本发明专利技术公开了一种基于单核苷酸多态性的小麦分子条形码。本发明专利技术提供了检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦品种中的应用；本研究拟利用目前高通量SNP芯片，从中筛选出数量最小、分辨率最强的一套SNP标记作为条形码，提高小麦育种和科研对小麦资源的利用效率。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术设及生物
，尤其设及一种基于单核巧酸多态性的小麦分子条形 码。
技术介绍
DNA指纹图谱技术已经被广泛用于作物材料鉴定、分析和品种保护（Wang2006). 作为DM指纹图谱的分子标记经历了Ξ个阶段：第一代分子标记是限制性片段长度多态性 (RFLP)，但其操作复杂、多态性低和花费高，利用时间较短（Grover&Sharma2015);第二代 分子标记是简单序列重复（SSR)，其操作相对简单、多态性较高和成本较低，因此被广泛应 用于作物遗传研究（Wu&Tanksley1993 巧runel1994 ;反Sd'gfetal. 1998);SNP是第Ξ代 分子标记，随着下一代测序技术的发展和全基因组测序成本逐步降低，许多重要作物全基 因组测序完成，产生了大量的SNP数据并据此开发了SNP忍片（Cavana曲etal. 2013 ;化en etal. 2014；Mondenetal. 201；Unterseeretal. 2014;Wangetal. 2014 ;Hulse-Kempet al. 2015;Leeetal. 2015 ;)。SNP忍片操作流程标准化，不同实验室间产生的数据具有可 比性。理论上讲，忍片上布列的SNP点在染色体或基因组上的位置是唯一的，从而在很大 程度上避免了多拷贝数基因SNP带来的分型困扰。运点对于普通小麦运样的多倍体物种尤 其重要。近年来，已经陆续有几款小麦SNP忍片产品，如illumina公司推出的9Κ、90ΚSNP 忍片和Affymetrix公司推出的35Κ、817Κ和660ΚSNP忍片。运些小麦SNP忍片已经用于 小麦群体结构、遗传变异、选择进化与全基因组关联分析（Cavana曲etal.2013;Fa;riset al. 2014；Wangetal. 2014；Zankeetal.,2015).
技术实现思路
本专利技术一个目的是提供检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的物 质的用途。 本专利技术提供检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的物质在鉴定或 辅助鉴定小麦品种中的应用； 或检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助 鉴定小麦品种的试剂盒中的应用；所述 43 个SNP位点为如下：IWA530、IWA2783、IWA5405、IWA5186、IWA4153、 IWA4154、IWA4155、IWA4031、IWA695、IWA4525、IWA4884、IWA2938、IWA2442、IWA4323、 IWA2961、IWA5285、IWA5106、IWA2037、IWA8303、IWA662、IWA5618、IWA6279、IWA3710、 IWA2124、IWA3835、IWA3011、IWA1691、IWA4854、IWA5375、IWA4805、IWA5326、IWA1755、 IWA2698、IWA6526、IWA7177、IWA224、IWA8380、IWA3312、IWA2476、IWA2506、IWA4187、 IWA1437 和IWA304。 上述应用中，鉴定或辅助鉴定小麦品种为鉴定或辅助鉴定待测小麦是否为表2和 /或表3所示某个小麦品种，具体方法包括如下步骤：检测待测小麦品种基因组所述43个 SNP位点基因型，将所述待测小麦品种43个SNP位点基因型与表2和/或表3所示每个小 麦品种的43个SNP位点基因型进行比较，确定待测小麦是否为表2和/或表3所示某个小 麦品种。 本专利技术另一个目的是提供检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的 物质的用途。 本专利技术提供检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的物质在区分或 辅助区分小麦品种中的应用； 或检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的物质在制备区分或辅助 区分小麦品种产品中的应用。 上述应用中，区分或辅助区分小麦品种为区分表2和/或表3所示至少两个品种， 具体方法包括如下步骤：检测表2和/或表3所示至少两个品种基因组所述43个SNP位点 基因型，比对所述两个品种43个SNP位点基因型，区分表2和/或表3所示至少两个品种。 本专利技术第Ξ个目的是提供检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的 物质的用途。 本专利技术提供检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的物质在小麦品 种分类中的应用. 或检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的物质在制备小麦品种分 类产品中的应用。[001引上述应用中，[001引所述SNP位点IWA530为序列1第51位核巧酸； 所述SNP位点IWA2783为序列2第101位核巧酸；[001引所述SNP位点IWA5405为序列3第101位核巧酸；[001引所述SNP位点IWA5186为序列4第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA4153为序列5第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA4154为序列6第101位核巧酸；[002引所述SNP位点IWA4155为序列7第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA4031为序列8第43位核巧酸； 所述SNP位点IWA695为序列9第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA4525为序列10第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA4884为序列11第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA2938为序列12第101位核巧酸；[002引所述SNP位点IWA2442为序列13第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA4323为序列14第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA2961为序列15第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA5285为序列16第101位核巧酸；[003引所述SNP位点IWA5106为序列17第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA2037为序列18第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA8303为序列19第26位核巧酸；[003引所述SNP位点IWA662为序列20第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA5618为序列21第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA6279为序列22第101位核巧酸；[003引所述SNP位点IWA3710为序列23第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA2124为序列24第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA3835为序列25第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA3011为序列26第101位核巧酸；[004引所述SNP位点IWA1691为序列27第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA4854为序列28第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA5375为序列29第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA4805为序列30第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA5326为序列31第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA1755为序列32第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA2698为序列33第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA6526为序列34第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA7177为序列35第101位核巧酸； 所述SNP位点IWA224为序列36第61位核巧酸；[005引所述SNP位点IWA8380为序列37第51位核巧酸；[005引所述SNP位本文档来自技高网...
【技术保护点】
检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦品种中的应用；或检测小麦基因组中43个SNP位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定小麦品种的试剂盒中的应用；所述43个SNP位点为如下：IWA530、IWA2783、IWA5405、IWA5186、IWA4153、IWA4154、IWA4155、IWA4031、IWA695、IWA4525、IWA4884、IWA2938、IWA2442、IWA4323、IWA2961、IWA5285、IWA5106、IWA2037、IWA8303、IWA662、IWA5618、IWA6279、IWA3710、IWA2124、IWA3835、IWA3011、IWA1691、IWA4854、IWA5375、IWA4805、IWA5326、IWA1755、IWA2698、IWA6526、IWA7177、IWA224、IWA8380、IWA3312、IWA2476、IWA2506、IWA4187、IWA1437和IWA304。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：高丽锋，孔秀英，贾继增，
申请(专利权)人：中国农业科学院作物科学研究所，
类型：发明
国别省市：北京;11
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