L-核糖-LNA类似物制造技术

技术编号:1531769 阅读:258 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
核苷类似物,其中,用在C-3’与C-4’转化的立体化学合成2’-4’-桥接锁定核苷构型的核苷类似物,以提供L-核糖-构型LNA核苷。该L-核糖-LNA-核苷合成可应用于所有核碱基,该核碱基包含胸腺嘧啶、腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤和尿嘧啶。这些具有L-核糖-构型的锁定核酸(LNA)已用于2’-O-4’-亚甲基-α-L-核糖呋喃糖基核苷酸以及其中含有L-核糖-LNA核苷酸的寡核苷酸的合成。利用这些L-核糖-LNA改性寡核苷酸,借助它们对于互补核酸的高亲和性,大幅改善靶标互补核酸的方法。(*该技术在2020年保护过期,可自由使用*)

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及L-核糖-构型双环状核苷类似物领域,以及用于合成寡核苷酸形成的核苷酸类似物的合成,该合成寡核苷酸可形成具有互补单链与双链核酸的核碱基特定性双显性组合(duplexes)。本专利技术还涉及可用来作为治疗药物并可结合于寡核苷酸的L-核糖-构型双环状核苷类似物的领域。专利技术背景合成寡核苷酸是在不同领域广泛使用的化合物,例如用于分子生物及以DNA为基础的诊断和治疗。综合考虑为了广泛地用于不同的应用范围,寡核苷酸必须满足许多不同的要求。以作为治疗剂为例,有用的寡核苷酸必须能够穿过细胞膜,具有良好的抗细胞外及细胞内核酸酶的性能,优选具有补充如RNAseH的内源酶的能力。在以DNA为基础的治疗及分子生物学中,其它性能,例如寡核苷酸对于作用在天然核酸的大量不同酶成长作为有效基质的能力很重要,该天然核酸如聚合酶、激酶、连接酶和磷酸酶。然而,各种用途的基础是寡核苷酸的基本性能寡核苷酸可辨识和杂交互补单链核酸的特异性序列,采用Watson-Crick氢键(A-T and G-C)或其它氢键结构如Hoogsteen模式。有两个重要术语即亲和力和特异性,常用于表现寡核苷酸的杂交性能。亲合性为该寡核苷酸对其互补目标序列的键合强度的测量(用该双显性组合的热稳定性(Tm)表示)。该双显性组合中各核碱基对增加热稳定性,因此亲合性随该寡核苷酸尺寸(核碱基)增大而增加。特异性为该寡核苷酸在完全互补和错配目标序列之间的辨别能力的测量。换言之,特异性为目标物中与错配核碱基有关的亲合性损失的测量。在寡核苷酸尺寸恒定时,特异性随着该寡核苷酸及其目标物之间的错配数目增加而增加(亦即,错配的百分比增加)。反之,在错配数目恒定时,当寡核苷酸尺寸增加时,特异性会减少(即错配的百分比减少)。换言之,寡核苷酸亲合性的增加是以牺牲其特异性为代价的,反之亦然。一般而言,考虑到天然寡核苷酸的缺点,增强特异性及亲合性的新方法对于以DNA为基础的治疗、诊断及对于分子生物技术极为令人期待。受构型限制的核苷已知寡核苷酸在杂交成为目标序列期间会经过构型转化,由单链态的相对任意线圈结构变成双显性组合态的规则结构。因此,构型限制近年来已应用在寡核苷酸,以寻找较未改性(2’-脱氧)寡核苷酸显示改良的杂交性能。例如具有附加的C-3’、C-5’-桥亚乙基的双环核苷(M.Tarky,M.Bolli,B.Schweizer and C.Leumann,Helv.Chem.Acta,1993,76,481;Tarkōy and C.Leumann,Angew.Chem.,Int.Ed.Engl.,1993,32,1432;M.Egli,P.Lubini,M.Dobler and C.Leumann,J.Am.Chem.Soc.,1993115,5855;M.Tarkōy,M.Bolli and C.Leumann,Helv.Chem.Acta,1994,77,716;M.Bolli and C.Leumann,Angew.Chem.,Int.Ed.Engl.,1995,34,694;M.Bolli,P.Lubini and C.Leumann,Helv.Chem.Acta,1995,78,2077;J.C.Litten,C.Epple and C.Leumann,Bioorg.Med.Chem.Lett.,1995,5,1231;J.C.Litten,C.Leumann,Helv.Chem.Acta,1996,79,1129;M.Bolli,J.C.Litten,R.Schültz and C.Leumann,Chem.Biol.,1996,3,197;M.Bolli,H.U.Trafelet and C.Leumann,Nucleic Acids Res.,1996,24,4660)、具有一附加C-1’、C-6’或C-6’、C-4’-桥亚甲基的双碳环核苷(K.-H.Altmann,R.Kesselring,E.Francotte and G.Rihs,Tetrahedrn Lett.,1994,35,2331;K.-H.Altmann,R.Imwinkelried,R.Kesselring and G.Rihs,Tetrahedron Lett.,1994,35,7635;V.E..Marquez,M.A.Siddiqui,A.Ezzitouni,P.Russ,J.Wang,R.W.Wagner and M.D.Matteucci,J.Med.Chem.,1996,39,3739;A.Ezzitouni and V.E.Marquez,J.Chem.Soc.,Perkin Trans.1,1997,1073)、含有一与一未经改性核苷合成为二聚物的附加C-2’、C-3’-二氧戊环的双环状-和核苷,其中该附加环为核苷间键替代天然磷酸二酯键的部份(R.J.Jones,S.Swaminathan,J.F.Millagan,S.Wadwani,B.S.Froehler and M.Matteucci,J.Am.Chem.Soc.,1993,115,9816;J.Wang and M.D.Matteucci,Bioorg.Med.Chem.Lett.,1997,7,229)、包含一具有C-2’、C-3’-桥亚甲基作为酰胺及磺酰胺型核苷间键部份的二聚物(C.G.Yannopoulus,W.Q.Zhou,P.Nower,D.Peoch,Y.S.Sanghvi and G.Just,Synlett,1997,378)、双环状葡萄糖衍生的核苷类似物透过甲醛核苷间键加入三聚物中间(C.G.Yannopoulus,W.Q.Zhou,P.Nower,D.Peoch,Y.S.Sanghvi and G.Just,Synlett,1997,378),具有C-2’、C-3’连接六元环和五元环的双环状-与核苷(P.Nielsen,H.M.Pfundheller,J.Wengel,Chem.Commun.,1997,826;P.Nielsen,H.M.Pfundheller,JWengel,XII International RoundtableNucleosides,Nucleotides and TheirBiological Application;La Jolla,California,September 15-19,1996;PosterPPI 43)已合成并结合到寡脱氧核苷酸中。在所发现的适度改善双显性组合稳定性的情形中,仅涉及DNA或RNA目标物,或关于完全改性而非部分改性的寡核苷酸,反之亦然。已经报告的大部分类似物的评估,由于缺乏含G、A及C核碱基类似物的数据,以及缺乏指示杂交特异性及杂交模式数据,因而益发复杂。在许多情形中,已经报告单体类似物的合成极为复杂,而在另外一些情况下,完全改性寡核苷酸的合成与广为人使用的标准phosphoramidite化学不兼容。近来,已报导含锁定核酸(LNA)的寡聚物(Nielsen,P.,Pfundheller,H.M.,Olsen,C.E.and Wengel.J.,J.Chem.Soc.,Perkin Trans.1,1997,3423;N本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种寡聚物,包括至少一种通式Ⅰ的核苷类似物, *** Ⅰ 其中X选自-O-、-S-、-N(R↑[N*])-、-C(R↑[6]R↑[6*])-; B选自氢、羟基、任选取代的C↓[1-4]-烷氧基、任选取代的C↓[1-4]-烷基、任选取代的C↓[1-4]-酰氧基、核碱基、DNA嵌体、光化学活性基、热化学活性基、螯合基、信息基和配体; P表示核苷间键连接到后一单体或5’-端基的自由基位置,该核苷间键或5’-端基任选地包含取代基R↑[5]或同等应用的取代基R↑[5*]; P↑[*]表示核苷间键连接到前一单体,或3’-端基; R↑[2*]与R↑[4*]表示选自-C(R↑[a]R↑[b])-、-C(R↑[a])=C(R↑[b])-、-C(R↑[a])=N-、-O-、-Si(R↑[3])↓[2]-、-S-、-SO↓[2]-、-N(R↑[a])-和>C=Z的1至4个基团/原子组成的双自由基, 其中Z选自-O-、-S-和-N(R↑[a])-,R↑[a]和R↑[b]分别选自氢、任选取代的C↓[1-12]-烷基、任选取代的C↓[2-12]-烯基、任选取代的C↓[2-12]-炔基、羟基、C↓[1-12]-烷氧基、C↓[2-12]-烯氧基、羧基、C↓[1-12]-烷氧羰基、C↓[1-12]-烷羰基、甲酰基、芳基、芳氧基-羰基、芳氧基、芳羰基、杂芳基、杂芳氧基-羰基、杂芳氧基、杂芳羰基、胺基、一和二(C↓[1-6]-烷基)胺基、甲酰基、一和二(C↓[1-6]-烷基)-胺基-羰基、胺基-C↓[1-6]-烷基-胺羰基、一和二(C↓[1-6]-烷基)胺基-C↓[1-6]-烷基-胺基羰基、C↓[1-6]-烷基-羰胺基、甲酰胺基、C↓[1-6]-烷酰氧基、磺酰基、C↓[1-6]-烷磺酰氧基、硝基、偶氮基、胺磺酰基、C↓[1-6]-烷硫基、卤素、DNA嵌体、光化学活性基、热化学活性基、螯合基、信息基和配体,其中芳基与杂芳基任选地被取代,成对取代基R↑[a]与R↑[b]都可为任选取代的亚甲基烯烃(=CH↓[2]); 在此取代基R↑[1*]、R↑[2]、R↑[3*]、R↑[5]、R↑[5*]、R↑[6]和R↑[6*]分别选自氢、任选取代的C↓[1-12]-烷基、任选取代的C↓[2-12]-烯基、任选取代的C↓[2-12]-炔基、羟基、C↓[1-12]-烷氧基、C↓[2-12]-烯氧基、羧基、C↓[1-12]-烷氧羰基、C↓[1-12]-烷...

【技术特征摘要】
...

【专利技术属性】
技术研发人员:叶斯佩尔文格尔
申请(专利权)人:埃克西库恩公司
类型:发明
国别省市:DK[丹麦]

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