本发明专利技术涉及试剂盒及其应用,具体地,所述试剂盒包含:细胞核分离液,其中,所述细胞核分离液包含:20‑50mmol/L Tris;0.01‑0.2%Triton X‑100;1‑10mmol/L EDTA;5‑50mmol/L MgCl
【技术实现步骤摘要】
试剂盒及其应用
本专利技术涉及生物
,具体涉及一种提取血液基因组DNA的试剂盒及其应用。
技术介绍
血液基因组DNA的提取是进行分子医学检测等的首要步骤,高质量的DNA的获得是保证后续检测成功的关键。对于遗传病相关基因检测以及甲基化位点研究等的研究,需要检测位点较多,基因组DNA的需求量更大,所以很多研究者需要从更大体积的血液,比如1-10ml中提取基因组DNA以满足后续需要。目前,现有的基因组DNA提取方法仍有待改进。
技术实现思路
本专利技术是专利技术人基于以下发现和事实所获得的:专利技术人发现目前常用的基因组DNA提取方法具有明显的不足之处,具体如下:传统的酚氯仿抽提方法需要接触有机试剂,长期使用有损人体健康。而且利用该方法耗时较长,提取得到的基因组DNA纯度不高,无法满足后续实验需求。离心柱法在很多实验室得到较多的应用,但是由于离心柱硅胶膜的吸附结合能力较低,结合30μg以上得率的DNA就需要更大体积的吸附膜,因此无法实现高通量的自动化操作。现有磁珠法和直接裂解法结合提取血液基因组DNA可以应用于小体积血液提取,但是血液体积较大时,利用现有磁珠法和直接裂解法结合提取血液基因组DNA,需要加入大量的蛋白酶K溶液、裂解液以及磁珠,耗时,也就是说,采用现有磁珠法和直接裂解法提取较大体积血液中基因组DNA存在以下问题:成本高,耗时,提取过程中体积大,不适合在自动核酸提取仪上进行使用,无法实现高通量。本专利技术旨在至少在一定程度上解决相关技术中的技术问题之一。根据本专利技术的一个方面,本专利技术提出一种试剂盒,包含:细胞核分离液,其中,所述细胞核分离液包含:20-50mmol/LTris;0.01-0.2%(体积百分比)TritonX-100;1-10mmol/LEDTA;5-50mmol/LMgCl2;以及5-50mmol/LKCl。经过细胞核分离液的前期处理,只需要等体积的细胞核裂解液就可以得到很好的效果,其中,此处“等体积”应该理解为加入与细胞核体积相等的细胞核裂解液,由此可以实现在采血管中直接处理1-10ml血样,不需要转移到更大体积的离心管中操作,浓缩后的细胞核沉淀只需要加入500μl-1ml的细胞核裂解液,节省了成本,体积更小,可以满足高通量自动化核酸提取的需求。由此,利用所述试剂盒可以有效地对血液进行前处理,从而获得细胞核沉淀,便于后续处理。根据本专利技术的一些实施例,所述细胞核分离液的pH值为7-8。根据本专利技术的具体实施例,可以采用氢氧化钠溶液调节所述细胞核分离液的pH值至7-8。由此,可以进一步提高细胞核分离液的分离效率。根据本专利技术的一些实施例,所述试剂盒进一步包含:细胞核裂解液,其中,所述细胞核裂解液包含:4-5mol/L盐酸胍;1-2mol/L异硫氢酸胍;30-50mmol/LTris(pH=8.0);30-50mmol/LEDTA;2-5%TritonX-100;以及0.2-0.5%(重量百分比)脱氧胆酸钠。细胞核裂解液中加入脱氧胆酸钠和TritonX-100等两种表明活性剂,增加对脂类等杂质的消化,提高了对细胞核的裂解能力,更加促进DNA的释放。无需加入蛋白酶K,无需加热在室温条件下就能达到很强的裂解作用。由此,利用所述试剂盒可以有效地对血液进行前处理,获得细胞核沉淀,并对细胞核进行有效裂解。根据本专利技术的一些实施例,所述细胞核裂解液的pH值为7.5-8.5。根据本专利技术的具体实施例,可以采用氢氧化钠溶液调节所述细胞核裂解液的pH值至7.5-8.5。由此,可以进一步提高细胞核裂解液的裂解效率。根据本专利技术的一些实施例,所述试剂盒进一步包含:玻璃珠。玻璃珠的使用可以避免细胞核沉淀在离心时形成过于紧密的团块,更易于细胞核的分散,提高后续的裂解效果。根据本专利技术的具体实施例,所述玻璃珠直径为0.5-1mm。由此,可以进一步分散细胞核,提高后续的裂解效果。根据本专利技术的一些实施例,所述试剂盒进一步包含:去蛋白缓冲液,漂洗液,洗脱液以及磁珠G悬浮液。由此,利用所述试剂盒可以有效地提取血液基因组DNA,尤其是可以有效地提取大体积血液基因组DNA,并且提取获得的基因组DNA纯度高,可以满足后续的各种常规操作,包括酶切、PCR、荧光定量PCR、文库构建、Southern杂交,芯片检测、高通量测序等实验。根据本专利技术的具体实施例,所述去蛋白缓冲液包含:5-6mol/L盐酸胍;30-50mmol/LTris(pH=8.0);30-50mmol/LEDTA;1%-2%(重量百分比)月桂酰肌氨酸钠;以及30%乙醇。需要说明的是,去蛋白缓冲液在使用前才加入30%(体积百分比)乙醇,由此,可以有效地除去蛋白杂质。根据本专利技术的具体实施例,所述漂洗液包含:10-20mmol/LTris(pH=8.0),以及80%乙醇。需要说明的是,漂洗液在使用前才加入80%乙醇。由此,可以更加有效地除去杂质。根据本专利技术的具体实施例,所述洗脱液包含:10mmol/LTris(pH=8.0)。由此,可以有效洗脱基因组DNA,获得分离纯化后的基因组DNA。根据本专利技术的具体实施例,所述磁珠G悬浮液的浓度为150-250mg/mL。由于磁珠G粒径很小,具有更大的比表面积,因此具有更强的吸附DNA的能力,另外,磁珠也更适合在高通量自动化上进行使用。根据本专利技术的再一个方面,本专利技术提出一种利用前述试剂盒制备血液基因组DNA的方法,包括:(1)将血液样品进行预处理,以便去除血浆;(2)将细胞核分离液以及玻璃珠加入步骤(1)中获得的经过预处理后的血液样品中,混合,离心,除去上清,以便获得细胞核沉淀;(3)将细胞核裂解液加入所述细胞核沉淀中,混合,加入异丙醇,以便获得第一混合液;(4)将磁珠G悬浮液加入所述第一混合液中,混合,除去液体,以便获得第一磁珠G;(5)将第一磁珠G进行漂洗,以便获得第二磁珠G;(6)将所述第二磁珠G进行洗脱,收集洗脱液,以便获得血液基因组DNA。根据本专利技术的一些实施例,所述步骤(5)包括:(5-1)将第一磁珠G中加入去蛋白缓冲液,静置于磁力架上,去除液体;(5-2)将步骤(5-1)处理后的磁珠G中加入漂洗液,静置与磁力加上,去除液体,以便获得所述第二磁珠G。本专利技术所述方法具有以下优势:(1)经过优化细胞核分离液的前期处理,只需要等体积的细胞核裂解液就可以得到很好的效果。可以实现在采血管中直接处理1-10ml血样,不需要转移到更大体积的离心管中操作,浓缩后的细胞核沉淀只需要加入500μl-1ml的细胞核裂解液,节省了成本,体积更小,可以满足高通量自动化核酸提取的需求。(2)玻璃珠的使用可以避免细胞核沉淀在离心时形成过于紧密的团块,更易于细胞核的分散,提高后续的裂解效果。(3)细胞核裂解液中加入脱氧胆酸钠和TritonX-100等两种表明活性剂,增加对脂类等杂质的消化,提高了对细胞核的裂解能力,更加促进DNA的释放。无需加入蛋白酶K,无需加热在室温条件下就能达到很强的裂解作用。(4)使用所述方法提取的基因组DNA纯度高,可以满足后续的各种常规操作,包括酶切、PCR、荧光定量PCR、文库构建、Southern杂交,芯片检测、高通量测序等实验。具体实施方式下面描述的实施例是示例性的,旨在用于解释本专利技术,而不能理解为对本专利技术的限制。另外,如果没有明确说明,在本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种试剂盒,其特征在于,包含:细胞核分离液,其中,所述细胞核分离液包含:20‑50mmol/LTris;0.01‑0.2%Triton X‑100;1‑10mmol/L EDTA;5‑50mmol/L MgCl
【技术特征摘要】
1.一种试剂盒,其特征在于,包含:细胞核分离液,其中,所述细胞核分离液包含:20-50mmol/LTris;0.01-0.2%TritonX-100;1-10mmol/LEDTA;5-50mmol/LMgCl2;以及5-50mmol/LKCl。2.根据权利要求1所述试剂盒,其特征在于,所述细胞核分离液的pH值为7-8。3.根据权利要求1所述试剂盒,其特征在于,进一步包含:细胞核裂解液,其中所述细胞核裂解液包含:4-5mol/L盐酸胍;1-2mol/L异硫氢酸胍;30-50mmol/LTris(pH=8.0);30-50mmol/LEDTA;2-5%TritonX-100;以及0.2-0.5%脱氧胆酸钠。4.根据权利要求3所述试剂盒,其特征在于,所述细胞核裂解液的pH值为7.5-8.5。5.根据权利要求1-4任一项所述试剂盒,其特征在于,进一步包含:玻璃珠,任选地,所述玻璃珠直径为0.5-1mm。6.根据权利要求1-5任一项所述试剂盒,其特征在于,进一步包含:去蛋白缓冲液,漂洗液,洗脱液以及磁珠G悬浮液,任选地,所述去蛋白缓冲液包含:5-6mol/L盐酸胍;30-50mmol/LTris(pH=8.0);30-50mm...
【专利技术属性】
技术研发人员:邹爱兰,刘玉方,李晓晨,孙克非,
申请(专利权)人:天根生化科技北京有限公司,
类型:发明
国别省市:北京,11
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。