本发明专利技术提供一种疟原虫检测试剂盒,所述试剂盒中包括用于荧光定量PCR检测的PCR反应液。具体地,所述PCR反应液中包含用于靶多核苷酸扩增的上游引物和下游引物序列,且上游引物:5’-CGACTAGGTGTTGGATGAAAGTGT-3’;下游引物:5’-CCAGAACCCAAAGACTTTGATTTC-3’。在一种具体实施方式中,所述PCR反应液中包含用于靶多核苷酸检测的探针序列,且探针序列为:5’-TTCGAGGTGACTTTTAGATTGCTTCCTTC-3’。本发明专利技术提供的试剂盒操作简便,灵敏度高,并可预防PCR产物污染,具有很好的特异性、重复性和稳定性,利用该试剂盒进行疟原虫荧光定量PCR检测,可以确定血液样本中疟原虫的有无,可为灵敏、早期诊断是否被疟原虫感染提供可靠的实验证据。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于检测试剂盒
,具体涉及一种疟原虫荧光定量PCR检测试剂 盒。
技术介绍
疟疾是全球最严重的由疟原虫引起的热带病之一,每年约有4亿人感染,其中大 部分发生在撒哈拉以南的非洲(恶性疟)和东南亚等国家(间日疟)。疟疾每年给非洲造 成的经济损失高达120亿美元。在针对疟疾的治疗过程中,病因的早期检测显得尤为的重 要,现在国内外成熟的商品化疟原虫检测试剂多为免疫学平台产品。 疟原虫的检测主要涉及到两个方面,核酸的提取和核酸的扩增检测。 国内成熟产品中,外周血中核酸的提取,目前主要有三种方法:1)直接煮沸法:向 外周血中加入核酸裂解液,直接煮沸,高速离心,上清即为模板。其优点是易于操作;缺点是 不能有效去除外周血中抑制PCR的因素,弱阳性经常无扩增。2)浓缩煮沸法:先将外周血 浓缩,再加裂解液,煮沸,高速离心,上清为模板,这种方法是目前国内临床通用的方法,其 优点是能部分去除"直接煮沸法"中无法去除的抑制性因素;缺点是不同厂家的浓缩效果不 一样,有的可以看到沉淀,有的无法看到。看得到沉淀的是因为将病毒与蛋白都浓缩了,导 致后面加入裂解液时很难充分混匀;无法看到沉淀的,使操作者无法确定吸弃杂质时会不 会把病毒一起吸弃,而导致病毒损失,导致成为假阴性。3)柱提取法:外周血通过裂解,过 柱后核酸吸附到膜上,通过两次洗涤,最后洗脱下来的为模板。这种方法相对前两种提取方 法而言,提取的核酸纯度大大提高,但步骤繁琐,时效性差。 临床上检测疟原虫的方法目前主要是免疫学方法,而基于实时荧光定量PCR技术 (探针法)对疟原虫进行检测的报导较少。实时荧光定量PCR技术是近年来发展迅速的 一种核酸检测技术;它使用一种带有荧光检测装置的PCR扩增仪,荧光检测装置能够按照 一定的程序周期性地发出特定波长的激发光,收集检测荧光信号,通过检测荧光信号的动 态变化实时反映PCR的每个循环的扩增水平,实验结束后可通过软件自动分析获得扩增曲 线,根据扩增曲线与荧光阈值线的交点(即Ct值)以及扩增曲线的形状,可以判断阴阳性 结果。与传统的PCR相对比,其在反应体系中增加了荧光探针。探针发出的荧光信号被荧 光检测装置收集。随着扩增的进行,荧光信号随着目的片段的扩增而呈现线性增强。实验 结束后,可以通过荧光PCR仪自带的软件自动分析数据,可以获得阴阳性结果。因此,该技 术在靶多核苷酸样品的检测分析中,已逐渐取代传统的PCR方法,得到十分广泛的应用。 国内已有多种基于免疫学方法用于疟原虫检测的试剂盒,但暂无实时荧光定量 PCR技术检测疟原虫的试剂盒应用于临床检测中。已有的这些试剂盒所提供的疟原虫提 取和检测方法有很多不足之处:1)核酸提取过程较复杂,样本处理耗时长,且在处理样本 时,需要经过多个步骤,样本中的DNA存在损耗,尤其对于高浓度的样本,裂解不充分、富集 不完全,会造成DNA的大量丢失导致样本丢失验证,核酸提取效率低;2)检测灵敏度低,在 5000 C〇pieS/ml左右;3) -般没有预防物污染的措施;4)没有荧光归一化校正系统,结果判 定受主观因素影响较大;5)方法学时效性差且通量小。 因此,本领域需要研宄开发一种操作简便、耗时短、高效、安全可靠且检测灵敏度 高的疟原虫检测试剂盒。
技术实现思路
本专利技术针对现有技术的不足,提供一种疟原虫荧光定量PCR检测试剂盒,该试剂 盒包括用于检测的探针、用于扩增的上游引物以及下游引物、PCR缓冲液和DNA聚合酶。该 试剂盒操作简便,灵敏度高,并可预防PCR产物污染,具有很好的特异性、重复性和稳定性, 利用该试剂盒进行疟原虫荧光定量PCR检测,可以确定血液样本中疟原虫有无,可为灵敏、 早期诊断是否被疟原虫感染提供可靠的实验证据。 因此,本专利技术提供一种疟原虫检测试剂盒,所述试剂盒中包括用于荧光定量PCR 检测的PCR反应液。具体地,所述PCR反应液中包含用于靶多核苷酸扩增的上游引物和下 游引物序列,且所述上游引物的序列为:5' -CGACTAGGTGTTGGATGAAAGTGT-3';所述下游引物 的序列为:5' -CCAGAACCCAAAGACITTGAITTC-3'。 在本专利技术的一种实施方式中,所述PCR反应液中包含用于靶多核苷酸检测的探针 序列,且所述探针序列为:5 ' -TTCGAGGTGACTTTTAGATTGCTTCCTTC-3 '。本专利技术中,所述探针的 羧基端用荧光素标记,并对羟基端用猝灭基团修饰,其中所述荧光素选自FAM、TET、JOE和 ffiX,所述猝灭基团选自BHQ1、DABCYL、TAMRA、BHQ2和BHQ3。优选所述荧光素为FAM,所述 猝灭基团为BHQ1。 本专利技术的试剂盒,因为采用了上述探针和上下游引物,所以具有很好的特异性和 灵敏性,应用本专利技术提供的试剂盒,可以对血液样本中的疟原虫进行快速、准确测定,特异 性好,能够检测出是否存在疟原虫感染。 在本专利技术的另一种实施方式中,所述试剂盒中还含有40~200mmol/L的参比染 料。本专利技术中,所述参比染料包括R0X参比染料(购自Roche公司)或其他适用于荧光定 量PCR的参比染料。加入R0X参比染料起到明显的归一化效果,对实验结果的重复性和稳 定性有明显改善。 本专利技术中,所述试剂盒中还包括酶混合液和疟原虫阴性对照,且所述酶混合液包 含浓度为1~5U/ y 1的耐热DNA聚合酶(Taq酶)和浓度为0? 05~0? 2U/ y 1的尿嘧啶DNA 糖基化酶(UNG酶)。其中UNG酶具有降解含有dU的PCR产物的功能,利用UNG酶和PCR反 应液中的dUTP可以起到预防PCR产物污染的作用。在本专利技术的另一个实施例中,所述疟原 虫阴性对照为不含有疟原虫任意一种型别的灭活阴性外周血。 本专利技术的PCR反应中优选地包括PCR反应缓冲液。在本专利技术的一个实施例中,所 述10XPCR反应缓冲液包括pH7. 5的200mmol/L三羟甲基氨基甲烷盐酸盐、30mmol/L氯化 镁、500mmol/L氯化钾、0. 2ml/100ml曲拉通、和10ml/100ml甲酰胺(各组分购自Sigma公 司 本专利技术还提供一种使用如上所述的试剂盒进行疟原虫荧光定量PCR检测的方法, 其包括:步骤K,将PCR反应液与酶混合液混合后制成PCR混合液;步骤L,将PCR混合液离 心处理,然后将经过离心处理的PCR混合液加入多个反应管,并向含有PCR混合液的反应 管中分别加入阴性对照或待测样本核酸,制成PCR反应样品,盖好管盖;步骤M,在荧光定量 PCR扩增仪上进行荧光PCR反应,检测并记录样品的扩增曲线与阈值线;步骤N,根据样品的 扩增曲线形状、扩增曲线与阈值线是否存在交点Ct,以及Ct值大小进行疟原虫分析;其中, 在步骤K中,PCR反应液的加入量为42~43 y 1/人份,酶混合液的加入量为1~2 y 1/人 份。 优选地,在步骤L中,每个反应管中阴性对照或待测样本核酸的加入量为3~ 5 y 1 〇【具体实施方式】 为使本专利技术更加容易理解,下面将结合实施例来详细说明本专利技术,这些实施例仅 起说明性作用,并不局限于本专利技术的应用范围,下列实施例中未提及的具体实验方法,通常 按照常规实验方法进行。 实施例1 本实施例提供一种疟原虫荧光定量PCR本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种疟原虫检测试剂盒,所述试剂盒中包括用于荧光定量PCR检测的PCR反应液。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:戴立忠,邓中平,付亚成,
申请(专利权)人:湖南圣湘生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:湖南;43
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。