SNP标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了SNP标记及其应用。其中，该SNP标记为山羊9号染色体18518518位置的碱基A或G。本发明专利技术的SNP标记与山羊的产羔数性状紧密相关，能够有效用于山羊的分子标记辅助育种。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及SNP标记及其应用。具体地，本专利技术涉及一种山羊产羔数性状相关的SNP标记，用于检测前述一组SNP标记的引物对和试剂盒，前述一种SNP标记、一组引物对、试剂盒在山羊选育中的用途，以及检测山羊产羔数性状的方法。
技术介绍
山羊是最早驯化的家畜之一，它为人类提供了丰富的畜产品。山羊能够在生态条件较差的环境中生存，在世界范围内有着广泛的分布，对世界农村和牧区的发展做出了重要贡献。山羊生产中，产羔数是一个重要经济性状，提高产羔数是增加收益的有效手段。但产羔数是复杂的数量性状，涉及多个基因、位点以及位点间的相互作用，极易受到环境的影响。传统的选择手段难以取得有效进展。分子标记辅助选择，可以通过影响选择时间、选择强度以及准确性而极大地提高这类性状的选择效果。目前应用较广泛的分子遗传标记技术有：限制性片段长度多态分析技术(RestrictionFragmentLengthPolymorphism，RFLP)、随机引物扩增多态性DNA技术(RandomAmplifiedPolymorphismDNA，RAPD)、扩增片段长度多态性分析技术(AmplifiedFragmentLengthPolymorphism，AFLP)、单核苷酸多态性标记(singlenucleotidepolymorphism，SNP)等。其中，SNP标记具有遗传稳定、突变率低、便于自动化检测等优点，因此开发与山羊多胎相关的SNP遗传标记将对培育多胎山羊新品种(系)产生重大影响。其中，目前关于山羊多胎遗传标记的研究多基于已在其它品种或物种中发现的多胎候选基因。这些在山羊多胎遗传机制研究中发现的多胎相关遗传标记多是初步的结果，并且局限于已有候选基因，利用这些结果，还难以对山羊多胎性状做出较准确的选择。因而，在全基因水平上挖掘与产羔数性状(在本文中有时也称为“多胎性状”)相关的遗传标记很有必有。
技术实现思路
本专利技术旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本专利技术的一个目的在于提出一种与山羊产羔数性状相关，能够有效用于山羊选育的SNP标记。其中，需要说明的是，SNP(singlenucleotidepolymorphism，SNP，即单核苷酸多态性)是1996年由美国麻省理工学院的人类基因组研究中心学者Lander提出的一类分子遗传标记，主要是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP表现出的多态性仅涉及到单个碱基的变异，表现是有转换、颠换、插入和缺失等。根据本专利技术的一个方面，本专利技术提供了一种山羊产羔数性状相关的SNP标记。根据本专利技术的实施例，该SNP标记为山羊9号染色体18518518位置的碱基A或G。根据本专利技术的实施例，所述SNP标记位于SEQIDNO：1所示核苷酸序列的方框标记处：CTGATCTAATACTCAAAATTCACAGATTTCAGTTAAAAATCACTCACCACACCCCAAATCAGGAAGATCTTAAACTGACTCATCCAAAACTGTCAGAATACAGAAAGGTTGAATGTTATAATAGAAACATTATAATAGAAGAGAAGGCGGGAGGAGCGGTGTGGGAGACACACCAGGCAAGAACCAACAGAAAGAAAGCTGGTTTCCCTTTTGGCGGTATAAACTAAAAACACAAAATAAACTTTAAGATGAGGAACTCTACATGAGATAAAGTGGGTCACTTCATCAAAGGTTTCAATAGATCAGGAAGACAAAACTTTAAAGTATTACTAATACAACCTCAAAATATACAAACATCATTAGAACTGTCGGAAGAAATGGAAAACAGGGGTCTATTCATTACCACAGCCTAGTCTTATTCTAACTGAAATTGCTGCACAGCAGATTTAATTCAGCAAGAAGCCTTGTTTAATTCTGGAGAAAACGAGGTATCGAGTACAGAAGAAGCTTTTTCAAAAAGAAATATGGTATAGTGTCACACCAGCCACACGTGTATCTCATCTACTCCCCTGGCATTCTGTCCCTAGGAGGTGTTTTGATGTGTCAAAGTGATGGCAACACTTCTCCTATGGATGCAGGGTGGGTGGATTGCAAATGAGAAGCAGCAGCATGGAAGTCAGCTGTGCCCAATGCTTATTGCAGGTTTCACTGCTACAAAGTCTGAGACTTCAGTGAGTCAAAAAAAGCATTAGACATTTCCACAAATATGAATAACATCTGTTGAGATTACGGCATTTTCTACAGCAAACACAACAGTAATGATTATCGAATGCTCCCATTAGAATATTCCATGAGTCATTCACTCAGAAGCAAACACCGAAGATTAATCTAAAGTAGATTGCTTATTACTGGTTCTTGGCATTCTGCTTTCCTAGGGGTAC(SEQIDNO：1)；根据本专利技术的实施例，所述SNP标记的AG基因型个体的产羔数显著高于GG基因型个体。即专利技术人发现，该SNP标记的位点处基因型为杂合型AG的山羊的产羔数显著高于此处基因型为纯合GG的山羊。进而，根据本专利技术的实施例，通过检测山羊的上述SNP，能够有效地确定其产羔数性状，具体地，如前所述，该SNP标记的AG基因型个体的产羔数显著高于GG基因型个体，从而能够根据该SNP位点的基因型对山羊的繁殖性能进行遗传评估。由此，专利技术人确定，本专利技术的一种SNP标记与山羊的产羔数性状紧密相关，能够有效用于山羊的分子标记辅助育种。进而能够根据实际育种需求对山羊育种材料进行早期选择(例如选择产羔数多即多胎的山羊个体)，进一步能够有效提高育种的效率和准确性，提高山羊繁殖群体的遗传水平，从而能够准确、高效地选育出山羊优良品种。此外，根据本专利技术的一些实施例，利用本专利技术的一种SNP标记进行山羊分子标记辅助育种，具有早期筛选、节省时间、成本低廉、准确性高的优点。根据本专利技术的另一方面，本专利技术还提供了一种用于检测前面所述的本专利技术的一种SNP标记的引物对。根据本专利技术的实施例，所述引物对包含：具有SEQIDNO：2-3所示的核苷酸序列，用于检测所述SNP标记。具体地，所述引物对的序列如下所示：F：GGTCACTTCATCAAAGGTTT(SEQIDNO：2)R：AGAAGTGTTGCCATCACTTT(SEQIDNO：3)根据本专利技术的实施例，利用本专利技术的一种引物对能本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种山羊产羔数性状相关的SNP标记，其特征在于，包含：所述SNP标记为山羊9号染色体18518518位置的碱基A或G。

【技术特征摘要】
1.一种山羊产羔数性状相关的SNP标记，其特征在于，包含：
所述SNP标记为山羊9号染色体18518518位置的碱基A或G。
2.根据权利要求1所述的一种SNP标记，其特征在于，该SNP位点的AG基因型个体
产羔数显著高于GG基因型的个体。
3.一种用于检测权利要求1或2所述的SNP标记的引物对，其特征在于，所述引物对
具有SEQIDNO：2-3所示的核苷酸序列，用于检测所述SNP标记。
4.一种用于检测权利要求1或2所述的SNP标记的试剂盒，其特征在于，包含：
权利要求3所述的引物对。
5.权利要求1或2所述的SNP标记、权利要求3所述的引物对或权利要求4所述的试
剂盒，在山羊选育中的用途。
6.一种检测山羊产羔数性状的方法，其特征在于，通过对待测山羊进行权利要求1或...

【专利技术属性】
技术研发人员：张清峰，李勇，张耕耘，全志武，宋峰峰，苗泽圃，夏秋菊，范艺翔，
申请(专利权)人：深圳华大农业与循环经济科技有限公司，
类型：发明
国别省市：广东;44