单核苷酸多态性rs930507和rs10824793在检测结核易感性中的应用制造技术

本发明专利技术公开了MBL2基因单核苷酸多态性rs930507和rs10824793在检测结核易感性中的应用。本发明专利技术所提供的应用为用于检测rs930507位点或rs10824793位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用。本发明专利技术的发明专利技术人通过中国汉族人群病例对照研究发现MBL2基因SNP‑rs930507和rs10824793位点基因多态性与结核罹患风险之间存在显著的相关性。携带MBL2‑rs930507CG基因型和MBL2“GT”单体型的人群在结核分枝杆菌感染时发病风险更高。本发明专利技术为炎性及免疫相关基因SNP与结核易感性之间的关联提供了新见解，对结核易感基因筛查与预防有重大价值。

Application of single nucleotide polymorphisms rs930507 and rs10824793 in detection of susceptibility to tuberculosis

The present invention discloses the application of MBL2 gene single nucleotide polymorphisms rs930507 and rs10824793 in detecting tuberculosis susceptibility. The invention provides the application of a substance for detecting single nucleotide polymorphisms of rs930507 loci or rs10824793 loci in the preparation, evaluation, or evaluation of a product of the risk of tuberculosis in a person to be tested. The inventor China Han population control through case studies found that MBL2 gene SNP rs930507 and rs10824793 gene polymorphism and tuberculosis have significant correlation between risk. Carrying MBL2 genotype rs930507CG and MBL2 \GT\ haplotype in the population of Mycobacterium tuberculosis infection at higher risk. The present invention provides new insights into the association between inflammatory and immune related genes, SNP, and susceptibility to tuberculosis, and is of great value for screening and preventing tuberculosis susceptible genes.

【技术实现步骤摘要】
单核苷酸多态性rs930507和rs10824793在检测结核易感性中的应用
本专利技术属于生物医学领域，涉及MBL2基因单核苷酸多态性rs930507和rs10824793在检测结核易感性中的应用，特别涉及MBL2基因单核苷酸多态性(SNP)rs930507和rs10824793位点标志物在人群对结核病易感性筛查和评估中的应用。
技术介绍
结核病(Tuberculosis，TB)是一种严重威胁人类健康的全球性疾病，其已成为人类三大感染性疾病杀手之一。世界卫生组织全球结核病报告指出，大约1/3的人被结核分枝杆菌感染，其中仅有10％的感染者发病。这就意味着结核感染者是否发病与宿主-病原体之间的相互作用、环境、遗传等有着密切的关系。最近，许多研究证明结核风险与免疫系统和炎性反应相关基因的多态性有密切的联系。人类MBL2基因位于染色体10q11.2-q21区，其编码产物是甘露糖结合凝集素2，该蛋白属于凝集素家族，是先天免疫系统中的重要元素。MBL2蛋白在许多微生物上识别甘露糖和N-乙酰葡糖胺，并且能够激活经典补体途径。这种基因的缺陷与自身免疫和感染性疾病的易感性有关，与MBL2相关的疾病包括慢性感染，MBL缺陷和肺结核。MBL2基因多态性与结核病易感性之间的关系已经被广泛报道。早期研究揭示MBL2基因单核苷酸多态性位点rs1800451，rs1800450，rs5030737，rs7096206，rs11003125和rs7095891与受损的血清水平和结核病的易感性相关，但多个研究团队的研究结果不尽一致。最近，AreeshiMY等人对前人22项相关研究(7095个TB患者和7662个对照)进行Meta分析，发现仅rs1800451的纯合变体基因型有统计学差异，在总体群体中显示降低的TB风险。而其它几个SNP多态性与TB风险没有任何关联。进一步研究发现，rs1800450和rs1800451位点多态性在非洲人群中与显著降低的结核病风险相关联，表明MBL2rs1800450和rs1800451多态性在结核感染中起到保护作用。随着基因组学的发展和结核分枝杆菌全基因组测序的完成，成千上万的单核苷酸多态性(SNP)位点从结核患者身上被鉴定。研究者利用这些数据绘制出结核分枝杆菌SNP系谱树并提出了结核分枝杆菌谱系的进化假说。尽管结核分枝杆菌SNP研究在方法学和基因组学上取得了举世瞩目的成就，但是中国人群MBL2基因SNP与结核感染风险之间的关系却依旧知之甚少。因此，确定中国人群MBL2基因的SNP并深入研究其与结核患病风险之间的关系显得非常有必要。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供MBL2基因单核苷酸多态性rs930507和rs10824793在检测结核易感性中的应用。本专利技术所提供的应用具体可为三个，即应用A、应用B和应用C。应用A：用于检测rs930507位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；应用B：用于检测rs10824793位点的单核苷酸多态性的物质在制备诊断或辅助诊断待测人是否患有结核病的产品中的应用。其中，所述rs930507位点为人类基因组10号染色体上自5’末端起第52768506位核苷酸；所述rs930507位点的核苷酸为G或C。所述rs10824793位点为人类基因组10号染色体上自5’末端起第52769720位核苷酸；所述rs10824793位点的核苷酸为G或A。进一步，所述应用A为所述用于检测rs930507位点的单核苷酸多态性的物质以及记载有如下(a1)或(a2)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(a1)在共显性遗传模型下，所述rs930507位点为CG基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs930507位点为CC基因型的待测人；(a2)在显性遗传模型下，所述rs930507位点为CG基因型或GG基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs930507位点为CC基因型的待测人。进一步，所述应用B为所述用于检测rs10824793位点的单核苷酸多态性的物质以及记载有如下(b1)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(b1)在显性遗传模型下，所述rs10824793位点为GA基因型或GG基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs10824793位点为AA基因型的待测人。应用C：用于检测单体型M的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用。单体型(Haplotype)是位于一条染色体特定区域的一组相互关联，并倾向于以整体遗传给后代的单核苷酸多态的组合。所述单体型M的单核苷酸多态组合如下：rs10824793位点和rs7916582位点。所述rs10824793位点为人类基因组10号染色体自5’末端起第52769720位核苷酸；所述rs10824793位点的核苷酸为G或A；所述rs7916582位点为人类基因组10号染色体自5’末端起第52773235位核苷酸；所述rs375947位点的核苷酸为C或T。进一步，所述应用C为所述用于检测单体型M的物质以及记载有如下(c1)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(c1)携带“GT”单体型的待测人患结核病的风险高于携带“AT”单体型的待测人。其中，“GT”单体型是指所述单体型M的各SNP位点依次为“GT”。“AT”单体型是指所述单体型M的各SNP位点依次为“AT”。本专利技术还保护一种产品，含有用于检测rs930507位点的单核苷酸多态性的物质；所述产品具有评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的功能。其中，所述rs930507位点为人类基因组10号染色体上自5’末端起第52768506位核苷酸；所述rs930507位点的核苷酸为G或C。在本专利技术中，所述用于检测rs930507位点的单核苷酸多态性的物质具体为引物对甲或成套单链DNA分子甲；所述引物对甲由序列表中序列1所示的单链DNA和序列表中序列2所示的单链DNA组成；所述成套单链DNA分子甲由序列表中序列1所示的单链DNA、序列表中序列2所示的单链DNA和序列表中序列3所示的单链DNA组成。所述产品中，还可含有记载有如上(a1)或(a2)所示内容的可读性载体。本专利技术还保护一种产品，含有用于检测rs10824793位点的单核苷酸多态性的物质；所述产品具有评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的功能。其中，所述rs10824793位点为人类基因组10号染色体上自5’末端起第52769720位核苷酸；所述rs10824793位点的核苷酸为G或A。在本专利技术中，所述用于检测rs10824793位点的单核苷酸多态性的物质为引物对乙或成套单链DNA分子乙；所述引物对乙由序列表中序列4所示的单链DNA和序列表中序列5所示的单链DNA组成；所述成套单链DNA分子乙由序列表中序列4所示的单链DNA、序列表中序列5所示的单链DNA和序列表中序列6所示的单链DNA组成。所述产品中，还可含有记载有如上(b1)所示内容的可读性载体。本专利技术还保护一种产品，含有用于检测单体型M的物质；所述单体型M的单核苷酸多态组合如下：rs10824793位点和rs79165本文档来自技高网...

【技术保护点】
应用，为如下应用A或应用B：应用A：用于检测rs930507位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；应用B：用于检测rs10824793位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用。

【技术特征摘要】
1.应用，为如下应用A或应用B：应用A：用于检测rs930507位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；应用B：用于检测rs10824793位点的单核苷酸多态性的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述rs930507位点为人类基因组10号染色体上自5’末端起第52768506位核苷酸；所述rs930507位点的核苷酸为G或C；所述rs10824793位点为人类基因组10号染色体上自5’末端起第52769720位核苷酸；所述rs10824793位点的核苷酸为G或A。3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于：所述应用A为所述用于检测rs930507位点的单核苷酸多态性的物质以及记载有如下(a1)或(a2)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(a1)在共显性遗传模型下，所述rs930507位点为CG基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs930507位点为CC基因型的待测人；(a2)在显性遗传模型下，所述rs930507位点为CG基因型或GG基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs930507位点为CC基因型的待测人；所述应用B为所述用于检测rs10824793位点的单核苷酸多态性的物质以及记载有如下(b1)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(b1)在显性遗传模型下，所述rs10824793位点为GA基因型或GG基因型的待测人患结核病的风险高于所述rs10824793位点为AA基因型的待测人。4.用于检测单体型M的物质在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；所述单体型M的单核苷酸多态组合如下：rs10824793位点和rs7916582位点。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于：所述rs10824793位点为人类基因组10号染色体上自5’末端起第52769720位核苷酸；所述rs10824793位点的核苷酸为G或A；所述rs7916582位点为人类基因组10号染色体自5’末端起第52773235位核苷酸，所述rs7916582位点的核苷酸为T或C。6.根据权利要求4或5所述的应用，其特征在于：所述应用为所述用于检测单体型M的物质以及记载有如下(c1)所示内容的可读性载体在制备评价或辅助评价待测人患结核病的风险性的产品中的应用；(c1)携带“GT”单体型的待测人患结核病的风险高于携带“AT”单体型的待测入；所述“GT”单体型是指构成所述单体型M的rs10824793位点和rs7916582位点的核苷酸依次为“GT”；所述“AT”单体型是指构成所述单体型M的rs10824793位点和rs7916...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴雪琼，龚文平，张俊仙，安慧茹，梁艳，阳幼荣，
申请(专利权)人：中国人民解放军第三〇九医院，
类型：发明
国别省市：北京,11