检测18种高危型HPV核酸的引物、探针及试剂盒制造技术

技术编号:13746367 阅读:106 留言:0更新日期:2016-09-24 00:48
本发明专利技术涉及一种检测18种高危型HPV核酸的探针,包括以下序列的探针:寡核苷酸序列SEQ ID No:1~15;寡核苷酸序列SEQ ID No:46;寡核苷酸序列SEQ ID No:49;寡核苷酸序列SEQ ID No:52;寡核苷酸序列SEQ ID No:55。本发明专利技术还涉及一种检测18种高危型HPV核酸的引物和试剂盒。本发明专利技术提供的检测引物、探针与试剂盒在可对HPV16、18和58型进行分型,可以更好的罹患宫颈癌风险的提示效果。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术设计核酸检测技术,特别涉及一种检测18种高危型HPV核酸的引物、探针及试剂盒
技术介绍
HPV是一种嗜上皮性病毒。根据HPV致癌风险性大小,可将引起高度宫颈上皮内瘤变(Cervical intraepithelial neoplasia,CIN)从而导致宫颈癌发生的HPV称为高危型HPV(high-risk HPV,HR-HPV)。2004年出版的《The Health Professional's HPV handbook》指出高危型HPV有18种,分别为HPV16、18、26、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68、73、82。目前国内临床主要的HPV检测方法有荧光PCR法、杂交捕获法、基因芯片法。现有荧光PCR法产品有以下三大缺点:1、现有荧光定量PCR检测试剂多数不对HPV16、HPV18分型。2、现有可对HPV16、HPV18具体分型的荧光定量PCR专利不可实现同时区分中国人群宫颈癌样本中检出率明显较高的HPV58和实现对导致宫颈癌的18种HPV高危型(HPV16、18、26、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68、73、82)进行检测。3、现有可同时对HPV16、HPV18与HPV58具体分型的荧光定量PCR检测试剂均不能实现仅需单管检测,致使检测通量低且操作繁琐难以满足对大规模筛查要求。而杂交捕获法缺点是:无内标、检测时间长(DNA分解45min、DNA-RNA杂交60min、抗体捕获60min、化学发光30min、计算机判读15min一次实验一般要5~6小时)、灵敏度过低(3.5×105copies/mL)、操作复杂、检测基因型少无法具体分型(仅13种高危型)且需要特定昂贵的仪器,成本高,和其检测外的高危型和低危型如HPV6、11等存在交叉反应,会出现假阳性结果。PCR-反向点杂交法、液态芯片法等基因芯片法类产品虽然能对HPV具体分型,且检测基因型相对多,但其缺点是不能实现实时检测,需要扩增后产物分析操作,耗时长(4h以上)、易存在PCR产物污染、操作复杂、不能满足临床宫颈癌大量筛查的需求。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是:提供一种可具体区分HPV16、HPV18与HPV58的检测18种高危型HPV核酸的引物、探针及试剂盒。为了解决上述技术问题,本专利技术采用的技术方案为:一种检测18种高危型HPV核酸的探针,包括以下序列的探针:与HPV26型、31型、33型、35型、39型、45型、51型、52型、53型、56型、59型、66型、68型、73型和82型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:1~15;与HPV16型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:46;与HPV18型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:49;与HPV58型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:52;与人类β-actin基因的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:55。本专利技术还提供了一种检测18种高危型HPV核酸的引物,包括以下序列的引物:与HPV26型、31型、33型、35型、39型、45型、51型、52型、53型、56型、59型、66型、68型、73型和82型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:16~45;与HPV16型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:47~48;与HPV18型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:50~51;与HPV58型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:53~54;与人类β-actin基因的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:56~57。本专利技术还提供了一种检测18种高危型HPV核酸的试剂盒,包括反应液,所述反应液包括检测18种高危型HPV核酸的探针和引物,所述探针包括寡核苷酸序列SEQ ID No:1~15、SEQ ID No:46、SEQ ID No:49、SEQ ID No:52和SEQ ID No:55,所述引物包括寡核苷酸序列SEQ ID No:16~45、SEQ ID No:47~48、SEQ ID No:50~51、SEQ ID No:53~54和SEQ ID No:56~57。本专利技术的有益效果在于:(1)本专利技术的检测引物、探针与试剂盒能够全面覆盖国际公认和宫颈癌密切相关的18种高危型HPV(HPV16、18、26、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68、73和82型),同时对中国人群风险度最高的3种高危型HPV(HPV16、18和58型)分型,比现有试剂盒更好的提示罹患宫颈癌的风险,更适合中国人群宫颈癌筛查;(2)本专利技术的检测方法只需要单一反应管,检测时间不超过1.5h,具有快速、简便和高通量的优点,特别适用于大样本检测。附图说明图1为本专利技术实施例的第一组15种高危型HPV在ABI Prism 7500上的检测结果的扩增曲线;图2为本专利技术实施例的第二组HPV16在ABI Prism 7500上的检测结果的扩增曲线;图3为本专利技术实施例的第三组HPV18在ABI Prism 7500上的检测结果的扩增曲线;图4为本专利技术实施例的第四组HPV58在ABI Prism 7500上的检测结果的扩增曲线;图5为本专利技术实施例的第五组人类β-actin基因在ABI Prism 7500上的检测结果的扩增曲线;图6为本专利技术实施例的含第一组至第五组的DNA在ABI Prism 7500上的检测结果的扩增曲线。具体实施方式为详细说明本专利技术的
技术实现思路
、构造特征、所实现目的及效果,以下结合实施方式并配合附图详予说明。本专利技术最关键的构思在于:设计出可检测18种高危型HPV核酸且同时可具体区分HPV16、HPV18与HPV58的引物和探针序列。请参阅图1至图6,本专利技术提供了基于Taqman探针法的实时荧光PCR技术的15+3种高危型HPV的检测引物与探针,包括:(1)具有仅与15种高危型HPV即HPV26、31、33、35、39、45、51、52、53、56、59、66、68、73、82的基因序列互补配对的寡核苷酸。其中SEQ ID No:1~15为探针,SEQ ID No:16~45为引物。(2)具有仅与HPV16的基因序列互补配对的寡核苷酸。其中,SEQ ID No:46为探针,SEQ ID No:47~48为引物。(3)具有仅与HPV18的基因序列互补配对的寡核苷酸。其中,SEQ ID No:49为探针,SEQ ID No:50~51为引物。(4)具有仅与HPV58的基因序列互补配对的寡核苷酸。其中,SEQ ID No:52为探针,SEQ ID No:53~54为引物。(5)具有仅人类β-actin基因的基因序列互补配对的寡核苷酸。其中,SEQ ID No:55为探针,SEQ ID No:56~57为引物。其中,上述每组探针的5’端分别标记最大发射光波长为510~518nm、538~560nm、563~583nm、600nm~610nm、640~670nm和705~715nm中的报告基团的其中一种,并且每组之间相互不本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种检测18种高危型HPV核酸的探针,其特征在于,包括以下序列的探针:与HPV26型、31型、33型、35型、39型、45型、51型、52型、53型、56型、59型、66型、68型、73型和82型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:1‑15;与HPV16型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:46;与HPV18型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:49;与HPV58型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:52;与人类β‑actin基因的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:55。

【技术特征摘要】
1.一种检测18种高危型HPV核酸的探针,其特征在于,包括以下序列的探针:与HPV26型、31型、33型、35型、39型、45型、51型、52型、53型、56型、59型、66型、68型、73型和82型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:1-15;与HPV16型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:46;与HPV18型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:49;与HPV58型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:52;与人类β-actin基因的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:55。2.根据权利要求1所述的检测18种高危型HPV核酸的探针,其特征在于,每组探针分别在5’端标记报告基团,并在3’端标记淬灭基团;所述报告基团的最大发射光波长为510-518nm、538-560nm、563-583nm、600nm-610nm、640-670nm和705-715nm中的任意一种,每组探针标记的报告基团的最大发射光波长不同;所述淬灭基团的吸收光波长为380-550nm、470-560nm、480-580nm、550-650nm和620-730nm中的任意一种。3.根据权利要求2所述的检测18种高危型HPV核酸的探针,其特征在于,所述报告基团为6-FAM、TET、HEX、JOE、VIC、TAMRA、NED、ROX、Texas Red、LC Red610、Cy3、Cy3.5、LC Red640、Cy5、Cy5.5、Quasar670、Quasar705、LC Red705或Alexa Fluor680,所述淬灭基团为ECLIPSE、DABCYL、TAMRA、BHQ1、BHQ2或BHQ3。4.一种检测18种高危型HPV核酸的引物,其特征在于,包括以下序列的引物:与HPV26型、31型、33型、35型、39型、45型、51型、52型、53型、56型、59型、66型、68型、73型和82型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:16~45;与HPV16型的基因序列互补配对的寡核苷酸序列SEQ ID No:47~48;与H...

【专利技术属性】
技术研发人员:蔡泽加杨勇贤田洁陈永娟王晓辉卢舟宇
申请(专利权)人:亚能生物技术深圳有限公司
类型:发明
国别省市:广东;44

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