区分细菌与病毒感染的标记物和决定因素以及其使用方法技术

本发明专利技术提供使用生物标记检测感染的方法。本发明专利技术还提供用于检测MX发动蛋白样GTP酶1(MX1)的表达水平的抗体以及用于检测C反应蛋白(CRP)的表达水平的抗体在制备用于区分对象中的细菌或混合感染与病毒感染的试剂盒中的用途，其中所述区分使用超平面实现，所述超平面通过将训练群的所述CRP和所述MX1的测量进行组合来计算。

【技术实现步骤摘要】
相关申请本申请要求2010年4月21日提交的U.S.S.N.61/326244的权益，其内容通过引用全文纳入本文。
本专利技术通常关于鉴定细菌和病毒感染(infection)相关的生物标记物和决定因素和在筛选诊断、治疗和感染监控中使用这些生物标记物的方法。技术背景抗生素(Abx)是世界上最常用的处方药类药物，全球市场达250-300亿美元。多个研究显示40-70％抗生素是错误的处方药(Linder和Stafford2001；Scott,Cohen等，2001；Davey,Brown等，2006；Cadieux,Tamblyn等，2007；Pulcini,Cua等，2007；2011),使抗生素成为世界上最滥用的药物(CDC2011)。抗生素滥用能分成两类：(i)处方用于治疗抗生素对之无效的非细菌疾病如病毒感染，和(ii)在细菌疾病情况下处方，但是使用了错误的抗生素谱。例如根据美国疾病控制和预防中心，在美国每年开出超过6千万错误的抗生素处方药以治疗抗生素对之无效和不合适的流感。限定当前诊断方法有效性以降低错误处方的主要因素包含：(i)诊断时间；(ii)不可及的感染位点；(iii)由于非致病性细菌引起的假阳性和(iv)混合感染诊断的挑战(即细菌和病毒共感染)。这些因素造成了诊断间隙，进而常导致医师或者过量处方抗生素(“以防万一的方案”)或者过低处方抗生素(“观望方案”)(Little和Williamson1994；Little2005；Spiro,Tay等，2006),两者都远没有达到健康和经济的效果。理想地，辅助医师正确处方抗生素的技术方案应该使诊断：(i)精确区分细菌和病毒感染；(ii)快速(数分钟内)；(iii)能区分致病性细菌和是人体正常菌群一部分的非致病性细菌,(iv)能区分混合和纯病毒感染，和(v)可用于病原体不可及的病例。当前解决方法(如培养、PCR和免疫试验)没有实现所有这些要求：(i)大部分试验(除了多重PCR)常限制于有限组的细菌或病毒株；(ii)其通常需要数小时到数天(例如培养和基于核酸的试验)；(iii)其经常不区分致病性和非致病性细菌(DelMar1992)；(iv)其常不能区分混合和纯病毒感染，和(v)其需要感染位点的直接取样，其中搜索致病剂的踪迹。后者阻止病原体驻留于不可及组织(这经常发生)的病例的诊断。因此，存在对精确区分细菌病毒与混合感染的方法的需求。
技术实现思路
本专利技术基于鉴定与细菌、病毒和混合(即细菌和病毒共感染)感染相关的标记物和决定因素。本专利技术的方法使能鉴定对象遭受感染的类型，进而能选择合适的治疗方案。重要的是，本专利技术的标记物和决定因素不仅确实区分病毒和细菌感染，而且标记物和决定因素也区分混合和病毒感染。因此，本专利技术的方法能选择需要抗生素治疗的对象，并且防止仅有病毒感染和非感染性(non-infectious)疾病对象的不必要抗生素治疗。因此，本专利技术的一个方面提供有预定水平可预测性的鉴定对象中感染的方法，所述方法通过测量对象样品中选自ABTB1、ADIPOR1、ARHGDIB、ARPC2、ATP6V0B、C1orf83、CD15、CES1、CORO1A、CSDA、EIF4B、EPSTI1、GAS7、HERC5、IFI6、KIAA0082、IFIT1、IFIT3、IFITM1、IFITM3、LIPT1、IL7R、ISG20、LOC26010、LY6E、LRDD、LTA4H、MAN1C1、MBOAT2、NPM1、OAS2、PARP12、PARP9、QARS、RAB13、RAB31、RAC2、RPL34、PDIA6、PTEN、RSAD2、SART3、SDCBP、SMAD9、SOCS3、TRIM22、UBE2N、XAF1和ZBP1的一种或多种多肽的表达水平。样品中一种或多种多肽水平的临床显著改变指示对象的感染。在一些方面，一种或多种多肽的水平与参照值如指数值作比较。在多个方面，所述方法将病毒感染对象区分于非感染性疾病对象或健康对象；将细菌感染对象区分于非感染性疾病对象或健康对象；将感染性(infectious)疾病对象区分于非感染性疾病对象或健康对象；将细菌感染对象区分于病毒感染对象或混合感染对象和病毒感染对象。可选地，所述方法还包含测量一种或多种非蛋白的特性(即非蛋白决定因素(DETERMINANT))，例如白细胞计数、嗜中性粒细胞％、淋巴细胞％、单核细胞％、淋巴细胞绝对计数、嗜中性粒细胞绝对计数和最大温度，或测量CRP或MX1的表达水平。例如，所述样品是全血或成分血样。成分血样包括含有淋巴细胞、单核细胞和粒细胞的细胞。通过电泳或免疫化学测量多肽的表达水平。免疫化学检测是例如通过流式细胞仪、放射性免疫实验、免疫荧光分析或通过酶联免疫吸附实验。本专利技术的一些方面中，优选选择决定因素(DETERMINANT)，从而其MCC>＝0.4。在多个方面，所述方法将病毒感染对象区分于非感染性疾病对象或健康对象。在这些方法中，测量一种或多种多肽，包含IFIT3、IFITM3、LOC26010、MAN1C1、MX1、OAS2、RAB13、RSAD2和SART3。在多个实施方式中，测量两种或更多种决定因素(DETERMINANT)，例如：a)测量C1orf83，和测量选自IFIT3、IFITM3、LOC26010、LRDD、最高温度(Maximaltemperature)、MX1、OAS2、PTEN、RAB13、RPL34、RSAD2、和SART3的第二决定因素(DETERMINANT)。b)测量IFIT3，和测量选自IFITM3、LOC26010、LRDD、最高温度(Maximaltemperature)、MX1、OAS2、PTEN、RAB13、RPL34、RSAD2、和SART3的第二决定因素(DETERMINANT)。c)测量LOC26010，和测量选自LRDD、最高温度(Maximaltemperature)、MX1、OAS2、PTEN、RAB13、RPL34、RSAD2、和SART3的第二决定因素(DETERMINANT)。d)测量LRDD，和测量选自最高温度(Maximaltemperature)、MX1、OAS2、PTEN、RAB13、RPL34、RSAD2、和SART3的第二决定因素(DETERMINANT)。e)测量最高温度(Maximaltemperature)，和测量选自OAS2、PTEN、RAB13、RPL34、RSAD2、和SART3的第二决定因素(DETERMINANT)。f)测量MX1，和测量选自最高温度(Maximaltemperature)、MX1、OAS2、PTEN、RAB13、RPL34、RSAD2、和SART3的第二决定因素(DETERMINANT)。g)测量OAS2，和测量选自PTEN、RAB13、RPL34、RSAD2、和SART3的第二决定因素(DETERMINANT)。h)测量PTEN，和测量选自RAB13、RPL34、RSAD2、和SART3的第二决定因素(DETERMINANT)。i)测量RAB13，和测量选自RPL34、RSAD2、和SART3的第二决定因素(DETERMINANT)。j)测量RPL34，和测量RSAD本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于检测MX发动蛋白样GTP酶1(MX1)的表达水平的抗体以及用于检测C反应蛋白(CRP)的表达水平的抗体在制备用于区分对象中的细菌或混合感染与病毒感染的试剂盒中的用途，其中所述区分使用超平面实现，所述超平面通过将训练群的所述CRP和所述MX1的测量进行组合来计算。

【技术特征摘要】
2010.04.21 US 61/326,2441.用于检测MX发动蛋白样GTP酶1(MX1)的表达水平的抗体以及用于检测C反应蛋白(CRP)的表达水平的抗体在制备用于区分对象中的细菌或混合感染与病毒感染的试剂盒中的用途，其中所述区分使用超平面实现，所述超平面通过将训练群的所述CRP和所述MX1的测量进行组合来计算。2.如权利要求1所述的用途，其中所述超平面使用统计分类算法进行计算。3.如权利要求2所述的用途，其中所述统计分类算法选自：支持向量机(SVM)、逻辑回归(LogReg)、神经网络、贝叶斯网络和隐马尔可夫模型。4....

【专利技术属性】
技术研发人员：K·奥夫德，E·埃登，
申请(专利权)人：米密德诊断学有限公司，
类型：发明
国别省市：以色列;IL