一组胃癌腹膜转移标志物及其用途制造技术

本发明专利技术属于生物医药技术领域，具体涉及胃癌腹膜转移标志物及其用途。本发明专利技术首次发现一系列的胃癌腹膜转移标志物，为研制相应的诊断试剂盒，对我国胃癌腹膜转移诊断现状必将是一次有力的推动，也为其药物筛选、药效评价及靶向治疗开辟了新的途径。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物医药
，具体涉及一组胃癌腹膜转移标志物及其用途。
技术介绍
胃癌是严重威胁我国人民生命健康的消化道恶性肿瘤，胃癌患者主要死于肿瘤的复发与转移，大约20％-53.5％的患者术后3年内出现腹膜转移。有关胃癌发生腹膜转移的分子机制至今未明，导致目前缺少相应的诊断试剂盒和其药物筛选、药效评价及靶向治疗的药靶。由于缺乏有效的早期筛查手段，绝大多数胃癌就诊时已达到中晚期，丧失了手术治疗最佳时期。因此，化疗成为中晚期胃癌、特别是无法进行手术治疗胃癌的不二选择。国内外胃癌的化疗基本上采用程式化治疗方案，即5-FU+铂类为主的治疗模式。故实际对化疗的应答率较低，只有20-40％的患者有效，而大部分患者接受了无谓的化疗毒副作用。如果不改善现有胃癌治疗模式，则很难切实提高胃癌的实际治疗效果。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是为胃癌或胃癌腹膜转移的诊断或药物筛选、药效评价及靶向治疗的药靶提供一种解决方法。为此，本专利技术公开了一种胃癌腹膜转移标志物，其为GPX4-MPND融合基因，GPX4(chr19:1106458)-MPND(chr19:4345742)，该基因的融合发生在GPX4的第7外显子与MPND的第3外显子之间。同时，本专利技术还公开了一组胃癌腹膜转移标志物在制备诊断胃癌或胃癌腹膜转移的检测试剂盒中的用途，所述胃癌腹膜转移标志物为导致氨基酸改变的体细胞单核苷酸变异其为RP1L1,NCBIGeneID:94137；和/或PRB1，NCBIGeneID:5542；和/或HS6ST3，NCBIGeneID:266722；和/或DCTN1，NCBIGeneID:1639；和/或ARMC4，NCBIGeneID:55130中之一或它们任何组合的单核苷酸变异。在一些实施例中，所述RP1L1为8p23.1的10467547位点发生G>A变异；PRB1为12p13.2的11506869位点发生C>A变异；HS6ST3为13q32.1的97484796发生G>A变异；DCTN1为2p13.1的74593112发生G>A变异；ARMC4为10p12.1的28142179位点发生C>T变异。本领域技术人员将能通过能够检测SNV位点的任何方法或技术在个体的核酸中进行在本文所公开的一个或几个SNV标记上存在的核苷酸的分析。例如，一个人能用本专利技术所述的方法通过进行Taqman法、质谱法、DNA微阵列法、测序法、微测序、杂交、限制性片段分析、寡核苷酸连接检测、等位基因特异性PCR-HRM或联合应用上述方法检测SNV生物标记。当然，这一列表仅是示例性的，并且绝不用于限制本专利技术。本领域技术人员可使用任何合适的方法来实现这种检测。另一方面，本专利技术还公开了胃癌腹膜转移标志物在制备诊断胃癌或胃癌腹膜转移的检测试剂盒中的用途，胃癌腹膜转移标志物为SFRP4，NCBIGeneID:6424；NOX4，NCBIGeneID:50507；HOXA11，NCBIGeneID:3207；NKX2-5，NCBIGeneID:1482；CDH16，NCBIGeneID:1014；RP1L1,NCBIGeneID:94137；PRB1，NCBIGeneID:5542；TUBB6，NCBIGeneID:84617；LOC100505875，NCBIGeneID:100505875；的表达产物中之一或它们任何组合。在一些实施例中，所述胃癌腹膜转移标志物为RP1L1,NCBIGeneID:94137；PRB1，NCBIGeneID:5542；TUBB6，NCBIGeneID:84617的表达产物中之一或它们任何组合。本专利技术还公开了胃癌腹膜转移标志物在制备诊断胃癌或胃癌腹膜转移的检测试剂盒中的用途，胃癌腹膜转移标志物为LIPF,NCBIGeneID:8513；NKX6-2,NCBIGeneID:84504；MIXL1,NCBIGeneID:83881；CWH43,NCBIGeneID:80157；SULT1E1,NCBIGeneID:6783；CXCL5,NCBIGeneID:6374；REG1A,NCBIGeneID:5967；GHRL,NCBIGeneID:51738；NKX2-2,NCBIGeneID:4821；HTR1E,NCBIGeneID:3354；HPGD,NCBIGeneID:3248；ESRRG,NCBIGeneID:2014；CYP2C19,NCBIGeneID:1557；ADH1C,NCBIGeneID:126；PNLIPRP3，NCBIGeneID:119548；和CEACAM5，NCBIGeneID:1048的表达产物中之一或它们任何组合。所述检测试剂盒在人类受试者中进行胃癌或胃癌腹膜转移的易感性评价和/或诊断和/或预测的体外方法中使用，其中所述试剂盒包含用于进行下列步骤的适当的工具：a)评价至少一种与所述的人类受试者的胃癌或胃癌腹膜转移标志物类型和/或水平；和b)将所述的人类受试者的在a)中评价的生物标记数据与健康的和/或患病的人的生物标记数据进行比较，来做出所述的人类受试者的胃癌或胃癌腹膜转移的风险评价和/或诊断和/或预测。术语“检测试剂盒”和“试剂盒”是同义词并可互换使用。在本专利技术的上下文中，当是指检测试剂盒时，术语“适当的工具”是指任何用于达到所指明的目的的任何技术手段。作为这种适当的工具的非限制性例子，能列举试剂和/或材料和/或流程和/或说明书和/或软件等。本专利技术所述的所有试剂盒可包含适当的包装和说明书用于在本文所公开的方法中使用。试剂盒可进一步包含适当的缓冲液和聚合酶，如耐热聚合酶，例如Taq聚合酶。这种试剂盒也包含对照引物和/或探针。根据优选的具体实施方式，本专利技术所述的检测试剂盒为核酸检测试剂盒，包括基因组DNA抽提试剂、PCR反应体系试剂和HRM荧光染料试剂，所述PCR反应体系包括dNTP、MgCl2、TaqDNA聚合酶、PCR反应缓冲液和引物。在可检测出SNP位点的前提下，HRM荧光染料试剂可被Taqman法、质谱法、DNA微阵列法、测序法、微测序等试剂替换。另一方面，本专利技术还公开了胃癌腹膜转移标志物在制备治疗胃癌或胃癌腹膜转移的药物筛选中的用途，所述胃癌腹膜转移标志物为SFRP4，NCBIGeneID:6424；NOX4，NCBIGeneID:50507；HOXA11，NCBIGeneID:3207；NKX2-5，NCBIGeneID:1482；CDH16，NCBIGeneID:1014；RP1L1,NCBIGeneID:94137；PRB1，NCBIGeneID:5542；TUBB6，NCBIGeneID:84617的表达产物中之一或它们任何组合。另一方面，本专利技术还公开了胃癌腹膜转移标志物在制备治疗胃癌或胃癌腹膜转移的药物筛选中的用途，所述胃癌腹膜转移标志物为LIPF,NCBIGeneID:8513；NKX6-2,NCBIGeneID:84504；MIXL1,NCBIGeneID:83881；CWH43,NCBIGeneID:80157；SULT1E1,NCBIGeneID:6783；CXCL5,NCBIGe本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种胃癌腹膜转移标志物，其为GPX4‑MPND融合基因，GPX4(chr19:1106458)‑MPND(chr19:4345742)，该基因的融合发生在GPX4的第7外显子与MPND的第3外显子之间。

【技术特征摘要】
1.一种胃癌腹膜转移标志物，其为GPX4-MPND融合基因，GPX4(chr19:1106458)-MPND(chr19:4345742)，该基因的融合发生在GPX4的第7外显子与MPND的第3外显子之间。2.胃癌腹膜转移标志物在制备诊断胃癌或胃癌腹膜转移的检测试剂盒中的用途，所述胃癌腹膜转移标志物为导致氨基酸改变的体细胞单核苷酸变异其为RP1L1,NCBIGeneID:94137；和/或PRB1，NCBIGeneID:5542；和/或HS6ST3，NCBIGeneID:266722；和/或DCTN1，NCBIGeneID:1639；和/或ARMC4，NCBIGeneID:55130中之一或它们任何组合的单核苷酸变异。3.如权利要求2所述的用途，其特征在于所述RP1L1为8p23.1的10467547位点发生G>A变异；PRB1为12p13.2的11506869位点发生C>A变异；HS6ST3为13q32.1的97484796发生G>A变异；DCTN1为2p13.1的74593112发生G>A变异；ARMC4为10p12.1的28142179位点发生C>T变异。4.癌腹膜转移标志物在制备诊断胃癌或胃癌腹膜转移的检测试剂盒中的用途，胃癌腹膜转移标志物为SFRP4，NCBIGeneID:6424；NOX4，NCBIGeneID:50507；HOXA11，NCBIGeneID:3207；NKX2-5，NCBIGeneID:1482；CDH16，NCBIGeneID:1014；RP1L1,NCBIGeneID:94137；PRB1，NCBIGeneID:5542；TUBB6，NCBIGeneID:84617；LOC100505875，NCBIGeneID:100505875的表达产物中之一或它们任何组合。5.如权利要求4所述的用途，其特征在所述胃癌腹膜转移标志物为RP1L1,NCBIGeneID:94137；PRB1，NCBIGeneID:5542；TUBB6，NCBIGeneID:84617的表达产物中之一或它们任何组合。6.胃癌腹膜转移标志物在制备诊断胃癌或胃癌腹膜转移的检测试剂盒中的用途，胃癌腹膜转移标志物为LIPF,NCBIGeneID:8513；NKX6-2,NCBIGeneID:84504；MIXL1,NCBIGene...

【专利技术属性】
技术研发人员：于颖彦，张俊，计骏，朱正纲，
申请(专利权)人：上海交通大学医学院附属瑞金医院，
类型：发明
国别省市：上海;31