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一种用于抑郁症诊断的lncRNA标志物、试剂盒及基因芯片制造技术

技术编号:13192612 阅读:141 留言:0更新日期:2016-05-11 19:44
本发明专利技术属于生物技术领域,涉及一种用于抑郁症诊断的lncRNA标志物及试剂盒。本发明专利技术提供了一种用于抑郁症诊断的lncRNA标志物,包括TCONS_l2_00001212、NONHSAT102891、TCONS_00019174、ENST00000566208、NONHSAG045500、ENST00000517573、NONHSAT034045和NONHSAT142707,上述八种lncRNA的引物序列如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.16所示;还提供了用于上述八种lncRNA的探针,探针序列如SEQ ID NO.17~SEQ ID NO.24所示。本发明专利技术的有益效果在于首次提供了抑郁症生物标记物和评估抗精神病药物疗效的生物标记物。经临床验证之后,具有较高的特异性和敏感值,有较高的诊断参考价值,lncRNA作为抑郁症特异性生物标记物将带来抑郁症诊断及治疗的革命性改变。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物
,涉及一种用于抑郁症诊断的IncRNA标志物、试剂盒及 基因芯片。
技术介绍
抑郁症的核心症状是情绪低落、兴趣减退、精力缺失,在全球范围内有超过3.5亿 人患有抑郁症。世界卫生组织预测,到2020年,抑郁症将占据世界疾病负担的第二位。 抑郁症对社会造成的重大负担,其原因有发病率高、发病年轻化、呈慢性发展、损 害其社会功能和认知能力,及非自然死亡,抑郁症患者中自杀死亡与自杀未遂的比例远远 高于在普通人群中的比值。因此研究抑郁症发病机理及可以体现其严重程度的生物标志 物,并及时针对病因进行干预与治疗是治疗疾病、减轻社会负担的关键因素。 关于抑郁症的发病机制及治疗原理目前尚不明确,既往认为遗传因素、生物学因 素、心理社会因素对抑郁症的发生有一定的影响,后来学术界开展了神经生化、神经内分 泌、神经可塑性、神经电生理以及神经影像学等多方面研究,提出了多种病因假说、可能有 关的内分泌轴、脑区结构及功能的变化、脑区环路以及信号通路的变化等,均取得了相应的 进展,但目前仍然无单一的理论即可完全解释抑郁症的发病原因。现代分子遗传学认为很 多社会环境或自身经历等因素可引起基因表达的变化,可导致某些特定的基因发生表观遗 传改变,这些变化可引起神经元的可塑性和功能异常,而这些异常表现可以被遗传下来,即 表观遗传机制,基于基因水平的MDD发病机理及生物标志物的研究逐步引起学者们的关注。 非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)即不编码蛋白质的RNA,按照其长短分为长非 编码RNA(>200bp)和短非编码RNA(〈200bp),广义上包括1111?嫩、丨1?嫩、冰嫩、小干扰卩祖、111丨尺· 以及功能尚未明确的长链非编码RNA。很多学者研究了miRNA在抑郁症患者中的差异表达, 提示miRNA可能通过不同方式参与抑郁症的发生发展,例如神经可塑性、神经内分泌、心理 社会因素、抗抑郁药等,而且认为miRNA-26b、miRNA-1972、miRNA-4485、miRNA-4498和 miRNA-4743等可以作为抑郁症的生物标志物。后来学者们发现LncRNA可以作为人类基因组 中一类非常重要的表观遗传调控因子,通过表观遗传、转录调控及转录后调控等多种机制 调控DNA甲基化、组蛋白修饰或染色质重构,使基因沉默或激活,LncRNA还广泛地参与中枢 神经系统的各种生物学进程,如海马发育、少突胶质细胞髓鞘形成、脑老化、CREB和PGCl-a 转录调控、GABA能神经元和G蛋白偶联受体等信号转导通路相关.LncRNA除了直接参与基因 的表达调控外,可作为一种竞争性内源性RNA(Competing endogenous RNA,ceRNA)与miRNA 相互作用,从而实现相互间的交流与调节。LncRNAs与很多的人类疾病有关,比如癌症、共济 失调及心血管疾病,但是关于LncRNA在抑郁症患者中差异表达的研究极少。 越来越多的研究证明,在大脑的发育、神经发生、神经元成熟及突触形成过程中, IncRNA起关键的调控作用。进一步的研究表明,抑郁症症的发生、发展中,IncRNA亦起重要 作用,并与抗抑郁药物的疗效有相关性。因此,某些IncRNA可成为抑郁症诊断和预测抗抑郁 药物治疗效果的生物标记物。 越来越多的研究证明,在大脑的发育、神经发生、神经元成熟及突触形成过程中, IncRNA起关键的调控作用。进一步的研究表明,抑郁症的发生、发展中,IncRNA亦起重要作 用,并与抗精神病药物的疗效有相关性。因此,某些IncRNA可成为抑郁症诊断和预测抗精神 病药物治疗效果的生物标记物。
技术实现思路
本专利技术要解决的技术问题是:提供一种用于抑郁症诊断的IncRNA标志物。 为解决上述技术问题,本专利技术采用的技术方案如下:一种用于抑郁症诊断的 IncRNA标志物,所述标记物包括TC0NS_12_00001212(PY1)、N0NHSAT102891(PY2)、T⑶NS_ 00019174(PY3)、ENST00000566208(PY4)、N0NHSAG045500(PY6)、ENST00000517573(PY8)、 N0NHSAT034045(PY9)和 N0NHSAT142707(PY10)。所述 TC0NS_12_00001212、N0NHSAT102891、 TC0NS_00019174、ENST00000566208、N0NHSAG045500、ENST00000517573、N0NHSAT034045、 N0NHSAT142707为数据库中的RNA代号,可以在数据库中检索得到,各IncRNA的具体来源数 据库见表4。 在本专利技术的第二方面,提供了一种抑郁症诊断试剂盒,其能够测定血液中的 TC0NS_12_00001212(PY1)、N0NHSAT102891(PY2)、TC0NS_00019174(PY3)、ENST00000566208 (PY4)、N0NHSAG045500(PY6)、ENST00000517573(PY8)、N0NHSAT034045(PY9)和 N0NHSAT142707(PY10)这八种 IncRNA 的含量。在本专利技术的一个优选例中,上述试剂盒含有!'(:(^3_12_00001212(?¥1)、 N0NHSAT102891(PY2)、T⑶NS_00019174(PY3)、ENST00000566208(PY4)、N0NHSAG045500 (PY6)、ENST00000517573(PY8)、N0NHSAT034045(PY9)和 N0NHSAT142707(PY10)的引物和探 针。 在本专利技术的一个优选例中,上述TC0NS_12_00001212的正向引物如SEQ ID N0.1所 示,TC0NS_12_00001212的反向引物如SEQ ID N0.2所示;N0NHSAT102891的正向引物如SEQ ID N0.3所示,N0NHSAT102891的反向引物如SEQ ID N0.4所示;TC0NS_00019174的正向引物 如SEQ ID N0.5所示,TC0NS_00019174的反向引物如SEQ ID N0.6所示;ENST00000566208的 正向引物如SEQIDN0.7所示,ENST00000566208的反向引物如SEQIDN0.8所示 ; N0NHSAG045500的正向引物如SEQIDN0.9所示,N0NHSAG045500的反向引物如SEQID N0.10所示 ;ENST00000517573的正向引物如SEQIDN0.11所示,ENST00000517573的反向引 物如SEQIDN0·12所示 ;N0NHSAT034045的正向引物如SEQIDN0·13所示,N0NHSAT034045 的反向引物如SEQIDN0.14所示 ;N0NHSAT142707的正向引物如SEQIDN0.15所示, N0NHSAT142707的反向引物如SEQIDN0.16所示。 在本专利技术的一个优选例中,上述TC0NS_12_00001212的探针序列如SEQ ID N0.17 所示;N0NHSAT102891的探针序列如SEQ ID N0.18本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种用于抑郁症诊断的lncRNA标志物,其特征在于所述标记物包括TCONS_l2_00001212、NONHSAT102891、TCONS_00019174、ENST00000566208、NONHSAG045500、ENST00000517573、NONHSAT034045和NONHSAT142707。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:张理义
申请(专利权)人:张理义
类型:发明
国别省市:江苏;32

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