一种鸡产蛋性能相关的分子遗传标记及应用制造技术

本发明专利技术一种鸡产蛋性能的分子遗传标记及应用；FSH‑β基因作为鸡产蛋性能相关的分子遗传标记，其特征在于，该遗传标记为SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，或该序列中至少包含第259bp处的T>G突变碱基的特异性片段；本发明专利技术是根据基因型对鸡产蛋性能的选择，具有精确度高、操作简单、费用低(选择成本约为0.3元/只)等特点，并可以进行自动化的规模检测；第二，利用本发明专利技术的分子标记方法可以在鸡的生命早期(出生后1周内)即可开始选择鸡产蛋性能的性状，可以缩短世代间隔，提高选择强度，较早地选择出优良的种鸡亲本，从而加速鸡的育种进程，与常规的鸡产蛋性能测定选择方法比较每代可缩短选择时间16个月。

Molecular genetic markers related to egg laying performance and its application

The molecular genetic marker of chicken laying performance of the invention and application; FSH beta gene as molecular genetic markers related to the production performance of laying hens, characterized in that the genetic marker for the nucleotide sequence of SEQ ID No.1 shown, or the sequence contains at least the 259bp T> G mutation specificity fragment; the invention is based on the selection of genotypes on laying performance, with high accuracy, simple operation, low cost (cost about 0.3 yuan / only) and other characteristics, scale and detection can be automated; second, the use of the invention can mark method in early chick life (1 weeks after birth) to start the chicken laying performance traits, can shorten the generation interval, increase the intensity of selection, earlier selected excellent breeder parents, so as to accelerate the breeding process of chicken, and conventional chicken egg Performance selection methods are compared and each generation shortens the selection time by 16 months.

【技术实现步骤摘要】
一种鸡产蛋性能相关的分子遗传标记及应用
本专利技术属于蛋鸡分子遗传标记辅助选择
，具体涉及一种鸡产蛋性能的分子遗传标记及应用。
技术介绍
我国地方肉鸡品种资源丰富，但与国外商业品种相比，总体表现产蛋性能不佳，提高肉鸡地方品种产蛋性能一直是我国家禽育种的主要目标之一。传统的鸡产蛋性能选育方法是通过测定一个世代(500日龄)的产蛋量表型来进行选择。蛋由于表型选择是一个长期的积累过程，其影响因素又很多，如选择强度、选择性状的数目、世代间距、环境条件和营养水平等，都会对表型选择发生作用，其变异呈连续性，加之性状的表型与其基因型之间的关系复杂，在大多数情况下并不完全吻合，因而选择往往难以准确，只有多次重复同一方法，连续数代定向选择才能取得显著效果，存在周期长、效率低、成本高、进展较慢等缺点。为此，许多研究者正在不断探索新的更为有效的鸡产蛋性状选择技术，以改变传统选择方法的不足。分子遗传标记以物种基因突变造成DNA片段长度多态性为基础，具有许多优点：(1)可以直接探测DNA水平的差异，不受时空的限制；(2)标记数量丰富、多态性高；(3)共显性标识，可以区分纯合子与杂合子；(4)可以解释家系内某些个体的遗传变异；(5)在选择产蛋性状的过程中，不必进行500日龄的产蛋测定试验。由此可见，采用DNA分析技术，通过在DNA分子水平上寻找与鸡产蛋性状密切相关的遗传标记，在育种计划中纳入分子标记信息进行辅助选择是提高选择效率，缩短世代间隔，提高选择强度，加快鸡产蛋性状遗传进展的有效途径。近年来，随着对鸡产蛋性状研究的不断深入，已经鉴定出大量与产蛋性状相关的基因，包括催乳素、促卵泡激素β亚基、雌激素受体α亚基、卵细胞卵黄生成受体、促性腺激素释放激素、血管活性肠肽、类胰岛素生长因子和促甲状腺激素等，这些基因主要是通过调节相应的激素合成和分泌来影响家禽的产蛋量。促卵泡激素(FollicalStimulateHormone,FSH)是动物垂体前叶嗜碱性细胞分泌的一种糖蛋白类促性腺激素，在下丘脑－垂体－性腺生殖轴中起到重要的作用。赵要风等(1997)在猪的FSHβ基因的+809和+810碱基中发现了一个292bp的插入/缺失突变，把FSHβ基因作为控制猪产仔数的候选基因同猪产仔数进行关联分析，证明FSHβ基因与猪产仔数显著相关。近年来的研究表明FSHβ基因与鸡繁殖性状也有一定的关系，如洪坤月等(2007)采用PCR-SSCP方法分析太湖鸡FSHβ基因多态性及其与产蛋20周的产蛋性能的关系，发现FSHβ基因对太湖鸡前期产蛋性能有一定的影响；韩厚明(2006)在文昌鸡FSHβ5’调控区检测到6个SNP位点，与开产日龄和40周龄产蛋数显著相关(P<0.05)；周俊(2008)在绿壳蛋鸡外显子3’UTR检测到A2447G,与开产日龄呈显著相关(P<0.05)；杨桓(2011)发现欣华鸡的内含子1的T+259G位点不同基因型个体开产日龄差异显著(P<0.05)。本专利技术采用连接酶反应方法(ligasedetectionreaction,LDR)进行FSHβ基因的多态性检测、SNP位点筛选和基因分型，并与鸡产蛋性能进行关联分析，获得一个新的鸡产蛋性能相关分子遗传标记，为具有优良产蛋性状的肉鸡品种选择提供可靠的依据。
技术实现思路
本专利技术目的是，针对利用分子标记技术选择鸡产蛋性能研究不足，提供一种在鸡的生命早期就可开始、准确性高、选育周期短、成本低的利用FSHβ基因分子遗传标记技术选择鸡产蛋性能的方法。为实现上述目的，本专利技术采用的技术方案是：一种FSH-β基因作为鸡产蛋性能相关的分子遗传标记，该遗传标记为SEQIDNo.1所示的核苷酸序列，或该序列中至少包含第259bp处的T>G突变碱基的特异性片段，导致FSH-β基因的单核苷酸多态性。本领域技术人员很容易根据本专利技术的分子遗传标记设计出用于扩增该分子标记的引物和探针，所述引物序列如SEQIDNo.2-3所示；鉴定所述分子标记的探针，所述探针序列如SEQIDNo.4-6所示，从而用于该遗传标记的检测，例如通过PCR扩增得到所述遗传标记，再通过克隆测序得到相应的序列，或者通过BsmI-RFLP多态性进行检测。因而，本专利技术还包括用于扩增所述分子遗传标记的引物或鉴定所述分子遗传标记的探针，以及含有所述引物或探针的试剂盒。本专利技术还提供一种分子遗传标记、引物或探针在鸡产蛋性状标记辅助选择中的应用。进一步的，扩增鸡育种材料的基因组DNA，PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳并回收，对测序得到的序列进行多态性分析，在FSH-β基因rs259突变位点获得TT、TG和GG三种基因型，选育出TT基因型纯合个体组建配套系，交配得到后代为产蛋量高的后代，可以提高产蛋数。本专利技术的原理：连接酶检测反应是一种高特异性基因检测技术，其主要基于核酸特异杂交原理，一对杂交探针杂交于待检DNA序列上相邻的位置，并在杂交后经连接酶连接形成一条完整的探针，再结合不同的检测方式实现检测。本专利技术的有益技术效果是：本专利技术提出鸡产蛋性能相关的FSHβ基因多态性分析与分子标记选择方法，可为通过分子标记辅助育种(MAS)技术提高母鸡产蛋性能提供新途径。在应用于鸡产蛋性能的选择工作中，具有以下的有益效果：第一，本专利技术是根据基因型对鸡产蛋性能的选择，具有精确度高、操作简单、费用低(选择成本约为0.3元/只)等特点，并可以进行自动化的规模检测；第二，利用本专利技术的分子标记方法可以在鸡的生命早期(出生后1周内)即可开始选择鸡产蛋性能的性状，可以缩短世代间隔，提高选择强度，较早地选择出优良的种鸡亲本，从而加速鸡的育种进程，与常规的鸡产蛋性能测定选择方法比较每代可缩短选择时间16个月；第三，利用本专利技术的分子标记方法对鸡产蛋性能性状进行选择，不仅可为鸡育种工作中标记辅助选择提供一个更为有效、简便易行的分子标记方法，同时可以克服常规鸡产蛋性能选择方法工作量大、易受环境影响和育种周期长等缺点，为鸡产蛋性能改良提供一种有效的分子标记育种手段，从而加速鸡的遗传进展。附图说明为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动性的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。图1本专利技术鸡FSH-β基因rs259位点基因分型图。具体实施方式下面将结合本专利技术实施例中的附图，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。实施例本专利技术所述的利用分子标记辅助选择鸡产蛋性能的方法，是在完成下列基础工作后取得的：1.引物与探针FSH-β基因多态性检测引物与探针如表1和表2：表1FSH-β基因多态性检测引物表2FSH-β基因多态性引物探针2.连接酶检测反应对SNP多态性的研究根据引物和探针的分子量加TE稀释至50pmol/μL作为母液。多重PCR、LDR时各引物母液等比混合成可直接进行反应的mixture溶液。PCR扩增SNP位点所在片段本文档来自技高网...

【技术保护点】
FSH‑β基因作为鸡产蛋性能相关的分子遗传标记，其特征在于，该遗传标记为SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，或该序列中至少包含第259bp处的T>G突变碱基的特异性片段，导致FSH‑β基因的单核苷酸多态性。

【技术特征摘要】
1.FSH-β基因作为鸡产蛋性能相关的分子遗传标记，其特征在于，该遗传标记为SEQIDNo.1所示的核苷酸序列，或该序列中至少包含第259bp处的T>G突变碱基的特异性片段，导致FSH-β基因的单核苷酸多态性。2.用于扩增权利要求1所述分子遗传标记的引物，其特征在于，所述引物序列如SEQIDNo.2-3所示。3.用于鉴定权利要求1所述分子遗传标记的探针，其特征在于，所述探针序列如SEQIDNo.4-6所示。4.含有权利要求...

【专利技术属性】
技术研发人员：李国勤，卢立志，田勇，陈黎，沈军达，陶争荣，曾涛，徐坚，
申请(专利权)人：浙江省农业科学院，
类型：发明
国别省市：浙江,33