本发明专利技术公开了一种检测胰腺癌的分子标记物，所述分子标记物为LOC80054。本发明专利技术进一步公开了LOC80054在制备胰腺癌诊断或预后试剂盒中的用途，所述诊断或预后为诊断、疗效评估或转移复发监控。利用该分子标记物可以进行胰腺癌高危人群的筛选、诊断、治疗、监测及预后，对胰腺癌的诊断和治疗具有重要意义。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物检测领域，具体涉及利用与胰腺癌相关的lncRNALOC80054作为检测胰腺癌的分子标记物及其用途。
技术介绍
胰腺癌是一种消化道常见肿瘤，是预后最差的恶性肿瘤之一。根据最新流行病学调查，胰腺癌位居欧美等发达国家恶性肿瘤死亡率第四位，全球每年约250万人死于胰腺癌。近20年来我国胰腺癌的发病率持续增高，目前胰腺癌位居恶性肿瘤死亡率第五位。在胰腺癌的治疗中，早期诊断困难，其起病隐匿，缺乏典型临床症状，且预后极差，胰腺癌侵袭性强，恶性度高，外科手术、化疗及放疗等手段的疗效均不尽人意，其术后1年生存率不到20％，5年生存率仅为4％，早期确诊率低和术后转移是胰腺癌死亡率高的主要原因。因此，胰腺癌的早期诊断和早期治疗是提高和改善胰腺癌预后的关键，尤其是发现一种特有的、可用于早期诊断和预后的标记物和靶向分子，对于战胜胰腺癌具有重要意义，成为目前国内外肿瘤专家的研究热点。近年来一些研究表明非编码RNA(ncRNAs)是一类具有重要生物学功能的RNA，参与基因组印记、染色体沉默、染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程，在细胞分化和发育、基因转录和翻译、遗传和表观遗传等生命活动中均发挥重要的调控作用。越来越多的权威研究证实lncRNA在肿瘤的发生发展中起着抑制或促进肿瘤的作用，在调控肿瘤细胞增殖、凋亡、细胞周期、侵袭转移能力等方面，均具有十分重要作用。目前己有较多lncRNAs被证实在包括乳腺癌、前列腺、黑色素瘤、肝癌、结肠癌、膀胱癌等在内的人类多种肿瘤中存在差异表达并执行重要的调控功能。目前尚未发现关于LOC80054在胰腺癌中作用的相关研究报道。由于胰腺癌发病隐匿、进展快且预后极差，本领域仍需一种准确、灵敏、特异性强的标记物用于辅助胰腺癌的诊断或预后，因此新的胰腺癌标记物的开发成为迫切的需求。
技术实现思路
为了实现胰腺癌的早期发现，早期干预，本专利技术的目的在于提供一种新的与胰腺癌相关的分子标记物。本专利技术的还一目的是提供LOC80054在胰腺癌诊断或预后中的用途。为实现上述目的，本专利技术首先提供一种检测胰腺癌的分子标记物，所述分子标记物为LOC80054，其核苷酸序列为SEQIDNO:1所示。本专利技术经研究发现所述LOC80054在胰腺癌组织或血清中高表达，显示LOC80054与胰腺癌的肿瘤发生、发展存在着密切的相关性。优选的，所述LOC80054在胰腺癌组织或血清中的表达水平与对应癌旁组织或正常胰腺组织中的比率为1.5倍以上的为高表达。进一步地，本专利技术提供了一种胰腺癌标记物LOC80054的检测试剂盒，所述试剂盒含有检测胰腺癌相关的分子标记物LOC80054的表达量的试剂。优选的，所述试剂盒包括一对特异扩增LOC80054的引物。优选的，所述引物如SEQIDNO:2和SEQIDNO:3所示。进一步地，本专利技术提供了所述分子标记物或所述试剂盒在胰腺癌诊断或预后中的用途。优选的，所述诊断或预后为诊断、疗效评估或转移复发。本专利技术的有益效果如下：本专利技术公开了一种与胰腺癌相关的lncRNALOC80054，并进一步证实LOC80054在胰腺癌组织中或血清中高表达。利用LOC80054作为分子标记物检测胰腺癌不仅能够快速有效的做到早期检测，而且为基因治疗、药物治疗等临床应用提供了治疗靶点和重要依据附图说明图1为LOC80054在胰腺癌组织和癌旁组织中的表达比较。具体实施方式以下实施例用于说明本专利技术，但不用来限制本专利技术的范围。若未特别指明，实施例中所用的技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段，所用的试剂可以商业购买得到。本专利技术的专利技术人，对于从确诊的胰腺癌患者采集的癌组织及对应的癌旁组织待测样品，通过使用RNA提取和定量PCR对胰腺癌组织中的特异性基因的表达水平进行检测，与对应的癌旁组织相比，采用统计学分析，显示LOC80054在胰腺癌组织与对应的癌旁组织中存在显著的表达差异，LOC80054在胰腺癌组织中的总体表达水平高于癌旁组织，提示LOC80054可能具有很好的辅助诊断价值，可成为胰腺癌标志物。本专利技术的LOC80054基因是在本专利技术之前的已知基因，其基本信息如下：Genbank登录号：GeneID:80054，来源于人类基因组，其核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。本专利技术采用RT-PCR方法检测上述lncRNA在胰腺癌组织或血清中高表达。荧光定量PCR法是通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针，对PCR产物进行标记跟踪，实时在线监控反应过程，结合相应的软件可以对产物进行分析，计算待测样品模板的初始浓度。荧光定量PCR的出现，极大地简化了定量检测的过程，而且真正实现了绝对定量。多种检测系统的出现，使实验的选择性更强。自动化操作提高了工作效率，反应快速、重复性好、灵敏度高、特异性强、结果清晰。本专利技术的LOC80054基因的核苷酸全长序列或其片段通常可以用PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。对于PCR扩增法，可根据已公开的有关核苷酸序列，尤其是开放阅读框序列来设计引物，并用市售的cDNA库或按本领域技术人员已知的常规方法所制备的cDNA作为模板，扩增而得到有关序列。当序列较长时，常常需要进行两次或多次扩增，然后再将多次扩增出的片段按正确次序拼接在一起。一旦获得了有关的序列，就可以用重组法来大批量地获得有关序列。这通常是将其克隆入载体，再转入细胞，然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到有关序列。此外，还可用人工合成的方法来合成有关序列，尤其是片段长度较短时。通常，通过先合成多个小片段，然后再进行连接可获得序列很长的片段。实施例1基于TCGA数据库信息进行胰腺癌的生存分析筛选相关基因1、临床信息筛选检索TCGA数据库中的胰腺癌患者临床信息，截至2015年12月10日，TCGA数据库中总共记载了185例胰腺癌临床病例。对这些数据进行筛选，共有160例患者纳入研究。筛选时排除具有其他恶性肿瘤病史、曾接受过放疗或化疗的患者，同时纳入研究的患者需含临床信息和mRNA数据。2、生存期研究样本统计160例胰腺癌患者生存时间的统计结果如下表所示:表1160例胰腺癌患者生存时间统计生存期时间t(年)期初进入研究人数期内死亡人数期内失访人数t<116027741≤t<25922152≤t<3221023≤t<410224≤t<560.15≤t5413、mRNA表达数据生存分析研究方案(1)对胰腺癌高通量mRNA转录组数据检索、数据下载及样本挑选和归类。由下载的转录组数据通过生物信息学分析筛选得出与胰腺癌生存时间相关的mRNA。(2)用Cytoscape软件构建由mRNAs组成的生物信息网络，通过DAVID对生物信息网络中与胰腺癌生存时间相关的mRNA进行GO分析和Pathway分析。4、胰腺癌mRNA表达数据的生存分析结果将胰腺癌组织的转录组数据下载后，去除readcount＝0小于20％的mRNA后用做下一步分析，包括17100个mRNA。提取mRNA基因表达量和胰腺癌TCGA数据库生存时间数据，采用survival包的coxph函数完成，经单因素Cox回归分析，筛选得到单因素Cox回归中p值<0.05的mRNA有580个，包括328个风险性mRNA和252个保本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种用于检测胰腺癌的分子标记物，其特征在于，所述分子标记物为LOC80054，其核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示。
【技术特征摘要】
1.一种用于检测胰腺癌的分子标记物，其特征在于，所述分子标记物为LOC80054，其核苷酸序列为SEQIDNO:1所示。2.如权利要求1所示的分子标记物，其特征在于，所述LOC80054在胰腺癌组织或血清中高表达。3.如权利要求2所述的分子标记物，其特征在于，所述LOC80054在胰腺癌组织或血清中的表达水平与对应癌旁组织或正常胰腺组织中的比率为1.5倍以上的为高表达。4.一种胰腺癌检测试剂盒，其特征在...
【专利技术属性】
技术研发人员：叶伟亮，吴志宏，邱宾涛，
申请(专利权)人：叶伟亮，
类型：发明
国别省市：北京;11
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