测序装置制造方法及图纸

技术编号:15443390 阅读:116 留言:0更新日期:2017-05-26 07:56
一种制备反应剂的方法包含将匣体插入到仪器中。所述匣体包含安置在所述匣体的腔中且使端口暴露于所述匣体的外部的多个反应剂围封体。每一反应剂围封体包含含有反应剂的反应剂容器和限定可压缩体积的内部腔,穿过所述反应剂容器到所述内部腔限定开口。所述方法进一步包含:将多个流体端口连接到所述多个反应剂围封体的所述开口;经由所述流体端口施加溶液以至少部分填充所述多个反应剂围封体;以及循环所述腔的压力,借此针对所述反应剂围封体中的每一者,在增加压力期间,所述溶液进入所述反应剂容器的所述内部腔,与具有反应剂组合,且压缩所述可压缩体积,且在减小压力期间,所述可压缩体积减小且所述反应剂经由所述开口喷出。

Sequencing device

A process for preparing a reactant comprising inserting a cartridge into an instrument. The cartridge comprises a plurality of reaction agents enclosing the cavity in the cartridge and exposing the port to the outside of the cartridge. Each reaction agent enclosing body contains a reactant container containing a reactant and an internal cavity defining a compressible volume that passes through the reactant container to the inner cavity defining openings. The method further includes: a plurality of fluid ports connected to the plurality of reactant enclosed body of the openings; via the fluid port solution is applied to at least partially filling the plurality of reactant enclosed body; and the cavity pressure cycle, whereby the reaction agent for each round a sealed body, an increase in pressure during the internal cavity of the solution into the reaction agent container, and a reagent combination, and compress the compressible volume, and reduce the pressure in the period, the compressible volume decreases and the reactant ejected through the opening.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】测序装置
本专利技术大体来说涉及改进的测序装置。
技术介绍
生物和医疗研究日益转向用于增强生物研究和医学的测序。举例来说,生物学家和动物学家正转向用以研究动物的迁移、物质的演变和特性的来源的测序。医疗团体转向用于研究疾病的起因、对药物的敏感度和感染的起因的测序。但测序历史上一直是一项昂贵的任务,因此限制了将其付诸实践。附图说明通过参考附图,可更好地理解本专利技术,并且使所属领域的技术人员清楚其众多特征和优点。图1包含实例测序仪器的说明。图2包含实例测序仪器的示意图。图3包含实例测序仪器的示意图。图4为描述示范性反应剂储存设备的透视图。图5为描述实例容器的透视图。图6为描述实例容器的横截面透视图。图7为描述实例容器的分解示意图。图8为描述实例容器的详细透视图。图9为描述示范性反应剂储存设备的透视图。图10为描述实例容器的透视图。图11为描述实例容器的横截面透视图。图12、图13、图14、图15和图16包含用于围封一或多个围封体的示范性匣体的说明。图17和图18说明实例方法的示意图。图19为描述实例阀的分解示意图。图20为描述实例阀的横截面示意图。图21为描述实例阀的横截面示意图。图22为描述实例阀的横截面示意图。图23和图24包含实例歧管和匣体的说明。图25包含实例流体回路的说明。图26包含用于制备反应剂溶液的实例方法的流程图。图27包含用于测量分析物的实例方法的流程图。图28包含用于制备反应剂匣体的实例方法的流程图。在不同图式中使用相同参考符号指示相似或相同的项目。具体实施方式在一示范性实施例中,一种测序系统包含用以接纳半导体测序芯片和实行产生基底序列的识别的过程的仪器。确切地说,所述仪器可接纳反应剂匣体、清洗溶液和半导体测序芯片。所述仪器可包含用户接口,例如触摸屏用户接口,且可包含计算电路和控制器以控制反应剂和清洗溶液到半导体测序芯片的递送,以及来自半导体测序芯片的数据的获取以促进所述基底序列的识别。示范性仪器包含反应剂匣体容座、用于接纳清洗缓冲剂匣体的另一容座,和用于接纳半导体测序芯片的芯片夹具。此外,所述仪器包含触摸屏用户接口。此仪器提供有限的测序器触摸点、无压缩气体利用(实际上利用闭合泵-驱动系统)、无高质量水利用、容易操作(包含直观的图形用户接口、即插即用消费品等)、快速单天运行时间、用于主要数据分析的集成机载计算、仅研究用(RUO)或诊断模式(Dx)中的双模操作、小桌面占用面积、可缩放性(用于不同性能水平的可升级底盘)或低成本,或其任何组合。确切地说,所述仪器可包含用于提供内部产生的气体压力的压缩器。反应剂可提供于预装载匣体中以限制用户与反应剂制备的交互。类似地,可例如在匣体内提供清洗溶液作为即插即用清洗溶液。在一实例中,清洗溶液的pH可使用固态缓冲剂而变稳定。可例如使用动态流量控制使用夹捏阀调整器来控制系统内反应剂的流动速率。所述系统还可包含执行自动运行后清洗的清洁溶液。所述仪器可包含用于处理从半导体测序芯片接收的数据的内部服务器。可替代地或附加地,所述系统可提供输出数据端口以连接外部服务器用于处理数据。此外,内部计算系统可为可配置和可升级的。所述系统可使用内部气体供应利用压力驱动液流,而不使用外部气体供应。确切地说,反应剂匣体系统可在单独围封体或袋子内利用液体或冻干核苷酸。可通过对袋子外部的腔室加压且使来自袋子的空气作为废料流出而排出围封体内的任何初始空气含量。清洗溶液可施加到袋子中。残余气泡可升高到顶部且可作为废料净化出去。通过对袋子外部的腔室进行加压和快速减压从而致使袋子中的液体加压和减压来实现混合。液体或冻干核苷酸包含在混合器(反应剂容器)内,混合器响应于减压而排出包含核苷酸的溶液,从而致使袋子内核苷酸的混合。随着外部气体压力施加到袋子围封体,内部清洗溶液流动到混合器中,且混合器内的内部可压缩体积压缩。当袋子外部的气体压力快速释放时,可压缩体积内充填的压力迫使清洗溶液经由喷嘴以高速度离开,从而使袋子内的包含核苷酸的液体混合。当经由半导体测序芯片的流动池施加流时,可通过利用夹捏流量调整器(夹捏阀调整器)实现动态流量控制。此动态流量控制减少电阻管道线圈的使用且减小堵塞的可能性。流动速率可为可编程的且可通过调整夹捏流量调整器内的控制压力来调整。所述系统可利用固态缓冲系统,例如陶瓷缓冲系统(例如粒子二氧化钛)。清洗溶液反应剂可提供于容易混合的单次使用瓶中。所述溶液可包含固态缓冲剂,消除自动pH例程,且提供长期pH稳定性。粒子二氧化钛可容易地被过滤器限制于瓶,因此将粒子限制在系统内。此外,初级清洗瓶可利用具有对气体的低渗透率且因此对酸化CO2的低渗透率的封装。所述容器还可随CO2吸收剂包一起运送,以进一步限制到二氧化碳的暴露。半导体测序芯片可接纳在芯片夹具中,芯片夹具将芯片装载在系统中且将芯片连接到流体系统。芯片夹具可包含集成鱿鱼阀歧管且移除管道连接。芯片夹具可进一步包含参考电极、集成芯片温度控制和集成歧管加热。所述仪器可进一步依赖于反应剂匣体,从而限制用户的接触和处理。装载简单的匣体,且其包含五个容器或围封体(用于核苷酸和珠粒寻找或pH调整反应剂)。所述匣体还可包含充填端口以利用例如连接到反应剂匣体的歧管上的排气阀对匣体进行快速加压/减压。任选地,静止子施加在排气装置上以减少与对匣体快速减压相关联的噪声。所述仪器进一步包含可缩放且可配置的电子器件。确切地说,计算能力和存储器可交换。所述系统可进一步包含对于(例如)半导体测序芯片或匣体上的RFID标签的支持。示范性反应剂匣体可包含用于不同核苷酸溶液和珠粒寻找或pH调整溶液的彩色译码端口。此外,反应剂匣体可包含用于CO2洗涤器的输入和输出端口。所述匣体还可具备识别(例如)批次号和到期日期的RFID标签。所述匣体可包含反应剂容器被施加到或CO2洗涤器被插入到的个体腔室。反应剂容器经由匣体封盖插入到紧固到匣体内的封盖的反应剂袋或围封体中。针对示范性反应剂匣体制造,将配件施加到袋中,例如包含低密度聚乙烯/聚对苯二甲酸亚乙酯膜。匣体基底、封盖、端口垫圈和其它部分随后组装:将袋施加到封盖、随后将封盖施加到基底,以及将垫圈插入到封盖中。反应剂容器包含泡沫部件插入到的混合器主体。混合器帽施加到混合器主体。在一实例中,混合器帽可包含冻干反应剂或液体反应剂。在另一实例中,反应剂可冷冻或储存在多孔陶瓷或聚合泡沫内。组装的反应剂混合器和洗涤器可随后施加到反应剂匣体组合件。RFID标签可施加到匣体,且所述匣体可装箱并储存以供装运。反应剂可以冻干形式或冷冻液体形式施加到混合器或匣体中。在一实例中,冻干核苷酸球粒可形成且接着插入到混合器中。在另一实例中,核苷酸可干燥到集成到“虫”(bug)混合器中的滤纸上。在另一实例中,核苷酸可直接干燥到可压缩泡沫上或混合器(反应剂容器)的封盖(第二部分)内。在一实例中,图1包含用于测序的示范性仪器100的说明。仪器100可包含用以接纳缓冲溶液104的容器的连接器、用以接纳测序装置的夹具106、和用以接纳反应剂匣体102的歧管。此外,测序仪器100包含计算电路以控制流体流动、从测序装置的数据检索、数据的解释、和用户接口108。在特定实例中,测序装置为pH或离子敏感装置,例如包含多个离子敏感场效应晶体管(ISFET)。在特定实例本文档来自技高网...
测序装置

【技术保护点】
一种制备反应剂的方法,所述方法包括:将匣体插入到仪器中,所述匣体包含安置在所述匣体的腔中且使端口暴露于所述匣体的外部的多个反应剂围封体,每一反应剂围封体包含含有反应剂的反应剂容器和限定可压缩体积的内部腔,经由所述反应剂容器到所述内部腔限定开口;将多个流体端口连接到所述多个反应剂围封体的所述开口;经由所述流体端口施加溶液以至少部分填充所述多个反应剂围封体;以及循环所述腔的压力,借此针对所述反应剂围封体中的每一者,在增加压力期间,所述溶液进入所述反应剂容器的所述内部腔,与所述反应剂组合,且压缩所述可压缩体积,且在减小压力期间,所述可压缩体积减小且所述反应剂经由所述开口喷出。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.06.17 US 62/013,4751.一种制备反应剂的方法,所述方法包括:将匣体插入到仪器中,所述匣体包含安置在所述匣体的腔中且使端口暴露于所述匣体的外部的多个反应剂围封体,每一反应剂围封体包含含有反应剂的反应剂容器和限定可压缩体积的内部腔,经由所述反应剂容器到所述内部腔限定开口;将多个流体端口连接到所述多个反应剂围封体的所述开口;经由所述流体端口施加溶液以至少部分填充所述多个反应剂围封体;以及循环所述腔的压力,借此针对所述反应剂围封体中的每一者,在增加压力期间,所述溶液进入所述反应剂容器的所述内部腔,与所述反应剂组合,且压缩所述可压缩体积,且在减小压力期间,所述可压缩体积减小且所述反应剂经由所述开口喷出。2.根据权利要求1所述的方法,其进一步包括在施加所述溶液之前对所述腔加压以从所述多个围封体移除气体。3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其中所述反应剂容器进一步包含安置在所述可压缩体积中的可压缩部件。4.根据权利要求1-3中任一权利要求所述的方法,其中所述反应剂包含核苷酸。5.根据权利要求1-4中任一权利要求所述的方法,其进一步包括在连接所述多个流体端口之前感测所述匣体的位置。6.根据权利要求1-5中任一权利要求所述的方法,其进一步包括用所述仪器读取所述匣体的识别标签。7.根据权利要求6所述的方法,其进一步包括基于所述读取连接所述多个流体端口。8.根据权利要求1-7中任一权利要求所述的方法,其中所述匣体进一步包含洗涤器,所述方法进一步包括将气体系统连接到所述洗涤器。9.根据权利要求8所述的方法,其中所述洗涤器为CO2洗涤器。10.根据权利要求8所述的方法,其中循环所述压力包含施加气体穿过所述洗涤器且进入所述腔。11.一种用仪器检测分析物的方法,所述方法包括:将压力施加到耦合到仪器的匣体,所述匣体包含安置在所述匣体的腔中且使端口暴露于所述匣体的外部的多个反应剂围封体,每一反应剂围封体包含含有反应剂的反应剂容器和限定可压缩体积的内部腔,经由所述反应...

【专利技术属性】
技术研发人员:J舒尔茨T罗斯韦克J霍希扎基A卡里罗J鲍尔
申请(专利权)人:生命技术公司
类型:发明
国别省市:美国,US

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