本发明专利技术涉及一种SNP的试剂盒,具体讲,涉及一种VKORC1基因扩增的检测引物组及试剂盒。所述VKORC1引物组包括:目标基因的上下游引物和荧光引物,在荧光引物的5’端标记有荧光基团。所述试剂盒包括该引物组、阴性质控品以及阳性质控品。利用本发明专利技术的引物组和试剂盒,可以快速、简便地确定VKORC1基因型别,具有检测灵敏度高、时间短,减少污染,操作简单方便,并且成本低,适合于大规模临床开展。从而实现对VKORC1基因扩增快速、有效且准确的检测,因而能保证及时的病例诊治及治疗效果监测。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种SNP的试剂盒,具体讲,涉及一种VK0RC1基因扩增的检测引物组 及试剂盒。
技术介绍
华法林是临床常用治疗血栓性疾病的一种香豆素类口服抗凝药,具有抗凝和溶 栓的双重作用。华法林的抗凝治疗指数范围狭窄,如果剂量不足则达不到治疗效果,剂量 稍过量则会引起出血,重者危及病人生命。然而,华法林血浆药物浓度和疗效存在明显的 个体差异和种族差异,有研究表明,不同患者使用抗凝血药物华法林的剂量可以相差20 倍,亚洲人的维持剂量比白种人要低30%~40%。因此,如何在临床上安全、合理使用华 法林长期以来是许多研究者关注的重点和难点。 近年来,随着药物基因组学的发展和华法林药理作用分子机制的阐明,单核苷酸 基因多态性在华法林用量个体差异中的作用越来越受到人们的重视。目前,已知与华法林 的药效学和药动学相关的基因达30余种,维生素K环氧化物还原酶复合体亚单位1基因 (VtaminKepoxidereductasecomplexsubunit1,VK0RC1)的基因多态性是影响华法林 用量个体差异最主要的遗传因素之一。维生素K环氧化物还原酶复合体亚单位1 (VK0RC1) 使还原型维生素K表氧化,可使凝血因子II、VE、IX和X以及蛋白C和蛋白S活化而产生凝 血效应。华法林是维生素K的拮抗剂(VKA),通过抑制肝脏环氧化还原酶而产生抗凝作用。 因此,VK0RC1决定了华法林的抗凝效果。 维生素K环氧化物还原酶(VK0R)是华法林作用的靶蛋白。华法林通过抑制VK0R, 使无活性的氧化型(环氧化物型)VK无法还原为有活性的还原型(氢醌型)VK而起到抗 凝作用。多个VK0RC1的SNP位点被发现与华法林用量个体差异相关,该基因目前主要研 究的位点是_1639A>G(SNPrs9923231),携带-1639G的患者,其对华法林的需求量较携 带-1639AA的患者高。研究表明,VK0RC1-1639G/A基因多态性存在民族差异,其基因多态 性是民族之间华法林剂量差异的主要原因。 华法林有R和S两个亚型,其中S型抗维生素K的作用最明显,R型在体内基本不 起作用,S型华法林直接作用于维生素K环氧化物还原酶,使维生素K的氧化型和还原型不 能相互转化,从而抑制维生素K的功能,同时也抑制一些凝血因子的激活。大量研究证明, VK0RC1基因多态性可影响华法林的起始使用剂量,VK0RC1GG型用药剂量最高,GA型次之, AA型最低。华法林在不同种族、年龄、性别人群中的剂量千差万别,很大的原因在于VK0RC1 基因的多态性。而在VK0RC1基因中,通过检测位点的多态性然后再结合患者相关临床信息 运用药理遗传学的相关法则基本上可确定华法林的起始使用剂量。 美国FDA批准的基因诊断和检测项目有2000项左右,其中1290多项已完全批准 用于临床,大约1000项正在审批过程中。实践证明,基因多态性检测是有效的。我国应该 使用华法林而未使用的人群达90%左右,房颤患者仅有6. 6%正确使用华法林,其原因是 不能确定华法林使用的准确剂量,不能规范监测INR。这样,房颤导致卒中患者明显增加,临 床统计显示大约有1/3的脑卒中患者由房颤引起。倘若临床医生通过基因检测的手段来确 定华法林的起始使用剂量,安全使用华法林,就会减少房颤的致残率和致死率。 以下是现在对VK0RC1的分型方法。 Taqman方法:针对SNP位点变异设计特异性的探针,探针标记成本较高;采用荧光 淬灭及双末端标记技术,有淬灭难以彻底、本底较高的缺陷;采用酶外切活性,定量时受酶 性能的影响。 DHPLC技术和质谱分析:分别需要用到高效液相色谱仪与质谱仪,设备昂贵,难以 在临床诊测中推广。 DNA芯片:由于高通量等优点在SNP检测中得到大量应用,但其依靠野生型与突 变型基因杂交动力学的差异对突变位点进行检测,由于不同位点之间的杂交动力学差异不 同,在进行多位点同时检测时条件难以控制、可重复性差,易出现假阳性假阴性结果。 微测序:作为一种基于阵列的突变分析,目前还面临着如何降低假阴性率和靶核 苷酸序列组成的变异等关键问题。 高温连接酶法:高温连接酶检测反应(ligasedetectionreaction,LDR)是近几 年逐渐引起人们注意的一种新型基因多态性检测方法,该技术操作简单、稳定,结果可靠。 俗称小测序。 限制性酶切方法(RFLP):准确性较好,费用也较低.但只能对一部分含有现成酶 切位点的多态位点进行分型。 SNaPshot法:基于焚光标记单碱基延伸原理的分型技术,通常用于10-30个SNP 位点分析。 DNA测序法:相对准确,价格较贵。DNA链的二级结构容易造成人工假相,使测序 结果出现偏差。 高分辨率熔解曲线法(HRM):是近几年兴起的SNP研究工具该方法,无需设计探 针,成本低,但结果准确度较低。 扩增阻碍突变系统(Amplificationrefractorymutationsystem,ARMS)):本技 术通过涉及特异性的引物,有选择性的扩增野生或突变模版,通过扩增产物的量来确定是 否为野生型或突变型,利用PCR引物的3'端末位碱基必须与其模板DNA互补才能有效扩增 的原理,设计等位基因特异性PCR扩增引物,在严格的条件下,只有在引物3'碱基与模板配 对时才能出现PCR扩增带,从而检测出突变。在不同的引物上加上3个T对扩增出的片段 进行区分。 毛细管电泳(capillaryelectrophoresis,CE)又称高效毛细管电泳(high performancecapillaryelectrophoresis,HPCE),是一类以毛细管为分离通道、以高压直 流电场为驱动力的新型液相分离技术。毛细管电泳实际上包含电泳、色谱及其交叉内容,它 使分析化学得以从微升水平进入纳升水平,并使单细胞分析,乃至单分子分析成为可能。 目前国内对VK0RC1的研究尚属空白,更没有成熟的检测方法或试剂。 有鉴于此,特提出本专利技术。
技术实现思路
本专利技术提供一种VK0RC1基因扩增的检测引物组; 本专利技术提供一种VK0RC1基因扩增的检测试剂盒。 为解决上述技术问题,本专利技术采用技术方案的基本构思是:VK0RC1基因扩增的检 测引物组,所述VK0RC1检测引物组包括: VK0RC1-PD-F1 :如SEQ ID N0:1所示的核苷酸序列,或由SEQ ID N0:1所示的核苷 酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列; ¥1(01^1-?042:如3£〇10勵:2所示的核苷酸序列,或由3£〇10勵 :2所示的核苷 酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列; VK0RC1-PD-R :如SEQ ID N0:3所示的核苷酸序列,或由SEQ ID N0:3所示的核苷 酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列; 所述VK0RC1-PD-R为荧光引物,其5'端标记有荧光基团; 作为本专利技术的优选技术方案,所述荧光基团选自由6-羧基荧光素、六氯-6-甲基 荧光素、VC荧光染料、四氯-6-羧基荧光素、羧基-X-罗丹明、6-羧基四甲基罗丹明、磺酰罗 丹明、6-羧基-4',5' -二氯-2',7' -二甲氧基荧光素琥珀酰亚胺酯、花菁3、花菁5和花 菁5. 5中的至少一种。 作本文档来自技高网...
【技术保护点】
VKORC1基因扩增的检测引物组,其特征在于,所述VKORC1检测引物组包括:VKORC1‑PD‑F1:如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列,或由SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列;VKORC1‑PD‑F2:如SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列,或由SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列;VKORC1‑PD‑R:如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列,或由SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列经取代、缺失、添加形成的核苷酸序列。其中,所述VKORC1‑PD‑R为荧光引物,其5’端标记有荧光基团。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:刘沛,丁朋举,李江浩,王林海,
申请(专利权)人:北京鑫诺美迪基因检测技术有限公司,
类型:发明
国别省市:北京;11
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