与结肠直肠癌的NSAID化学预防相关的材料和方法技术

本文中描述了预防癌症、治疗癌症、抑制肿瘤生长、预测患者结果、优化剂量和监控治疗功效的方法。具体地，某些microRNA和信使RNA是患有Lynch综合征或遗传性非息肉性结肠直肠癌的患者对NSAID化学预防和疗法的响应的有用的指示物。

Materials and methods relating to NSAID chemoprevention of colorectal cancer

Methods for the prevention of cancer, the treatment of cancer, the inhibition of tumor growth, the prediction of patient outcomes, the optimization of dosage, and the monitoring of therapeutic efficacy are described in this paper. Specifically, certain microRNA and messenger RNA are useful indicators of the response to NSAID chemoprevention and therapy in patients with Lynch syndrome or hereditary nonpolyposis colorectal cancer.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】专利技术人：RichardFishel,CarloM.Croce,LevyKopelovich,BruceAronow,JuanaMartin-Lopez相关申请的交叉参考本申请要求2011年12月1日提交的美国临时申请No.61/565,540的利益，所述美国临时申请的公开内容通过引用并入本文，用于所有目的。关于联邦政府资助的研究的声明本专利技术是在NationalCancerInstitute授予的基金号NO1-CN-43302和NO1-CN-53301下由美国政府支持进行的。美国政府具有本专利技术的某些权利。专利
本申请涉及医学，特别地肿瘤学的领域。本专利技术还涉及分子生物学，特别地microRNA和mRNA的领域。专利技术背景Lynch综合征或遗传性非息肉性结肠直肠癌(LS/HNPCC)是最常见的人癌症易感性综合征，占3-5％的结肠直肠癌(CRC)和5-7％的子宫内膜癌和卵巢癌。LS/HNPCC由人错配修复(MMR)基因的缺陷引起。此外，15-40％的散发性结肠直肠肿瘤、子宫内膜肿瘤、卵巢肿瘤和上泌尿道肿瘤显示简单重复序列的遗传不稳定性(微卫星不稳定性或MSI)，其指示了MMR缺陷。非类固醇抗炎药(NSAID)是可有效地预防几种类型的人癌症包括结肠直肠癌的、结构上多样的化合物的家族。乙酰水杨酸(ASA)，通常称为阿斯匹林，是NSAID家族的原始型。许多流行病学研究已证明ASA使用与CRC的发病率之间的反相关性。最近的临床分析显示，定期的ASA使用与已被诊断为CRC的个体的癌症特异性死亡率的更低的风险相关。证据表明，对非类固醇抗炎药(NSAID)的长期暴露减少CRC发病率。值得注意地，最近对于LS/HNPCC患者的随机试验显示，对阿斯匹林的长期暴露使肿瘤发生的比率降低至少2倍。NSAID、阿斯匹林(ASA)和舒林酸通过奇特地选择遗传上稳定的MMR缺陷细胞的遗传机制抑制MSI。MSI抑制不依赖于环加氧酶(COX)基因1和2(CRC化学预防研究的常见关注点)。一氧化氮供体型ASA(NO-ASA)抑制MSI的剂量为ASA的1/300-1/3000。日益增加的证据显示，NSAID是强有力的抗癌工具。然而，任何特定NSAID化合物的效力和剂量相较于其它NSAID可发生相当大的变化。NSAID化学预防疗法可需要数年来显示基于肉眼检查的有效肿瘤抑制。存在对在分子和细胞水平上测量和评估效力的另外的工具和方法的需要。此外，还存在对帮助理解NSAID癌症化学预防的机制的工具和方法的需要。本专利技术提供了治疗癌症、预测结果、优化剂量和监控治疗功效的替代方法。公开的方法克服了常规治疗法的限制，并且提供了根据下面详细描述将很显然的额外的有利方面。专利技术概述提供了预测患者结果、优化NSAID剂量、监控治疗功效、就功效筛选NSAID化合物、预防癌症、治疗癌症和抑制肿瘤生长的方法。具体地，某些microRNA(miR)和信使RNA(mRNA)是患有Lynch综合征或遗传性非息肉性结肠直肠癌(LS/HNPCC)的患者对NSAID化学预防和疗法的响应的有用指示物。提供了用于表征患有LS/HNPCC或怀疑患有LS/HNPCC的受试者的疾病的方法，包括：将样品中的至少一个生物标志物的水平与对照相比较，其中至少一个生物标志物选自：活化miR、抑制miR、活化mRNA、抑制mRNA及其组合；和，确定与对照相比，样品中至少一个生物标志物的水平是否下降或至少一种miR的水平是否升高，从而表征受试者的疾病。提供了活化miR，包括：miR-136、miR-199a-3p、miR-27b、miR-377、miR-21、miR-128、miR-103、miR-34a、miR-193、miR-328、miR-296-3p、miR-19a、miR126-5p、miR-29b、miR-29a、miR-301a、miR-1、miR-218、miR142-3p、miR-190、miR-144、miR-33、miR-377、miR-1196、mir-375-A、mir-615-P、miR-706-P、mir-485-3p-A、mir-290-P、miR-543-A、mir-425-3p-A、mir-326-A、mir-589-A、mir-129-2-A、mir-553-A、mir-96-A、mir-7-2-A、mir-519e*-5p-A、mir-293-A、has、mir-551a-A、mir-594-P、mir-601-A、miR-487b-A、miR-676-3p-A、miR-500-P、miR-706、miR-543、miR-328、miR-202、miR-338和miR-483。提供了抑制miR，包括：miR-341、miR-297c、miR-423-5p、miR762、miR-2135、miR-423-5p、miR-297c、miR-222、miR-223、miR-130、miR-133、miR-100、miR-184、miR-135、miR-141、miR-199、miR-102、miR-143、miR-27b、miR193和miR-9。提供了活化mRNA，包括：RPL13A、Npas2、Arntl、Kitl、Malat1、Ept1、1810014B01Rik、Aes、Sepw1、Rab4a、bak1、mall、Zfand5、Nfil3、Npas2、Irf2bp21700110K17Rik、Bmpr1a、Suhw4、Msi2、Smc1a,2,5、jmjd1c、Blrc6、CdkN1b、jarid1a和Bclaf1。提供了抑制miR，包括：Slc38a10、Aes、Rab5c、Cfl1、PPARD、Actb、Pttg1ip、Espn、Elovl1、Angptl2、Hlf、Per2、Tef、Per3、Dbp、Ste20a1、Gm129、Ang4、Bambi、Cd24a、Ccl6、Entpd5、Wee1、Ank3、Trp53、Sel1l、Ube4b、Arid5b、Prkab2、Per1、Bace1和Stox2。提供了评估NSAID癌症化学预防治疗在人或动物受试者中的功效的方法，所述方法包括：从接受NSAID治疗的受试者获得含核酸的样品；测量至少一种活化miR的miRNA表达，所述活化miR选自：miR-103、miR-193、miR-128、miR-136、miR-199a-3p、miR-27b、miR-377、miR-21、miR-34a、miR-328、miR-296-3p；如果样品中测量的活化miR被激活，则确定NSAID治疗是有效的。本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于评估NSAID癌症化学预防治疗在人或动物受试者中的功效的方法，所述方法包括：从接受NSAID治疗的受试者获得含核酸的样品；测量至少一种活化miR的miRNA表达，所述活化miR选自：miR‑103、miR‑193、miR‑128、miR‑136、miR‑199a‑3p、miR‑27b、miR‑377、miR‑21、miR‑34a、miR‑328、miR‑296‑3p；如果所述样品中测量的所述活化miR被激活，则确定所述NSAID治疗是有效的。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2011.12.01 US 61/565,5401.一种用于评估NSAID癌症化学预防治疗在人或动物受试者中的功效的方法，所述方
法包括：
从接受NSAID治疗的受试者获得含核酸的样品；
测量至少一种活化miR的miRNA表达，所述活化miR选自：miR-103、miR-193、miR-128、
miR-136、miR-199a-3p、miR-27b、miR-377、miR-21、miR-34a、miR-328、miR-296-3p；
如果所述样品中测量的所述活化miR被激活，则确定所述NSAID治疗是有效的。
2.权利要求1的方法，其中所述至少一种活化miR包括：miR-103、miR-193和miR-128。
3.一种用于评估NSAID癌症化学预防治疗在人或动物受试者中的功效的方法，所述方
法包括：
从接受NSAID治疗的受试者获得含核酸的样品；
测量至少一种抑制miR的microRNA(miR)表达，所述抑制miR选自：miR-341、miR-297c、
miR-423-5p、miR762、miR-2135、miR-423-5p、miR-297c；
如果所述样品中测量的所述抑制miR被抑制，则确定所述NSAID治疗是有效的。
4.一种用于评估NSAID癌症化学预防治疗在人或动物受试者中的功效的方法，所述方
法包括：
从接受NSAID治疗的受试者获得含核酸的样品；
测量至少一种活化miR的miRNA表达，所述活化miR选自：miR-19a、miR-126-5p、miR-
29b、miR-301a、miR-1、miR-218、miR-142-3p、miR-190、miR-144、miR-33、miR-377、miR-
1196；
如果所述样品中测量的所述活化miR被激活，则确定所述NSAID治疗是有效的。
5.一种用于评估NSAID癌症化学预防治疗在人或动物受试者中的功效的方法，所述方
法包括：
从接受NSAID治疗的受试者获得含核酸的样品；
测量至少一种活化miR的miRNA表达，所述活化miR选自：miR-375-A、miR-615-P、miR-
706-P、miR-485-3p-A、miR-290-P、miR-543-A、miR-425-3p-A、miR-326-A、miR-589-A、miR-
129-2-A、miR-553-A、miR-96-A、miR-7-2-A、miR-519e*-5p-A、miR-293-A、miR-551a-A、miR-
594-P、miR-601-A、miR-487b-A、miR-676-3p-A、miR-500-P；
如果所述样品中测量的所述活化miR被激活，则确定所述NSAID治疗是有效的。
6.一种用于评估NSAID癌症化学预防治疗在人或动物受试者中的功效的方法，所述方
法包括：
从接受NSAID治疗的受试者获得含核酸的样品；
测量至少一种活化miR的miRNA表达，所述活化miR选自：miR-103、miR-193、miR-128、
miR-136、miR-199a-3p、miR-27b、miR-377、miR-21、miR-34a、miR-328、miR-296-3p、miR-
19a、miR-126-5p、miR-29b、miR-301a、miR-1、miR-218、miR-142-3p、miR-190、miR-144、miR-
33、miR-377、miR-1196、miR-375-A、miR-615-P、miR-706-P、miR-485-3p-A、miR-290-P、miR-
543-A、miR-425-3p-A、miR-326-A、miR-589-A、miR-129-2-A、miR-553-A、miR-96-A、miR-7-
2-A、miR-519e*-5p-A、miR-293-A、miR-551a-A、miR-594-P、miR-601-A、miR-487b-A、miR-
676-3p-A、miR-500-P、miR-706、miR-543、miR-328、miR-202、miR-338和miR-483；
如果所述样品中测量的所述活化miR被激活，则确定所述NSAID治疗是有效的。
7.一种用于评估NSAID癌症化学预防治疗在人或动物受试者中的功效的方法，所述方
法包括：
从接受NSAID治疗的受试者获得含核酸的样品；
测量至少一种活化mRNA的信使RNA(mRNA)表达，所述活化mRNA选自：RPL13A、Npas2、
Arntl、Kitl、Malat1、Ept1、1810014B01Rik、Aes、Sepw1、Rab4a、bak1、mall、Zfand5、Nfil3、
Npas2和Irf2bp21700110K17Rik；
如果所述样品中测量的所述活化mRNA被激活，则确定所述NSAID治疗是有效的。
8.权利要求6的方法，其中所述至少一种活化mRNA包括Kitl。
9.一种用于评估NSAID癌症化学预防治疗在人或动物受试者中的功效的方法，所述方
法包括：
从接受NSAID治疗的受试者获得含核酸的样品；
测量至少一种抑制mRNA的信使RNA(mRNA)表达，所述抑制mRNA选自：Slc38a10、Aes、
Rab5c、Cfl1、PPARD、Actb、Pttg1ip、Espn、Elovl1、Angptl2、Hlf、Per2、Tef、Per3、Dbp；
Ste20a1和Gm129；
如果所述样品中测量的所述抑制mRNA被抑制，则确定所述NSAID治疗是有效的。
10.权利要求9的方法，其还包括测量至少一种选自Ang4、Bambi、Cd24a、Ccl6、Entpd5、
Wee1、Ank3、Trp53、Sel1l、Ube4b、Arid5b、Prkab2、Per1、Bace1和Stox2的抑制mRNA。
11.一种用于评估NSAID癌症化学预防治疗在人或动物受试者中的功效的方法，所述方
法包括：
从接受NSAID治疗的受试者获得含核酸的样品；
测量至少一种mRNA和/或miR生物标志物；
基于所述至少一种mRNA和/或miR生物标志物的表达确定NSAID治疗是否有效。
12.上述权利要求的任一项的方法，其中从下列的至少一种中提取样品：组织、血液、肿
瘤、粪便、粘液、发育不良的组织、结肠直肠组织、卵巢组织、泌...

【专利技术属性】
技术研发人员：R·菲舍尔，C·M·克罗斯，L·科普洛维奇，B·阿罗诺，J·马丁洛佩兹，
申请(专利权)人：俄亥俄州国家创新基金会，由卫生与公众服务部代表的美利坚合众国政府，儿童医院医疗中心，
类型：发明
国别省市：美国;US