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使用序列标签的序列确定方法技术

技术编号:11298526 阅读:181 留言:0更新日期:2015-04-15 15:28
本发明专利技术涉及使用序列标签以改善相关序列的扩增子特别是大的和复杂的扩增子,例如包含编码免疫受体分子的重组核酸的扩增子的序列确定。在一个方面,比对具有相同序列标签的序列读段(read),然后,由在每个位置的序列读段碱基响应(base call)的(可能加权的)平均碱基响应确定最终碱基响应。相似地,在另一个方面,通过共同序列标签比对包括一系列的掺入信号的序列读段,并且均聚物区域中的碱基响应被作为在每个“流”位置的功能掺入信号值。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

【技术保护点】
一种确定免疫组库的克隆型的方法,所述方法包括步骤:(a)从个体获得包含T细胞和/或B细胞的样品;(b)将序列标签附接到T细胞受体基因或者T细胞和/或B细胞的免疫球蛋白基因的重组核酸的分子,以形成标签‑分子轭合物,其中所述标签‑分子轭合物的基本上每个分子具有独特的序列标签;(c)扩增所述标签‑分子轭合物;(d)测序所述标签‑分子轭合物;以及(e)比对相似序列标签的序列读段以确定相应于所述组库的相同克隆型的序列读段。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:马利克·法哈姆马丁·穆尔黑德托马斯·威利斯建标·郑
申请(专利权)人:赛昆塔公司
类型:发明
国别省市:美国;US

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