菜豆荚斑驳病毒LAMP引物、试剂盒及检测方法技术

本发明专利技术公开了菜豆荚斑驳病毒LAMP引物、试剂盒及检测方法，其中所述引物包括：正向外引物F3，反向外引物B3，正向内引物FIP，和反向内引物BIP。本发明专利技术的目的是为了克服现有技术中的不足之处，提供一种菜豆荚斑驳病毒LAMP引物；本发明专利技术的另一个目的是提供一种包含上述引物的试剂盒；本发明专利技术的另一个目的是提供一种采用上述试剂盒检测菜豆荚斑驳病毒的方法，该检测方法具有：引物特异性强，设备简单，快速、检测灵敏度高、闭管检测、操作简单、结果直接可以判读等特点。

Bean pod mottle virus LAMP primer, kit and detection method

The invention discloses a bean pod mottle virus LAMP primer, a kit and a detection method, wherein the primer comprises a forward outer primer F3, a reverse outer primer B3, a forward inner primer FIP, and a reverse internal primer BIP. The purpose of the invention is to overcome the deficiencies in the existing technology, providing a vegetable bean pod mottle virus LAMP primer; another object of the invention is to provide a kit containing the primer; another object of the invention is to provide a method of using the kit for detection of bean pod mottle virus with this, detection method: primer specificity, the equipment is simple, rapid, high sensitivity, simple operation, closed tube detection, the results can direct interpretation.

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种菜豆荚斑驳病毒LAMP引物、本专利技术还涉及一种包括上述引物的试剂盒；本专利技术还涉及一种采用上述试剂盒检测菜豆荚斑驳病毒的方法。
技术介绍
菜豆荚斑驳病毒5’TTGACACCAATAACAAAATCAC3’,BPMV是我国进境检疫性有害生物，属于豇豆花叶病毒科Comoviridae、豇豆花叶病毒属Comovirus，主要传播介体为菜豆叶甲Cerotoma trifurcata，在南美洲、北美洲及亚洲都有广泛的分布，大豆被其侵染后，叶片斑驳、皱缩、荚和种子斑驳，甚至坏死、植株死亡，还能延迟大豆茎杆成熟，引起“绿茎”现象，可以造成在3％～52.4％的损失，如果和大豆花叶病毒复合侵染,产量损失可达66％,且种子的斑驳率上升，影响产品品质。BPMV粒子为直径28nm的等轴对称二十面体，无包膜，二分体基因组,由两条正链RNA-1和RNA-2组成，其中RNA-2编码外壳蛋白，由大、小两种亚基组成，大亚基有374个氨基酸，分子量为41KD,小亚基有198个氨基酸，分子量为22KD。近年来我国从国外尤其是美国和南美洲进境的大豆数量逐年增加，而BPMV可以通过大豆种子进行远距离传播，虽然BPMV的种传率很低，但不影响该病毒造成大豆等作物大面积危害，因此加强进境大豆的口岸检测，是防止该病毒传入我国的有效措施。目前植物病毒的检测方法主要有生物学、血清学和分子生物学三种，生物学方法就是用病毒指示植物来检测病毒的存在与否，一般需要7-10天；血清学方法是根据抗原抗体的特异性结合来检测病毒，一般只需要4-6小时左右，但是它需要特异性的抗血清，而且检测灵敏度不高，还存在有非特异性问题；分子生物学方法主要是指PCR方法，该方法快且准确性也比较高，但是需要昂贵的检测仪器和相关设备，而且对于像BPMV这个病毒，由于其带毒率非常低，故需要灵敏度非常高的检测方法才能将潜在的BPMV检测出来，以上三种方法灵敏度都难以达到，这样必将存在漏检的可能，所以急需研究新的检测方法。
技术实现思路
本专利技术的目的是为了克服现有技术中的不足之处，提供一种菜豆荚斑驳病毒LAMP引物；本专利技术的另一个目的是提供一种包含上述引物的试剂盒；本专利技术的另一个目的是提供一种采用上述试剂盒检测菜豆荚斑驳病毒的方法，该检测方法具有：引物特异性强，设备简单，快速、检测灵敏度高、闭管检测、操作简单、结果直接可以判读等特点。为了达到上述目的，本专利技术采用以下方案：一种菜豆荚斑驳病毒LAMP引物，其特征在于包括：正向外引物F3：5’CAGGAAAAAGTTGTGCTGAA3’；反向外引物B3：5’GCACATATTTTCTATGATCGTCA3’；正向内引物FIP：5’CAGCAAGGTTGTTGCAGGAC-TTTCACAAGAGGAGTTTCTCAC3’；其中所述正向内引物FIP包含F1c和F2：F1c：5’CAGCAAGGTTGTTGCAGGAC3’；F2：5’TTTCACAAGAGGAGTTTCTCAC3’；反向内引物BIP：5’TGGGTGCCCATATTTGTATGC-TTGACACCAATAACAAAATCAC3’；其中所述反向内引物BIP包括含B1c和B2：其中B1c：5’TGGGTGCCCATATTTGTATGC3’；B2:5’TTGACACCAATAACAAAATCAC3’。本专利技术一种菜豆荚斑驳病毒LAMP试剂盒，其特征在于该试剂盒包括有：其中所述引物包括：正向外引物F3：5’CAGGAAAAAGTTGTGCTGAA3’；反向外引物B3：5’GCACATATTTTCTATGATCGTCA3’；正向内引物FIP：5’CAGCAAGGTTGTTGCAGGAC-TTTCACAAGAGGAGTTTCTCAC3’；其中所述正向内引物FIP包含F1c和F2：F1c：5’CAGCAAGGTTGTTGCAGGAC3’；F2：5’TTTCACAAGAGGAGTTTCTCAC3’；反向内引物BIP：5’TGGGTGCCCATATTTGTATGC-TTGACACCAATAACAAAATCAC3’；其中所述反向内引物BIP包括含B1c和B2：其中B1c：5’TGGGTGCCCATATTTGTATGC3’；B2:5’TTGACACCAATAACAAAATCAC3’；其中该试剂盒的产品规格：40次。如上所述的菜豆荚斑驳病毒LAMP试剂盒，其特征在于所述的LAMP反应液缓冲液由以下组分组成：如上所述的菜豆荚斑驳病毒LAMP试剂盒，其特征在于所述荧光染料为钙黄绿素；所述酶溶液为Bst DNA聚合酶和AMV逆转录酶混合液。本专利技术一种菜豆荚斑驳病毒LAMP检测方法，其特征在于包括以下步骤：A、提取样品RNA；B、建立LAMP反应体系：按检测所需的反应量从权利要求2所述的试剂盒中分别取各种试剂，放入灭菌试管中，在冰上配制预混液；轻弹击灭菌试管使其混匀，瞬时离心数秒使溶液集中在灭菌试管底部；20μL LAMP反应体包括：C、加样：在三个装有20μL LAMP反应体的灭菌试管中分别加入待检测的待检测样品RNA、阴性对照反应样品、阳性对照反应样品各5μL，使各自的总量达到25μL，盖上试管盖轻击混合，瞬时离心使反应溶液集中在灭菌试管底部；其中阴性对照反应使用去离子水作为样品，阳性对照反应使用带有BPMV RNA的阳性对照，D、扩增：将步骤C中的灭菌试管放置在恒温器中，在60-65℃下保持恒温1小时，然后在80℃下保持恒温5分钟使酶灭活以终止反应；E、检测：使用紫外线照射装置从灭菌试管底部向上进行照射，佩戴紫外防护眼镜从试管侧面进行观查；如果与阳性对照一样发出绿光，则判定为阳性，如果与阴性对照一样没有发出荧光，而判定为阴性。如上所述的菜豆荚斑驳病毒LAMP检测方法，其特征在于步骤A中所述提取样品RNA，具体按以下步骤提取：a1、取0.1g的BPMV和SMV感病组织加入1mL抽提缓冲液进行研磨；a2、清洗纳米磁珠：取出纳米磁珠到PCR管中，用ddH2O反复清洗纳米磁珠3次，在磁铁的作用下吸去ddH2O；a3、结合：加入100μL的样品到PCR管中，用移液枪吸吐混匀样品和纳米磁珠，室温下吸附；a4、清洗：在磁铁的作用下移去上清，纳米磁珠清洗3次；a5、裂解：加入50μL ddH2O到PCR管中,用移液枪吸吐混匀纳米磁珠后，95℃，10min；a6、取样：用磁铁吸附纳米磁珠，待PCR管内溶液澄清后，上清即为BPMV和SMV的RNA。如上所述的菜豆荚斑驳病毒LAMP检测方法，其特征在于步骤E中紫外线照射装置的紫外线范围：波长240－260nm或350-370nm。如上所述的菜豆荚斑驳病毒LAMP检测方法，其特征在于所述引物中外引物与内引物的比例为l:2-1:10。如上所述的菜豆荚斑驳病毒LAMP检测方法，其特征在于所述引物包括1.6μl正向外引物F3，1.6μl反向外引物B3，0.2μl正向内引物FIP、0.2μl反向内引物BIP。如上所述的菜豆荚斑驳病毒LAMP检测方法，其特征在于步骤D中扩增温度优选为63℃。综上所述，本专利技术相对于现有技术其有益效果是：本专利技术采用磁珠法提取BPMV的RNA并根据BPMV主要株系的外壳蛋白编码基因设计了检测BPMV外壳蛋白大亚基的LAMP扩增的通用型引物，且建立了BP本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种菜豆荚斑驳病毒LAMP引物，其特征在于包括：正向外引物F3：5’CAGGAAAAAGTTGTGCTGAA3’；反向外引物B3：5’GCACATATTTTCTATGATCGTCA3’；正向内引物FIP：5’CAGCAAGGTTGTTGCAGGAC‑TTTCACAAGAGGAGTTTCTCAC3’；其中所述正向内引物FIP包含F1c和F2：F1c：5’CAGCAAGGTTGTTGCAGGAC3’；F2：5’TTTCACAAGAGGAGTTTCTCAC3’；反向内引物BIP：5’TGGGTGCCCATATTTGTATGC‑TTGACACCAATAACAAAATCAC3’；其中所述反向内引物BIP包括含B1c和B2：其中B1c：5’TGGGTGCCCATATTTGTATGC3’；B2:5’TTGACACCAATAACAAAATCAC3’。

【技术特征摘要】
1.一种菜豆荚斑驳病毒LAMP引物，其特征在于包括：正向外引物F3：5’CAGGAAAAAGTTGTGCTGAA3’；反向外引物B3：5’GCACATATTTTCTATGATCGTCA3’；正向内引物FIP：5’CAGCAAGGTTGTTGCAGGAC-TTTCACAAGAGGAGTTTCTCAC3’；其中所述正向内引物FIP包含F1c和F2：F1c：5’CAGCAAGGTTGTTGCAGGAC3’；F2：5’TTTCACAAGAGGAGTTTCTCAC3’；反向内引物BIP：5’TGGGTGCCCATATTTGTATGC-TTGACACCAATAACAAAATCAC3’；其中所述反向内引物BIP包括含B1c和B2：其中B1c：5’TGGGTGCCCATATTTGTATGC3’；B2:5’TTGACACCAATAACAAAATCAC3’。2.一种菜豆荚斑驳病毒LAMP试剂盒，其特征在于该试剂盒包括有：其中所述引物包括：正向外引物F3：5’CAGGAAAAAGTTGTGCTGAA3’；反向外引物B3：5’GCACATATTTTCTATGATCGTCA3’；正向内引物FIP：5’CAGCAAGGTTGTTGCAGGAC-TTTCACAAGAGGAGTTTCTCAC3’；其中所述正向内引物FIP包含F1c和F2：F1c：5’CAGCAAGGTTGTTGCAGGAC3’；F2：5’TTTCACAAGAGGAGTTTCTCAC3’；反向内引物BIP：5’TGGGTGCCCATATTTGTATGC-TTGACACCAATAACAAAATCAC3’；其中所述反向内引物BIP包括含B1c和B2：其中B1c：5’TGGGTGCCCATATTTGTATGC3’；B2:5’TTGACACCAATAACAAAATCAC3’；其中该试剂盒的产品规格：40次。3.根据权利要求2所述的菜豆荚斑驳病毒LAMP试剂盒，其特征在于所述的LAMP反应液缓冲液由以下组分组成：4.根据权利要求2所述的菜豆荚斑驳病毒LAMP试剂盒，其特征在于所述荧光染料为钙黄绿素；所述酶溶液为Bst DNA聚合酶和AMV逆转录酶混合液。5.一种菜豆荚斑驳病毒LAMP检测方法，其特征在于包括以下步骤：A、提取样品RNA；B、建立LAMP反应体系：按检测所需的反应量从权利要...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈定虎，管维，
申请(专利权)人：陈定虎，
类型：发明
国别省市：广东;44