本发明专利技术提供一种肺分割方法,包括以下步骤:步骤S1、输入原始图像,对原始图像进行预处理;步骤S2、肺区域的粗分割;步骤S2包括:步骤S201、设定阈值,使用阈值分割对预处理后的图像进行二值化处理,提取出肺部区域及与肺部区域灰度值相近的部分背景;步骤S202、从图像四角边缘开始背景反填充;步骤S203、找出从头顶往下的z方向上面积最大一层的肺;步骤S204、通过最大一层的肺进行z方向上向前和向后逐层区域生长,进行逐层判断,防止与背景粘连;步骤S3:肺区域的细分割,用于提取并去除气管和分离左右肺。如此设置,加快了分割速度,改善了分割效果。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及医学领域断层扫描(Computed Tomography,简称CT)图像的处理,尤其 涉及图像中肺部的分割方法。
技术介绍
近年来,由于计算机断层扫描技术能够提供高清晰度、高对比度的CT图像,通常被 应用于肺部疾病的诊断。借助胸部CT观察肺部结构及功能特征是当今临床针对肺部各种疾 病的重要辅助手段,原始的胸部CT图像通常包括背景、肺组织、脂肪、肌肉、血管、气管、骨骼 等,为了向医生提供可靠的诊断数据,利于及早发现及治疗患者病情,通常需要对胸部CT图 像进行后续处理,提取即分割出肺组织图像。 现有技术中,对于三维CT数据,(1)阈值法是最常见的肺部分割方法,虽然简单、快 速,但不能有效去除背景和气管分支,且确定阈值较难,往往根据经验确定。(2)区域增长法 是大多数工作中采用的方法,该方法能够有效的弥补边缘追踪的遗漏缺陷,但常常需要手 动选择种子点,是一种需要人工参与的半自动分割方法;(3)基于模式分类的方法。该方法 能提取有些数据的图像特征,但是需要大量的训练样本,分割结果对样本与特征的依赖性 强,处理时间较长。(4)基于图像配准和形状模型的方法,该方法一般效果较好,但其受训练 集数据影响会导致结果变异性大,建立模型较为困难,并且计算量大,从而导致速度慢,难 以满足临床应用的实时性需求。 综上所述,现有的CT肺部分割方法需要加以改善,提升分割速度和精度,满足医学 诊断对肺部图像的要求。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种,用于改善肺分割的效果。 为了实现前述专利技术目的,本专利技术提供一种,包括以下步骤: -种,包括以下步骤: 步骤S1、输入原始图像,对原始图像进行预处理;步骤S2、肺区域的粗分割;步骤S2包括:步骤S201、设定阈值,使用阈值分割对预处 理后的图像进行二值化处理,提取出肺部区域及与肺部区域灰度值相近的部分背景(图4中 肺之外的白色,背景全部是指肺之外的所有区域);步骤S202、从步骤S201处理后获得的图 像四角边缘开始对部分背景进行反填充;步骤S203、找出从头顶往下的z方向上面积最大一 层的肺;步骤S204、通过最大一层的肺进行z方向上向前和向后逐层区域生长,进行逐层判 断,防止与背景粘连;步骤S3:肺区域的细分割,用于提取并去除气管和分离左右肺。 优选地,所述阈值为-500HU。优选地,逐层判断的方法是标记当前层为C u r r e n t S 1 i c e,传播层则为 SpreadSlice,求出SpreadSlice上肺区域点的个数总和与CurrentSlice上肺区域点的个数 总和的比值,如果比值小于0.4或者大于2.25,则判断为泄露至背景,终止生长;如果比值大 于等于0.4且小于等于2.25,则判断为未泄露至背景,继续生长。 优选地,步骤S204还包括通过对最大一层的肺在二维上求取连通区域进行判断: 将图像中值为1的每个点都作为种子点,然后将种子点进行区域生长,如果只求出一个连通 区域,就把该连通区域作为肺的起始生长层;如果求出多个连通区域,取最大两个连通区域 作为肺的起始生长层,去除其他连通区域。 优选地,逐层判断开始时,设定当前层为起始生长层。 优选地,步骤S202中背景反填充的方法是从图像的四个边框往里进行区域生长, 长至胸腔区域,即值为0处终止,同时把区域生长过的地方的值赋值为0。 优选地,步骤S202中区域生长的方法为:首先选择一组种子点,种子点可以为图像 的四个边框,然后查找种子点的8邻域,如果8邻域的标记值跟种子点一致,则将8邻域的点 也加入到种子点,不停的生长,直到遇到8邻域的点与种子点不一致,则终止生长,同时把生 长过的地方赋值为〇,即为背景。 优选地,步骤S203中通过逐层累加值为1的个数,选取个数最大的一层作为最大一 层的肺。 优选地,步骤S3中提取气管的方法为:求取二维连通区域和三维连通区域,从头顶 往下的z方向起始层开始遍历,将二维连通区域的面积圆形度大于0.5,三维连通区域最大 的作为气管种子点,然后用水平集算法将气管提取。 优选地,步骤S3还包括:生成肺结节所需的肺掩膜和工作站显示所需的肺掩膜并 进行融合。 本专利技术通过逐层对比判断,防止与背景粘连,明显改善了肺分割的效果,另外,加 快了分割速度。【附图说明】 图1为本专利技术实施例中的步骤流程示意图。 图2为本专利技术实施例中步骤S2的流程示意图。图3为本专利技术实施例中步骤S1中输入的原始图像。 图4为本专利技术实施例中步骤S201提取出的图像。 图5为本专利技术实施例中步骤S202提取出的图像。 图6为本专利技术实施例中三维方向的示意图。图7a_7c分别为本专利技术实施例中步骤S204提取出具有一个、两个、三个连通区域的 肺部图像。图8显示的是工作站显示所需的肺掩膜。 图9为本专利技术实施例中步骤S3的流程示意图。【具体实施方式】 以下结合附图和具体实施例对本专利技术作进一步详细说明。根据下面说明和权利要 求书,本专利技术的优点和特征将更清楚。需说明的是,附图均采用非常简化的形式且均使用非 精准的比率,仅用以方便、明晰地辅助说明本专利技术实施例的目的。 请参考图1所示,本专利技术实施例中的包括以下步骤: 步骤S1:输入原始图像,对原始图像进行预处理。 如图3所示,原始图像为CT设备扫描获得的符合DIC0M 3.0标准的胸部CT图像。预 处理采用的方法是对原始图像进行降噪处理,例如进行高斯平滑处理,高斯平滑是通过高 斯平滑滤波器在x、y、z三个方向上分别按如下公式: 生成高斯肀滑滤波器(Gaussian Smoothing Filter)的高斯核,然后再与原始图 像中的每个像素进行加权求和。加权求和是对图像中的每个像素的原始灰度值与高斯核进 行卷积,累加求和所得结果作为每个像素的灰度值,达到的效果是消除伪影,去除噪声,改 善图像质量,避免噪声对后续的分割造成不利影响。上述公式中〇2为方差,决定高斯函数的宽度,也就是决定平滑程度,X表示的是当 前像素点到对应像素点的距离。步骤S2:肺区域的粗分割。 粗分割的对象主要包括气管、肺。预处理后的图像为三维数据,为便于说明粗分割 的过程,随机选取一例数据,并截取其第121层的图像,该图像为二维图像。 步骤S2包括以下步骤: 步骤S201:设定阈值,使用阈值分割对预处理后的图像进行二值化处理,提取出肺 部区域及部分背景,部分背景是指与肺部区域灰度值相近的部分背景即图4中肺之外的白 色,全部背景是指肺之外的所有区域。 本实施例中阈值(Thr e sho 1 d)选定为-500HU,大于阈值的区域的值(标记值)设为 〇,小于阈值的区域的值(标记值)设为1,背景的值(标记值)为〇,肺的值(标记值)为1,从而 将胸腔区域,包括肺部区域及背景的大部分都提取出来,具体如图4所示。 步骤S202:从图像四角边缘开始背景反填充,从而提取出肺部区域及少量床板,具 体如图5所示,肺部区域为白色大块区域,床板为肺部区域下方的白色短线条。 背景反填充的方法是从图像的四个边框往里进行区域生长,长至胸腔区域,即值 (标记值)为〇处终止,同时把区域生长过的地方的值(标记值)赋值为〇,接着计算二维连通 区域,去除小连通区域即去除连通域个数小于10的区域。二维连通区域的计算方法为与步 骤S204本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种肺分割方法,包括以下步骤:步骤S1、输入原始图像,对原始图像进行预处理;步骤S2、肺区域的粗分割;步骤S2包括:步骤S201、设定阈值,使用阈值分割对预处理后的图像进行二值化处理,提取出肺部区域及与肺部区域灰度值相近的部分背景;步骤S202、从步骤S201处理后获得的图像四角边缘开始对部分背景进行反填充;步骤S203、找出从头顶往下的z方向上面积最大一层的肺;步骤S204、通过最大一层的肺进行z方向上向前和向后逐层区域生长,进行逐层判断,防止与背景粘连;步骤S3:肺区域的细分割,用于提取并去除气管和分离左右肺。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:姚庆,
申请(专利权)人:上海联影医疗科技有限公司,
类型:发明
国别省市:上海;31
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