基化减少。C:对人白蛋白特异的酶联免疫吸附测定(ELISA)检测到在20nMC/EBPα-saRNA转染后白蛋白分泌明显增加。D:在C/EBPα-saRNA转染的细胞中编码鸟氨酸循环酶鸟氨酸氨甲酰基转移酶(OTC)的基因表达增加,提示产生脲的能力改善。E:在C/EBPα-saRNA转染的细本文档来自技高网...
C/EBPα组合物和使用方法

【技术保护点】
一种调节细胞中基因表达的方法,所述方法包括使所述细胞接触包含靶向C/EBPα转录物的saRNA的组合物,其中所述基因选自癌基因或肿瘤抑制基因。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2013.11.22 US 61/907,7321.一种调节细胞中基因表达的方法,所述方法包括使所述细胞接触包含靶向C/EBPα转录物的saRNA的组合物,其中所述基因选自癌基因或肿瘤抑制基因。2.根据权利要求1所述的方法,其中所述基因是癌基因。3.根据权利要求2所述的方法,其中所述癌基因的表达减少。4.根据权利要求3所述的方法,其中所述癌基因的表达减至少1倍。5.根据权利要求2所述的方法,其中所述基因选自ADAM17、AKT1、ANGPT2、BCL2、BCL2L1、BIRC2、BIRC5、CCL5、CCND1、CCND2、CDH1、CDH13、CDKN1A、CDKN1B、CDKN2A、CFLAR、CTNNB1、CXCR4、E2F1、EGF、EGFR、EP300、FADD、FLT1、FZD7、GSTP1、HGF、HRAS、IGFBP1、IGFBP3、IRS1、ITGB1、KDR、MCL1、MET、MSH2、MSH3、MTDH、MYC、NFKB1、NRAS、OPCML、PDGFRA、PIN1、PTGS2、PYCARD、RAC1、RASSF1、RELN、RHOA、SFRP2、SMAD7、SOCS1、STAT3、TCF4、TERT、TGFA、TGFB1、TLR4、TNFRSF10B、VEGFA、WT1、XIAP和YAP1。6.根据权利要求1所述的方法,其中所述基因是肿瘤抑制基因。7.根据权利要求7所述的方法,其中所述肿瘤抑制基因的表达增加。8.根据权利要求8所述的方法,其中所述肿瘤抑制基因的表达增加至少1倍。9.根据权利要求9所述的方法,其中所述基因选自BAX、BID、CASP8、DAB21P、DLC1、FAS、FHIT、GADD45B、HHIP、IGF2、LEF1、PTEN、PTK2、RB1、RUNX3、SMAD4、SOCS3、TGFBR2、TNFBR2、TNFSF10和P53。10.根据权利要求1所述的方法,其中所述saRNA包含SEQIDNo.2、4、6、8、10或12。11.一种减少过度增殖性细胞增殖的方法,所述方法包括使细胞接触包含靶向C/EBPα转录物的saRNA的组合物。12.根据权利要求11所述的方法,其中所述过度增殖性细胞是肿瘤细胞。13.根据权利要求12所述的方法,其中所述过度增殖性细胞是肝肿瘤细胞、乳腺癌细胞、白血病细胞、淋巴瘤细胞、肺癌细胞、卵巢癌细胞或胰腺癌细胞。14.根据权利要求11所述的方法,其中saRNA包含SEQIDNo.2、4、6、8、10或12。15.一种治疗或预防过度增殖性疾病的方法,所述方法包括向有需求的受试者施用包含靶向C/EBPα转录物的saRNA的组合物。16.根据权利要求15所述的方法,其中所述过度增殖性疾病是肿瘤。17.根据权利要求16所述的方法,其中所述肿瘤的负荷减少至少10%。18.根据权利要求16所述的方法,其中所述肿瘤选自肝细胞癌、乳腺癌、肺癌、白血病、卵巢癌和胰腺癌。19.根据权利要求18所述的方法,其中所述肿瘤是肝细胞癌。20.根据权利要求18所述的方法,其中所述肿瘤是乳腺癌。21.根据权利要求20所述的方法,其中所述组合物还包含抑制C/EBPβ基因表达的siRNA。22.根据权利要求15所述的方法,其中所述saRNA包含SEQIDNo.2、4、6、8、10或12。23.根据权利要求21所述的方法,其中所述siRNA包含SEQIDNo.30或32。24.一种调节细胞中微RNA表达的方法,所述方法包括使细胞接触包含靶向C/EBPα转录物的saRNA的组合物。25.根据权利要求24所述的方法,其中所述细胞是肿瘤细胞。26.根据权利要求25所述的方法,其中所述微RNA是致瘤性微RNA。27.根据权利要求26所述的方法,其中所述微RNA的表达减少。28.根据权利要求27所述的方法,其中所述微RNA的表达减少至少1倍。29.根据权利要求26所述的方法,其中所述微RNA选自hsa-miR-20b-5p、hsa-miR-125a-5p、hsa-miR-148b-3p、hsa-miR-92a-3p、hsa-miR-378a-3p、hsa-miR-130a-3p、hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-132-3p、hsa-miR-193b-3p、hsa-miR-183-5p、hsa-miR-148a-3p、hsa-miR-138-5p、hsa-miR-373-3p、hsa-miR-29b-3p、hsa-miR-135b-5p、hsa-miR-21-5p、hsa-miR-181d、hsa-miR-301a-3p、hsa-miR-200c-3p、hsa-miR-7-5p、hsa-miR-29a-3p、hsa-miR-210、hsa-miR-17-5p、hsa-miR-98-5p、hsa-miR-25-3p、hsa-miR-143-3p、hsa-miR-19a-3p、hsa-miR-18a-5p、hsa-miR-125b-5p、hsa-miR-126-3p、hsa-miR-27a-3p、hsa-miR-372、hsa-miR-149-5p和hsa-miR-32-5p。30.根据权利要求25所述的方法,其中所述微RNA是肿瘤抑制性微RNA。31.根据权利要求30所述的方法,其中所述微RNA的表达增加。32.根据权利要求31所述的方法,其中所述微RNA的表达增加至少1倍。33.根据权利要求30所述的方法,其中所述微RNA选自hsa-let-7a-5p、hsa-miR-133b、hsa-miR-122-5p、hsa-miR-335-5p、hsa-miR-196a-5p、hsa-miR-142-5p、hsa-miR-96-5p、hsa-miR-184、hsa-miR-214-3p、hsa-miR-15a-5p、hsa-let-7b-5p、hsa-miR-205-5p、hsa-miR-181a-5p、hsa-miR-140-5p、hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-34c-5p、hsa-miR-134、hsa-let-7g-5p、hsa-let-7c、hsa-miR-218-5p、hsa-miR-206、hsa-miR-124-3p、hsa-miR-100-5p、hsa-miR-10b-5p、hsa-miR-155-5p、hsa-miR-1、hsa-miR-150-5p、hsa-let-7i-5p、hsa-miR-27b-3p、hsa-miR-127-5p、hsa-miR-191-5p、hsa-let-7f-5p、hsa-miR-10a-5p、hsa-miR-15b-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-144-3p、hsa-miR-128、hsa-miR-215、hsa-miR-193a-5p、hsa-miR-23b-3p和hsa-miR-203a。34.根据权利要求24所述的方法,其中所述saRNA包含SEQIDNo.2、4、6、8、10或12。35.一种治疗非酒精性脂肪肝病、肝...

【专利技术属性】
技术研发人员:P·塞尔特龙
申请(专利权)人:米纳治疗有限公司
类型:发明
国别省市:英国,GB

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