本发明专利技术涉及一种检测莲草直胸跳甲肌动蛋白(actin)基因转录水平的试剂盒,该发明专利技术属于分子生物学检测技术中的荧光定量DNA体外扩增技术领域。本发明专利技术首先保护了一种检测引物,序列如SEQ. ID NO.1和SEQ. ID NO.2所示,其次提供了一种操作简便、快速,且能够定量检测莲草直胸跳甲actin基因转录水平的荧光定量PCR检测试剂盒,该试剂盒由SYBR Premix Ex Taq、引物混合物、标准actin基因模板和超纯水组成。本发明专利技术还保护了该试剂盒用于检测莲草直胸跳甲actin基因的表达量的用途。本发明专利技术可以准确的测定actin基因的转录水平,并具有高度的特异性,扩增曲线结果表明actin基因荧光信号值符合标准的“S”型曲线,熔解曲线表明该荧光定量具有高度的检测专一性。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种检测莲草直胸跳甲肌动蛋白(actin)基因转录水平的试剂盒,该 专利技术属于分子生物学检测技术中的荧光定量DNA体外扩增
技术介绍
聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction,PCR),即DNA体外扩增技术,是 1985年由美国Mullis首创的一种生物高技术,随着耐高温的Taq酶的出现,扩增自动化的 完善,PCR近年得以迅速推广,它仅需要微微克水平的模板就能快速特异大量地复制任何所 希望的基因或DNA片断。 荧光定量PCR是一种核酸定量技术,该技术在PCR反应系统中引入了特定的荧光 标记物质,通过检测每个热循环后PCR反应体系中的荧光值的变化情况来实时监测DNA的 扩增情况,并获得每个样本的荧光定量变化曲线,从而获得每个反应管的Ct值(荧光变化 达到阈值时的循环数),以起始模板数的对数为横坐标,以Ct值为纵坐标制备标准曲线,据 此标准曲线和各个标本的Ct值对每个反应的起始DNA模板数进行定量测定。SYBRGreen是一种结合于双链DNA小沟中的结合染料。利用荧光染料(SYBR Green)与双链DNA分子结合发光的特性来指示扩增产物的增加。在PCR反应体系中,加入 过量SYBRGreenI荧光染料,当该染料掺入DNA双链后,荧光信号增强;当DNA变性时SYBR GreenI染料释放出来,荧光急剧减少;随后在聚合延伸过程中引物退火并形成PCR产物, SYBRGreenI染料与双链产物结合,经检测获得荧光的净增量。荧光信号的增加与PCR产 物的增加完全同步。这种高灵敏度、较低毒性的核酸染料在结合双链DNA分子后荧光增强 800-1000 倍。SYBRGreen在核酸的实时检测方面有很多优点,由于它与所有的双链DNA相结 合,不必因为模板不同而特别定制,因此设计的程序通用性好,且价格相对较低。此外,由于 一个PCR产物可以与多分子的染料结合,因此SYBRGreen的灵敏度很高。但是,由于SYBR Green与所有的双链DNA结合,因此由引物二聚体、单链二级结构以及错误的扩增产物引起 的假阳性会影响定量的精确性。通过测量升高温度后荧光的变化可以帮助降低非特异产物 的影响。由解链曲线来分析产物的均一性有助于分析由SYBRGreen得到定量结果的准确 性。 在荧光定量PCR检测基因表达水平时,经常检测某个基因的相对表达量,其中内 参基因常常选择actin。|3-actin即|3肌动蛋白,是actin家族的一员,在维持细胞结 构,细胞内运动,细胞分裂等细胞生理活动方面发挥着重要的作用。0-actin基因是应用 较为广泛的管家基因之一。管家基因(house-keepinggenes)是指所有细胞中均要表达的 一类基因,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的。在进行定量PCR时,可以通过计 算目的基因和管家基因的比值,得到基因表达的相对浓度。通过大量的实验研宄,我们优化 出了一套能够有效检测莲草直胸跳甲actin基因表达量的引物和PCR反应体系,并组装成 actin基因表达检测荧光定量聚合酶链式反应试剂盒,以满足生命科学、植物保护研宄者的 检测需要。
技术实现思路
本专利技术目的在于提供一种操作简便、快速,且能够定量检测莲草直胸跳甲actin 基因转录水平的荧光定量PCR检测试剂盒。 本专利技术的技术方案如下: 本专利技术首先提供了一种莲草直胸跳甲actin基因转录水平荧光定量PCR检测引 物混合物,所述引物混合物由引物1 : 5 ' -AAGCCCAAAGCAAAAGAGGTAT-3 '和引物2 : 5 ' -TGTAGAAGGTGTGATGCCAGAT-3 '组成。 其次,本专利技术提供了一种利用所述引物混合物的莲草直胸跳甲actin基因转录水 平焚光定量PCR检测试剂盒,该试剂盒由SYBRPremixExTaq、引物混合物、标准actin基 因模板和超纯水组成。 所述引物混合物中:引物1为10Mmol/L、引物2为10Mmol/L。 所述标准actin基因模板:浓度为1. 0Mmol/L,标准actin基因模板序列为: 5'-AAGCCCAAAGCAAAAGAGGTATCCTCACCTTGAAATACCCAATTGAACACGGTATCATCACCAACTGGGATGA TATGGAGAAGATCTGGCATCACACCTTCTACA-3 '。 超纯水组成:纯度超过18. 25MQ?CM。 本专利技术还保护了所述的莲草直胸跳甲actin基因转录水平荧光定量PCR检测试剂 盒的用途,将该试剂盒用于检测莲草直胸跳甲actin基因的表达量。 所述检测包括建立PCR反应体系:总体积为25ML,SYBRPremixExTaq12. 5 ML、模板cDNA或标准actin基因模板1. 5ML、引物混合物1. 0ML、超纯水10mL。 本专利技术可以准确的测定actin的表达水平,并具有高度的特异性,扩增曲线结果 表明actin基因荧光信号值符合标准的"S"型曲线(图1),熔解曲线表明该荧光定量具有高 度的检测专一性(图2)。【附图说明】 图1:莲草直胸跳甲actin基因扩增曲线; 图2 :莲草直胸跳甲actin基因熔解曲线。【具体实施方式】 以下结合具体实施例,对本专利技术进行详细说明。 本试剂盒由SYBR?PremixExTaq? (购自Takara公司)、引物混合物、标准actin 基因模板和超纯水组成,试剂盒组成: 表1试剂盒中各组成成分如下: SYBR?PremixExTaq?:内含TaKaRaExTaq?HS,dNTPMixture,Mg2+,TliRNaseH,SYBR?GreenI等。 引物混合物:引物1为10Mmol/L、引物2为10Mmol/L, 引物 1 序列为 5 ' -AAGCCCAAAGCAAAAGAGGTAT-3 '、 引物 2 序列为 5 ' -TGTAGAAGGTGTGATGCCAGAT-3 '; 标准actin基因模板:浓度为1. 0Mmol/L,actin基因模板序列为:5 ^-AAGCCCAAAGCA AMGAGGTATCCTCACCTTGAAATACCCAATTGAACACGGTATCATCACCMCTGGGATGATATGGAGAAGATCTGGC ATCACACCTTCTACA-3 '; 超纯水组成:纯度超过18. 25MQ?CM。 混合适当前第1页1 2 本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种莲草直胸跳甲actin基因转录水平荧光定量PCR检测引物混合物,其特征在于:所述引物混合物由引物1:5'‑AAGCCCAAAGCAAAAGAGGTAT‑3'和引物2:5'‑TGTAGAAGGTGTGATGCCAGAT‑3'组成。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:郑丽祯,傅建炜,史梦竹,李建宇,游泳,林涛,
申请(专利权)人:福建省农业科学院植物保护研究所,
类型:发明
国别省市:福建;35
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