IDH1 R132H突变阳性癌症治疗或诊断的手段与方法技术

技术编号:12466933 阅读:170 留言:0更新日期:2015-12-09 16:46
本发明专利技术涉及肿瘤治疗及诊断领域。具体而言,本发明专利技术涉及一种包含至少8个以连续氨基酸序列形式存在于I型人异柠檬酸脱氢酶中的氨基酸长度的肽,其中所述肽的至少一个氨基酸在与132位点相对应的位点上由R置换为H,用于预防和/或治疗癌症。本发明专利技术进一步预想为包含所述肽的药剂。另外,本发明专利技术涉及一种诊断具有以下特点癌症的方法:至少一些癌细胞的基因组发生突变,导致具有R132H突变的IDH1突变体表达,该方法包括如下步骤:使用包含至少10个以连续氨基酸序列形式存在于IDH1中的氨基酸长度的肽接触怀疑患有该肿瘤受试者的血液样本,其中在允许免疫系统成分特异性结合到肽上并能确定免疫系统的上述成分是否结合到肽上的一段时间和条件,所述肽的至少一个氨基酸在与132位点相对应的位点上由R置换为H,其中如果确定发生结合就可以诊断癌症。本发明专利技术还提供实施该方法的试剂盒和装置。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】IDH1R132H突变阳性癌症治疗或诊断的手段与方法本专利技术涉及肿瘤治疗及诊断领域。具体而言,本专利技术涉及一种包含至少8个氨基酸长度的作为I型人异柠檬酸脱氢酶(IDH1)中连续氨基酸序列形式存在的肽,其中该肽的至少一个氨基酸在与132位点相对应的位点上由R置换为H,用于预防和/或治疗癌症。本专利技术进一步设想为包含所述肽的药剂。另外,本专利技术涉及一种诊断具有以下特点癌症的方法,其中至少有一些癌细胞的基因组发生突变,导致具有R132H突变的IDH1突变体的表达,该方法包括如下步骤:使包含至少10个氨基酸长度的作为IDH1中连续氨基酸序列存在的肽与怀疑患有该种肿瘤的受试者的血液样本在使得免疫系统成分特异性结合到该肽的条件下接触一段时间,并且确定该免疫系统成分是否结合到肽上,其中如果确定发生了结合,则诊断为癌症,其中,该肽的至少一个氨基酸在与132位点相对应的位点上由R置换为H。本专利技术还提供了实施该方法的试剂盒和装置。成胶质细胞瘤(GBM)序列分析的一个意外发现是,编码胞质NADP+依赖型异柠檬酸脱氢酶(IDH1)的基因发生突变(Parsons2008,Science321(5897):1807-12)。最近的研究报道称IDH1基因突变导致约70%的间变性胶质瘤和12%的成细胞胶质瘤132位点的氨基酸置换(Balls2008,ActaNeuropathol116(6):597-602,Yan2009,NEnglJMed.360(8):765-73,Watanabe2009,AmJPathol.174(4):1149-53,DeCarli2009,NEnglJMed.360(21):2248,Ducray2009,NEnglJMed.360(21):2248,Hartmann2009,ActaNeuropathol.118(4):469-74,Ichimura2009,NeuroOncol.11(4):341-7,Sanson2009,JClinOncol.27(25):4150-4)。异柠檬酸脱氢酶通过把NADP+还原成NADPH,催化异柠檬酸氧化脱羧生成α-酮戊二酸。突变影响属于进化保守区域的氨基酸序列第132位氨基酸精氨酸,其位于异柠檬酸结合位点。报道的突变都是杂合型的,而且未检测到提示蛋白质失活的改变,例如剪切位点或无义突变,从而引发对突变激活性质的猜测。然而,酶活性的测定表明突变的灭活作用(Yan2009,NEnglJMed.360(8):765-73)。然而,IDH1在癌症的发生和/或发展中的作用仍然捉摸不定。IDH1在世界卫生组织(WHO)分级II及III级弥散性胶质瘤中发生突变的频率高。93%的IDH1突变特点是氨基酸发生置换R132H(Hartmann2009,ActaNeuropathol.118(4):469-74)。上述类型癌症及伴有IDH1R132H的其他类型癌症的有效治疗是高度期求的,因为这些癌症是最常见的侵略性癌症,且预后效果差。上述癌症类型目前的诊断方法,特别是确定癌症是否伴有IDH1R132H突变的诊断方法,主要是基于基因组DNA测序方法或免疫组化染色方法(参见,例如EP2256214A2)。但是,这两种技术都需要适当的癌组织样本,这种样本只能通过繁琐、有潜在危险的活检获得。因此,这些癌症类型的可靠、有效的诊断方法也是期求的。本专利技术要解决的技术问题可认为是提供符合上述需求的治疗及诊断的手段与方法。技术问题通过权利要求书及以下所述的实施例得到解决。因此,本专利技术涉及一种包含至少8个以连续氨基酸序列形式存在于I型人异柠檬酸脱氢酶(IDH1)中的氨基酸长度的肽,其中该肽的至少一个氨基酸在与132位点相对应的位点上由R置换为H,用于预防和/或治疗癌症。文中所用的术语“肽”是指有机小分子,其中氨基酸是通过肽键共价偶联。与多肽(蛋白质)相比,肽仅由2至约100个氨基酸组成。由于分子量小,肽通常是生物可利用的分子,即它们能进入有机体的大多数组织中,甚至可进入细胞中。本专利技术中肽为包含至少8个氨基酸的长度。因此,肽的长度可基本由至少8个至约100个氨基酸组成,最好为从至少8个至约50个氨基酸、从至少8个至约40个氨基酸、从至少8个至约35个氨基酸、从至少8个至约30个氨基酸、从至少8个至25个氨基酸、从至少8个至约20个氨基酸、从至少8个至约15个氨基酸或从至少8个至约10个氨基酸组成。在本文中使用的术语“大约”是指氨基酸的数量,它与准确数字差+/-一个,即加或减一个氨基酸。最好目的为准确的数字。文中所用的术语“I型异柠檬酸脱氢酶”或“IDH1”是指生理上参与催化异柠檬酸氧化脱羧从而生成α-酮戊二酸和CO2的柠檬酸循环的一种酶。反应需要把NAD+转化成NADH。本专利技术首选酶的另一种异型体利用NADP+而非NAD+作为辅助因子在细胞质以及线粒体或/和过氧化物酶体中催化相同的反应。此处提到的IDH1最好是人IDH1,其氨基酸序列由Kim等人披露(Kim1995,BiochemJ308(Pt1):63-68)或通过NCBI/Genbank登录号CAG46496.1,GI:49456351;CAG38738.1,GI:49168486;CAG38553.1,GI:49065470;或AAH12846.1,GI:15277488获取。但是,该术语也包括具有所述特定氨基酸序列的上述人IDH1的变异体。这些变异体通常可以是直系同源体、旁系同源体或同系物。此处提到的变异体其氨基酸序列最好不同于上述特定氨基酸序列,有至少一个氨基酸取代、增加和/或缺失。该变异体氨基酸序列的整个长度最好有至少70%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%是与上述特定氨基酸序列相同。等同度最好能通过比较窗口比较两个最优对齐的序列来确定,其中与参考序列(不包含增加或缺失)相比,比较窗口的氨基酸序列片段的最优对齐可能包含增加或缺失(例如缺口或突出部分)。百分比的计算是通过确定两个序列出现相同氨基酸残基位点的数量得到匹配位点的数量,然后用比较窗口的总位点数量除以匹配位点数量,再把结果乘以100得到序列等同度的百分比。可以用局部地同源性算法(SmithandWatermanAdd.APL.Math.2:482(1981))、同源性对齐算法(NeedlemanandWunschJ.Mol.Biol.48:443(1970))、相似性查找方法(PearsonandLipmanProc.Natl.AcadSci.(USA).1988,85:2444(1988)),这些算法的计算机化实施(GAP,BESTFIT,BLAST,PASTA,andTFASTAintheWisconsinGeneticsSoftwarePackage,GeneticsComputerGroup(GCG),575ScienceDr.,Madison,WI)或目测比较序列的最优对齐。鉴于这两个序列已经确定进行比较,最好使用GAP和BESTFIT确定它们的最优对齐,从而确定等同度。最好是,缺口权重和缺口权重长度的默认值分别为5.00和0.30。变异体最好有以上提到的、基本上与上述人IDH1免疫学性质相同的酶活性。本专利技术的肽应包含至本文档来自技高网...
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【技术保护点】
一种包含至少8个以连续氨基酸序列形式存在于I型人异柠檬酸脱氢酶(IDH1)中的氨基酸长度的肽,其中所述肽的至少一个氨基酸在与132位点相对应的位点上由R置换为H,用于预防和/或治疗癌症。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2012.01.05 EP 1215029831.一种肽在制备用于诊断癌症的药剂或试剂盒中的用途,其中所述肽由选自SEQIDNO:3、SEQIDNO:5、SEQIDNO:4和SEQIDNO:9的氨基酸序列构成,所述癌症的特点在于至少一些癌细胞的基因组发生突变,引起具有R132H突变的IDH1突变体的表达。2.根据权利要求1...

【专利技术属性】
技术研发人员:迈克尔·普拉藤特蕾沙·舒马赫沃尔夫冈·威克
申请(专利权)人:德国癌症研究中心鲁普莱希特卡尔斯海德堡大学
类型:发明
国别省市:德国;DE

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