一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法和试剂盒及应用技术

本发明专利技术公开一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法和试剂盒及应用。本发明专利技术将光倒刺鲃的黑素皮质激素受体的启动子第‑686位和第‑522位核苷酸分别命名为SNP1和SNP2，并进行检测；第SNP1位为CT杂合子时为快速生长群体，为C纯合子时为次快速生长群体，为T纯合子时为劣势群体；第SNP2位为AG杂合子时为快速生长群体，为G纯合子时为次快速生长群体，为A纯合子时为劣势群体；由于微效基因的加性效应，当SNP1位点和SNP2位点均为杂合子时生长速度最快，当两个位点中只有一个是杂合子另一个是生长较快的纯合子时，生长速度次之，其他以此类推。依据该方法，得到试剂盒，并用于光倒刺鲃快速生长个体的快速筛选中。

A rapid screening of Spinibarbus hollandi rapid growth of individual methods and kits and Application

The invention discloses a method for rapid screening of Spinibarbus hollandi rapid growth of individual methods and kits and application. The invention of the Spinibarbus hollandi melanocortin receptor promoter article 686 and article 522 nucleotides were named as SNP1 and SNP2, and the SNP1 for detection; CT heterozygous for the rapid growth of population, as for rapid growth of C homozygous group, T homozygous for vulnerable groups; the SNP2 was AG heterozygous for the rapid growth of population, as for rapid growth of G homozygous group, A homozygous for the disadvantaged group; due to the additive effect genes, when SNP1 loci and SNP2 loci were heterozygous at the fastest growth rate, while two loci only one is heterozygous for another growth homozygous, growth rate of other and so on. According to the method, get the kit for rapid screening and rapid growth in individual Spinibarbus hollandi.

【技术实现步骤摘要】
一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法和试剂盒及应用
本专利技术属于水产遗传和分子育种
，特别涉及一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法和试剂盒及应用。
技术介绍
光倒刺鲃(Spinibarbushollandi)属鲤形目，鲤科，鲃亚科，倒刺鲃属。具有个体大、生长快、食性广、耐低氧、抗病力强、易养殖等优点。分布于长江、钱塘江、闽江、九龙江、珠江、元江、台湾岛及海南岛等诸水系。由于光倒刺鲃近亲繁殖，肆意杂交导致光倒刺鲃的种质资源遭到破坏，使其物种退化，造成减产，易感病等结果，对于光倒刺鲃的种质改善是当下亟待解决的问题。单核苷酸多态性，全称(SingleNucleotidePolymorphisms，SNPs)，是指在基因组上单个核苷酸的变异，包括转换、颠换、缺失和插入，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富。在人类的基因组中每1000个碱基中，就存在一个SNP。在鱼类中，SNP可能会影响到鱼类的免疫，代谢，耐低氧程度，生长性状等等，以SNP作为分子标记进行辅助育种，将会极大地提高筛选的速度以及准确率。黑素皮质激素受体(Melanocortin-4Receptor，MC4R)，是一种G蛋白偶联受体，与体内的能量平衡，脂肪代谢，平衡等其他方面有着广泛的影响。MC4R由于是重要的生长性状控制基因，该基因的多态性也会导致生物生长指标的多态性，对MC4R的研究有着很大的经济价值，所以近年来在畜牧业和渔业对该基因十分关注。目前，还没有关于光倒刺鲃的MC4RSNP与光倒刺鲃生长特性的相关研究报道。
技术实现思路
本专利技术的首要目的在于克服现有技术的缺点与不足，提供一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法。本专利技术的另一目的在于提供一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的试剂盒。本专利技术的再一目的在于提供所述的快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法以及试剂盒的应用。本专利技术的目的通过下述技术方案实现：一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法，包括如下步骤：(1)将光倒刺鲃的黑素皮质激素受体的启动子第-686位和第-522位核苷酸分别命名为SNP1和SNP2，并进行检测；(2)依据如下标准进行筛选：①第SNP1位为CT杂合子时为快速生长群体；为C纯合子时为次快速生长群体；为T纯合子时为劣势群体；②第SNP2位为AG杂合子时为快速生长群体；为G纯合子时为次快速生长群体；为A纯合子时为劣势群体；③由于微效基因的加性效应，当SNP1位点和SNP2位点均为杂合子时生长速度最快；当两个位点中只有一个是杂合子另一个是生长较快的纯合子时，生长速度次之；其他以此类推，即按生长速度，SNP1位点和SNP2位点均为杂合子＞SNP1位点和SNP2位点中一个为杂合子且另一个为生长较快纯合子(C纯合子或G纯合子)＞SNP1位点和SNP2位点均为生长较快纯合子(C纯合子和G纯合子)＞SNP1位点和SNP2位点中一个为杂合子且另一个为生长较慢纯合子＞SNP1位点和SNP2位点中一个为生长较快纯合子且另一个为生长较慢纯合子＞SNP1位点和SNP2位点均为生长较慢纯合子(T纯合子和A纯合子)。步骤(1)中所述的光倒刺鲃的黑素皮质激素受体基因组序列如下(SEQIDNO.1)所示；或是如下(SEQIDNO.1)所示的序列发生一个或若干个突变、或缺失的序列；下划线部分为编码区，粗体方框部分为发现的SNPs位点。ATATCTTTAGATTTATTCACAAACTAAAGTGACTCTCTTTGCATGAATCGTTGGATTATTAATATAGCCAATTCATTCAAAAATTGACTCATTCAGAAATTAAACAAGTGATTGTCGCAGTGAATCACTGAATCATTTATATATTTAAATATACTTTGAATTACTTGATTTTATAAACATACCATCAAAATGCTTTAAGAAATCATGCACTTCCTATAAAGGATTTTATCTATTTGTTGAAAACAAGGCAACCCCATTCATACACTGACCTCCTTCTGATATTTGCTTACATTCACCCATCAGAACTGCCTCTGATTGGTGGAGAAAGCTGGGGGAGGAGCCTGGGCTCAGTGTGCCAGACAGTGGCTGTGGAGGCAAGAGTATCTCACTCGCCCGCCTGCCAAGTGCTGGAAGCTCTGGAGACTGCCTCGCTCTGAACACTGTTTGCACTTCAACAGTGTTGAAACAGAGTCAGCGTTTTCAGATTCGGTCAACTGACGCTGTCTCCTATCCTCTGATTCTCTGTCTGCATGTTTCTGTCTCTATTTTTTTTACATTTTATTTATTTTTGTTTTGTGTAGGAGGCTCTTGCAGACCACTGGCGGACGTTTTTGCTGATTTGGAGGAAGAGTTATCACAGAGGTGAGGTGACGGATGCTCACACAGCACCTGCTTTGTTTGATCTACATGACGGATGATGTTCAATTTGAATTCACCTGACTGAAGTAGACACAGATCAAAACACTGACTACAGATATTAAGGGAAATGAACACCTCACATCATCATGGACTGCATCATTCATACCGGAATCACAGCCAGGGAGCTTTACCGGTGGGAAAGCCTGCTCAGGGCGAGAGAAGATCAACCTCTGGATGCTATGAGCAGCTGCTCATCTCCACAGAGGTCTTCCTCACACTCGGGCTCGTCAGTCTCCTGGAGAACATTCTGGTGATTGCGGCTATTGTCAAGACAAGAACTTCATCTCCCATGTACTTCTTTATCTGCAGTTTAGCCGTAGCAGACTTGTTGGTCAGTGTCTCCAATGCGTCAGAAACAGTAGTGATGGCGCTCATCACGGGTGGCAACCTGACCAATCGCGAGAGCATCATCAAGAACATGGACAACATTTTTGACTCGATGATCTGCAGCTCGCTGTTGGCCTCCATTTGGAGTTTGTTGGCCATTGCGGTGGACCGCTACATCACAATCTTCTACGCTTTGCGCTACCACAACATCATGACCCAACGGCGGGCGGGCACCATCATCACCTGCATTTGGACCTTCTGCACGGTCTCTGGTGTGCTCTTTATCGTGTACTCGGAGAGCACCACCGTTCTCATCTGCCTTATCAGCATGTTCTTCACCATGCTGGCGCTTATGGCCTCGCTCTATGTCCACATGTTTCTTCTAGCCCGACTGCACATGAAGCGCATTGCCGCCCTCCCCGGCAACGGCCCTATCTGGCAGGCGGCAAATATGAAAGGGGCCATCACCATCACTATCCTGCTGGGTGTATTCGTGGTGTGCTGGGCTCCCTTTTTCTTGCACCTCATCCTCATGATCTCCTGCCCTCGGAACCCTTATTGCATCTGTTTCATGTCCCACTTCAA本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法，其特征在于包括如下步骤：(1)将光倒刺鲃的黑素皮质激素受体的启动子第‑686位和第‑522位核苷酸分别命名为SNP1和SNP2，并进行检测；(2)依据如下标准进行筛选：①第SNP1位为CT杂合子时为快速生长群体；为C纯合子时为次快速生长群体；为T纯合子时为劣势群体；②第SNP2位为AG杂合子时为快速生长群体；为G纯合子时为次快速生长群体；为A纯合子时为劣势群体；③由于微效基因的加性效应，按生长速度，SNP1位点和SNP2位点均为杂合子＞SNP1位点和SNP2位点中一个为杂合子且另一个为生长较快纯合子＞SNP1位点和SNP2位点均为生长较快纯合子＞SNP1位点和SNP2位点中一个为杂合子且另一个为生长较慢纯合子＞SNP1位点和SNP2位点中一个为生长较快纯合子且另一个为生长较慢纯合子＞SNP1位点和SNP2位点均为生长较慢纯合子。

【技术特征摘要】
1.一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法，其特征在于包括如下步骤：(1)将光倒刺鲃的黑素皮质激素受体的启动子第-686位和第-522位核苷酸分别命名为SNP1和SNP2，并进行检测；(2)依据如下标准进行筛选：①第SNP1位为CT杂合子时为快速生长群体；为C纯合子时为次快速生长群体；为T纯合子时为劣势群体；②第SNP2位为AG杂合子时为快速生长群体；为G纯合子时为次快速生长群体；为A纯合子时为劣势群体；③由于微效基因的加性效应，按生长速度，SNP1位点和SNP2位点均为杂合子＞SNP1位点和SNP2位点中一个为杂合子且另一个为生长较快纯合子＞SNP1位点和SNP2位点均为生长较快纯合子＞SNP1位点和SNP2位点中一个为杂合子且另一个为生长较慢纯合子＞SNP1位点和SNP2位点中一个为生长较快纯合子且另一个为生长较慢纯合子＞SNP1位点和SNP2位点均为生长较慢纯合子。2.根据权利要求1所述的快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法，其特征在于：步骤(1)中所述的光倒刺鲃的黑素皮质激素受体基因组序列如SEQIDNO.1所示；或是如SEQIDNO.1所示的序列发生一个或若干个突变、或缺失的序列。3.权利要求1或2所述的快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法在筛选光倒刺鲃快速生长个体中的应用。4.一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的试剂盒，是依据权利要求1或2所述的方法设计得到，其特征在于：含有检测光倒刺鲃的黑素皮质激素受体的第SNP1位核苷酸的引物组和检测光倒刺鲃的黑素皮质激素受体的第SNP2位核苷酸的引物组。5.根据权利要求4所述的快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的试剂盒，其特征在于：还包括PCR用酶、PCR用缓冲液和PCR用水中的至少一种。6.根据权利要求4或5所述的快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的试剂盒，其特征在于：所述的检测光倒刺鲃的黑...

【专利技术属性】
技术研发人员：舒琥，杨扬，蓝昭军，李强，谷平华，
申请(专利权)人：广州大学，
类型：发明
国别省市：广东,44