水稻高抗性淀粉含量突变基因sbe3-rs的SNP检测方法技术

技术编号:11370266 阅读:145 留言:0更新日期:2015-04-30 01:59
本发明专利技术公开了一种水稻高抗性淀粉含量突变基因sbe3-rs的SNP检测方法,根据sbe3-rs基因存在单核苷酸变异,采用四引物扩增受阻突变体系PCR即ARMS-PCR的方法,设计四条基因特异性引物,加入同一PCR反应体系对不同水稻DNA进行扩增,根据其PCR的特征条带,能够快速、准确地鉴定水稻种植资源或其育种群体中是否含有突变基因sbe3-rs,本发明专利技术的检测方法具有灵敏度高、特异性强的特点,可以提高对高抗性淀粉突变基因sbe3-rs的选择效率,加速高抗性淀粉水稻品种的选育过程。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种水稻高抗性淀粉含量突变基因sbe3‑rs的SNP检测方法,其为四引物扩增受阻突变体系PCR即ARMS‑PCR的分子标记方法,包括如下步骤:1)ARMS引物设计根据sbe3‑rs基因在第16个外显子的第105位处具有T→C的单核苷酸碱基突变,设计四条基因特异性引物,分别为:正向外引物、反向外引物、正向内引物和反向内引物;其中,正向内引物和反向内引物的3’末端终止在待检测突变位点,在正向内引物和反向内引物的3’端倒数第3位设置碱基错配;2)ARMS‑PCR扩增将步骤1)中的四条基因特异性引物加入同一PCR反应体系,并对水稻植株的DNA进行PCR扩增,进行琼脂糖凝胶电泳;3)根据电泳结果确定基因型如果有572bp和218bp两条特征条带,即为不含sbe3‑rs基因型纯合体即低抗性淀粉含量植株;如果有572bp和397bp两条带,即为高抗性淀粉突变体基因sbe3‑rs纯合体;如果同时存在572bp、218bp和397bp三条带,则为高抗性淀粉突变体基因sbe3‑rs的杂合体。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:朴钟泽杨瑞芳白建江方军
申请(专利权)人:上海市农业科学院
类型:发明
国别省市:上海;31

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1