用于调节共济失调蛋白2表达的组合物制造技术

本文公开了用于降低共济失调蛋白2mRNA和蛋白质表达的反义化合物和方法。所述方法、化合物和组合物可用于治疗、预防或改善共济失调蛋白2相关疾病、病症或病状。所述共济失调蛋白2相关疾病包括脊髓小脑性共济失调2型(SCA2)、肌萎缩性侧索硬化症(ALS)和帕金森症。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】关于政府支持的声明本专利技术在美国国家卫生研究院(National Institutes of Health)授予的R21NS081182的政府支持下作出。政府享有本专利技术的某些权利。序列表本申请与电子形式的序列表一同提交。该序列表以2015年3月19日创建的标题为BIOL0239WOSEQ_ST25.txt的文件提供，其大小为232Kb。该电子形式序列表中的信息通过引用整体并入本文。领域提供了用于在动物中降低共济失调蛋白(Ataxin)2(ATXN2)mRNA和蛋白质表达的组合物和方法。所述方法可用于通过抑制动物中共济失调蛋白2的表达通过抑制共济失调蛋白2的表达来治疗、预防或改善神经变性疾病，所述神经变性疾病包括脊髓小脑性共济失调2型(SCA2)、肌萎缩性侧索硬化症(ALS)和帕金森症。背景脊髓小脑性共济失调2型(SCA2)是一种常染色体显性神经变性疾病，其特征在于小脑、脑干和脊髓中神经元的进行性功能和细胞损失。SCA2的原因是ATXN2基因中CAG扩增导致共济失调蛋白-2蛋白质中聚谷氨酰胺(polyQ)扩增。SCA2患者的特征是进行性小脑共济失调、慢扫视眼动及其他神经特征，例如神经病变(Pulst,S.M.(著),Genetics of Movement Disorders.Elsevier,Inc.,Amsterdam,2003，第19-34页)。ATXN2基因中CAG的中度扩增还与帕金森症或肌萎缩性侧索硬化症(ALS)相关，其无法与这些疾病的先天形式区分开(Kim等，Arch.Neurol.,2007,64:1510-1518；Ross等，Hum.Mol.Genet.,2011,20:3207-3212；Corrado等，Hum.Genet.,2011,130:575-580；Elden等，Nature,2010,466:1069-1075；Van Damme等，Neurology,2011,76:2066-2072)。伴随polyQ扩增而发生的polyQ疾病蛋白质的致病功能可归因于与核内内涵体的产生或者与可溶性毒性低聚物相关的毒性的获得(Lajoie等，PLoS One,2011,5:e15245)。在SCA2患者脑的特征在于Purkinje细胞的损失的同时，SCA2Purkinje细胞缺乏内涵体，表明polyQ扩增的共济失调蛋白-2可导致与内涵体形成无关的毒性(Huynh等，Ann.Neurol.,1999,45:232-241)。polyQ扩增的共济失调蛋白-2所得功能可包括高尔基体中的异常积累(Huynh等，Hum.Mol.Genet.,2003,12:1485-1496)、正常功能的获得(Duvick等，Neuron,2010,67:929-935)和针对其他polyQ蛋白质的转录因子(TF)与甘油醛-3-磷酸脱氢酶的隔离(Yamanaka等，Methods Mol.Biol.,2010:648,215-229；Koshy等，Hum.Mol.Genet.,1996,5:1311-1318；Burke等，Nat.Med.,1996,2:347-350)。已对共济失调蛋白-2的一些正常功能进行了表征。共济失调蛋白-2存在于应激颗粒和P体中，表明其在应激期间隔离mRNA和蛋白质翻译调节的功能(Nonhoff等，Mol.Biol.Cell,2007,18:1385-1396)。共济失调蛋白-2过表达干扰P体装配，而表达不足(underexpression)干扰应激颗粒装配(Nonhoff等，Mol.Biol.Cell,2007,18:1385-1396)。与polyA-结合蛋白1、RNA剪接因子A2BP1/Fox1和多聚核糖体的相互作用进一步支持共济失调蛋白-2在RNA代谢中的作用(Shibata等，Hum.Mol.Genet.,2000,9:1303-1313；Ciosk等，Development,2004,131:4831-4841；Satterfield等，Hum.Mol.Genet.,2006,15:2523-2532)。共济失调蛋白-2通过与SRC激酶和内吞蛋白CIN85相互作用作为EGF受体内化及信号传导的调节因子(Nonis等，Cell Signal.,2008,20:1725-1739)。共济失调蛋白-2还与ALS相关蛋白TDP-43以RNA依赖方式相互作用，并且家族性和散发性ALS与长的正常CAG重复扩增ATXN2的发生有关(Elden等，Nature,2010,466:1069-1075；Van Damme等，Neurology,2011,76:2066-2072)。目前缺少用于治疗所述神经变性疾病的可接受的选择。因此，本文的一个目的是提供用于治疗所述疾病的方法。概述本文提供了用于调节共济失调蛋白2(ATXN2)mRNA和蛋白质表达的方法、化合物和组合物。在某些实施方案中，可用于调节共济失调蛋白2mRNA和蛋白质表达的化合物是反义化合物。在某些实施方案中，反义化合物是经修饰寡核苷酸。在某些实施方案中，调节可发生在细胞或组织中。在某些实施方案中，细胞或组织在动物中。在某些实施方案中，动物是人。在某些实施方案中，共济失调蛋白2mRNA水平降低。在某些实施方案中，共济失调蛋白2蛋白质水平降低。该降低可以以时间依赖性的方式或剂量依赖性的方式发生。还提供了可用于预防、治疗和缓解疾病、病症或病状的方法、化合物和组合物。在某些实施方案中，所述共济失调蛋白2相关疾病、病症或病状是神经变性疾病。在某些实施方案中，所述神经变性疾病、病症或病状包括脊髓小脑性共济失调2型(SCA2)、肌萎缩性侧索硬化症(ALS)和帕金森症。所述疾病、病症或病状通常可具有一个或更多个风险因素、原因或结果。产生神经变性病症的某些风险因素和原因包括变老、有个人或家族病史或遗传倾向。与产生神经变性病症相关的某些症状和结果包括但不限于：共济失调、语言和吞咽困难、强直、震颤、眼肌麻痹、扫视减慢、周围神经病变、萎缩、肌张力障碍、舞蹈病和痴呆。在某些实施方案中，治疗方法包括向有此需要的个体施用共济失调蛋白2反义化合物。在某些实施方案中，治疗方法包括向有此需要的个体施用共济失调蛋白2经修饰寡核苷酸。详述应理解，上文中的一般描述和下文中的详细描述二者均仅为示例性和解释性的，并不限制所要求保护的本专利技术。在本文中，单数的使用包括复数，另有指明除外。本文所用的“或”意指“和/或”，另有指明除外。另外，本文所用的“和”意指“和/或”，另有指明除外。此外，术语“包括”及其他形式例如“包含”和“含有”的使用是非限制性的。另外，术语例如“要素”或“组分”涵盖包含一个单位的要素和组分及包含多于一个亚单元的要素和组分二者，另有指明除外。本文所用的章节标题仅用于组织目的，而不应解释为限制所描述的主题。在本公开内容中引用的全部文件或文件的一部分均通过引用本文所述文件的部分及其以其整体明示地并入本文，所述文件包括但不限于专利、专利申请、公开的专利申请、文章、书籍、论文和GENBANK登记号及通过数据库例如美国国家生物技术信息中心(NCBI)可得到的相关序列信息及在本公开内容通篇中引用的其他数据。定义除非提供了具体的定义，否则与本文所述分析本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种化合物，其包含经修饰寡核苷酸，所述经修饰寡核苷酸由12至30个相连的核苷组成并且具有含SEQ ID NO:11‑165的任何核碱基序列的至少8个、至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基的核碱基序列。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.03.19 US 61/955,705;2014.04.21 US 61/982,1311.一种化合物，其包含经修饰寡核苷酸，所述经修饰寡核苷酸由12至30个相连的核苷组成并且具有含SEQ ID NO:11-165的任何核碱基序列的至少8个、至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核碱基的核碱基序列。2.根据权利要求2所述的化合物，其中所述经修饰寡核苷酸的所述核碱基序列与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3至少80％、至少81％、至少82％、至少83％、至少84％、至少85％、至少86％、至少87％、至少88％、至少89％、至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％互补。3.根据前述权利要求中任一项所述的化合物，其由单链经修饰寡核苷酸组成。4.根据前述权利要求中任一项所述的化合物，其中至少一个核苷酸间键合是经修饰核苷酸间键合。5.根据权利要求4所述的化合物，其中至少一个经修饰核苷酸间键合是硫代磷酸酯核苷酸间键合。6.根据权利要求4所述的化合物，其中每个经修饰核苷酸间键合是硫代磷酸酯核苷酸间键合。7.根据前述权利要求中任一项所述的化合物，其中至少一个核苷酸间键合是磷酸二酯核苷酸间键合。8.根据前述权利要求中任一项所述的化合物，其中至少一个核苷酸间键合是硫代磷酸酯键，至少一个核苷酸间键合是磷酸二酯键。9.根据前述权利要求中任一项所述的化合物，其中至少一个核...

【专利技术属性】
技术研发人员：S·M·弗赖尔，G·洪，C·F·贝内特，
申请(专利权)人：IONIS制药公司，
类型：发明
国别省市：美国;US