基因突变体及其应用制造技术

技术编号:12739899 阅读:122 留言:0更新日期:2016-01-21 01:25
提供了分离的核酸、分离的多肽、筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的方法、筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的系统以及用于筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的试剂盒。其中,该分离的核酸,与SEQ ID NO:1相比具有c.703C>T突变,或者与SEQ ID NO:3相比具有选自下列的至少一种突变:c.338G>T和c.358A>G。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】基因突变体及其应用优先权信息无
本专利技术涉及基因突变体及其应用。具体地,本专利技术涉及分离的核酸、分离的多肽、筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的方法、筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的系统以及用于筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的试剂盒。
技术介绍
青年人中的成年发病型糖尿病(maturityonsetdiabetesoftheyoung,MODY),是一组具有高度遗传及临床表型异质性的单基因疾病。1975年由Fajans和Tattersall依据1950年以来系列报道分析并命名,并总结其以下临床特征:(1)累及3代或以上家族成员,呈常染色体显性遗传,而与人类白细胞抗原(HLA)无关;(2)家族中一般有2个以上患者在25岁以前发病;(3)外显率高,可超过90%;(4)病程进展缓慢,在青年期可以无症状或仅表现为糖耐量减低;(5)一般无酮症酸中毒,至少在发病2年内不依赖胰岛素治疗。现阶段,寻找致病基因对疾病诊断或治疗意义重大。虽然目前已发现一些青年人中的成年发病型糖尿病的致病基因,例如GCK、HNF1A、HNF4A、HNF1B基因,但仍存在着相当一部分未知致病基因位点。因而,目前对青年人中的成年发病型糖尿病的研究仍有待深入。
技术实现思路
本专利技术旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此,本专利技术的一个目的在于提出一种能够有效筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的方法。本专利技术是基于专利技术人的下列工作而完成的:专利技术人通过高通量外显子组测序联合候选基因突变验证的方法确定了青年人中的成年发病型糖尿病的致病基因上的新突变。根据本专利技术的第一方面,本专利技术提出了一种分离的核酸。根据本专利技术的实施例,与SEQIDNO:1相比,该核酸具有c.703C>T突变;或者与SEQIDNO:3相比,该核酸具有选自下列的至少一种突变:c.338G>T和c.358A>G。根据本专利技术的实施例,专利技术人确定了HNF1B和HNF1A基因突变体,这些新突变体与青年人中的成年发病型糖尿病的发病密切相关,从而通过检测这些新突变体在生物样品中是否存在,可以有效地检测生物样品是否易感青年人中的成年发病型糖尿病。根据本专利技术的第二方面,本专利技术提出了一种分离的多肽。根据本专利技术的实施例,与SEQIDNO:2相比,该分离的多肽具有p.Arg235Trp突变;或者与SEQIDNO:4相比,该分离的多肽具有选自下列的至少一种突变:p.Trp113Leu和p.Lys120Glu。通过检测生物样品中是否表达该多肽,可以有效地检测生物样品是否易感青年人中的成年发病型糖尿病。根据本专利技术的第三方面,本专利技术提出了一种筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的方法。根据本专利技术的实施例,该方法包括以下步骤:从生物样品提取核酸样本;确定所述核酸样本的核酸序列;所述核酸样本的核酸序列或其互补序列,与SEQIDNO:1相比具有选自c.703C>T突变,或者与SEQIDNO:3相比具有选自c.338G>T和c.358A>G的至少一种突变,是所述生物样品易感青年人中的成年发病型糖尿病的指示。通过根据本专利技术实施例的筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的方法,可以有效地筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品。根据本专利技术的第四方面,本专利技术提出了一种筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的系统。根据本专利技术的实施例,该系统包括:核酸提取装置,所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本;核酸序列确定装置,所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连,用于对所述核酸样本进行分析,以便确定所述核酸样本的核酸序列;判断装置,所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连,以便基于所述核酸样本的核酸序列或其互补序列,与SEQIDNO:1相比具有c.703C>T突变,或者与SEQIDNO:3相比具有选自c.338G>T和c.358A>G的至少一种突变,判断所述生物样品是否易感青年人中的成年发病型糖尿病。利用该系统,能够有效地实施前述筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的方法,从而可以有效地筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品。根据本专利技术的第五方面,本专利技术提出了一种用于筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的试剂盒。根据本专利技术的实施例,该试剂盒含有:适于检测HNF1B和HNF1A基因突变体的至少一种的试剂,其中与SEQIDNO:1相比,所述HNF1B基因突变体具有c.703C>T突变;与SEQIDNO:3相比,所述HNF1A基因突变体具有选自下列的至少一种突变:c.338G>T和c.358A>G。利用根据本专利技术的实施例的试剂盒,能够有效地筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品。本专利技术的附加方面和优点将在下面的描述中部分给出,部分将从下面的描述中变得明显,或通过本专利技术的实践了解到。附图说明本专利技术的上述和/或附加的方面和优点从结合下面附图对实施例的描述中将变得明显和容易理解,其中:图1:显示了根据本专利技术一个实施例的筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的系统及其组成部分的示意图,其中,A为根据本专利技术实施例的筛选易感青年人中的成年发病型糖尿病的生物样品的系统的示意图,B为根据本专利技术实施例的核酸提取装置的示意图,C为根据本专利技术实施例的核酸序列确定装置的示意图;图2:显示了根据本专利技术一个实施例的MODY患者家系CZ01和CZ02的家系图谱,其中,A为根据本专利技术实施例的CZ01家系的家系图谱,B为根据本专利技术实施例的CZ02家系的家系图谱;图3:显示了根据本专利技术一个实施例,MODY患者家系CZ01家系内的患者及正常人的HNF1B基因突变位点的Sanger测序验证峰图;图4:显示了根据本专利技术一个实施例,MODY患者家系CZ02家系内的患者及正常人的HNF1A基因突变位点的Sanger测序验证峰图;图5:显示了根据本专利技术一个实施例,MODY散发患者及家系外正常人的HNF1A基因突变位点的Sanger测序验证峰图。专利技术详细描述下面详细描述本专利技术的实施例,所述实施例的示例在附图中示出。下面通过参考附图描述的实施例是示例性的,仅用于解释本专利技术,而不能理解为对本专利技术的限制。HNF1B及HNF1A基因突变体根据本专利技术的第一方面,本专利技术提出了一种分离的核酸。根据本专利技术的实施例,与SEQIDNO:1相比,该核酸具有c.703C>T突变;或者与SEQIDNO:3相比,该核酸具有选自下列的至少一种突变:c.338G>T和c.358A>G。需要说明的是,本专利技术的分离的核酸编码HNF1B或者HNF1A突变体,也可以称为“编码HNF1B或者HNF1A突变体的核酸”,即该核酸可以理解为与编码HNF1B或者HNF1A突变体的基因相对应的核酸物质,即核酸的类型不受特别限制,可以是任何包含与HNF1B和HNF1A的编码基因相对应的脱氧核糖核苷酸和/或核糖核苷酸的聚合物,包括但不限于DNA、RNA或cDNA。根据本专利技术的一个具体示例,前面所述的编码HNF1B和HNF1A突变体的核酸为DNA。根据本专利技术的实施例,专利技术人确定了HNF1B和HNF1A基因的新突变体,该突变体与青年人中的成年发病型糖尿病的发病密切相关,从而通过检测该突变体在生物样品中是否存在,可以有效地检测生物样本文档来自技高网...
基因突变体及其应用

【技术保护点】
PCT国内申请,权利要求书已公开。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种分离的核酸,其特征在于,所述核酸编码肝细胞核因子1α,与SEQIDNO:3相比,所述核酸具有选自下列的至少一种突变:c.338G>T和c.358A>G。2.根据权利要求1所述的核酸,其特征在于,所述核酸为DNA。3.一种分离的多肽,其特征在于,所述分离的多肽表达肝细胞核因子1α,与SEQIDNO:4相比,所述分离的多肽具有选自下列的至...

【专利技术属性】
技术研发人员:张建国方明艳王海荣杜萨特科瓦·佩特拉王威王俊
申请(专利权)人:深圳华大基因股份有限公司
类型:发明
国别省市:广东;44

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