用于检测结肠直肠肿瘤的蛋白质生物标志物谱制造技术
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】相关申请的交叉引用本申请要求于2014年3月28日提交的美国临时序列号61/972,153的优先权，该申请通过引用而全文并入于此；本申请要求于2014年5月30日提交的美国临时序列号62/005,835的优先权，该申请通过引用而全文并入于此；并且本申请要求于2015年1月23日提交的美国临时序列号62/107,265的优先权，该申请通过引用而全文并入于此。专利技术背景结肠直肠癌(CRC)可由结肠或直肠(大肠的一部分)或阑尾中不受控制的细胞生长造成。CRC可从结肠息肉发展而来。结肠息肉通常包含在大肠或直肠的内层上形成的良性细胞团块。虽然许多结肠息肉是非恶性的，但息肉可发展成腺瘤。结肠直肠腺瘤随后可生长成晚期结肠直肠腺瘤，该晚期结肠直肠腺瘤随后可发展成CRC。CRC是世界上第三大常被诊断出的癌症，仅在2008年就有大约123万新诊断的病例和608,000例由于CRC导致的死亡。在发达国家，约33％的CRC患者最终死于该疾病。存活可能与检测时癌症的阶段有关。例如，早期检测的存活率可能是晚期癌症存活率的约5倍。CRC的早期诊断可具有将CRC死亡减少60％的可能性。I期患者的存活率约为85％，而II期患者的5年存活率下降至约65-75％，III期患者的5年存活率降至35-50％。对结肠直肠癌最常见的非侵入性检验是粪便潜血试验(“FOBT”)。遗憾的是，FOBT除了其假阳性率较高之外，其灵敏度保持在50％左右，并且可能对早期CRC的检测具有较低的灵敏度。已经研究了结肠直肠癌的许多血清标志物，如癌胚抗原(“CEA”)、碳水化合物抗原19-9和脂质相关唾液酸。然而，其低灵敏...
【技术保护点】
一种对个体的结肠直肠癌状态进行分类的方法，其包括以下步骤：从所述个体获得血液样品；确定所述血液样品中的蛋白质系列组的蛋白质累积水平；将从所述个体获得的样品中的蛋白质系列组的蛋白质累积水平与对应于已知癌症状态的水平进行比较，以及如果所述个体的结肠直肠癌状态系列组蛋白质累积水平与对应于所述已知结肠直肠癌状态的所述结肠直肠癌状态系列组蛋白质累积水平基本匹配，则将所述个体的所述结肠直肠癌状态分类为所述已知结肠直肠癌状态，其中所述分类具有至少70％的特异性，并且其中所述分类具有至少70％的特异性。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.03.28 US 61/972,153;2014.05.30 US 62/005,835;1.一种对个体的结肠直肠癌状态进行分类的方法，其包括以下步骤：从所述个体获得血液样品；确定所述血液样品中的蛋白质系列组的蛋白质累积水平；将从所述个体获得的样品中的蛋白质系列组的蛋白质累积水平与对应于已知癌症状态的水平进行比较，以及如果所述个体的结肠直肠癌状态系列组蛋白质累积水平与对应于所述已知结肠直肠癌状态的所述结肠直肠癌状态系列组蛋白质累积水平基本匹配，则将所述个体的所述结肠直肠癌状态分类为所述已知结肠直肠癌状态，其中所述分类具有至少70％的特异性，并且其中所述分类具有至少70％的特异性。2.如权利要求1所述的方法，其中所述分类具有至少75％的特异性。3.如权利要求1所述的方法，其中所述分类具有至少80％的特异性。4.如权利要求1所述的方法，其中所述分类具有至少85％的特异性。5.如权利要求1所述的方法，其中所述分类具有至少90％的特异性。6.如权利要求1所述的方法，其中所述分类具有至少75％的灵敏度。7.如权利要求1所述的方法，其中所述分类具有至少80％的灵敏度。8.如权利要求1所述的方法，其中所述分类具有至少85％的灵敏度。9.如权利要求1所述的方法，其中所述分类具有至少90％的灵敏度。10.如权利要求1所述的方法，其中所述确定包括对所述血液样品进行ELISA测定。11.如权利要求1所述的方法，其中所述确定包括对所述血液样品进行质谱分析。12.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、CATD、CEA、CO9、OSTP和SEPR。13.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、APOA1、CATD、CEA、CLUS、CO3、CO9、FGB、FIBG、GELS、PRDX1、SBP1和SEPR。14.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、CATD、CEA、CO9和SEPR。15.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、AACT、CATD、CEA、CO9、CRP、GELS、SAA1和SEPR。16.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含CATD、CEA、CO3、CO9、GELS和SEPR。17.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少两种蛋白质。18.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少三种蛋白质。19.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少四种蛋白质。20.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少五种蛋白质。21.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少六种蛋白质。22.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少七种蛋白质。23.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少八种蛋白质。24.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少九种蛋白质。25.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十种蛋白质。26.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十一种蛋白质。27.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十二种蛋白质。28.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十三种蛋白质。29.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含CO9和GELS，并且其中所述分类具有大于0.76的接受者操作特征曲线下面积。30.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、AACT、ANXA1、APOA1、CO9、CRP、CSF1、FHL1、FIBG、GELS、HPT和SAA1。31.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、AACT、ANXA1、APOA1、CO9、CRP、CSF1、FHL1、FIBG、GELS、HPT和SAA1，并且其中所述分类具有大于0.83的接受者操作特征曲线下面积。32.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含APOA1、CO3和CO9。33.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含APOA1、CO3和CO9，并且其中所述分类具有大于0.81的接受者操作特征曲线下面积。34.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含AACT、CO3、CO9、CRP和GELS。35.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含AACT、CO3、CO9、CRP和GELS，并且其中所述分类具有大于0.81的接受者操作特征曲线下面积。36.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含SPB6、GELS、A1AT、FIBG和CO3。37.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含SPB6、GELS、A1AT、FIBG和CO3，并且其中所述分类具有大于0.79的接受者操作特征曲线下面积。38.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、AMY2B、CLUS、CO9、ECH1、FRIL、GELS、OSTP、SBP1、SEPR、SPON2和TIMP1。39.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、AMY2B、CLUS、CO9、ECH1、FRIL、GELS、OSTP、SBP1、SEPR、SPON2和TIMP1，并且其中所述分类具有大于0.91的接受者操作特征曲线下面积。40.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含CO9和GELS。41.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含CO9和GELS，并且其中所述分类具有大于0.87的接受者操作特征曲线下面积。42.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含GELS、PRDX1、CO9和CATD。43.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含GELS、PRDX1、CO9和CATD，并且其中所述分类具有大于0.84的接受者操作特征曲线下面积。44.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AT、APOA1和FIBG。45.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AT、APOA1和FIBG，并且其中所述分类具有大于0.81的接受者操作特征曲线下面积。46.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AT和TRFE。47.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AT和TRFE，并且其中所述分类具有大于0.89的接受者操作特征曲线下面积。48.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AT、APOA1、FIBB和CEAM3。49.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含A1AT、APOA1、FIBB和CEAM3，并且其中所述分类具有大于0.80的接受者操作特征曲线下面积。50.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含CAH1、CRP、FIBG和CTNB1。51.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含CAH1、CRP、FIBG和CTNB1，并且其中所述分类具有大于0.78的接受者操作特征曲线下面积。52.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含CRP、SEPR、SBP1、SRC和DPP4。53.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含CRP、SEPR、SBP1、SRC和DPP4，并且其中所述分类具有大于0.78的接受者操作特征曲线下面积。54.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含CRP和TMP。55.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含CRP和TMP，并且其中所述分类具有大于0.76的接受者操作特征曲线下面积。56.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含SYG、AACT和CO9。57.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含SYG、AACT和CO9，并且其中所述分类具有大于0.86的接受者操作特征曲线下面积。58.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述系列组包含CATD、CEA、CO9和SEPR。59.如权利要求1-58中任一项所述的方法，其进一步包括提供与所述分类有关的建议。60.如权利要求1-59中任一项所述的方法，其中所述分类是分类为无癌症个体。61.如权利要求59所述的方法，其中所述建议包括继续监测。62.如权利要求1-59中任一项所述的方法，其中所述分类是分类为患有CRC的个体。63.如权利要求62所述的方法，其中所述建议包括进行结肠镜检查。64.如权利要求62所述的方法，其中所述建议包括进行乙状结肠镜检查。65.如权利要求62所述的方法，其中所述建议包括进行独立的癌症测定。66.如权利要求62所述的方法，其中所述建议包括进行粪便癌症测定。67.如权利要求62所述的方法，其中所述建议包括进行化疗。68.如权利要求62所述的方法，其中所述建议包括施用生物抗癌剂。69.如权利要求62所述的方法，其中所述建议包括手术干预。70.一种用于监测个体对施用于所述个体的结肠直肠癌治疗方案的反应的方法，其包括：将在第一时间段从所述个体获得的血液样品中蛋白质系列组的累积水平与在第二时间段从所述个体获得的血液样品中蛋白质系列组的累积水平进行比较。71.如权利要求70所述的方法，其中所述监测包括对所述血液样品进行ELISA测定。72.如权利要求70所述的方法，其中所述监测包括对所述血液样品进行质谱分析。73.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、CATD、CEA、CO9、OSTP和SEPR。74.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、APOA1、CATD、CEA、CLUS、CO3、CO9、FGB、FIBG、GELS、PRDX1、SBP1和SEPR。75.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、CATD、CEA、CO9和SEPR。76.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、AACT、CATD、CEA、CO9、CRP、GELS、SAA1和SEPR。77.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含CATD、CEA、CO3、CO9、GELS和SEPR。78.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含CATD、CEA、CO9和SEPR。79.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少两种蛋白质。80.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少三种蛋白质。81.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少四种蛋白质。82.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少五种蛋白质。83.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少六种蛋白质。84.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少七种蛋白质。85.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少八种蛋白质。86.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少九种蛋白质。87.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十种蛋白质。88.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十一种蛋白质。89.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十二种蛋白质。90.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十三种蛋白质。91.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含CO9和GELS。92.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含CO9和GELS，并且其中所述分类具有大于0.76的接受者操作特征曲线下面积。93.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、AACT、ANXA1、APOA1、CO9、CRP、CSF1、FHL1、FIBG、GELS、HPT和SAA1。94.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、AACT、ANXA1、APOA1、CO9、CRP、CSF1、FHL1、FIBG、GELS、HPT和SAA1，并且其中所述分类具有大于0.83的接受者操作特征曲线下面积。95.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含APOA1、CO3和CO9。96.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含APOA1、CO3和CO9，并且其中所述分类具有大于0.81的接受者操作特征曲线下面积。97.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含AACT、CO3、CO9、CRP和GELS。98.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含AACT、CO3、CO9、CRP和GELS，并且其中所述分类具有大于0.81的接受者操作特征曲线下面积。99.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含SPB6、GELS、A1AT、FIBG和CO3。100.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含SPB6、GELS、A1AT、FIBG和CO3，并且其中所述分类具有大于0.79的接受者操作特征曲线下面积。101.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、AMY2B、CLUS、CO9、ECH1、FRIL、GELS、OSTP、SBP1、SEPR、SPON2和TIMP1。102.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AG1、A1AT、AMY2B、CLUS、CO9、ECH1、FRIL、GELS、OSTP、SBP1、SEPR、SPON2和TIMP1，并且其中所述分类具有大于0.91的接受者操作特征曲线下面积。103.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含CO9和GELS，并且其中所述分类具有大于0.87的接受者操作特征曲线下面积。104.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含GELS、PRDX1、CO9和CATD。105.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含GELS、PRDX1、CO9和CATD，并且其中所述分类具有大于0.84的接受者操作特征曲线下面积。106.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AT、APOA1和FIBG。107.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AT、APOA1和FIBG，并且其中所述分类具有大于0.81的接受者操作特征曲线下面积。108.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AT和TRFE。109.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AT和TRFE，并且其中所述分类具有大于0.89的接受者操作特征曲线下面积。110.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AT、APOA1、FIBB和CEAM3。111.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含A1AT、APOA1、FIBB和CEAM3，并且其中所述分类具有大于0.80的接受者操作特征曲线下面积。112.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含CAH1、CRP、FIBG和CTNB1。113.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含CAH1、CRP、FIBG和CTNB1，并且其中所述分类具有大于0.78的接受者操作特征曲线下面积。114.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含CRP、SEPR、SBP1、SRC和DPP4。115.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含CRP、SEPR、SBP1、SRC和DPP4，并且其中所述分类具有大于0.78的接受者操作特征曲线下面积。116.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含CRP和TMP。117.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含CRP和TMP，并且其中所述分类具有大于0.76的接受者操作特征曲线下面积。118.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含SYG、AACT和CO9。119.如权利要求70所述的方法，其中所述系列组包含SYG、AACT和CO9，并且其中所述分类具有大于0.86的接受者操作特征曲线下面积。120.如权利要求70所述的方法，其中在第一时间段获得的样品包含血清。121.如权利要求70所述的方法，其中在第一时间段获得的样品包含血液蛋白质。122.如权利要求70所述的方法，其中在第一时间段获得的样品包含从血液样品获得的蛋白质。123.如权利要求70-122中任一项所述的方法，其进一步包括将在所述第一时间段从所述个体获得的血液样品中蛋白质系列组的所述累积水平与在第三时间段从所述个体获得的血液样品中所述蛋白质系列组的累积水平进行比较。124.如权利要求70-123中任一项所述的方法，其中所述第一样品在所述治疗方案开始之前获得。125.一种试剂盒，其包含供用于评估结肠直肠癌状态的ELISA测定使用的抗体系列组。126.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对A1AG1、A1AT、CATD、CEA、CO9、OSTP和SEPR的抗体。127.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对A1AG1、A1AT、APOA1、CATD、CEA、CLUS、CO3、CO9、FGB、FIBG、GELS、PRDX1、SBP1和SEPR的抗体。128.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对A1AG1、A1AT、CATD、CEA、CO9和SEPR的抗体。129.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对A1AG1、A1AT、AACT、CATD、CEA、CO9、CRP、GELS、SAA1和SEPR的抗体。130.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对CATD、CEA、CO3、CO9、GELS和SEPR的抗体。131.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对CATD、CEA、CO9和SEPR的抗体。132.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少两种生物标志物的抗体。133.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少三种生物标志物的抗体。134.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少四种生物标志物的抗体。135.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少五种生物标志物的抗体。136.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少六种生物标志物的抗体。137.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少七种生物标志物的抗体。138.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少八种生物标志物的抗体。139.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少九种生物标志物的抗体。140.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十种生物标志物的抗体。141.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十一种生物标志物的抗体。142.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十二种生物标志物的抗体。143.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CO3、CO9、CRP、CSF1、CTNB1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SRC、SYG、TIMP、TIMP1和TRFE的至少十三种生物标志物的抗体。144.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对A1AG1、A1AT、AACT、ANXA1、APOA1、CO9、CRP、CSF1、FHL1、FIBG、GELS、HPT和SAA1的抗体。145.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对APOA1、CO3和CO9的抗体。146.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对AACT、CO3、CO9、CRP和GELS的抗体。147.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对SPB6、GELS、A1AT、FIBG和CO3的抗体。148.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对A1AG1、A1AT、AMY2B、CLUS、CO9、ECH1、FRIL、GELS、OSTP、SBP1、SEPR、SPON2和TIMP1的抗体。149.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对CO9和GELS的抗体。150.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对GELS、PRDX1、CO9和CATD的抗体。151.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对A1AT、APOA1和FIBG的抗体。152.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对A1AT和TRFE的抗体。153.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对A1AT、APOA1、FIBB和CEAM3的抗体。154.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对CAH1、CRP、FIBG和CTNB1的抗体。155.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对CRP、SEPR、SBP1、SRC和DPP4的抗体。156.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对CRP和TMP的抗体。157.如权利要求125所述的试剂盒，其中所述抗体系列组包含针对SYG、AACT和CO9的抗体。158.如权利要求125所述的试剂盒，其中用于评估结肠直肠癌状态的ELISA测定具有至少80％的灵敏度。159.如权利要求125所述的试剂盒，其中用于评估结肠直肠癌状态的ELISA测定具有至少85％的灵敏度。160.如权利要求125所述的试剂盒，其中用于评估结肠直肠癌状态的ELISA测定具有至少90％的灵敏度。161.如权利要求125所述的试剂盒，其中用于评估结肠直肠癌状态的ELISA测定具有至少80％的特异性。162.如权利要求125所述的试剂盒，其中用于评估结肠直肠癌状态的ELISA测定具有至少85％的特异性。163.如权利要求125所述的试剂盒，其中用于评估结肠直肠癌状态的ELISA测定具有至少90％的特异性。164.如权利要求125-163中任一项所述的试剂盒，其中所述试剂盒包含用于从个体提取血液的试剂以及用于从血液中提取蛋白质的试剂。165.一种对受试者的结肠直肠癌和晚期结肠直肠腺瘤中的至少一种进行治疗的方法，其包括：(a)测量从所述受试者获得的生物样品中的生物标志物系列组，其中所述生物标志物系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CTNB1、CO3、CO9、CRP、CSF1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SYG、TIMP1和TRFE的至少两种生物标志物；(b)基于所述测量，检测所述受试者中是否存在结肠直肠癌和/或晚期结肠直肠腺瘤；以及(c)基于所述检测，治疗所述受试者的结肠直肠癌。166.一种对受试者的结肠直肠癌和晚期结肠直肠腺瘤中的至少一种进行诊断的方法，其包括：(a)测量从所述受试者获得的生物样品中的生物标志物系列组，其中所述生物标志物系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CTNB1、CO3、CO9、CRP、CSF1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SYG、TIMP1和TRFE的至少两种生物标志物；(b)基于所述测量，检测所述受试者中是否存在结肠直肠癌和晚期结肠直肠腺瘤中的至少一种；以及(c)基于所述检测，向所述受试者推荐所述受试者的结肠镜检查、乙状结肠镜检查和组织活检中的至少一种。167.一种方法，其包括：(a)获得数据，该数据包括从受试者获得的生物样品中的生物标志物系列组的测量结果，其中所述生物标志物系列组包含选自A1AG1、A1AT、AACT、AMY2B、ANXA1、APOA1、CAH1、CATD、CEAM3、CLUS、CTNB1、CO3、CO9、CRP、CSF1、DPP4、ECH1、FHL1、FIBB、FIBG、FRIL、GELS、HPT、OSTP、PRDX1、SAA1、SBP1、SEPR、SPB6、SPON2、SYG、TIMP1和TRFE的至少两种生物标志物；(b)基于测量数据生成所述生物标志物系列组的受试者特异性谱；(c)将所述生物标志物系列组的受试者特异性谱与所述生物标志物系列组的参考谱进行比较；以及(d)基于(c)确定晚期结肠直肠腺瘤和结肠直肠癌中的至少一种的可能性。168.如权利要求167所述的方法，其包括检测所述受试者中是否存在晚期结肠直肠腺瘤。169.如权利要求168所述的方法，其中所述晚期结肠直肠腺瘤具有大于或等于1厘米的尺寸。170.如权利要求168所述的方法，其中所述晚期结肠直肠腺瘤具有绒毛特征。171.如权利要求168-170中任一项所述的方法，其包括以大于70％的灵敏度检测是否存在所述晚期结肠直肠腺瘤。172.如权利要求168-171中任一项所述的方法，其包括以大于75％、80％、85％、90％或95％的灵敏度检测是否存在所述晚期结肠直肠腺瘤。173.如权利要求168-172中任一项所述的方法，其进一步包括从所述受试者中去除所述晚期结肠直肠腺瘤，从而阻止所述受试者的结肠直肠癌的发展。174.如权利要求168-173中任一项所述的方法，其中所述生物标志物系列组包含CATD和FUCO。175.如权利要求174所述的方法，其包括如果从所述受试者获得的生物样品中CATD和FUCO的至少一种的水平与CATD和FUCO的至少一种的阴性对照参考水平相差至少10％，则检测出所述受试者中存在晚期结肠直肠腺瘤。176.如权利要求174所述的方法，其包括如果从所述受试者获得的生物样品中CATD和FUCO的至少一种的水平与CATD和FUCO的至少一种的阳性对照参考水平相差小于10％，则检测出所述受试者中存在晚期结肠直肠腺瘤。177.如权利要求174所述的方法，其中所述生物标志物系列组包含三种生物标志物。178.如权利要求177所述的方法，其中所述三种生物标志物为CATD、CATS和FUCO。179.如权利要求178所述的方法，其包括如果从所述受试者获得的生物样品中CATD、CATS和FUCO的至少一种的水平与CATD、CATS和FUCO的至少一种的阴性对照参考水平相差至少...
【专利技术属性】
技术研发人员：约翰·布卢姆，瑞恩·本茨，莉萨·克罗纳，罗斯林·狄龙，杰弗里·琼斯，阿提特·卡欧，理查德·普雷斯顿，希瑟·斯科尔，布鲁斯·威尔考克斯，
申请(专利权)人：应用蛋白质组学公司，
类型：发明
国别省市：美国;US
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。